MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Helicobacter pylori UM299

Total Repeats: 1293

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021216	CCCGC	2	10	3890	3899	0 %	0 %	20 %	80 %	529858351
2	NC_021216	AGCCT	2	10	4885	4894	20 %	20 %	20 %	40 %	529858352
3	NC_021216	ACGCC	2	10	5384	5393	20 %	0 %	20 %	60 %	499082916
4	NC_021216	AAGAT	2	10	11647	11656	60 %	20 %	20 %	0 %	499082908
5	NC_021216	TGGGT	2	10	12011	12020	0 %	40 %	60 %	0 %	499082908
6	NC_021216	CAAGC	2	10	12189	12198	40 %	0 %	20 %	40 %	499082908
7	NC_021216	AAAAT	2	10	12702	12711	80 %	20 %	0 %	0 %	499082907
8	NC_021216	AGCAT	2	10	15352	15361	40 %	20 %	20 %	20 %	499082903
9	NC_021216	AAAGA	2	10	15687	15696	80 %	0 %	20 %	0 %	499082902
10	NC_021216	GTTTT	2	10	18489	18498	0 %	80 %	20 %	0 %	499082901
11	NC_021216	AGATA	2	10	19310	19319	60 %	20 %	20 %	0 %	499082899
12	NC_021216	GCATC	2	10	21100	21109	20 %	20 %	20 %	40 %	499082899
13	NC_021216	ATTCA	2	10	24283	24292	40 %	40 %	0 %	20 %	499082895
14	NC_021216	GATCG	2	10	25331	25340	20 %	20 %	40 %	20 %	499082894
15	NC_021216	ATCGC	2	10	26405	26414	20 %	20 %	20 %	40 %	499082894
16	NC_021216	TTTAT	2	10	28162	28171	20 %	80 %	0 %	0 %	499082892
17	NC_021216	ACGCT	2	10	28320	28329	20 %	20 %	20 %	40 %	499082892
18	NC_021216	AGCAT	2	10	30047	30056	40 %	20 %	20 %	20 %	499082890
19	NC_021216	GGCAT	2	10	30320	30329	20 %	20 %	40 %	20 %	499082890
20	NC_021216	ATTTT	2	10	31986	31995	20 %	80 %	0 %	0 %	499082888
21	NC_021216	AGGGC	2	10	32960	32969	20 %	0 %	60 %	20 %	499082887
22	NC_021216	CGTTT	2	10	33700	33709	0 %	60 %	20 %	20 %	499082885
23	NC_021216	CGCAG	2	10	34400	34409	20 %	0 %	40 %	40 %	499082884
24	NC_021216	ATTGA	2	10	34747	34756	40 %	40 %	20 %	0 %	499082884
25	NC_021216	TAAAG	2	10	36240	36249	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021216	GCATG	2	10	36426	36435	20 %	20 %	40 %	20 %	499082882
27	NC_021216	TCATG	2	10	37355	37364	20 %	40 %	20 %	20 %	499082880
28	NC_021216	GCTTG	2	10	37373	37382	0 %	40 %	40 %	20 %	499082880
29	NC_021216	TTAAT	2	10	37859	37868	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021216	TCTTA	2	10	37930	37939	20 %	60 %	0 %	20 %	499082879
31	NC_021216	ATCAA	2	10	41031	41040	60 %	20 %	0 %	20 %	499082876
32	NC_021216	TTTTA	2	10	41179	41188	20 %	80 %	0 %	0 %	499082876
33	NC_021216	GCATG	2	10	41296	41305	20 %	20 %	40 %	20 %	499082876
34	NC_021216	TCTTG	2	10	42671	42680	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
35	NC_021216	GGAAA	2	10	43057	43066	60 %	0 %	40 %	0 %	499082874
36	NC_021216	GCAAG	2	10	44570	44579	40 %	0 %	40 %	20 %	499082873
37	NC_021216	TTGCC	2	10	45216	45225	0 %	40 %	20 %	40 %	499082872
38	NC_021216	AATCG	2	10	46361	46370	40 %	20 %	20 %	20 %	499082872
39	NC_021216	AGCCA	2	10	47664	47673	40 %	0 %	20 %	40 %	499082871
40	NC_021216	ATAAA	2	10	48044	48053	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021216	AAAAT	2	10	48078	48087	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021216	TTTGT	2	10	52853	52862	0 %	80 %	20 %	0 %	499082865
43	NC_021216	TTCAT	2	10	53937	53946	20 %	60 %	0 %	20 %	499082864
