MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori UM299

Total Repeats: 186

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021216	TAAAG	2	10	36240	36249	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021216	TTAAT	2	10	37859	37868	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021216	TCTTG	2	10	42671	42680	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
4	NC_021216	ATAAA	2	10	48044	48053	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021216	AAAAT	2	10	48078	48087	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021216	TAACA	2	10	68404	68413	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_021216	AATAA	2	10	69793	69802	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021216	TTTGA	2	10	72278	72287	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021216	AAAAT	2	10	74498	74507	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021216	TATCC	2	10	84764	84773	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
11	NC_021216	TACTA	2	10	88100	88109	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_021216	ACACC	2	10	88117	88126	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
13	NC_021216	AAAAT	2	10	95874	95883	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021216	TTAAA	2	10	100545	100554	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021216	TAAAA	2	10	122931	122940	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021216	TTTAA	2	10	131363	131372	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021216	GCTTG	2	10	132308	132317	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
18	NC_021216	TAAAT	2	10	161329	161338	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021216	GAGAG	2	10	164735	164744	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021216	ATAAA	2	10	182703	182712	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021216	TAAAA	2	10	191950	191959	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021216	AAAGA	2	10	209042	209051	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021216	AAGCA	2	10	240708	240717	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
24	NC_021216	ATCAA	2	10	242040	242049	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_021216	TACTA	2	10	243903	243912	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_021216	TAAAT	2	10	245746	245755	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021216	AGAAA	2	10	255084	255093	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021216	ATTAA	2	10	261254	261263	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021216	GTTTT	2	10	268304	268313	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021216	GTTTT	2	10	291915	291924	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021216	TTAAT	2	10	295100	295109	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021216	AGAAC	2	10	302015	302024	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
33	NC_021216	CTTTT	2	10	302034	302043	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_021216	AAAGC	2	10	315411	315420	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
35	NC_021216	TTGCA	2	10	315866	315875	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
36	NC_021216	AAAAT	2	10	344920	344929	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021216	TTAAA	2	10	371282	371291	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021216	CCTTA	2	10	402272	402281	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
39	NC_021216	ATGAA	2	10	425450	425459	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021216	CTAAA	2	10	435224	435233	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_021216	TACAA	2	10	438028	438037	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_021216	TAAAA	2	10	442243	442252	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021216	TTTAA	2	10	442322	442331	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021216	ATTAA	2	10	443768	443777	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021216	GTTAG	2	10	459910	459919	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021216	AAAAC	2	10	460020	460029	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
47	NC_021216	TTAAA	2	10	464731	464740	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021216	TTTTA	2	10	490692	490701	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021216	ATTTT	2	10	490882	490891	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021216	TTGAA	2	10	490903	490912	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021216	AGCCT	2	10	496431	496440	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
52	NC_021216	AGTTA	2	10	505769	505778	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021216	AAACT	2	10	510099	510108	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_021216	CTAAA	2	10	514474	514483	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_021216	TATAA	2	10	516932	516941	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021216	ATAAA	2	10	531307	531316	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021216	TCGTA	2	10	533975	533984	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
58	NC_021216	ATGAT	2	10	545794	545803	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021216	TCAAG	2	10	569053	569062	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
60	NC_021216	ATCTC	2	10	603543	603552	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
61	NC_021216	ATTTT	2	10	609346	609355	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021216	TTAGT	2	10	617333	617342	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021216	TTCAA	2	10	629499	629508	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
64	NC_021216	CTCAT	2	10	629729	629738	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
65	NC_021216	TCACT	2	10	631208	631217	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
66	NC_021216	TACTT	2	10	631507	631516	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
67	NC_021216	AACGA	2	10	635712	635721	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
68	NC_021216	GTTTT	2	10	635959	635968	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021216	TCCAT	2	10	653798	653807	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
70	NC_021216	TGAAT	2	10	654736	654745	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021216	AATTG	2	10	675248	675257	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021216	ATAAA	2	10	679341	679350	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021216	TAAAA	2	10	690280	690289	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021216	CAAAA	2	10	697048	697057	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
