MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Helicobacter pylori UM032

Total Repeats: 1294

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021215	GGGCT	2	10	2193	2202	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
2	NC_021215	TTTGG	2	10	3181	3190	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021215	TTTGG	2	10	4271	4280	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021215	AGAGA	2	10	4944	4953	60 %	0 %	40 %	0 %	529973390
5	NC_021215	GGGTC	2	10	5297	5306	0 %	20 %	60 %	20 %	499081265
6	NC_021215	ATCCA	2	10	7102	7111	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
7	NC_021215	GAATG	2	10	7465	7474	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021215	CTTGA	2	10	11178	11187	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
9	NC_021215	AAGAA	2	10	11907	11916	80 %	0 %	20 %	0 %	529973490
10	NC_021215	TGGCG	2	10	16547	16556	0 %	20 %	60 %	20 %	499081256
11	NC_021215	GAAAA	2	10	17638	17647	80 %	0 %	20 %	0 %	499081255
12	NC_021215	TTTTA	2	10	19624	19633	20 %	80 %	0 %	0 %	499081253
13	NC_021215	TGATT	2	10	22370	22379	20 %	60 %	20 %	0 %	529973391
14	NC_021215	AAAAG	2	10	23616	23625	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021215	TGGGG	2	10	23691	23700	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021215	TCAAA	2	10	24435	24444	60 %	20 %	0 %	20 %	499081248
17	NC_021215	CTTTT	2	10	25750	25759	0 %	80 %	0 %	20 %	499081247
18	NC_021215	CCTTG	2	10	28425	28434	0 %	40 %	20 %	40 %	499081245
19	NC_021215	TTTTG	2	10	30505	30514	0 %	80 %	20 %	0 %	499081242
20	NC_021215	CTTTT	2	10	30681	30690	0 %	80 %	0 %	20 %	499081241
21	NC_021215	ACATC	2	10	33769	33778	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
22	NC_021215	AGCGT	2	10	34883	34892	20 %	20 %	40 %	20 %	499081236
23	NC_021215	AAGAT	2	10	35950	35959	60 %	20 %	20 %	0 %	499081234
24	NC_021215	TGTTT	2	10	37645	37654	0 %	80 %	20 %	0 %	499081232
25	NC_021215	GTGAA	2	10	37970	37979	40 %	20 %	40 %	0 %	499081231
26	NC_021215	TAAAA	2	10	38601	38610	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021215	TTTTG	2	10	39503	39512	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021215	ATAAA	2	10	39598	39607	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021215	TCAAG	2	10	40050	40059	40 %	20 %	20 %	20 %	499081228
30	NC_021215	ATTTA	2	10	42866	42875	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021215	AAGGC	2	10	43950	43959	40 %	0 %	40 %	20 %	499081225
32	NC_021215	TAAAA	3	15	44267	44281	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021215	TTAAA	2	10	44696	44705	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021215	TAAAA	2	10	47376	47385	80 %	20 %	0 %	0 %	499081219
35	NC_021215	TTTGT	2	10	48199	48208	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021215	AATTA	2	10	48699	48708	60 %	40 %	0 %	0 %	499081217
37	NC_021215	TTTTA	2	10	50702	50711	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021215	GTTGA	2	10	51676	51685	20 %	40 %	40 %	0 %	499081215
39	NC_021215	TTTGA	2	10	52054	52063	20 %	60 %	20 %	0 %	499081215
40	NC_021215	TTGCT	2	10	52172	52181	0 %	60 %	20 %	20 %	499081215
41	NC_021215	TTTCT	2	10	54225	54234	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_021215	TTGAA	2	10	57729	57738	40 %	40 %	20 %	0 %	499081212
43	NC_021215	TTTTG	2	10	57745	57754	0 %	80 %	20 %	0 %	499081212
44	NC_021215	TGGTG	2	10	58793	58802	0 %	40 %	60 %	0 %	499081210
45	NC_021215	GCTTT	2	10	59620	59629	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
46	NC_021215	CAAAA	2	10	64672	64681	80 %	0 %	0 %	20 %	499081205
47	NC_021215	CATCA	2	10	66048	66057	40 %	20 %	0 %	40 %	499081204
48	NC_021215	TGAAA	2	10	67016	67025	60 %	20 %	20 %	0 %	499081203