44	NC_021216	ATTCA	2	10	55151	55160	40 %	40 %	0 %	20 %	499082864
45	NC_021216	TAGGA	2	10	56134	56143	40 %	20 %	40 %	0 %	499082863
46	NC_021216	ATCAA	2	10	57091	57100	60 %	20 %	0 %	20 %	499082862
47	NC_021216	TTTTG	2	10	57476	57485	0 %	80 %	20 %	0 %	499082862
48	NC_021216	TCTTT	2	10	59685	59694	0 %	80 %	0 %	20 %	499082861
49	NC_021216	AATAA	2	10	60538	60547	80 %	20 %	0 %	0 %	499082861
50	NC_021216	AAAGC	2	10	60796	60805	60 %	0 %	20 %	20 %	529858445
51	NC_021216	ATTGA	2	10	63757	63766	40 %	40 %	20 %	0 %	499082857
52	NC_021216	TTTTC	2	10	67957	67966	0 %	80 %	0 %	20 %	499082852
53	NC_021216	TAACA	2	10	68404	68413	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_021216	TAAAA	2	10	68526	68535	80 %	20 %	0 %	0 %	499082851
55	NC_021216	CAAAA	2	10	69384	69393	80 %	0 %	0 %	20 %	499082851
56	NC_021216	AATAA	2	10	69793	69802	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021216	TAAAA	2	10	69887	69896	80 %	20 %	0 %	0 %	529858446
58	NC_021216	TTTGA	2	10	72278	72287	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021216	TAAAA	2	10	73141	73150	80 %	20 %	0 %	0 %	499082845
60	NC_021216	AAAAT	2	10	74498	74507	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021216	GCCAT	2	10	74712	74721	20 %	20 %	20 %	40 %	499082844
62	NC_021216	GCTTT	2	10	75408	75417	0 %	60 %	20 %	20 %	499082844
63	NC_021216	AAAAT	2	10	76745	76754	80 %	20 %	0 %	0 %	499082843
64	NC_021216	ATCAA	2	10	77580	77589	60 %	20 %	0 %	20 %	499082842
65	NC_021216	GAAAA	2	10	78743	78752	80 %	0 %	20 %	0 %	499082841
66	NC_021216	AAAAG	2	10	79466	79475	80 %	0 %	20 %	0 %	499082841
67	NC_021216	GAATG	2	10	81439	81448	40 %	20 %	40 %	0 %	499082839
68	NC_021216	TGCCG	2	10	82658	82667	0 %	20 %	40 %	40 %	499082838
69	NC_021216	GTCGT	2	10	83902	83911	0 %	40 %	40 %	20 %	499082836
70	NC_021216	TCTCA	2	10	84258	84267	20 %	40 %	0 %	40 %	499082836
71	NC_021216	TATCC	2	10	84764	84773	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
72	NC_021216	TGGAT	2	10	85541	85550	20 %	40 %	40 %	0 %	499082835
73	NC_021216	GTGGC	2	10	85941	85950	0 %	20 %	60 %	20 %	499082835
74	NC_021216	GAATT	2	10	86791	86800	40 %	40 %	20 %	0 %	499082834
75	NC_021216	TATTG	2	10	87853	87862	20 %	60 %	20 %	0 %	499082834
76	NC_021216	TACTA	2	10	88100	88109	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
77	NC_021216	ACACC	2	10	88117	88126	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
78	NC_021216	AGAAC	2	10	90534	90543	60 %	0 %	20 %	20 %	499082833
79	NC_021216	AAAGA	2	10	91102	91111	80 %	0 %	20 %	0 %	499082833
80	NC_021216	GGGTG	2	10	92613	92622	0 %	20 %	80 %	0 %	499082830
81	NC_021216	GCGAT	2	10	93332	93341	20 %	20 %	40 %	20 %	499082829
82	NC_021216	AAAAT	2	10	95874	95883	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021216	TGGCG	2	10	100235	100244	0 %	20 %	60 %	20 %	499082823
84	NC_021216	TTAAA	2	10	100545	100554	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021216	TTGAA	2	10	101383	101392	40 %	40 %	20 %	0 %	499082822
86	NC_021216	TGTTT	2	10	101912	101921	0 %	80 %	20 %	0 %	499082822
