MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori UM299

Total Repeats: 65

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021216	GATTGA	2	12	21198	21209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021216	AAAATA	2	12	48014	48025	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021216	TAAAAA	2	12	61610	61621	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021216	TATTAG	2	12	70957	70968	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021216	ATAAAA	2	12	72552	72563	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021216	ATTTTT	2	12	73015	73026	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021216	TAATTC	2	12	84859	84870	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_021216	TATTTT	2	12	86556	86567	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021216	AGTTTT	2	12	125241	125252	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021216	TTTATG	2	12	131481	131492	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021216	CAAGCT	2	12	241365	241376	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_021216	AAACCA	2	12	260499	260510	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_021216	TATCAC	2	12	275532	275543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_021216	CTCATT	2	12	302000	302011	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_021216	GCCCCC	2	12	375800	375811	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
16	NC_021216	TTTGAT	2	12	401975	401986	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021216	TTAAAA	2	12	409068	409079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021216	TATTTT	2	12	432073	432084	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021216	TTTAAA	2	12	442184	442195	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021216	ATTTTT	2	12	464746	464757	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021216	TCCAAA	2	12	490803	490814	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_021216	AAAAAG	2	12	528304	528315	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021216	AAAAAG	2	12	528454	528465	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021216	ATTGAA	2	12	559266	559277	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021216	TAAAAT	2	12	590801	590812	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021216	TATCCT	2	12	598581	598592	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_021216	TTAAAA	2	12	608914	608925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021216	TATGGG	2	12	608975	608986	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021216	CTAAAA	2	12	635656	635667	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_021216	AAAGCC	2	12	654320	654331	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_021216	ATAAAG	2	12	774878	774889	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021216	TTGTAT	2	12	810033	810044	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021216	ACTTAA	2	12	827227	827238	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_021216	TCATTT	2	12	850797	850808	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_021216	AAACTT	2	12	850820	850831	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_021216	AAAAAG	2	12	865612	865623	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021216	ATTTTT	2	12	882025	882036	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021216	TAAAAA	2	12	910114	910125	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021216	AAGAAA	2	12	941076	941087	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021216	ATCCTA	2	12	971954	971965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_021216	TCTAAA	2	12	972460	972471	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_021216	TTGATA	2	12	973078	973089	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021216	AGTTTT	2	12	973575	973586	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021216	GTTTTA	2	12	995595	995606	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021216	TAAAAA	2	12	996420	996431	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021216	ATAGGG	2	12	1009748	1009759	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021216	TGTTTA	2	12	1016158	1016169	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021216	TAAGCC	2	12	1121222	1121233	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_021216	AACCTA	2	12	1126668	1126679	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_021216	TTGCTA	2	12	1138967	1138978	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_021216	AAAAAG	2	12	1193889	1193900	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021216	AAACAC	2	12	1207313	1207324	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_021216	AGAAAA	2	12	1262661	1262672	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021216	AATATT	2	12	1284615	1284626	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021216	CTAAAA	2	12	1301600	1301611	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_021216	ATTTTT	2	12	1325026	1325037	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021216	TAAAAA	2	12	1378419	1378430	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021216	AATTTC	2	12	1382548	1382559	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_021216	ATTCTT	2	12	1396271	1396282	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_021216	ACTCAA	2	12	1415200	1415211	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_021216	TATAAT	2	12	1422029	1422040	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021216	CAAAAC	2	12	1434539	1434550	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_021216	ATTAAA	2	12	1436044	1436055	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021216	ATTTTA	2	12	1459152	1459163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021216	AAGAGC	2	12	1557852	1557863	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.