MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis MAP4

Total Repeats: 13070

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021200	CCGC	2	8	153	160	0 %	0 %	25 %	75 %	499074416
2	NC_021200	GCCG	2	8	339	346	0 %	0 %	50 %	50 %	499074416
3	NC_021200	ACGA	2	8	733	740	50 %	0 %	25 %	25 %	499074416
4	NC_021200	AAGG	2	8	841	848	50 %	0 %	50 %	0 %	499074416
5	NC_021200	GTGG	2	8	2180	2187	0 %	25 %	75 %	0 %	499074417
6	NC_021200	GCCG	2	8	2516	2523	0 %	0 %	50 %	50 %	499074417
7	NC_021200	CGGC	2	8	2560	2567	0 %	0 %	50 %	50 %	499074417
8	NC_021200	ACCG	2	8	2640	2647	25 %	0 %	25 %	50 %	499074417
9	NC_021200	GGGC	2	8	2785	2792	0 %	0 %	75 %	25 %	499074417
10	NC_021200	GCCA	2	8	4176	4183	25 %	0 %	25 %	50 %	499074418
11	NC_021200	ACCG	2	8	4489	4496	25 %	0 %	25 %	50 %	499074419
12	NC_021200	GCCG	2	8	4562	4569	0 %	0 %	50 %	50 %	499074419
13	NC_021200	GGTC	2	8	4750	4757	0 %	25 %	50 %	25 %	499074419
14	NC_021200	CCGC	2	8	5222	5229	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
15	NC_021200	GCGA	2	8	5370	5377	25 %	0 %	50 %	25 %	499074420
16	NC_021200	TCGT	2	8	6407	6414	0 %	50 %	25 %	25 %	499074420
17	NC_021200	GGGC	2	8	6568	6575	0 %	0 %	75 %	25 %	499074420
18	NC_021200	CGGC	2	8	6648	6655	0 %	0 %	50 %	50 %	499074420
19	NC_021200	GGCC	2	8	7039	7046	0 %	0 %	50 %	50 %	499074420
20	NC_021200	TGAC	2	8	7304	7311	25 %	25 %	25 %	25 %	499074421
21	NC_021200	CGGT	2	8	7528	7535	0 %	25 %	50 %	25 %	499074421
22	NC_021200	GCCG	2	8	7674	7681	0 %	0 %	50 %	50 %	499074421
23	NC_021200	TCGC	2	8	8837	8844	0 %	25 %	25 %	50 %	499074421
24	NC_021200	GACC	2	8	8895	8902	25 %	0 %	25 %	50 %	499074421
25	NC_021200	CCGC	2	8	9074	9081	0 %	0 %	25 %	75 %	499074421
26	NC_021200	CGAC	2	8	9359	9366	25 %	0 %	25 %	50 %	499074421
27	NC_021200	ACCT	2	8	9466	9473	25 %	25 %	0 %	50 %	499074421
28	NC_021200	TCGC	2	8	9749	9756	0 %	25 %	25 %	50 %	499074421
29	NC_021200	CGGC	2	8	9896	9903	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NC_021200	GCCG	2	8	10293	10300	0 %	0 %	50 %	50 %	499074422
31	NC_021200	GCCG	2	8	11470	11477	0 %	0 %	50 %	50 %	499074423
32	NC_021200	GGGT	2	8	11562	11569	0 %	25 %	75 %	0 %	499074423
33	NC_021200	GCGG	2	8	11608	11615	0 %	0 %	75 %	25 %	499074423
34	NC_021200	GATC	2	8	11620	11627	25 %	25 %	25 %	25 %	499074423
35	NC_021200	GATG	2	8	11698	11705	25 %	25 %	50 %	0 %	499074423
36	NC_021200	GCGG	2	8	11836	11843	0 %	0 %	75 %	25 %	499074423
37	NC_021200	CCGG	2	8	11901	11908	0 %	0 %	50 %	50 %	499074423
38	NC_021200	ACCA	2	8	12401	12408	50 %	0 %	0 %	50 %	499074423
39	NC_021200	AAAC	2	8	12421	12428	75 %	0 %	0 %	25 %	499074423
40	NC_021200	AACC	2	8	12753	12760	50 %	0 %	0 %	50 %	499074424
41	NC_021200	TCGG	2	8	12831	12838	0 %	25 %	50 %	25 %	499074424
42	NC_021200	GACG	2	8	13162	13169	25 %	0 %	50 %	25 %	499074424
43	NC_021200	GATC	2	8	14475	14482	25 %	25 %	25 %	25 %	499074425
44	NC_021200	GAGC	2	8	14574	14581	25 %	0 %	50 %	25 %	499074425
45	NC_021200	CTGG	2	8	14764	14771	0 %	25 %	50 %	25 %	499074425
46	NC_021200	CGGG	2	8	15344	15351	0 %	0 %	75 %	25 %	499074426
47	NC_021200	GCTG	2	8	15447	15454	0 %	25 %	50 %	25 %	499074426
48	NC_021200	CACC	2	8	15585	15592	25 %	0 %	0 %	75 %	499074426