87	NC_021216	GGAAT	2	10	102086	102095	40 %	20 %	40 %	0 %	499082822
88	NC_021216	TGGCT	2	10	105391	105400	0 %	40 %	40 %	20 %	499082817
89	NC_021216	TTAGA	2	10	105710	105719	40 %	40 %	20 %	0 %	499082816
90	NC_021216	TTGAT	2	10	106290	106299	20 %	60 %	20 %	0 %	499082816
91	NC_021216	AAAGA	2	10	107836	107845	80 %	0 %	20 %	0 %	499082815
92	NC_021216	AAAGC	2	10	112327	112336	60 %	0 %	20 %	20 %	499082809
93	NC_021216	GGAAA	2	10	112453	112462	60 %	0 %	40 %	0 %	499082809
94	NC_021216	AAATT	2	10	112816	112825	60 %	40 %	0 %	0 %	499082809
95	NC_021216	TTTTC	2	10	113167	113176	0 %	80 %	0 %	20 %	499082808
96	NC_021216	AACGC	2	10	114235	114244	40 %	0 %	20 %	40 %	499082807
97	NC_021216	CAATT	2	10	119450	119459	40 %	40 %	0 %	20 %	499082802
98	NC_021216	TTTTG	2	10	119560	119569	0 %	80 %	20 %	0 %	499082802
99	NC_021216	GAAAA	2	10	119945	119954	80 %	0 %	20 %	0 %	499082801
100	NC_021216	CAAAG	2	10	120787	120796	60 %	0 %	20 %	20 %	499082800
101	NC_021216	TAAAA	2	10	122931	122940	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_021216	GCTTT	2	10	128116	128125	0 %	60 %	20 %	20 %	499082794
103	NC_021216	CCTAA	2	10	128518	128527	40 %	20 %	0 %	40 %	499082793
104	NC_021216	TAGGC	2	10	128758	128767	20 %	20 %	40 %	20 %	499082793
105	NC_021216	CCATT	2	10	129388	129397	20 %	40 %	0 %	40 %	499082793
106	NC_021216	GCCGT	2	10	129898	129907	0 %	20 %	40 %	40 %	499082793
107	NC_021216	TCTCT	2	10	130498	130507	0 %	60 %	0 %	40 %	499082792
108	NC_021216	TTCAA	2	10	130971	130980	40 %	40 %	0 %	20 %	499082791
109	NC_021216	TTTAA	2	10	131363	131372	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021216	ATAAG	2	10	131675	131684	60 %	20 %	20 %	0 %	499082790
111	NC_021216	AAATA	2	10	131685	131694	80 %	20 %	0 %	0 %	499082790
112	NC_021216	GCTTG	2	10	132308	132317	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
113	NC_021216	AAATC	2	10	133517	133526	60 %	20 %	0 %	20 %	499082788
114	NC_021216	AAATC	2	10	134357	134366	60 %	20 %	0 %	20 %	499082787
115	NC_021216	ATACG	2	10	135117	135126	40 %	20 %	20 %	20 %	499082786
116	NC_021216	GCTTG	2	10	136101	136110	0 %	40 %	40 %	20 %	499082785
117	NC_021216	ATTAT	2	10	136146	136155	40 %	60 %	0 %	0 %	499082785
118	NC_021216	TATTT	2	10	136874	136883	20 %	80 %	0 %	0 %	499082784
119	NC_021216	GATTT	2	10	137385	137394	20 %	60 %	20 %	0 %	499082784
120	NC_021216	TCGTT	2	10	139707	139716	0 %	60 %	20 %	20 %	499082782
121	NC_021216	CCCCA	2	10	140910	140919	20 %	0 %	0 %	80 %	499082779
122	NC_021216	CTCAT	2	10	142339	142348	20 %	40 %	0 %	40 %	499082778
123	NC_021216	CCACC	2	10	144356	144365	20 %	0 %	0 %	80 %	499082775
124	NC_021216	CTTTT	2	10	144721	144730	0 %	80 %	0 %	20 %	499082774
125	NC_021216	TTAAA	2	10	147605	147614	60 %	40 %	0 %	0 %	499082771
126	NC_021216	TTTCT	2	10	147839	147848	0 %	80 %	0 %	20 %	499082770
127	NC_021216	TTTGA	2	10	147918	147927	20 %	60 %	20 %	0 %	499082770
128	NC_021216	CTTTT	2	10	148565	148574	0 %	80 %	0 %	20 %	499082770
129	NC_021216	ACCCC	2	10	148991	149000	20 %	0 %	0 %	80 %	499082770
130	NC_021216	GATGG	2	10	149035	149044	20 %	20 %	60 %	0 %	499082770
