MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus suis TL13

Total Repeats: 796

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021213	AAAT	2	8	4188	4195	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021213	TTGG	2	8	5624	5631	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021213	TTAT	2	8	15769	15776	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021213	GTGA	2	8	17378	17385	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021213	AGCG	2	8	17549	17556	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6	NC_021213	AGCC	2	8	18431	18438	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7	NC_021213	GTAA	2	8	18896	18903	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021213	TCAC	2	8	18953	18960	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_021213	GCGA	2	8	19052	19059	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10	NC_021213	ATTC	2	8	19918	19925	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_021213	CTAA	2	8	20274	20281	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_021213	CTGA	2	8	20548	20555	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_021213	TAGG	2	8	20930	20937	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021213	AATC	2	8	22076	22083	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_021213	GCGT	2	8	22987	22994	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
16	NC_021213	TTTG	2	8	26175	26182	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021213	ATTT	2	8	27242	27249	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021213	AAAT	2	8	43829	43836	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021213	AGGT	2	8	44013	44020	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021213	TCAA	2	8	44281	44288	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_021213	TTAT	2	8	44735	44742	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021213	TAAG	2	8	44845	44852	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021213	AATA	2	8	47841	47848	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021213	CTCC	2	8	47867	47874	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
25	NC_021213	TAAG	2	8	48115	48122	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021213	GTTT	2	8	48276	48283	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021213	CATT	2	8	49900	49907	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_021213	AATA	2	8	50130	50137	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021213	ATCT	2	8	50157	50164	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_021213	TTTA	2	8	51907	51914	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021213	AATA	2	8	54379	54386	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021213	ATAA	2	8	54621	54628	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021213	GTTT	2	8	56532	56539	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021213	TTTA	2	8	56540	56547	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021213	AATA	2	8	58959	58966	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021213	GAAG	2	8	63646	63653	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021213	AAGT	2	8	69414	69421	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021213	GTTT	2	8	69493	69500	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021213	TAGG	2	8	69515	69522	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021213	AAAC	2	8	75871	75878	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_021213	AAAC	2	8	75912	75919	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_021213	CTGC	2	8	77116	77123	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
43	NC_021213	TACA	2	8	79550	79557	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_021213	ACAT	2	8	87258	87265	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_021213	TTAT	2	8	87364	87371	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021213	GTGA	2	8	89071	89078	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021213	AGCG	2	8	89242	89249	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
48	NC_021213	AGCC	2	8	90124	90131	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
49	NC_021213	GTAA	2	8	90590	90597	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021213	TCAC	2	8	90647	90654	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_021213	GCGA	2	8	90746	90753	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
52	NC_021213	ATTC	2	8	91612	91619	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_021213	CTAA	2	8	91968	91975	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_021213	CTGA	2	8	92242	92249	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
55	NC_021213	TAGG	2	8	92632	92639	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021213	GCGT	2	8	94020	94027	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
57	NC_021213	CTTT	2	8	94133	94140	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_021213	TCTT	2	8	96049	96056	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_021213	TAGT	2	8	96104	96111	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021213	CTTT	2	8	97584	97591	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_021213	ATGT	2	8	97712	97719	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021213	CAGT	2	8	97768	97775	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_021213	TGCT	2	8	98982	98989	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_021213	CAGT	2	8	100080	100087	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
65	NC_021213	TCAA	2	8	100758	100765	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_021213	TTTA	2	8	102391	102398	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021213	ACTT	2	8	102503	102510	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_021213	TTAA	2	8	102574	102581	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021213	TCTT	2	8	106103	106110	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_021213	ATGG	2	8	121098	121105	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021213	GCTA	2	8	121186	121193	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
72	NC_021213	GAAA	2	8	124967	124974	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021213	ATTT	2	8	130969	130976	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021213	AATC	2	8	131104	131111	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_021213	CAAA	2	8	133099	133106	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_021213	GAAT	2	8	133355	133362	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021213	TGTT	2	8	137571	137578	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021213	CTGT	2	8	137599	137606	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_021213	TGTT	2	8	139090	139097	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021213	AGAA	2	8	141980	141987	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021213	TATG	2	8	142016	142023	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021213	AGAA	2	8	143507	143514	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021213	ATTC	2	8	147973	147980	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_021213	TCTA	2	8	149434	149441	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_021213	AATA	2	8	152628	152635	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021213	CAAT	2	8	157159	157166	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_021213	TAAA	2	8	159621	159628	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021213	GTTT	2	8	159678	159685	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021213	TCAT	2	8	172112	172119	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_021213	TTTG	2	8	173163	173170	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021213	CTTT	2	8	180000	180007	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_021213	GTCT	2	8	180045	180052	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
93	NC_021213	AATG	2	8	189401	189408	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021213	GTAT	2	8	191554	191561	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021213	TGTA	2	8	196028	196035	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_021213	GAAA	2	8	196101	196108	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021213	GTAG	2	8	196109	196116	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021213	CAAC	2	8	206269	206276	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_021213	AGGG	2	8	208021	208028	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021213	TAAT	2	8	209891	209898	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_021213	AATA	2	8	211271	211278	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_021213	GTCT	2	8	213148	213155	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