49	NC_021200	CACC	2	8	15960	15967	25 %	0 %	0 %	75 %	499074426
50	NC_021200	GCCG	2	8	16037	16044	0 %	0 %	50 %	50 %	499074427
51	NC_021200	CGCC	2	8	16553	16560	0 %	0 %	25 %	75 %	499074427
52	NC_021200	CCAA	2	8	16832	16839	50 %	0 %	0 %	50 %	499074427
53	NC_021200	AAGG	2	8	16844	16851	50 %	0 %	50 %	0 %	499074427
54	NC_021200	GATT	2	8	16898	16905	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021200	TCAA	2	8	16955	16962	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_021200	ACAA	2	8	17180	17187	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_021200	CACC	2	8	17220	17227	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
58	NC_021200	CAGC	2	8	17416	17423	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
59	NC_021200	GGCC	2	8	17602	17609	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
60	NC_021200	GTCC	2	8	19178	19185	0 %	25 %	25 %	50 %	499074429
61	NC_021200	ATCA	2	8	19646	19653	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_021200	CCTG	2	8	19707	19714	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
63	NC_021200	TCGC	2	8	19778	19785	0 %	25 %	25 %	50 %	499074430
64	NC_021200	AAGT	2	8	19877	19884	50 %	25 %	25 %	0 %	499074430
65	NC_021200	GCCG	2	8	20163	20170	0 %	0 %	50 %	50 %	499074430
66	NC_021200	CATC	2	8	20703	20710	25 %	25 %	0 %	50 %	499074430
67	NC_021200	CTGG	2	8	21710	21717	0 %	25 %	50 %	25 %	499074431
68	NC_021200	TCGG	2	8	22819	22826	0 %	25 %	50 %	25 %	499074431
69	NC_021200	GCCG	2	8	23735	23742	0 %	0 %	50 %	50 %	499074431
70	NC_021200	CTGC	2	8	24633	24640	0 %	25 %	25 %	50 %	499074432
71	NC_021200	GCCC	2	8	25440	25447	0 %	0 %	25 %	75 %	499074433
72	NC_021200	GACC	2	8	25695	25702	25 %	0 %	25 %	50 %	499074433
73	NC_021200	GGGT	2	8	25998	26005	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021200	GCCT	2	8	26066	26073	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
75	NC_021200	ATCG	2	8	26818	26825	25 %	25 %	25 %	25 %	499074434
76	NC_021200	CGCT	2	8	26985	26992	0 %	25 %	25 %	50 %	499074434
77	NC_021200	GGCC	2	8	27100	27107	0 %	0 %	50 %	50 %	499074434
78	NC_021200	CCGG	2	8	27562	27569	0 %	0 %	50 %	50 %	499074435
79	NC_021200	ATCA	2	8	27837	27844	50 %	25 %	0 %	25 %	499074435
80	NC_021200	GCTG	2	8	27937	27944	0 %	25 %	50 %	25 %	499074435
81	NC_021200	AATC	2	8	28120	28127	50 %	25 %	0 %	25 %	499074435
82	NC_021200	AGGC	2	8	28216	28223	25 %	0 %	50 %	25 %	499074435
83	NC_021200	CCCG	2	8	28263	28270	0 %	0 %	25 %	75 %	499074435
84	NC_021200	AGCC	3	12	28334	28345	25 %	0 %	25 %	50 %	499074435
85	NC_021200	TGGC	2	8	28407	28414	0 %	25 %	50 %	25 %	499074435
86	NC_021200	CCGG	2	8	28600	28607	0 %	0 %	50 %	50 %	499074435
87	NC_021200	TGCC	2	8	29103	29110	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
88	NC_021200	ATGG	2	8	30075	30082	25 %	25 %	50 %	0 %	499074437
89	NC_021200	CGAT	2	8	30781	30788	25 %	25 %	25 %	25 %	499074438
90	NC_021200	CCGG	2	8	31091	31098	0 %	0 %	50 %	50 %	499074438
91	NC_021200	TGTC	2	8	32022	32029	0 %	50 %	25 %	25 %	499074439
92	NC_021200	GTGC	2	8	32061	32068	0 %	25 %	50 %	25 %	499074439
93	NC_021200	GCAT	2	8	32328	32335	25 %	25 %	25 %	25 %	499074439
94	NC_021200	GCGT	2	8	32821	32828	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