49	NC_021215	GCATG	2	10	68924	68933	20 %	20 %	40 %	20 %	499081201
50	NC_021215	CCATG	2	10	69248	69257	20 %	20 %	20 %	40 %	499081200
51	NC_021215	CTCTT	2	10	69278	69287	0 %	60 %	0 %	40 %	499081200
52	NC_021215	ATTTT	2	10	73578	73587	20 %	80 %	0 %	0 %	499081197
53	NC_021215	ATTTG	2	10	75695	75704	20 %	60 %	20 %	0 %	499081196
54	NC_021215	TTTTA	2	10	78409	78418	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021215	GGCGT	2	10	78431	78440	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
56	NC_021215	GATTT	2	10	79608	79617	20 %	60 %	20 %	0 %	499081191
57	NC_021215	AGGGC	2	10	79958	79967	20 %	0 %	60 %	20 %	499081190
58	NC_021215	ATTGA	2	10	80622	80631	40 %	40 %	20 %	0 %	499081190
59	NC_021215	TGGTG	2	10	80744	80753	0 %	40 %	60 %	0 %	499081190
60	NC_021215	TTTTA	2	10	80928	80937	20 %	80 %	0 %	0 %	499081189
61	NC_021215	GCGCT	2	10	81380	81389	0 %	20 %	40 %	40 %	499081189
62	NC_021215	ATTTT	2	10	81863	81872	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021215	TAAAA	2	10	82604	82613	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021215	AAAAT	2	10	83039	83048	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021215	ATTTA	2	10	85536	85545	40 %	60 %	0 %	0 %	529973494
66	NC_021215	GTCTT	2	10	88377	88386	0 %	60 %	20 %	20 %	529973393
67	NC_021215	ATTTC	2	10	88630	88639	20 %	60 %	0 %	20 %	529973393
68	NC_021215	AAGAT	2	10	88756	88765	60 %	20 %	20 %	0 %	529973393
69	NC_021215	TTTAA	2	10	89000	89009	40 %	60 %	0 %	0 %	499081182
70	NC_021215	TGGCT	2	10	90683	90692	0 %	40 %	40 %	20 %	499081181
71	NC_021215	TTTAG	2	10	91038	91047	20 %	60 %	20 %	0 %	499081181
72	NC_021215	TTTTC	2	10	92383	92392	0 %	80 %	0 %	20 %	499081180
73	NC_021215	TTTGT	2	10	93835	93844	0 %	80 %	20 %	0 %	529973394
74	NC_021215	GAAAG	2	10	94498	94507	60 %	0 %	40 %	0 %	499081177
75	NC_021215	AACGA	2	10	96700	96709	60 %	0 %	20 %	20 %	499081174
76	NC_021215	AATTG	2	10	98111	98120	40 %	40 %	20 %	0 %	529973496
77	NC_021215	GCCAA	2	10	101040	101049	40 %	0 %	20 %	40 %	529973497
78	NC_021215	TGCCT	2	10	101144	101153	0 %	40 %	20 %	40 %	529973497
79	NC_021215	GCAAG	2	10	101959	101968	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
80	NC_021215	AAAAC	2	10	102611	102620	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
81	NC_021215	AAATG	2	10	106181	106190	60 %	20 %	20 %	0 %	529973395
82	NC_021215	GCTTG	2	10	106996	107005	0 %	40 %	40 %	20 %	499081163
83	NC_021215	AATTC	2	10	108053	108062	40 %	40 %	0 %	20 %	499081162
84	NC_021215	AAAAT	2	10	110756	110765	80 %	20 %	0 %	0 %	499081160
85	NC_021215	TCTTT	2	10	111383	111392	0 %	80 %	0 %	20 %	499081159
86	NC_021215	AGAAA	2	10	111663	111672	80 %	0 %	20 %	0 %	499081159
87	NC_021215	AGGCT	2	10	112169	112178	20 %	20 %	40 %	20 %	499081157
88	NC_021215	TGCCT	2	10	112544	112553	0 %	40 %	20 %	40 %	499081157
89	NC_021215	TGAAA	2	10	113943	113952	60 %	20 %	20 %	0 %	499081155
90	NC_021215	TCAAA	2	10	114197	114206	60 %	20 %	0 %	20 %	499081155
91	NC_021215	TCGCC	2	10	116940	116949	0 %	20 %	20 %	60 %	499081154
92	NC_021215	TCAAA	2	10	117952	117961	60 %	20 %	0 %	20 %	499081154
93	NC_021215	TTAAA	2	10	118975	118984	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021215	ACAAA	2	10	119003	119012	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
95	NC_021215	TATCC	2	10	121886	121895	20 %	40 %	0 %	40 %	499081150
96	NC_021215	GTCAT	2	10	123346	123355	20 %	40 %	20 %	20 %	529973499
97	NC_021215	TCTAC	2	10	124544	124553	20 %	40 %	0 %	40 %	499081147
98	NC_021215	CAATA	2	10	124684	124693	60 %	20 %	0 %	20 %	499081147
99	NC_021215	GGTGG	2	10	126181	126190	0 %	20 %	80 %	0 %	529973502
100	NC_021215	GCGTT	2	10	128498	128507	0 %	40 %	40 %	20 %	499081142