131	NC_021216	AAGTA	2	10	151641	151650	60 %	20 %	20 %	0 %	499082766
132	NC_021216	CATGA	2	10	157604	157613	40 %	20 %	20 %	20 %	529858360
133	NC_021216	AAAGG	2	10	157685	157694	60 %	0 %	40 %	0 %	529858360
134	NC_021216	AAAGC	2	10	158800	158809	60 %	0 %	20 %	20 %	529858360
135	NC_021216	TTTTG	2	10	159344	159353	0 %	80 %	20 %	0 %	499082759
136	NC_021216	TAAAT	2	10	161329	161338	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_021216	GGCGA	2	10	162183	162192	20 %	0 %	60 %	20 %	499082754
138	NC_021216	TGATT	2	10	162252	162261	20 %	60 %	20 %	0 %	499082754
139	NC_021216	CAACG	2	10	163450	163459	40 %	0 %	20 %	40 %	529858454
140	NC_021216	AATGA	2	10	164101	164110	60 %	20 %	20 %	0 %	499082752
141	NC_021216	GAGAG	2	10	164735	164744	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
142	NC_021216	GATTT	2	10	165537	165546	20 %	60 %	20 %	0 %	499082749
143	NC_021216	AAAGA	2	10	167498	167507	80 %	0 %	20 %	0 %	499082746
144	NC_021216	TTAGT	2	10	168117	168126	20 %	60 %	20 %	0 %	499082745
145	NC_021216	CAATT	2	10	174987	174996	40 %	40 %	0 %	20 %	499082740
146	NC_021216	TTTTG	2	10	175097	175106	0 %	80 %	20 %	0 %	499082740
147	NC_021216	CAATT	2	10	175671	175680	40 %	40 %	0 %	20 %	499082740
148	NC_021216	TTTTG	2	10	175781	175790	0 %	80 %	20 %	0 %	499082740
149	NC_021216	GAGAA	2	10	178462	178471	60 %	0 %	40 %	0 %	529858361
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151	NC_021216	TTTCA	2	10	182296	182305	20 %	60 %	0 %	20 %	499082735
152	NC_021216	ATAAA	2	10	182703	182712	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_021216	ATGAA	2	10	183205	183214	60 %	20 %	20 %	0 %	499082734
154	NC_021216	ATTAA	2	10	183924	183933	60 %	40 %	0 %	0 %	499082733
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156	NC_021216	TACCA	2	10	184721	184730	40 %	20 %	0 %	40 %	529858362
157	NC_021216	TCGTA	2	10	185755	185764	20 %	40 %	20 %	20 %	529858362
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159	NC_021216	GCATC	2	10	188362	188371	20 %	20 %	20 %	40 %	529858364
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161	NC_021216	AGGGT	2	10	191582	191591	20 %	20 %	60 %	0 %	499082727
162	NC_021216	TAAAA	2	10	191950	191959	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_021216	TTATT	2	10	198822	198831	20 %	80 %	0 %	0 %	499082721
164	NC_021216	TGGTA	2	10	199234	199243	20 %	40 %	40 %	0 %	499082720
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169	NC_021216	TGGGC	2	10	205985	205994	0 %	20 %	60 %	20 %	499082710
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172	NC_021216	TTTGA	2	10	212624	212633	20 %	60 %	20 %	0 %	499082701
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179	NC_021216	ACGCT	2	10	223847	223856	20 %	20 %	20 %	40 %	529858366
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183	NC_021216	CGATA	2	10	228192	228201	40 %	20 %	20 %	20 %	499082687
184	NC_021216	TTTGA	2	10	228352	228361	20 %	60 %	20 %	0 %	499082687
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192	NC_021216	GTTTG	2	10	239902	239911	0 %	60 %	40 %	0 %	529858369
