MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori UM299

Total Repeats: 522

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021216	TGGC	2	8	259	266	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2	NC_021216	GTTC	2	8	476	483	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_021216	TTTC	2	8	1525	1532	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_021216	CGCA	2	8	1659	1666	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5	NC_021216	CATT	2	8	1688	1695	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_021216	GTTT	2	8	2052	2059	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021216	TTTC	2	8	6384	6391	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_021216	GGGT	2	8	8275	8282	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021216	AACA	2	8	8345	8352	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_021216	TTGA	2	8	19055	19062	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021216	GGGA	2	8	21170	21177	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021216	CCAA	2	8	22535	22542	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_021216	AAGG	2	8	36250	36257	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021216	TCAA	2	8	40398	40405	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_021216	CAAT	2	8	41777	41784	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_021216	CAAT	2	8	42633	42640	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_021216	TCGC	2	8	42826	42833	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
18	NC_021216	CACC	2	8	55635	55642	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
19	NC_021216	TATC	2	8	69803	69810	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_021216	AAAT	2	8	71139	71146	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021216	ACTC	2	8	71250	71257	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_021216	TTGA	2	8	71356	71363	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021216	TCAA	2	8	72988	72995	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_021216	AGCG	2	8	88206	88213	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
25	NC_021216	AGCC	2	8	88262	88269	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
26	NC_021216	ATAA	2	8	91681	91688	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021216	ATAA	2	8	92891	92898	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021216	TCTT	2	8	95895	95902	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_021216	CATT	2	8	97698	97705	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_021216	CAAT	2	8	100479	100486	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_021216	AAAG	2	8	112883	112890	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021216	TAAA	2	8	114086	114093	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021216	CATG	2	8	116142	116149	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_021216	TGAT	2	8	116550	116557	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021216	AAAG	2	8	116740	116747	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021216	CTTT	2	8	116771	116778	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_021216	ACCA	2	8	117609	117616	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_021216	GCTT	2	8	131620	131627	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_021216	ACTT	2	8	139165	139172	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_021216	TTTA	2	8	140509	140516	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021216	AATG	2	8	141588	141595	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021216	TTTA	2	8	149375	149382	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021216	GAAG	2	8	154280	154287	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021216	ATTT	2	8	154410	154417	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021216	AGAA	2	8	154433	154440	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021216	ATAA	2	8	156419	156426	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021216	ATTA	2	8	156547	156554	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021216	ATTT	2	8	160562	160569	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021216	AAAG	2	8	165018	165025	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021216	GTTG	2	8	166149	166156	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021216	TCGT	2	8	178679	178686	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_021216	GTCA	2	8	178741	178748	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_021216	ATTT	2	8	182658	182665	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021216	CCAA	2	8	183692	183699	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_021216	AAGG	2	8	183805	183812	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021216	CAAC	2	8	187307	187314	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_021216	TTGA	2	8	199082	199089	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021216	TTGA	2	8	199096	199103	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021216	TAAA	2	8	200874	200881	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021216	CATG	2	8	201344	201351	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_021216	GTTT	2	8	201799	201806	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021216	CAAT	2	8	202932	202939	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_021216	TGCT	2	8	203036	203043	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_021216	ATTG	2	8	210503	210510	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021216	AAGA	2	8	221841	221848	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021216	ACAA	2	8	222037	222044	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_021216	GATA	2	8	222098	222105	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021216	ATGA	2	8	222222	222229	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021216	GCTT	2	8	222331	222338	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
70	NC_021216	ATTC	2	8	222341	222348	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_021216	GCAT	2	8	222778	222785	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
72	NC_021216	CAAG	2	8	222818	222825	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
73	NC_021216	ACCC	2	8	222935	222942	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
74	NC_021216	CGGG	2	8	223244	223251	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
