MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Helicobacter pylori UM032

Total Repeats: 12640

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021215	CTT	2	6	111	116	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529973486
2	NC_021215	GAA	2	6	236	241	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529973486
3	NC_021215	TTA	2	6	269	274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529973486
4	NC_021215	GGT	2	6	293	298	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529973487
5	NC_021215	AGA	2	6	329	334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529973487
6	NC_021215	GAA	2	6	351	356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529973487
7	NC_021215	TAT	2	6	366	371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529973487
8	NC_021215	AGA	2	6	459	464	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529973487
9	NC_021215	TCT	2	6	487	492	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529973487
10	NC_021215	AGA	3	9	560	568	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529973487
11	NC_021215	CAT	2	6	698	703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529973488
12	NC_021215	AGA	2	6	734	739	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529973488
13	NC_021215	CAA	2	6	913	918	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	529973489
14	NC_021215	ACG	2	6	2452	2457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499081269
15	NC_021215	GTT	2	6	2475	2480	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	499081269
16	NC_021215	CAA	2	6	2521	2526	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	499081269
17	NC_021215	ACC	2	6	2650	2655	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499081269
18	NC_021215	GAA	2	6	2695	2700	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499081269
19	NC_021215	GTG	2	6	2701	2706	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499081269
20	NC_021215	AAC	2	6	2713	2718	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	499081269
21	NC_021215	ATT	2	6	4313	4318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529973390
22	NC_021215	AAG	2	6	4492	4497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529973390
23	NC_021215	AAG	2	6	4516	4521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529973390
24	NC_021215	AGA	2	6	4562	4567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529973390
25	NC_021215	GCG	2	6	4648	4653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529973390
26	NC_021215	ATG	2	6	4816	4821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529973390
27	NC_021215	ATT	2	6	4926	4931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529973390
28	NC_021215	CTT	2	6	5032	5037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529973390
29	NC_021215	GTG	2	6	5052	5057	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529973390
30	NC_021215	ATT	2	6	5088	5093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529973390
31	NC_021215	TTG	2	6	5172	5177	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529973390
32	NC_021215	ACC	2	6	5337	5342	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499081265
33	NC_021215	GGT	2	6	5372	5377	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499081265
34	NC_021215	GTT	2	6	5378	5383	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	499081265
35	NC_021215	AAT	2	6	5520	5525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	499081265
36	NC_021215	TGC	2	6	8080	8085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499081263
37	NC_021215	CGC	2	6	8117	8122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499081263
38	NC_021215	TGA	2	6	8212	8217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499081263
39	NC_021215	ATT	2	6	8280	8285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	499081263
40	NC_021215	AAG	2	6	8329	8334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499081263
41	NC_021215	ATA	2	6	8383	8388	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	499081263
42	NC_021215	TAT	2	6	8424	8429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	499081263
43	NC_021215	AAT	2	6	8553	8558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	499081263
44	NC_021215	GCA	2	6	8723	8728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499081262
45	NC_021215	TTA	2	6	8749	8754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	499081262
46	NC_021215	TTG	2	6	8837	8842	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	499081262
47	NC_021215	CAG	2	6	8892	8897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499081262
48	NC_021215	ATT	2	6	8957	8962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	499081262
49	NC_021215	ATC	2	6	9124	9129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499081262
50	NC_021215	CAA	2	6	9136	9141	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	499081262
51	NC_021215	CCA	2	6	9246	9251	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499081262
52	NC_021215	AAG	2	6	9326	9331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499081262
53	NC_021215	AGA	2	6	9438	9443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499081262
54	NC_021215	GAA	2	6	9568	9573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499081262
55	NC_021215	ATT	2	6	9662	9667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	499081262
56	NC_021215	TAG	2	6	9686	9691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499081262
57	NC_021215	AGA	2	6	9719	9724	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499081262
58	NC_021215	CAT	2	6	9758	9763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499081261
59	NC_021215	TGA	2	6	9764	9769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499081261
60	NC_021215	TCA	2	6	9817	9822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499081261
61	NC_021215	GTT	2	6	9828	9833	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	499081261
62	NC_021215	ATG	2	6	10078	10083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499081261
63	NC_021215	ACC	2	6	10195	10200	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499081261
64	NC_021215	AGA	2	6	10556	10561	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499081261
65	NC_021215	GAA	2	6	10580	10585	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499081261
66	NC_021215	AGA	2	6	10601	10606	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499081261
67	NC_021215	GTG	2	6	11657	11662	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529973490
68	NC_021215	GGT	2	6	11677	11682	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529973490
69	NC_021215	TAA	2	6	11722	11727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529973490
70	NC_021215	TGG	2	6	11829	11834	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529973490
71	NC_021215	GTT	2	6	11890	11895	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529973490
72	NC_021215	TAG	2	6	15138	15143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499081257
73	NC_021215	GTT	2	6	15176	15181	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	499081257
74	NC_021215	AAG	2	6	15219	15224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499081257