101	NC_021215	TCAAT	2	10	129352	129361	40 %	40 %	0 %	20 %	529973504
102	NC_021215	CTTCT	2	10	130195	130204	0 %	60 %	0 %	40 %	499081140
103	NC_021215	TCCAA	2	10	130684	130693	40 %	20 %	0 %	40 %	499081139
104	NC_021215	TTTTG	2	10	133992	134001	0 %	80 %	20 %	0 %	499081135
105	NC_021215	ACGCC	2	10	134298	134307	20 %	0 %	20 %	60 %	499081135
106	NC_021215	AAAGC	2	10	135064	135073	60 %	0 %	20 %	20 %	499081134
107	NC_021215	TTACA	2	10	135847	135856	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
108	NC_021215	CAAGC	2	10	138837	138846	40 %	0 %	20 %	40 %	499081128
109	NC_021215	ATCTT	2	10	142818	142827	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
110	NC_021215	TGGCT	2	10	143361	143370	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
111	NC_021215	ATGCC	2	10	143785	143794	20 %	20 %	20 %	40 %	499081124
112	NC_021215	TTGAT	2	10	144718	144727	20 %	60 %	20 %	0 %	499081122
113	NC_021215	GGCGT	2	10	146532	146541	0 %	20 %	60 %	20 %	499081120
114	NC_021215	ATTTT	2	10	149597	149606	20 %	80 %	0 %	0 %	499081119
115	NC_021215	TAAAA	2	10	149794	149803	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_021215	AAAAG	2	10	149895	149904	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_021215	AATGA	2	10	150922	150931	60 %	20 %	20 %	0 %	499081118
118	NC_021215	TTAAG	2	10	154772	154781	40 %	40 %	20 %	0 %	499081114
119	NC_021215	TCTTT	2	10	158869	158878	0 %	80 %	0 %	20 %	499081110
120	NC_021215	TTTTC	2	10	159374	159383	0 %	80 %	0 %	20 %	499081108
121	NC_021215	TTTTC	2	10	159692	159701	0 %	80 %	0 %	20 %	499081108
122	NC_021215	ACGCA	2	10	159853	159862	40 %	0 %	20 %	40 %	499081108
123	NC_021215	ACAAA	2	10	161886	161895	80 %	0 %	0 %	20 %	529973396
124	NC_021215	AAGCG	2	10	162239	162248	40 %	0 %	40 %	20 %	529973397
125	NC_021215	AAGTC	2	10	163148	163157	40 %	20 %	20 %	20 %	529973397
126	NC_021215	AAATC	2	10	163679	163688	60 %	20 %	0 %	20 %	529973397
127	NC_021215	CAGCG	2	10	163829	163838	20 %	0 %	40 %	40 %	529973397
128	NC_021215	GATTG	2	10	164619	164628	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
129	NC_021215	GAAAA	2	10	164758	164767	80 %	0 %	20 %	0 %	499081103
130	NC_021215	GGCTT	2	10	166858	166867	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
131	NC_021215	GAGCT	2	10	168746	168755	20 %	20 %	40 %	20 %	499081101
132	NC_021215	CGATC	2	10	168765	168774	20 %	20 %	20 %	40 %	499081101
133	NC_021215	TTTAG	2	10	172792	172801	20 %	60 %	20 %	0 %	499081099
134	NC_021215	ATTAA	2	10	173898	173907	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_021215	AGGGT	2	10	175416	175425	20 %	20 %	60 %	0 %	499081095
136	NC_021215	ATTTG	2	10	176845	176854	20 %	60 %	20 %	0 %	499081094
137	NC_021215	AAGAC	2	10	177237	177246	60 %	0 %	20 %	20 %	499081094
138	NC_021215	GCTTT	2	10	178710	178719	0 %	60 %	20 %	20 %	499081092
139	NC_021215	AAAAG	2	10	181470	181479	80 %	0 %	20 %	0 %	499081090
140	NC_021215	TTTTG	2	10	182187	182196	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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152	NC_021215	CGCTG	2	10	203440	203449	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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174	NC_021215	ATTTT	2	10	229964	229973	20 %	80 %	0 %	0 %	499081039
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402	NC_021215	TAACA	2	10	520096	520105	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
403	NC_021215	TAAAA	2	10	520218	520227	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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406	NC_021215	TAAAA	2	10	521581	521590	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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