MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori UM299

Total Repeats: 272

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021216	GT	3	6	1811	1816	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021216	GA	4	8	2767	2774	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021216	GA	3	6	19042	19047	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021216	CT	3	6	21112	21117	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_021216	AT	3	6	42750	42755	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021216	TA	3	6	55559	55564	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021216	GC	3	6	55651	55656	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_021216	AT	4	8	69813	69820	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021216	CT	3	6	71381	71386	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_021216	AT	3	6	72070	72075	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021216	CT	3	6	72623	72628	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_021216	CT	3	6	72892	72897	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_021216	AG	3	6	73079	73084	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021216	TA	3	6	88355	88360	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021216	CA	3	6	117527	117532	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_021216	GT	3	6	140178	140183	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021216	AT	3	6	142914	142919	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021216	TG	3	6	154177	154182	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021216	GA	3	6	154190	154195	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021216	GA	3	6	161520	161525	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021216	AC	3	6	167000	167005	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_021216	GA	3	6	169334	169339	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021216	GA	3	6	172001	172006	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021216	CT	3	6	187661	187666	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_021216	TC	3	6	201163	201168	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_021216	CG	3	6	202917	202922	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_021216	AG	3	6	221771	221776	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021216	TC	3	6	222489	222494	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_021216	TA	3	6	223384	223389	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021216	CT	3	6	242475	242480	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_021216	CT	3	6	245001	245006	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_021216	TA	3	6	245177	245182	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021216	AG	3	6	260185	260190	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021216	GC	3	6	260237	260242	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_021216	AG	3	6	260311	260316	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021216	AC	3	6	260538	260543	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_021216	AG	3	6	260545	260550	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021216	AG	3	6	260711	260716	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021216	TA	3	6	268622	268627	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021216	CT	3	6	270168	270173	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_021216	GT	3	6	286739	286744	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021216	TA	3	6	292999	293004	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021216	GA	3	6	301470	301475	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021216	GA	3	6	310139	310144	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021216	GC	3	6	315372	315377	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
46	NC_021216	AT	3	6	315881	315886	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021216	CA	3	6	321414	321419	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_021216	TA	3	6	331679	331684	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021216	TC	4	8	331806	331813	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_021216	AG	3	6	345158	345163	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021216	CA	3	6	345299	345304	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_021216	CG	3	6	345423	345428	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53	NC_021216	CT	4	8	360641	360648	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_021216	TG	3	6	385495	385500	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021216	AT	3	6	402408	402413	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021216	GA	3	6	404162	404167	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021216	TA	3	6	429050	429055	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021216	CT	3	6	431952	431957	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_021216	AG	3	6	432002	432007	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021216	GT	3	6	432117	432122	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021216	TA	3	6	433547	433552	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021216	TC	4	8	437956	437963	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_021216	CT	3	6	438517	438522	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_021216	AG	3	6	444645	444650	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021216	AC	3	6	449114	449119	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_021216	AG	3	6	450185	450190	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021216	TC	3	6	460243	460248	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_021216	AC	3	6	460592	460597	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_021216	AG	3	6	460631	460636	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021216	TC	3	6	460943	460948	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_021216	CA	3	6	462194	462199	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_021216	CT	3	6	463045	463050	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_021216	CT	3	6	463068	463073	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_021216	TC	4	8	464643	464650	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_021216	TG	3	6	478416	478421	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021216	AT	3	6	478617	478622	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021216	AG	3	6	490456	490461	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021216	CT	3	6	526723	526728	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_021216	AT	3	6	526782	526787	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021216	AT	3	6	551983	551988	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021216	GC	3	6	554649	554654	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
82	NC_021216	AG	3	6	558383	558388	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021216	AC	3	6	576524	576529	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_021216	GC	3	6	580038	580043	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
85	NC_021216	AG	3	6	588729	588734	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021216	AT	3	6	588892	588897	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021216	CT	3	6	589137	589142	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_021216	CT	3	6	591888	591893	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_021216	CT	3	6	602182	602187	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_021216	TA	3	6	603593	603598	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021216	GA	3	6	608261	608266	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021216	CT	3	6	608380	608385	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_021216	TG	3	6	608887	608892	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021216	AG	9	18	609022	609039	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021216	CT	3	6	621624	621629	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_021216	TG	3	6	626118	626123	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021216	CT	3	6	628434	628439	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_021216	GT	3	6	628659	628664	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_021216	CA	3	6	628980	628985	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_021216	AT	3	6	630089	630094	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_021216	CA	3	6	630329	630334	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_021216	AT	3	6	630541	630546	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_021216	CT	3	6	631225	631230	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_021216	CT	3	6	631345	631350	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_021216	GA	3	6	632415	632420	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_021216	GT	3	6	635745	635750	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021216	CT	3	6	653421	653426	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_021216	GA	3	6	653498	653503	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021216	CT	3	6	653635	653640	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_021216	CT	3	6	654540	654545	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_021216	TC	3	6	655145	655150	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_021216	AT	3	6	655502	655507	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021216	CA	3	6	696777	696782	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_021216	TG	3	6	696873	696878	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021216	CA	3	6	697215	697220	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_021216	AT	3	6	705077	705082	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_021216	AT	3	6	711047	711052	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_021216	GT	3	6	714089	714094	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021216	TC	3	6	723367	723372	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_021216	TG	3	6	723397	723402	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_021216	GA	3	6	729823	729828	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_021216	AG	3	6	735161	735166	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_021216	AT	3	6	750191	750196	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_021216	GA	3	6	751611	751616	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_021216	AT	3	6	752446	752451	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_021216	TG	4	8	754644	754651	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_021216	GT	3	6	754887	754892	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_021216	TC	3	6	755118	755123	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_021216	GA	3	6	755272	755277	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_021216	GT	3	6	755783	755788	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_021216	TA	4	8	756295	756302	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_021216	GT	3	6	771714	771719	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_021216	AG	3	6	779272	779277	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_021216	TA	3	6	780946	780951	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_021216	AT	3	6	786475	786480	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_021216	AG	3	6	790159	790164	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_021216	TA	3	6	794778	794783	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_021216	CT	3	6	807611	807616	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_021216	AG	3	6	812270	812275	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_021216	TA	3	6	829051	829056	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_021216	AT	3	6	834350	834355	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_021216	TA	3	6	836683	836688	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_021216	CA	3	6	843726	843731	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
144	NC_021216	GA	4	8	848587	848594	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_021216	AC	3	6	850874	850879	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
146	NC_021216	TC	3	6	860234	860239	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_021216	TC	3	6	861340	861345	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
148	NC_021216	GA	3	6	861493	861498	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
149	NC_021216	GA	7	14	867871	867884	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
150	NC_021216	AG	3	6	876797	876802	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
151	NC_021216	TG	3	6	907231	907236	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
152	NC_021216	GA	3	6	912467	912472	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
153	NC_021216	TA	3	6	928055	928060	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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155	NC_021216	TA	3	6	928071	928076	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.