MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Streptococcus suis TL13

Total Repeats: 23640

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021213	AAC	2	6	11	16	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	499142349
2	NC_021213	AAG	2	6	279	284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499142349
3	NC_021213	CTC	2	6	323	328	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	499142349
4	NC_021213	AAT	2	6	400	405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	499142349
5	NC_021213	ATT	2	6	465	470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	499142349
6	NC_021213	TGG	2	6	477	482	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499142349
7	NC_021213	TCA	2	6	581	586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499142349
8	NC_021213	TGA	2	6	666	671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499142349
9	NC_021213	TAA	2	6	687	692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	499142349
10	NC_021213	CAA	2	6	695	700	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	499142349
11	NC_021213	GAA	2	6	706	711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499142349
12	NC_021213	GAA	2	6	799	804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499142349
13	NC_021213	TGC	2	6	1041	1046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499142349
14	NC_021213	CTC	2	6	1312	1317	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	499142349
15	NC_021213	GAT	2	6	1321	1326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499142349
16	NC_021213	TAA	2	6	1545	1550	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	499142350
17	NC_021213	TTA	2	6	1772	1777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	499142350
18	NC_021213	AAG	2	6	1880	1885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499142350
19	NC_021213	GTC	2	6	2000	2005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499142350
20	NC_021213	TGA	2	6	2115	2120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499142350
21	NC_021213	TGT	2	6	2127	2132	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	499142350
22	NC_021213	GAT	2	6	2176	2181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499142350
23	NC_021213	TCT	2	6	2198	2203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499142350
24	NC_021213	AAT	2	6	2209	2214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	499142350
25	NC_021213	TTA	2	6	2257	2262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	499142350
26	NC_021213	AAC	2	6	2310	2315	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	499142350
27	NC_021213	TCT	2	6	2364	2369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499142350
28	NC_021213	TAA	2	6	2412	2417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	499142350
29	NC_021213	TGT	2	6	2418	2423	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	499142350
30	NC_021213	TCT	2	6	2581	2586	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499142350
31	NC_021213	AAT	2	6	2611	2616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	499142350
32	NC_021213	CTG	2	6	2799	2804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499142351
33	NC_021213	AGT	2	6	2921	2926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499142351
34	NC_021213	TTA	2	6	3007	3012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	499142351
35	NC_021213	ATT	2	6	3265	3270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	499142351
36	NC_021213	TGA	2	6	3304	3309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499142351
37	NC_021213	TGG	2	6	3367	3372	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499142351
38	NC_021213	TTA	2	6	3476	3481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	499142351
39	NC_021213	TCT	2	6	3497	3502	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499142351
40	NC_021213	ATT	3	9	3556	3564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	499142351
41	NC_021213	TCA	2	6	3696	3701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499142352
42	NC_021213	AAG	2	6	3713	3718	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499142352
43	NC_021213	TGT	2	6	3784	3789	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	499142352
44	NC_021213	ATG	2	6	3791	3796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499142352
45	NC_021213	CAG	2	6	4407	4412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499142354
46	NC_021213	TGG	2	6	4524	4529	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499142354
47	NC_021213	TCA	2	6	4566	4571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499142354
48	NC_021213	TGA	3	9	4717	4725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499142354
49	NC_021213	TTG	2	6	4761	4766	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	499142354
50	NC_021213	CAA	2	6	4828	4833	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	499142354
51	NC_021213	GAA	2	6	4967	4972	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499142354
52	NC_021213	ACC	2	6	5003	5008	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499142354
53	NC_021213	GCA	2	6	5096	5101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499142354
54	NC_021213	GTG	3	9	5117	5125	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499142354
55	NC_021213	CAG	2	6	5271	5276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499142354
56	NC_021213	TAT	2	6	5338	5343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	499142354
57	NC_021213	ATG	2	6	5391	5396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499142354
58	NC_021213	AAG	2	6	5430	5435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499142354
59	NC_021213	GAA	2	6	5450	5455	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499142354
60	NC_021213	CGT	2	6	5467	5472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499142354
61	NC_021213	CAT	2	6	5485	5490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499142354
62	NC_021213	ATC	2	6	5682	5687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499142355
63	NC_021213	TGC	2	6	5743	5748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499142355
64	NC_021213	TTA	2	6	5906	5911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	499142355
65	NC_021213	TAG	2	6	5935	5940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499142355
66	NC_021213	ATG	2	6	5944	5949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499142355
67	NC_021213	CAG	2	6	5995	6000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499142355
68	NC_021213	AGA	2	6	6131	6136	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499142355
69	NC_021213	AGA	3	9	6194	6202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499142355
70	NC_021213	AAT	2	6	6388	6393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	499142356