75	NC_021216	AAATC	2	10	719975	719984	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
76	NC_021216	AAAAC	2	10	724809	724818	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
77	NC_021216	ATTAA	2	10	724838	724847	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021216	ATGAA	2	10	750286	750295	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021216	GATTT	2	10	753789	753798	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021216	AATTT	2	10	753825	753834	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021216	CAAAA	2	10	754469	754478	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
82	NC_021216	CACGA	2	10	755038	755047	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
83	NC_021216	TTACC	2	10	755836	755845	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
84	NC_021216	ACAAT	2	10	756303	756312	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
85	NC_021216	TTAAA	2	10	764305	764314	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021216	AAAAG	2	10	765895	765904	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021216	TAAAA	2	10	775111	775120	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021216	TTAAT	2	10	789987	789996	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021216	TATTT	2	10	790023	790032	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021216	TTGTG	2	10	790055	790064	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021216	GATAT	2	10	792885	792894	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021216	TACAT	2	10	794725	794734	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
93	NC_021216	AAATC	2	10	798161	798170	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
94	NC_021216	ACTTT	2	10	811198	811207	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
95	NC_021216	AAAAT	2	10	812063	812072	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_021216	AATCC	2	10	824632	824641	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
97	NC_021216	CCTCC	2	10	827430	827439	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
98	NC_021216	TAATA	2	10	829529	829538	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_021216	ATGAG	2	10	855884	855893	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021216	AACAA	2	10	855914	855923	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
101	NC_021216	TAAAT	2	10	867917	867926	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_021216	AATCA	2	10	875659	875668	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
103	NC_021216	TTTCA	2	10	875851	875860	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
104	NC_021216	GGCTG	2	10	875911	875920	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
105	NC_021216	AATTG	2	10	876507	876516	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
106	NC_021216	AAACT	2	10	876829	876838	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
107	NC_021216	AAATC	2	10	876998	877007	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
108	NC_021216	AAACA	2	10	877186	877195	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
109	NC_021216	TAAGC	2	10	899941	899950	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
110	NC_021216	TTATT	2	10	912710	912719	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_021216	AAAAC	2	10	912811	912820	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
112	NC_021216	CCTTT	2	10	919058	919067	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
113	NC_021216	TATAT	2	10	925797	925806	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021216	AATAA	2	10	926799	926808	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021216	TATTT	2	10	928178	928187	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_021216	CAAAA	2	10	941151	941160	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
117	NC_021216	ACAAA	2	10	946355	946364	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
118	NC_021216	TAAAA	2	10	951061	951070	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021216	TGTGA	2	10	973359	973368	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
120	NC_021216	ATTAA	2	10	973555	973564	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_021216	TTCAA	2	10	978027	978036	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
122	NC_021216	CTCAT	2	10	978257	978266	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
123	NC_021216	TCACT	2	10	979736	979745	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
124	NC_021216	TACTT	2	10	980035	980044	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
125	NC_021216	ATTTA	2	10	984496	984505	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_021216	TTTTA	2	10	996311	996320	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_021216	CACGA	2	10	1010819	1010828	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
128	NC_021216	TTACC	2	10	1011617	1011626	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
129	NC_021216	ACAAT	2	10	1012084	1012093	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
130	NC_021216	ATAAA	2	10	1063780	1063789	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_021216	TTATT	2	10	1068819	1068828	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_021216	TAATA	2	10	1081836	1081845	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_021216	AGTTT	2	10	1088813	1088822	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
134	NC_021216	GATAA	2	10	1102076	1102085	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
135	NC_021216	GCTTG	2	10	1103957	1103966	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
136	NC_021216	TATAA	2	10	1114571	1114580	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_021216	AGAAA	2	10	1117273	1117282	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
138	NC_021216	ATATT	2	10	1132115	1132124	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_021216	TTTTG	2	10	1133681	1133690	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
140	NC_021216	AATCA	2	10	1135737	1135746	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
141	NC_021216	ACATC	2	10	1176733	1176742	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
142	NC_021216	TTTTG	2	10	1182464	1182473	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
143	NC_021216	ATAAA	2	10	1182559	1182568	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_021216	ATTTA	2	10	1185827	1185836	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_021216	TAAAA	3	15	1187228	1187242	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_021216	TTAAA	2	10	1187657	1187666	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_021216	TTTGT	2	10	1191160	1191169	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.