MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori UM066

Total Repeats: 347

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021218	CT	3	6	834	839	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_021218	TG	3	6	960	965	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021218	CT	3	6	1819	1824	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_021218	CT	3	6	2018	2023	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_021218	AC	3	6	2222	2227	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_021218	TC	3	6	4278	4283	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_021218	TG	3	6	5082	5087	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021218	CT	3	6	5151	5156	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_021218	CT	4	8	5506	5513	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_021218	CT	3	6	5649	5654	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_021218	AG	4	8	5834	5841	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021218	CT	3	6	5905	5910	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_021218	TC	5	10	6042	6051	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_021218	CT	3	6	6116	6121	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_021218	TA	3	6	7408	7413	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021218	TC	4	8	16311	16318	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_021218	GA	3	6	25827	25832	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021218	CT	3	6	27111	27116	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_021218	TC	3	6	32081	32086	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_021218	CA	3	6	35672	35677	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_021218	TG	3	6	38206	38211	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021218	CT	3	6	43324	43329	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_021218	TG	3	6	43722	43727	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021218	CT	3	6	44008	44013	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_021218	GC	3	6	44051	44056	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_021218	AG	3	6	46761	46766	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021218	AG	3	6	47634	47639	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021218	TC	3	6	58886	58891	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_021218	AG	3	6	77968	77973	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021218	AT	3	6	78934	78939	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021218	CT	3	6	78974	78979	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_021218	TA	3	6	88542	88547	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021218	AG	3	6	101392	101397	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021218	AC	3	6	115029	115034	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_021218	TA	3	6	117122	117127	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021218	TA	3	6	120395	120400	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021218	TC	3	6	120442	120447	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_021218	AG	3	6	122708	122713	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021218	CT	3	6	128697	128702	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_021218	CT	3	6	128724	128729	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_021218	CT	3	6	128768	128773	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_021218	AG	3	6	133176	133181	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021218	TA	4	8	135482	135489	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021218	AT	5	10	135491	135500	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021218	CT	3	6	141834	141839	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_021218	CT	4	8	146377	146384	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_021218	AC	3	6	146786	146791	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_021218	CT	3	6	146864	146869	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_021218	TA	3	6	147502	147507	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021218	GA	3	6	149630	149635	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021218	CG	3	6	149777	149782	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52	NC_021218	GA	3	6	154712	154717	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021218	CT	3	6	177239	177244	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_021218	AG	3	6	177784	177789	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021218	TA	3	6	177968	177973	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021218	CT	3	6	188783	188788	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_021218	AG	3	6	195216	195221	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021218	TG	3	6	207927	207932	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021218	GT	3	6	211002	211007	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021218	CT	3	6	214281	214286	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_021218	CT	8	16	217324	217339	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_021218	GA	3	6	219831	219836	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021218	TA	3	6	231539	231544	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021218	CA	3	6	243265	243270	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_021218	AG	3	6	248944	248949	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021218	AC	3	6	252887	252892	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_021218	CT	3	6	255620	255625	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_021218	GT	3	6	289529	289534	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021218	CT	3	6	289871	289876	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_021218	CT	3	6	289892	289897	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_021218	TG	3	6	294355	294360	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021218	TG	3	6	294385	294390	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021218	AC	3	6	294628	294633	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_021218	AT	3	6	294898	294903	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021218	AG	3	6	295360	295365	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021218	TG	3	6	304529	304534	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021218	AT	3	6	305300	305305	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021218	CA	3	6	305677	305682	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_021218	TA	3	6	319406	319411	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021218	TC	3	6	347780	347785	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_021218	AG	3	6	347971	347976	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021218	TC	3	6	348397	348402	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_021218	AC	3	6	349257	349262	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_021218	CT	6	12	352105	352116	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_021218	AT	3	6	356651	356656	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021218	TG	3	6	368998	369003	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021218	GT	3	6	376938	376943	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021218	TA	3	6	407566	407571	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021218	AG	3	6	444795	444800	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021218	TA	3	6	466867	466872	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021218	AG	3	6	473351	473356	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021218	GC	3	6	478191	478196	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
93	NC_021218	AG	3	6	478904	478909	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021218	AG	3	6	479026	479031	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021218	CT	3	6	481723	481728	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_021218	AG	3	6	481754	481759	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021218	TC	3	6	483677	483682	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_021218	TC	4	8	483685	483692	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_021218	CT	3	6	499318	499323	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_021218	AC	3	6	499445	499450	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_021218	TC	3	6	511883	511888	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_021218	AG	3	6	515502	515507	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_021218	CT	3	6	515715	515720	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_021218	TA	5	10	516738	516747	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021218	AG	3	6	518490	518495	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_021218	AG	3	6	519944	519949	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021218	GA	4	8	528047	528054	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_021218	GA	3	6	544309	544314	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021218	AC	3	6	572042	572047	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_021218	AC	3	6	572121	572126	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_021218	CA	3	6	572250	572255	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_021218	GA	3	6	572336	572341	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021218	TC	3	6	572713	572718	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_021218	AG	3	6	573206	573211	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021218	TA	3	6	580975	580980	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_021218	TA	3	6	581044	581049	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_021218	GC	3	6	581136	581141	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
118	NC_021218	TG	3	6	587080	587085	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021218	AG	3	6	587647	587652	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_021218	TA	3	6	587890	587895	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_021218	AG	3	6	588735	588740	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_021218	GT	4	8	588845	588852	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_021218	GC	3	6	590380	590385	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
124	NC_021218	GC	3	6	590929	590934	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
125	NC_021218	AT	4	8	595313	595320	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_021218	CT	3	6	596867	596872	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_021218	AT	3	6	597565	597570	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_021218	CT	3	6	598118	598123	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_021218	CG	3	6	598318	598323	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
130	NC_021218	CT	3	6	598404	598409	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_021218	GT	4	8	609090	609097	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_021218	GA	3	6	609107	609112	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_021218	AG	3	6	613703	613708	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_021218	CA	3	6	641972	641977	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_021218	GT	3	6	643737	643742	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_021218	AT	3	6	667738	667743	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_021218	TG	3	6	685947	685952	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_021218	GA	4	8	685960	685967	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_021218	TC	3	6	688330	688335	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NC_021218	GC	3	6	688416	688421	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
141	NC_021218	GC	3	6	688993	688998	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
142	NC_021218	GC	3	6	689155	689160	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
143	NC_021218	CA	3	6	690389	690394	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
144	NC_021218	AC	3	6	697941	697946	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_021218	GA	3	6	700276	700281	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_021218	GA	3	6	702943	702948	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_021218	TG	3	6	714108	714113	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_021218	CT	3	6	714309	714314	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_021218	AG	3	6	714936	714941	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
150	NC_021218	CT	3	6	717356	717361	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
151	NC_021218	TC	3	6	730728	730733	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
152	NC_021218	GA	3	6	733128	733133	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
153	NC_021218	CT	3	6	733188	733193	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
154	NC_021218	CT	3	6	733235	733240	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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156	NC_021218	CT	3	6	772500	772505	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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341	NC_021218	AT	3	6	1633787	1633792	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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344	NC_021218	CA	3	6	1643703	1643708	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
345	NC_021218	TG	3	6	1643749	1643754	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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347	NC_021218	CT	3	6	1656619	1656624	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.