75	NC_021215	GAA	2	6	15389	15394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499081257
76	NC_021215	ATG	2	6	15548	15553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499081257
77	NC_021215	GAA	2	6	15596	15601	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499081256
78	NC_021215	CAT	2	6	15812	15817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499081256
79	NC_021215	AAG	2	6	15820	15825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499081256
80	NC_021215	TCA	2	6	15883	15888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499081256
81	NC_021215	TAT	2	6	15915	15920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	499081256
82	NC_021215	GAT	2	6	15944	15949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499081256
83	NC_021215	GAT	2	6	15962	15967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499081256
84	NC_021215	GGC	2	6	16037	16042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499081256
85	NC_021215	TTA	2	6	16048	16053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	499081256
86	NC_021215	TGG	2	6	16093	16098	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499081256
87	NC_021215	TGT	2	6	16118	16123	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	499081256
88	NC_021215	AAG	2	6	16240	16245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499081256
89	NC_021215	AGA	2	6	16268	16273	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499081256
90	NC_021215	CGC	2	6	16453	16458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499081256
91	NC_021215	TTC	2	6	16515	16520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499081256
92	NC_021215	TAT	2	6	16862	16867	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	499081255
93	NC_021215	TAA	2	6	16969	16974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	499081255
94	NC_021215	GCC	2	6	17083	17088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499081255
95	NC_021215	TCA	2	6	17139	17144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499081255
96	NC_021215	ATT	2	6	17379	17384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	499081255
97	NC_021215	ATG	2	6	17411	17416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499081255
98	NC_021215	TCA	2	6	17451	17456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499081255
99	NC_021215	TAT	2	6	17880	17885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	499081254
100	NC_021215	TTA	2	6	17886	17891	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	499081254
101	NC_021215	TTA	2	6	17903	17908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	499081254
102	NC_021215	TAT	2	6	17945	17950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	499081254
103	NC_021215	TAT	2	6	17992	17997	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	499081254
104	NC_021215	CAC	2	6	18039	18044	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499081254
105	NC_021215	TAA	2	6	18159	18164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	499081254
106	NC_021215	AGA	2	6	18255	18260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499081254
107	NC_021215	GTT	2	6	18264	18269	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	499081254
108	NC_021215	TAT	2	6	18316	18321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	499081254
109	NC_021215	GGA	2	6	18326	18331	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	499081254
110	NC_021215	CAG	2	6	18336	18341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499081254
111	NC_021215	CTT	2	6	18383	18388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499081254
112	NC_021215	TAT	2	6	18739	18744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	499081254
113	NC_021215	ATG	2	6	18791	18796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499081254
114	NC_021215	TAT	2	6	18823	18828	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	499081254
115	NC_021215	TGT	2	6	18870	18875	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	499081254
116	NC_021215	CAA	2	6	18945	18950	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	499081254
117	NC_021215	CTT	2	6	18953	18958	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499081254
118	NC_021215	TAT	2	6	19036	19041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	499081254
119	NC_021215	GAA	2	6	19246	19251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499081254
120	NC_021215	GAT	2	6	19276	19281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499081254
121	NC_021215	TTG	2	6	19294	19299	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	499081254
122	NC_021215	AAT	2	6	19311	19316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	499081254
123	NC_021215	TTC	2	6	19755	19760	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499081253
124	NC_021215	TGT	2	6	19838	19843	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	499081253
125	NC_021215	CAC	2	6	19947	19952	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499081253
126	NC_021215	AGG	2	6	20196	20201	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	499081253
127	NC_021215	CAA	2	6	20348	20353	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	499081253
128	NC_021215	TGC	2	6	20492	20497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499081253
129	NC_021215	TAA	2	6	20618	20623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	499081253
130	NC_021215	TTC	2	6	20637	20642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499081253
131	NC_021215	TTG	2	6	20811	20816	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	499081253
132	NC_021215	TTC	2	6	20883	20888	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499081253
133	NC_021215	CGC	2	6	20951	20956	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499081253
134	NC_021215	AGC	2	6	21063	21068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499081253
135	NC_021215	TCT	2	6	21181	21186	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499081253
136	NC_021215	TCA	2	6	21302	21307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499081253
137	NC_021215	CCA	2	6	21353	21358	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499081253
138	NC_021215	CAA	2	6	21378	21383	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	499081253
139	NC_021215	TAT	2	6	21464	21469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	499081253
140	NC_021215	TTG	2	6	21672	21677	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	499081252
141	NC_021215	GTT	2	6	21800	21805	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	499081252
142	NC_021215	TGC	2	6	21868	21873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499081252
143	NC_021215	TTC	2	6	21878	21883	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499081252
144	NC_021215	TGT	2	6	21895	21900	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	499081252
145	NC_021215	ACC	2	6	22195	22200	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529973391
146	NC_021215	TCA	2	6	22265	22270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529973391
147	NC_021215	ATC	2	6	22281	22286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529973391
