MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Candidatus Saccharimonas aalborgensis

Total Repeats: 272

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021219	TACC	2	8	362	369	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_021219	TGGG	2	8	2986	2993	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021219	AAAT	2	8	17359	17366	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021219	TATT	2	8	17389	17396	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021219	TTCG	2	8	18436	18443	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_021219	GACA	2	8	27790	27797	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_021219	GGAC	2	8	31974	31981	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8	NC_021219	GTCC	2	8	32003	32010	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9	NC_021219	TATG	2	8	32545	32552	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021219	CCTG	2	8	37603	37610	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11	NC_021219	AACG	2	8	37613	37620	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_021219	ACCA	2	8	37877	37884	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_021219	CAGC	2	8	38163	38170	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
14	NC_021219	GCCA	2	8	41464	41471	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
15	NC_021219	GGTT	2	8	42703	42710	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021219	GACA	2	8	51256	51263	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_021219	GCCG	2	8	58624	58631	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_021219	CGCC	2	8	59372	59379	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
19	NC_021219	GGGA	2	8	59383	59390	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021219	GACA	2	8	60249	60256	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_021219	GCCC	2	8	61420	61427	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
22	NC_021219	GAGC	2	8	61434	61441	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
23	NC_021219	GCCC	2	8	62143	62150	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
24	NC_021219	GAGC	2	8	62157	62164	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
25	NC_021219	CTGT	2	8	63994	64001	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_021219	GACA	2	8	72435	72442	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_021219	TAAA	2	8	85098	85105	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021219	TTTA	2	8	85777	85784	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021219	ACCA	2	8	114954	114961	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_021219	ATAG	2	8	126251	126258	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021219	GCCC	2	8	126637	126644	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
32	NC_021219	CAAT	2	8	129066	129073	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_021219	GTTA	2	8	134610	134617	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021219	GTTC	2	8	134963	134970	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_021219	TATG	2	8	136739	136746	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021219	AGTA	2	8	139193	139200	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021219	CGAG	2	8	140621	140628	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
38	NC_021219	TACT	2	8	141679	141686	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_021219	ACCA	2	8	150636	150643	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_021219	TGTT	2	8	150937	150944	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021219	AAGT	2	8	151044	151051	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021219	CTCA	2	8	151755	151762	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_021219	ACGT	2	8	152052	152059	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_021219	CAAT	2	8	153699	153706	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_021219	TCTT	2	8	155624	155631	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_021219	TAGC	2	8	162572	162579	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_021219	TAAA	2	8	171264	171271	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021219	CAAC	2	8	172435	172442	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_021219	CAAA	2	8	172639	172646	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_021219	GCTC	2	8	173853	173860	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
51	NC_021219	TCTA	2	8	174237	174244	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_021219	TAGG	2	8	174246	174253	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021219	GCAA	2	8	175266	175273	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_021219	CCAG	2	8	175383	175390	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
55	NC_021219	TGTA	2	8	178922	178929	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021219	GTAC	2	8	179748	179755	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_021219	AATT	2	8	197716	197723	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021219	TGTT	2	8	197868	197875	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021219	TTAG	2	8	203081	203088	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021219	GGAA	2	8	203111	203118	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021219	GCCT	2	8	211508	211515	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
62	NC_021219	CTTT	2	8	216282	216289	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_021219	GAAA	2	8	231849	231856	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021219	TCTT	2	8	232014	232021	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_021219	TCAG	2	8	233517	233524	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
66	NC_021219	CTGT	2	8	264586	264593	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
67	NC_021219	CTTT	2	8	272511	272518	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_021219	AAGC	2	8	285035	285042	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_021219	ACCA	2	8	285102	285109	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_021219	TTAA	2	8	288099	288106	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021219	CAAG	2	8	298070	298077	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