75	NC_021216	GGAG	2	8	223561	223568	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021216	TGCT	2	8	223613	223620	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_021216	TCTA	2	8	228567	228574	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_021216	TCAA	2	8	238350	238357	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_021216	ATAA	2	8	240383	240390	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021216	CAAA	2	8	241386	241393	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_021216	AGCA	2	8	241843	241850	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_021216	AAGA	2	8	242132	242139	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021216	AAGA	2	8	242313	242320	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021216	ATTT	2	8	243884	243891	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021216	TTTG	2	8	243980	243987	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021216	TTTG	2	8	246395	246402	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021216	CAAT	2	8	247146	247153	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_021216	GTTG	2	8	252558	252565	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021216	ATTG	2	8	254172	254179	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021216	CCAA	2	8	260099	260106	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_021216	TTGT	2	8	260215	260222	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021216	AAAG	2	8	260341	260348	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021216	AGCG	2	8	260437	260444	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
94	NC_021216	CAAC	2	8	260885	260892	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_021216	AGCG	2	8	261116	261123	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
96	NC_021216	AAAG	2	8	261268	261275	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021216	TTTA	2	8	268265	268272	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021216	AACT	2	8	268415	268422	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_021216	CAAA	2	8	268540	268547	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_021216	TGTT	2	8	268602	268609	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_021216	ACCC	2	8	268647	268654	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
102	NC_021216	TGGC	2	8	268677	268684	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
103	NC_021216	TTGT	2	8	268879	268886	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_021216	ATTA	2	8	268976	268983	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021216	TTGT	3	12	270047	270058	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_021216	AAAT	2	8	270117	270124	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021216	GTTT	2	8	275496	275503	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_021216	GAAA	2	8	275506	275513	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021216	AGGT	2	8	275555	275562	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021216	ATTC	2	8	286765	286772	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
111	NC_021216	ACTA	2	8	308806	308813	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_021216	CAAT	2	8	315650	315657	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NC_021216	GTTG	2	8	316047	316054	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021216	ATCC	2	8	343978	343985	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_021216	CGCA	2	8	345654	345661	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
116	NC_021216	AGCG	2	8	348106	348113	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
117	NC_021216	TTGA	2	8	365957	365964	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_021216	TCTT	2	8	374810	374817	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_021216	TATC	2	8	374900	374907	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_021216	TAAA	2	8	374959	374966	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_021216	TTTG	2	8	375373	375380	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_021216	TAAA	2	8	375393	375400	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_021216	TACC	2	8	375555	375562	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_021216	ATTT	2	8	375772	375779	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_021216	AAGA	2	8	393763	393770	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_021216	TTTA	2	8	402064	402071	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_021216	ATAA	2	8	404131	404138	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_021216	ATTT	2	8	434742	434749	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_021216	TTTG	2	8	437966	437973	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_021216	TGAA	2	8	438007	438014	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_021216	GAAA	2	8	438066	438073	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_021216	CAAT	2	8	438557	438564	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
133	NC_021216	TTAA	2	8	442413	442420	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_021216	TTAG	2	8	444974	444981	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_021216	CAAA	2	8	449075	449082	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
136	NC_021216	GTAA	2	8	459663	459670	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_021216	CTTG	2	8	459699	459706	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
138	NC_021216	TTTG	2	8	459818	459825	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_021216	AAAC	2	8	459830	459837	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
140	NC_021216	AGAT	2	8	460753	460760	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_021216	CAAA	2	8	461465	461472	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_021216	TTTA	2	8	461997	462004	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_021216	TAAC	2	8	462914	462921	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_021216	TACC	2	8	462993	463000	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_021216	CAAC	2	8	464829	464836	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
146	NC_021216	AAGG	2	8	478553	478560	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_021216	TTGT	2	8	478699	478706	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_021216	GCAT	2	8	488715	488722	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
149	NC_021216	ATCA	2	8	488783	488790	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
150	NC_021216	AATC	2	8	496536	496543	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
151	NC_021216	TAAG	2	8	505812	505819	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
152	NC_021216	ATTT	2	8	510186	510193	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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