148	NC_021215	CCA	3	9	22301	22309	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529973391
149	NC_021215	CTT	2	6	22436	22441	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529973391
150	NC_021215	CCT	2	6	22443	22448	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529973391
151	NC_021215	CCT	2	6	22456	22461	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529973391
152	NC_021215	AGA	2	6	22497	22502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529973391
153	NC_021215	AGA	2	6	22557	22562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529973391
154	NC_021215	CAT	2	6	22718	22723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499081250
155	NC_021215	CAT	2	6	24429	24434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499081248
156	NC_021215	GTT	2	6	24622	24627	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	499081248
157	NC_021215	ACA	2	6	25046	25051	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	499081248
158	NC_021215	GCC	2	6	25091	25096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499081248
159	NC_021215	GCT	2	6	25105	25110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499081248
160	NC_021215	ATT	2	6	25244	25249	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	499081248
161	NC_021215	TAA	2	6	25330	25335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	499081248
162	NC_021215	TGA	2	6	25701	25706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499081247
163	NC_021215	ATC	2	6	25795	25800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499081247
164	NC_021215	TGG	2	6	25940	25945	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499081247
165	NC_021215	ATG	2	6	25976	25981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499081247
166	NC_021215	GAA	2	6	25990	25995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499081247
167	NC_021215	GAA	2	6	26125	26130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499081247
168	NC_021215	CAG	2	6	26147	26152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499081247
169	NC_021215	TAT	2	6	26391	26396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	499081246
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172	NC_021215	ACA	2	6	26912	26917	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	499081246
173	NC_021215	ATT	2	6	26943	26948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	499081246
174	NC_021215	AGA	2	6	27033	27038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499081246
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180	NC_021215	TAG	2	6	28135	28140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499081245
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182	NC_021215	CTT	2	6	28305	28310	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499081245
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185	NC_021215	ACT	2	6	28364	28369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499081245
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205	NC_021215	TAT	2	6	30576	30581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	499081242
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210	NC_021215	ATC	2	6	30882	30887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499081241
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245	NC_021215	TGA	2	6	33929	33934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499081237
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248	NC_021215	CCT	2	6	34102	34107	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	499081237
249	NC_021215	TTG	2	6	34249	34254	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	499081237
250	NC_021215	TTG	2	6	34296	34301	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	499081237
251	NC_021215	GTA	2	6	34341	34346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499081237
252	NC_021215	TCA	2	6	34411	34416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499081237
253	NC_021215	CAT	2	6	34427	34432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499081237
254	NC_021215	CTT	2	6	34565	34570	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499081237
255	NC_021215	AGA	2	6	35122	35127	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499081236
256	NC_021215	GCC	2	6	35339	35344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499081235
257	NC_021215	GAA	2	6	35516	35521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499081235
258	NC_021215	GTG	2	6	35534	35539	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499081235
259	NC_021215	GTA	2	6	35619	35624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499081234
260	NC_021215	ATT	2	6	35978	35983	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	499081234
261	NC_021215	AGA	2	6	35999	36004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499081234
262	NC_021215	AAC	2	6	36046	36051	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	499081234
263	NC_021215	CGT	2	6	36188	36193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499081234
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267	NC_021215	GTG	2	6	36507	36512	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499081234
268	NC_021215	GCA	2	6	36523	36528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499081234
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270	NC_021215	ATT	2	6	36805	36810	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	499081233
271	NC_021215	ATG	2	6	36997	37002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499081233
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274	NC_021215	ATT	2	6	37174	37179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	499081233
275	NC_021215	TAA	2	6	37448	37453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	499081232
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277	NC_021215	ATA	2	6	37744	37749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	499081232
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279	NC_021215	TAA	2	6	37848	37853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	499081232
280	NC_021215	CCA	2	6	38045	38050	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499081231
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282	NC_021215	GCT	2	6	39789	39794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499081228
283	NC_021215	TTA	2	6	39965	39970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	499081228
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286	NC_021215	ATT	2	6	40268	40273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	499081228
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288	NC_021215	TTA	2	6	40616	40621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	499081227
289	NC_021215	GAT	2	6	40703	40708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499081227
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294	NC_021215	ATC	2	6	40823	40828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499081227
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336	NC_021215	CTT	2	6	46575	46580	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499081220
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