72	NC_021219	TAAG	2	8	298191	298198	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021219	TGTT	2	8	298215	298222	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021219	TTGT	2	8	298233	298240	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021219	TTGC	2	8	299181	299188	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_021219	AAAC	2	8	310330	310337	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_021219	AAAG	2	8	314092	314099	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021219	CTTT	2	8	314120	314127	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_021219	ATCT	2	8	317480	317487	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_021219	AACT	2	8	326969	326976	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_021219	AAAT	2	8	327792	327799	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021219	CTTT	2	8	332140	332147	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_021219	TGTA	2	8	355786	355793	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021219	TGCA	2	8	358599	358606	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
85	NC_021219	CATA	2	8	369719	369726	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_021219	CCCG	2	8	373322	373329	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
87	NC_021219	AAGG	2	8	377654	377661	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021219	TTAT	2	8	379964	379971	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021219	GCTT	2	8	382478	382485	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
90	NC_021219	ACGC	2	8	382542	382549	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
91	NC_021219	TGTT	2	8	386401	386408	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021219	GCAA	2	8	386443	386450	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
93	NC_021219	GGAT	2	8	386820	386827	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021219	GCTT	2	8	400991	400998	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
95	NC_021219	AAGA	2	8	401023	401030	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_021219	TATT	2	8	401871	401878	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021219	GGCA	2	8	401901	401908	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
98	NC_021219	CTGC	2	8	402095	402102	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
99	NC_021219	CCAC	2	8	402133	402140	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
100	NC_021219	TATC	2	8	421280	421287	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_021219	GTAT	2	8	425576	425583	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_021219	CTTT	2	8	440528	440535	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_021219	TTAT	2	8	442099	442106	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_021219	TGGC	2	8	449410	449417	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
105	NC_021219	GTTT	2	8	451915	451922	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_021219	ATTT	2	8	463758	463765	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021219	TCAG	2	8	465010	465017	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
108	NC_021219	CTAC	2	8	465995	466002	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_021219	CTGC	2	8	484643	484650	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
110	NC_021219	CCTA	2	8	485017	485024	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_021219	CGAA	2	8	485150	485157	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
112	NC_021219	GTGA	2	8	485411	485418	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021219	TAGA	2	8	485472	485479	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021219	ACAA	2	8	487638	487645	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_021219	AGTG	2	8	501283	501290	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_021219	TATT	2	8	502434	502441	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_021219	ATCT	2	8	502477	502484	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_021219	AAAT	2	8	502831	502838	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021219	GAAA	2	8	512683	512690	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_021219	TATT	2	8	521019	521026	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_021219	TGTT	3	12	521059	521070	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_021219	TTAT	2	8	521090	521097	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_021219	TGAG	2	8	521231	521238	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_021219	TCCA	2	8	522766	522773	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_021219	CTAT	2	8	533875	533882	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
126	NC_021219	GTTT	2	8	542132	542139	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_021219	CTTG	3	12	546180	546191	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
128	NC_021219	AGCG	2	8	546199	546206	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
129	NC_021219	ACAA	2	8	560160	560167	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
130	NC_021219	ACAA	2	8	560678	560685	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
131	NC_021219	CGGG	2	8	564437	564444	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
132	NC_021219	AGCT	2	8	568577	568584	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
133	NC_021219	CTTG	2	8	568607	568614	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
134	NC_021219	CTGT	2	8	576838	576845	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
135	NC_021219	GATA	2	8	583526	583533	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_021219	TGTC	2	8	585157	585164	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
137	NC_021219	ATAA	2	8	606779	606786	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_021219	TCAA	2	8	615248	615255	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_021219	TATC	2	8	619920	619927	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
140	NC_021219	TTCG	2	8	621747	621754	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
141	NC_021219	CTGA	2	8	621890	621897	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
142	NC_021219	CGAG	2	8	621910	621917	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
143	NC_021219	TAAC	2	8	621982	621989	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_021219	GTAG	2	8	622042	622049	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_021219	TTAC	2	8	624974	624981	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
146	NC_021219	GTGA	2	8	624996	625003	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_021219	CAGA	2	8	633016	633023	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
148	NC_021219	GAAG	2	8	641970	641977	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
149	NC_021219	TTTG	2	8	646327	646334	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
150	NC_021219	ACAA	2	8	646400	646407	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
151	NC_021219	TTTC	2	8	666212	666219	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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272	NC_021219	AAAC	2	8	1005299	1005306	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.