MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori UM037

Total Repeats: 82

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021217	TAGGCA	2	12	172	183	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_021217	GTTTTA	2	12	10716	10727	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021217	AAAAAC	2	12	42913	42924	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_021217	TAAAAA	2	12	46912	46923	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021217	AATTTT	2	12	84465	84476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021217	TTATAA	2	12	93742	93753	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021217	ATTAAA	2	12	107816	107827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021217	ATTTTA	2	12	130956	130967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021217	TCCCGC	2	12	134856	134867	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_021217	TCCCGC	2	12	135669	135680	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_021217	AAAGAA	2	12	245420	245431	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021217	TTGTTT	2	12	251618	251629	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021217	ACCCAT	2	12	271478	271489	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_021217	TTTTAA	2	12	271545	271556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021217	CTGGGG	2	12	277629	277640	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_021217	TATTTT	2	12	298415	298426	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021217	GTTTTT	2	12	300847	300858	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021217	ATGTTT	2	12	325753	325764	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021217	CAAATT	2	12	353622	353633	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_021217	ATTTTA	2	12	424360	424371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021217	CTTTAT	2	12	471292	471303	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_021217	TTTGAT	2	12	553182	553193	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021217	TTAAAA	2	12	560281	560292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021217	AAAATT	2	12	602161	602172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021217	ATTTTT	2	12	680516	680527	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021217	ATTATA	2	12	724933	724944	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021217	TTTGGG	2	12	726451	726462	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021217	ATTGAA	2	12	732617	732628	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021217	ATAAAA	2	12	742779	742790	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021217	TTGTAA	2	12	784755	784766	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021217	TTTAAA	2	12	791227	791238	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021217	TCTTGT	2	12	803114	803125	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_021217	ATTAAA	2	12	818060	818071	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021217	AAAATA	2	12	831745	831756	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021217	AAAGAA	2	12	862791	862802	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021217	TATTTT	2	12	870840	870851	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021217	AGAAAG	2	12	898414	898425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021217	ATAAAA	2	12	930042	930053	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021217	GCCTTT	2	12	951872	951883	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_021217	ATCATG	2	12	952203	952214	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_021217	TCTTTT	2	12	980265	980276	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_021217	GCTATC	2	12	989136	989147	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_021217	CATGCC	2	12	996008	996019	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
44	NC_021217	TTCCTT	2	12	1065501	1065512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_021217	GCATTA	2	12	1067534	1067545	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_021217	ATTAAA	2	12	1110942	1110953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021217	ATCCTT	2	12	1119916	1119927	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_021217	GTGCAT	2	12	1119935	1119946	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_021217	TTGTAT	2	12	1122337	1122348	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021217	ACTTAA	2	12	1140865	1140876	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_021217	AAACTT	2	12	1163195	1163206	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_021217	TGTTAT	2	12	1172635	1172646	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021217	ATTTTT	2	12	1194972	1194983	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021217	CAGTGG	2	12	1213903	1213914	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_021217	TTTGAG	2	12	1220133	1220144	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021217	AAAATT	2	12	1227708	1227719	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021217	AGTTTT	2	12	1309523	1309534	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021217	AAAAAC	2	12	1321073	1321084	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_021217	ATTTTG	2	12	1321400	1321411	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021217	AGATTT	2	12	1321908	1321919	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021217	AGCGGG	2	12	1325946	1325957	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_021217	GTTTTA	2	12	1336055	1336066	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021217	AAAAAT	2	12	1337689	1337700	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021217	TAAAAA	2	12	1337884	1337895	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021217	CTAAGT	2	12	1347713	1347724	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_021217	TGTTTA	2	12	1356283	1356294	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021217	AAAATT	2	12	1453833	1453844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021217	AAACCA	2	12	1487256	1487267	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_021217	AGAAAG	2	12	1492123	1492134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021217	TATCAA	2	12	1505167	1505178	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_021217	AAAGAT	2	12	1558236	1558247	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021217	AAACAC	2	12	1581701	1581712	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_021217	AAATGA	2	12	1589008	1589019	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021217	ACTTAG	3	18	1608193	1608210	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_021217	TTTGTT	2	12	1614291	1614302	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021217	TACAAA	2	12	1656965	1656976	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_021217	GAAAAG	2	12	1657404	1657415	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021217	ATAAAG	2	12	1657772	1657783	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021217	TTCTAT	2	12	1689873	1689884	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_021217	GTTCTA	2	12	1690289	1690300	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_021217	TGAATT	2	12	1692144	1692155	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021217	TTTCAA	2	12	1692302	1692313	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.