MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Thermotoga maritima MSB8

Total Repeats: 79

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021214	AAACT	2	10	1240	1249	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_021214	GAAAC	2	10	1304	1313	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
3	NC_021214	GCCTC	2	10	1523	1532	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
4	NC_021214	TTCTC	2	10	2535	2544	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
5	NC_021214	AAAAG	2	10	11454	11463	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021214	TTTTG	2	10	44412	44421	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021214	TTTGC	2	10	157333	157342	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
8	NC_021214	AGGGG	2	10	192730	192739	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021214	CATCC	2	10	193400	193409	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
10	NC_021214	GATAT	2	10	291414	291423	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021214	CCCCT	2	10	307968	307977	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
12	NC_021214	CTCTT	2	10	318036	318045	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
13	NC_021214	TTTCT	2	10	331309	331318	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_021214	CATTT	2	10	392104	392113	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_021214	CTTTG	2	10	395991	396000	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
16	NC_021214	ATGTT	2	10	396030	396039	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021214	ACAAG	2	10	409291	409300	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
18	NC_021214	CGATG	2	10	410731	410740	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
19	NC_021214	TGCAT	2	10	419252	419261	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
20	NC_021214	ATAAA	2	10	435645	435654	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021214	GCCTT	2	10	442124	442133	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
22	NC_021214	TGTTT	2	10	452292	452301	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021214	GGAAA	2	10	474190	474199	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021214	AAAAG	2	10	502640	502649	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021214	AAAGT	2	10	519707	519716	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021214	TCCCC	2	10	556938	556947	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
27	NC_021214	TGTCT	2	10	560752	560761	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
28	NC_021214	CATAC	2	10	600222	600231	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
29	NC_021214	AAAAG	2	10	629278	629287	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021214	TGTTT	2	10	645588	645597	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021214	GAAAA	2	10	689449	689458	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021214	GCCCC	2	10	716282	716291	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
33	NC_021214	TGATA	2	10	726178	726187	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021214	AAAAG	2	10	774435	774444	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021214	ACAGA	2	10	830415	830424	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
36	NC_021214	AACAG	2	10	846407	846416	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
37	NC_021214	ATAGA	2	10	887109	887118	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021214	ACCCC	2	10	945699	945708	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
39	NC_021214	CCTTC	2	10	948925	948934	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
40	NC_021214	TTCAT	2	10	958938	958947	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_021214	TCCTC	2	10	964269	964278	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
42	NC_021214	CAAAA	2	10	966174	966183	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
43	NC_021214	TAAAT	2	10	984293	984302	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021214	TGGTC	2	10	988190	988199	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
45	NC_021214	ATCAG	2	10	990173	990182	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
46	NC_021214	GAAGA	2	10	1018881	1018890	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021214	ATAAC	2	10	1019799	1019808	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
48	NC_021214	TGGTC	2	10	1020611	1020620	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
49	NC_021214	TATCA	2	10	1028339	1028348	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
50	NC_021214	ATTTT	2	10	1046194	1046203	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021214	AATAT	2	10	1083505	1083514	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021214	CCCGA	2	10	1124759	1124768	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
53	NC_021214	AATCT	2	10	1138247	1138256	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_021214	GAGGG	2	10	1148069	1148078	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021214	ACCTT	2	10	1218878	1218887	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
56	NC_021214	AAAAG	2	10	1221950	1221959	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021214	TTGTG	2	10	1230586	1230595	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021214	CCCCG	2	10	1246001	1246010	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
59	NC_021214	AAGTC	2	10	1253762	1253771	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
60	NC_021214	GAGAA	2	10	1324827	1324836	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021214	AAAGA	2	10	1349975	1349984	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021214	ACCTC	2	10	1359434	1359443	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
63	NC_021214	GCTTT	2	10	1428805	1428814	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
64	NC_021214	TGTAA	2	10	1435359	1435368	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021214	GAAAA	2	10	1443414	1443423	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021214	TTCTT	2	10	1519766	1519775	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
67	NC_021214	CTTTT	2	10	1540384	1540393	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
68	NC_021214	AAAGG	2	10	1580324	1580333	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021214	ATATA	2	10	1580341	1580350	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021214	AAGTC	2	10	1662850	1662859	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
71	NC_021214	CATAA	2	10	1721886	1721895	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
72	NC_021214	GAGGT	2	10	1738679	1738688	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021214	CCTCT	2	10	1755685	1755694	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
74	NC_021214	CTTCG	2	10	1762946	1762955	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
75	NC_021214	GAAGA	2	10	1780337	1780346	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021214	AAAAG	2	10	1804146	1804155	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021214	ATTAT	2	10	1806983	1806992	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021214	AATTA	2	10	1831860	1831869	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021214	TAACA	2	10	1840707	1840716	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.