71	NC_021213	ATT	2	6	6449	6454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	499142356
72	NC_021213	CTT	2	6	6475	6480	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499142356
73	NC_021213	GAT	2	6	6485	6490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499142356
74	NC_021213	GCT	2	6	6602	6607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499142356
75	NC_021213	TAG	2	6	6943	6948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499142356
76	NC_021213	TTG	2	6	7100	7105	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	499142356
77	NC_021213	GAT	2	6	7139	7144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499142356
78	NC_021213	TTG	2	6	7196	7201	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	499142356
79	NC_021213	GAT	2	6	7205	7210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499142356
80	NC_021213	CTT	2	6	7291	7296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499142356
81	NC_021213	CCA	2	6	7378	7383	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499142356
82	NC_021213	GTT	2	6	7436	7441	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	499142356
83	NC_021213	GCA	2	6	7520	7525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499142356
84	NC_021213	TAG	2	6	7533	7538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499142356
85	NC_021213	TCA	2	6	7608	7613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499142356
86	NC_021213	TGT	2	6	7720	7725	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	499142356
87	NC_021213	ATT	2	6	7794	7799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	499142356
88	NC_021213	TCT	2	6	7855	7860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499142356
89	NC_021213	TAA	2	6	7900	7905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	499142356
90	NC_021213	GGA	2	6	7957	7962	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	499142356
91	NC_021213	GAT	2	6	7970	7975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499142356
92	NC_021213	GAT	2	6	8030	8035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499142356
93	NC_021213	ACT	2	6	8058	8063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499142356
94	NC_021213	CGA	2	6	8080	8085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499142356
95	NC_021213	TGA	2	6	8101	8106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499142356
96	NC_021213	ATG	2	6	8214	8219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499142356
97	NC_021213	TGT	2	6	8425	8430	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	499142356
98	NC_021213	CTA	2	6	8781	8786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499142356
99	NC_021213	CAA	2	6	8877	8882	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	499142356
100	NC_021213	GTG	2	6	9132	9137	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499142356
101	NC_021213	TGC	2	6	9154	9159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499142356
102	NC_021213	GAA	2	6	9392	9397	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499142356
103	NC_021213	GTA	2	6	9428	9433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499142356
104	NC_021213	GAC	2	6	9501	9506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499142356
105	NC_021213	TGT	2	6	9631	9636	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	499142356
106	NC_021213	TAA	2	6	9938	9943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	499142357
107	NC_021213	ACT	2	6	9944	9949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499142357
108	NC_021213	GAA	2	6	10044	10049	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499142357
109	NC_021213	AAT	2	6	10069	10074	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	499142358
110	NC_021213	CAA	2	6	10126	10131	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	499142358
111	NC_021213	TTG	2	6	10199	10204	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	499142358
112	NC_021213	CAG	3	9	10222	10230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499142358
113	NC_021213	GAA	2	6	10264	10269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499142358
114	NC_021213	GCA	2	6	10330	10335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499142358
115	NC_021213	AAG	2	6	10367	10372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499142358
116	NC_021213	TGA	2	6	10454	10459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499142359
117	NC_021213	AGA	2	6	10466	10471	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499142359
118	NC_021213	AGA	2	6	10502	10507	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499142359
119	NC_021213	AAG	2	6	10624	10629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499142360
120	NC_021213	GAA	2	6	10722	10727	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499142360
121	NC_021213	CTA	2	6	10854	10859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499142360
122	NC_021213	TGA	2	6	10862	10867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499142360
123	NC_021213	ACT	2	6	10884	10889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499142360
124	NC_021213	AAC	2	6	11012	11017	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	499142360
125	NC_021213	AAT	2	6	11067	11072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	499142360
126	NC_021213	ATA	2	6	11086	11091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	499142360
127	NC_021213	GTT	2	6	11111	11116	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	499142360
128	NC_021213	TTA	2	6	11240	11245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	499142360
129	NC_021213	ACT	2	6	11283	11288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499142360
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134	NC_021213	TTA	2	6	11450	11455	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	499142360
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249	NC_021213	AAC	2	6	25334	25339	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	499142367
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251	NC_021213	ACT	2	6	25396	25401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499142367
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254	NC_021213	AGA	2	6	25551	25556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499142367
255	NC_021213	AGC	2	6	25557	25562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499142367
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257	NC_021213	CAT	2	6	25751	25756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499142367
258	NC_021213	GCA	2	6	25777	25782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499142367
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261	NC_021213	TAT	2	6	25969	25974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	499142367
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