MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori UM066

Total Repeats: 106

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021218	CTCTTT	2	12	755	766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_021218	AGCTTG	2	12	3182	3193	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_021218	TCTTGC	2	12	5088	5099	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_021218	GTTATT	2	12	6413	6424	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021218	ATTTTT	2	12	7760	7771	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021218	AAGAAT	2	12	27194	27205	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021218	GAAATT	2	12	41333	41344	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021218	TTAGAA	2	12	43783	43794	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021218	ATTTTT	2	12	45461	45472	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021218	TTATAA	2	12	50536	50547	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021218	ATTTGT	2	12	120463	120474	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021218	CCTGTT	2	12	122787	122798	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_021218	AAAAAT	2	12	135312	135323	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021218	ATCCAC	2	12	152846	152857	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_021218	GTGTTT	2	12	206286	206297	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021218	TTTAAT	2	12	210926	210937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021218	CGGGAA	2	12	217679	217690	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_021218	CGCAAG	2	12	218366	218377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_021218	TATAAT	2	12	222989	223000	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021218	TCATTA	2	12	231950	231961	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_021218	ATTTTT	2	12	289018	289029	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021218	GTGATG	2	12	289634	289645	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021218	AGTGGT	2	12	304082	304093	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021218	TCCCTT	2	12	304173	304184	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_021218	TGGGAG	2	12	304618	304629	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021218	TATTTA	2	12	319421	319432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021218	CTGTAT	2	12	348670	348681	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_021218	AATTTT	2	12	349359	349370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021218	TATAAT	2	12	356682	356693	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021218	AAGTTA	2	12	366270	366281	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021218	ATTTAG	2	12	366307	366318	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021218	ATTAAA	2	12	370469	370480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021218	AGTGAG	2	12	371774	371785	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021218	CAAAAA	2	12	376917	376928	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_021218	GATTCT	2	12	384292	384303	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_021218	ATTTTA	2	12	393630	393641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021218	CAAAAG	2	12	478278	478289	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_021218	TTATTT	2	12	515247	515258	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021218	AAAAAG	2	12	572643	572654	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021218	AAAATA	2	12	573443	573454	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021218	TAAAAA	2	12	587125	587136	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021218	TTGGCT	2	12	590739	590750	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_021218	TATTAG	2	12	596443	596454	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021218	ATAAAA	2	12	598047	598058	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021218	TATTTT	2	12	612076	612087	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021218	AGTTTT	2	12	650090	650101	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021218	ACAGGC	2	12	688562	688573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_021218	GCACAA	2	12	689947	689958	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_021218	GATATT	2	12	696805	696816	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021218	CCAAAG	2	12	714472	714483	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_021218	CAAATT	2	12	753397	753408	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_021218	TGGAAG	2	12	766611	766622	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021218	AAGCCT	2	12	767154	767165	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_021218	AAGAAA	2	12	827390	827401	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021218	AATGAG	2	12	827426	827437	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021218	AAAAAT	3	18	834380	834397	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021218	CACCGG	2	12	868278	868289	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
58	NC_021218	CCACAT	2	12	892808	892819	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_021218	TTGAAG	2	12	894128	894139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021218	ATTGAG	2	12	895842	895853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021218	TTCAAA	2	12	896977	896988	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_021218	GTTTGG	2	12	897076	897087	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021218	AATTAA	2	12	897385	897396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021218	TTTGAT	2	12	917640	917651	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021218	TTAAAA	2	12	924733	924744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021218	GAAGCG	2	12	953875	953886	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_021218	TTTAAA	2	12	957543	957554	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021218	TTACAA	2	12	982692	982703	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_021218	TCCAAA	2	12	1006079	1006090	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_021218	TCTTTA	2	12	1012370	1012381	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_021218	CAAAAA	2	12	1045712	1045723	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_021218	AAAAAG	2	12	1045922	1045933	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021218	ATTATA	2	12	1069793	1069804	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021218	ATTGAA	2	12	1077202	1077213	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021218	ATTTTT	2	12	1101770	1101781	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021218	TTAAAA	2	12	1124227	1124238	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021218	TCCTAT	2	12	1164624	1164635	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_021218	AAAGCC	2	12	1169614	1169625	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_021218	ATTTGA	2	12	1215293	1215304	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021218	ACTTAA	2	12	1269907	1269918	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_021218	GGCCTA	2	12	1289605	1289616	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_021218	TAAAGA	2	12	1292172	1292183	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021218	TTTTGT	2	12	1311643	1311654	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021218	ATCCTT	2	12	1326448	1326459	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_021218	TTGTAT	2	12	1328869	1328880	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021218	ACTTAA	2	12	1346136	1346147	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_021218	TCATTT	2	12	1368352	1368363	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_021218	AAACTT	2	12	1368375	1368386	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_021218	AAATTA	2	12	1385396	1385407	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021218	ATTTTT	2	12	1399349	1399360	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021218	TAAAAA	2	12	1427533	1427544	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021218	ATTTTT	2	12	1445683	1445694	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021218	GGAGAA	2	12	1459149	1459160	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021218	AGTTTT	2	12	1489950	1489961	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021218	TTTTTC	2	12	1500146	1500157	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_021218	GTTTTA	2	12	1511178	1511189	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021218	CATGGG	2	12	1516053	1516064	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_021218	CTAAGT	5	30	1523297	1523326	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_021218	TTTGAG	2	12	1525423	1525434	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021218	TGTTTA	2	12	1531743	1531754	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_021218	TAAAAA	2	12	1562675	1562686	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_021218	TAAGAT	2	12	1607016	1607027	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_021218	TCTAAT	2	12	1628747	1628758	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_021218	ATCAGC	2	12	1630420	1630431	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_021218	ACCATA	2	12	1638017	1638028	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_021218	TGTTTA	2	12	1649465	1649476	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.