103	NC_021213	ATTT	2	8	217853	217860	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_021213	TTTA	2	8	223258	223265	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021213	TGTC	2	8	225683	225690	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
106	NC_021213	ATAA	2	8	226129	226136	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021213	AAAT	2	8	232134	232141	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_021213	AAAT	2	8	232196	232203	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021213	TAGT	2	8	233988	233995	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021213	TTGT	2	8	239189	239196	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_021213	ATTG	2	8	242010	242017	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021213	TTTA	2	8	242056	242063	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021213	GAAT	2	8	243449	243456	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021213	TCCC	2	8	243584	243591	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
115	NC_021213	ATAG	2	8	248789	248796	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_021213	TAGG	2	8	253401	253408	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_021213	AACG	2	8	257537	257544	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
118	NC_021213	ACTG	2	8	262454	262461	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
119	NC_021213	CTTT	2	8	267257	267264	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_021213	GTAA	2	8	267312	267319	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_021213	AAAT	2	8	281587	281594	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_021213	ATAA	2	8	281616	281623	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_021213	GATT	2	8	282277	282284	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_021213	GATT	2	8	284590	284597	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_021213	CAAC	2	8	284601	284608	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_021213	GGGA	2	8	288032	288039	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
127	NC_021213	TAGT	2	8	288113	288120	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_021213	TATC	2	8	293813	293820	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_021213	GAAT	2	8	297043	297050	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_021213	AATG	2	8	298194	298201	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_021213	AGAA	2	8	298298	298305	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_021213	CAAA	2	8	298346	298353	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
133	NC_021213	TAGG	2	8	301276	301283	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_021213	TTGT	2	8	301381	301388	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_021213	TCTA	2	8	301466	301473	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
136	NC_021213	GTTT	2	8	303061	303068	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_021213	GTTT	2	8	310695	310702	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_021213	AAAG	2	8	318615	318622	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_021213	TCAG	2	8	321704	321711	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
140	NC_021213	ATGA	2	8	324169	324176	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_021213	CTTT	2	8	327856	327863	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_021213	AAGG	2	8	337802	337809	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_021213	TAAT	2	8	338129	338136	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_021213	CAAT	2	8	338303	338310	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
145	NC_021213	AAAG	2	8	341177	341184	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
146	NC_021213	TTAT	2	8	341190	341197	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_021213	TTAC	2	8	349011	349018	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
148	NC_021213	CCTC	2	8	349790	349797	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
149	NC_021213	ATCA	2	8	349925	349932	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
150	NC_021213	ATTT	2	8	352231	352238	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_021213	CAAT	2	8	358177	358184	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
152	NC_021213	AAAG	2	8	360606	360613	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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445	NC_021213	AAGA	2	8	1164429	1164436	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
446	NC_021213	AATT	2	8	1165196	1165203	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
447	NC_021213	AATT	2	8	1165931	1165938	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
448	NC_021213	ATTC	2	8	1166513	1166520	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
449	NC_021213	TTCG	2	8	1166975	1166982	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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451	NC_021213	AAGT	2	8	1167276	1167283	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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453	NC_021213	CAGT	2	8	1171967	1171974	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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459	NC_021213	TAGA	2	8	1183450	1183457	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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461	NC_021213	TGCA	2	8	1183604	1183611	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
462	NC_021213	AATA	2	8	1183621	1183628	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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466	NC_021213	TTAT	2	8	1187582	1187589	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
467	NC_021213	GCAA	2	8	1188577	1188584	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
468	NC_021213	AGTC	2	8	1188664	1188671	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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471	NC_021213	AAGA	2	8	1206594	1206601	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
472	NC_021213	GATG	2	8	1207032	1207039	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
473	NC_021213	AATC	2	8	1207197	1207204	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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478	NC_021213	CTAG	2	8	1232146	1232153	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
479	NC_021213	TTTC	2	8	1234480	1234487	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
480	NC_021213	ATCA	2	8	1234558	1234565	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
481	NC_021213	TGAA	2	8	1237065	1237072	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
482	NC_021213	CAAA	2	8	1237522	1237529	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
483	NC_021213	TTCT	2	8	1240180	1240187	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
484	NC_021213	TTTC	2	8	1240234	1240241	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
485	NC_021213	CAAA	2	8	1242700	1242707	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
486	NC_021213	CAAA	2	8	1243565	1243572	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
487	NC_021213	CAGG	2	8	1244167	1244174	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
488	NC_021213	AGGG	2	8	1244829	1244836	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
489	NC_021213	AGTC	2	8	1249604	1249611	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
490	NC_021213	TCTA	2	8	1252050	1252057	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
491	NC_021213	TTAC	2	8	1252269	1252276	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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495	NC_021213	GTAT	2	8	1265328	1265335	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
496	NC_021213	TTTA	2	8	1273146	1273153	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
497	NC_021213	AGCG	2	8	1273568	1273575	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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499	NC_021213	AGCG	2	8	1273883	1273890	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
500	NC_021213	AGTA	2	8	1281923	1281930	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding

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