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194	NC_021216	AAGCA	2	10	240708	240717	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
195	NC_021216	ATCAA	2	10	242040	242049	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
196	NC_021216	CCACG	2	10	242947	242956	20 %	0 %	20 %	60 %	499082671
197	NC_021216	ATAAG	2	10	243759	243768	60 %	20 %	20 %	0 %	499082671
198	NC_021216	TACTA	2	10	243903	243912	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
199	NC_021216	TAAAT	2	10	245746	245755	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
200	NC_021216	TGAAA	2	10	248674	248683	60 %	20 %	20 %	0 %	499082666
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202	NC_021216	TTGAT	2	10	253908	253917	20 %	60 %	20 %	0 %	499082659
203	NC_021216	AGAAA	2	10	255084	255093	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
204	NC_021216	AACAA	2	10	255421	255430	80 %	0 %	0 %	20 %	499082657
205	NC_021216	ATTAA	2	10	261254	261263	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
206	NC_021216	TGTTT	2	10	261549	261558	0 %	80 %	20 %	0 %	499082651
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212	NC_021216	GTTTT	2	10	268304	268313	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
213	NC_021216	TAATA	2	10	270332	270341	60 %	40 %	0 %	0 %	499082640
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234	NC_021216	ATCAA	2	10	295969	295978	60 %	20 %	0 %	20 %	499082620
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239	NC_021216	CTTTT	2	10	302034	302043	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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249	NC_021216	TTTGA	2	10	308876	308885	20 %	60 %	20 %	0 %	499082607
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259	NC_021216	TTGCA	2	10	315866	315875	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
260	NC_021216	AAATC	2	10	318205	318214	60 %	20 %	0 %	20 %	499082602
261	NC_021216	AAATA	2	10	319194	319203	80 %	20 %	0 %	0 %	499082601
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265	NC_021216	TAAAA	2	10	321912	321921	80 %	20 %	0 %	0 %	499082597
266	NC_021216	ATCTT	2	10	322727	322736	20 %	60 %	0 %	20 %	499082596
267	NC_021216	GCTTG	2	10	322770	322779	0 %	40 %	40 %	20 %	499082596
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269	NC_021216	TCGCA	2	10	324746	324755	20 %	20 %	20 %	40 %	499082595
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271	NC_021216	GTTTG	2	10	325645	325654	0 %	60 %	40 %	0 %	529858372
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393	NC_021216	TTGAA	2	10	490903	490912	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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396	NC_021216	AGCCT	2	10	496431	496440	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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401	NC_021216	TAAAA	2	10	503986	503995	80 %	20 %	0 %	0 %	499082429
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404	NC_021216	ATGAA	2	10	505005	505014	60 %	20 %	20 %	0 %	499082428
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