MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus suis TL13

Total Repeats: 111

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021213	TGGAAG	2	12	21650	21661	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021213	AAATGG	2	12	43730	43741	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021213	TCGGTG	2	12	49909	49920	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_021213	CATTTT	2	12	54794	54805	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_021213	TGGAAG	2	12	93352	93363	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021213	TTCGGG	2	12	94289	94300	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_021213	TCAATA	2	12	99089	99100	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_021213	CTTTGT	2	12	100712	100723	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_021213	ATTTTT	2	12	139077	139088	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021213	AAAAGA	2	12	153228	153239	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021213	TAAGAT	2	12	157092	157103	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021213	TTAACA	2	12	171214	171225	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_021213	ACTAAG	2	12	180245	180256	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_021213	TGATTT	2	12	180600	180611	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021213	GTTATA	2	12	183779	183790	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021213	TCGCAC	2	12	207877	207888	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
17	NC_021213	GATTTT	2	12	213156	213167	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021213	ATCCTT	2	12	226206	226217	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_021213	ATCTGC	2	12	241931	241942	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_021213	AAAATT	2	12	244061	244072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021213	AAAATC	2	12	249711	249722	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_021213	GAGTGG	2	12	249746	249757	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021213	TAGAAA	2	12	318686	318697	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021213	TAGCCG	2	12	318725	318736	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_021213	TAAAAC	2	12	330056	330067	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_021213	TAAAAA	2	12	367510	367521	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021213	TGGAAG	2	12	374783	374794	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021213	GTGGGA	2	12	393379	393390	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021213	ATCTGC	2	12	399439	399450	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_021213	TCTTTT	2	12	423634	423645	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_021213	TGGAAG	2	12	466457	466468	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021213	ATTGTA	2	12	470148	470159	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021213	CGCCAA	2	12	483636	483647	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
34	NC_021213	GAAAAA	3	18	483661	483678	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021213	AAAATC	2	12	522317	522328	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_021213	ATCTGC	2	12	522370	522381	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_021213	TGATTT	2	12	522393	522404	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021213	ACCTAT	2	12	530874	530885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_021213	GGAGAA	2	12	557883	557894	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021213	TCCTTT	2	12	566491	566502	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_021213	TATTTT	2	12	607895	607906	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021213	AAAATC	2	12	629768	629779	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_021213	GCAGAT	2	12	629792	629803	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_021213	TGATTT	2	12	629839	629850	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021213	TTTACG	2	12	632786	632797	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_021213	ATCTGC	2	12	666954	666965	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_021213	AAAATC	2	12	672974	672985	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_021213	AGAAAA	2	12	715575	715586	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021213	ATGTAA	2	12	728443	728454	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021213	AAAATC	2	12	734522	734533	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_021213	AAAATC	2	12	749910	749921	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_021213	AAAATC	2	12	788965	788976	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_021213	ACCCTT	2	12	805809	805820	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_021213	TATAAA	2	12	835148	835159	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021213	ATAGAG	2	12	885178	885189	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021213	TTTGAT	2	12	895921	895932	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021213	TCCCTA	2	12	909433	909444	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_021213	TGTTTT	2	12	935705	935716	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021213	GAAAAA	2	12	935772	935783	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021213	CTCCAT	2	12	987037	987048	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_021213	CCCGAA	2	12	1053199	1053210	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
62	NC_021213	ACTCTT	2	12	1054738	1054749	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_021213	TCCAAC	2	12	1072176	1072187	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_021213	TCCTTT	2	12	1078478	1078489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_021213	GCAGAT	2	12	1132542	1132553	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_021213	TGATTT	2	12	1132589	1132600	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021213	ATTTTT	2	12	1187652	1187663	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021213	CAGTGC	2	12	1207116	1207127	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_021213	GGAAAA	2	12	1234501	1234512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021213	CCTGCT	2	12	1237503	1237514	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
71	NC_021213	TTTCTA	2	12	1244280	1244291	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_021213	TTTACG	2	12	1278826	1278837	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_021213	AAATAA	2	12	1295391	1295402	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021213	AAATCA	2	12	1296376	1296387	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_021213	TTCTTT	2	12	1300276	1300287	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_021213	TTTTCA	2	12	1338825	1338836	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_021213	AGATTA	2	12	1348110	1348121	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021213	AAATAA	2	12	1353856	1353867	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021213	TTCCTG	2	12	1374117	1374128	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_021213	AAAATC	2	12	1398997	1399008	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_021213	ATCTGC	2	12	1399045	1399056	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_021213	TTTATG	2	12	1472173	1472184	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021213	AAAATC	2	12	1478708	1478719	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_021213	GCAGAT	2	12	1478732	1478743	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_021213	TTTATC	2	12	1495360	1495371	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_021213	TAAAAA	2	12	1501956	1501967	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021213	TGATTT	2	12	1503723	1503734	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021213	GATTTT	2	12	1521913	1521924	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021213	TTTGCT	2	12	1564344	1564355	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_021213	TGATTT	2	12	1567264	1567275	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021213	AATTCC	2	12	1587885	1587896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_021213	GGCATG	2	12	1609657	1609668	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_021213	AGCTGA	2	12	1628051	1628062	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_021213	GATGTG	2	12	1630213	1630224	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021213	ATCACT	2	12	1659693	1659704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_021213	ATTTTT	2	12	1692479	1692490	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021213	AAACAT	2	12	1703909	1703920	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_021213	ATTTTT	2	12	1750348	1750359	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_021213	GTTGGG	2	12	1761047	1761058	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021213	AAAATC	2	12	1832889	1832900	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_021213	TGTATG	2	12	1849527	1849538	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_021213	TTTATT	2	12	1858347	1858358	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_021213	AGTCCC	2	12	1862613	1862624	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
104	NC_021213	TAAAAA	2	12	1904281	1904292	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021213	TAGTGT	2	12	1913635	1913646	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_021213	ATTTTT	2	12	1947836	1947847	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021213	CCGCCA	2	12	1955633	1955644	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_021213	TGGAAG	2	12	1958767	1958778	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021213	GACTAT	2	12	1965589	1965600	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_021213	AGCTAA	2	12	1995493	1995504	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_021213	CTTTGA	2	12	2003044	2003055	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.