95	NC_021200	ACCG	2	8	33008	33015	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
96	NC_021200	CGAA	2	8	34111	34118	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
97	NC_021200	GGTT	2	8	34571	34578	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021200	TTCG	2	8	35169	35176	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
99	NC_021200	TCCG	2	8	36367	36374	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
100	NC_021200	TCGC	2	8	37537	37544	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
101	NC_021200	CAAG	2	8	37608	37615	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
102	NC_021200	GATG	2	8	37821	37828	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_021200	CTGA	2	8	38649	38656	25 %	25 %	25 %	25 %	499074440
104	NC_021200	GGTC	2	8	38897	38904	0 %	25 %	50 %	25 %	499074440
105	NC_021200	GGTC	2	8	39062	39069	0 %	25 %	50 %	25 %	499074440
106	NC_021200	CGGG	2	8	39534	39541	0 %	0 %	75 %	25 %	499074440
107	NC_021200	GTCG	2	8	40128	40135	0 %	25 %	50 %	25 %	499074440
108	NC_021200	CGGC	2	8	40190	40197	0 %	0 %	50 %	50 %	499074440
109	NC_021200	GTCC	2	8	40250	40257	0 %	25 %	25 %	50 %	499074440
110	NC_021200	GTCG	2	8	40270	40277	0 %	25 %	50 %	25 %	499074440
111	NC_021200	CCAG	2	8	41189	41196	25 %	0 %	25 %	50 %	499074440
112	NC_021200	GCGT	2	8	43422	43429	0 %	25 %	50 %	25 %	499074440
113	NC_021200	CGGT	2	8	43676	43683	0 %	25 %	50 %	25 %	499074440
114	NC_021200	CGGG	2	8	44056	44063	0 %	0 %	75 %	25 %	499074440
115	NC_021200	GTGG	2	8	44064	44071	0 %	25 %	75 %	0 %	499074440
116	NC_021200	CTGG	2	8	44667	44674	0 %	25 %	50 %	25 %	499074440
117	NC_021200	AGGA	2	8	44797	44804	50 %	0 %	50 %	0 %	499074440
118	NC_021200	AGGC	2	8	45027	45034	25 %	0 %	50 %	25 %	499074440
119	NC_021200	GTGC	2	8	45081	45088	0 %	25 %	50 %	25 %	499074440
120	NC_021200	GGTG	2	8	45113	45120	0 %	25 %	75 %	0 %	499074440
121	NC_021200	CGGC	2	8	45271	45278	0 %	0 %	50 %	50 %	499074440
122	NC_021200	CGAC	2	8	45349	45356	25 %	0 %	25 %	50 %	499074440
123	NC_021200	GGTG	2	8	45639	45646	0 %	25 %	75 %	0 %	499074440
124	NC_021200	CGCC	2	8	46018	46025	0 %	0 %	25 %	75 %	499074440
125	NC_021200	TGCC	2	8	47183	47190	0 %	25 %	25 %	50 %	499074440
126	NC_021200	CGGT	2	8	48023	48030	0 %	25 %	50 %	25 %	499074441
127	NC_021200	TCGT	2	8	48877	48884	0 %	50 %	25 %	25 %	499074441
128	NC_021200	CCCA	2	8	48973	48980	25 %	0 %	0 %	75 %	499074441
129	NC_021200	CAAG	2	8	49511	49518	50 %	0 %	25 %	25 %	499074442
130	NC_021200	TCGG	2	8	49972	49979	0 %	25 %	50 %	25 %	499074443
131	NC_021200	GGCC	2	8	50633	50640	0 %	0 %	50 %	50 %	499074443
132	NC_021200	GTTG	2	8	51084	51091	0 %	50 %	50 %	0 %	499074443
133	NC_021200	ACGG	2	8	51658	51665	25 %	0 %	50 %	25 %	499074444
134	NC_021200	ATCC	2	8	52039	52046	25 %	25 %	0 %	50 %	499074444
135	NC_021200	ACCG	2	8	52456	52463	25 %	0 %	25 %	50 %	499074444
136	NC_021200	ACCT	2	8	52580	52587	25 %	25 %	0 %	50 %	499074444
137	NC_021200	TGGC	2	8	52703	52710	0 %	25 %	50 %	25 %	499074445
138	NC_021200	CGGT	2	8	53112	53119	0 %	25 %	50 %	25 %	499074445
139	NC_021200	ATCC	2	8	53124	53131	25 %	25 %	0 %	50 %	499074445
140	NC_021200	GCCG	2	8	53436	53443	0 %	0 %	50 %	50 %	499074445
141	NC_021200	ACGC	2	8	54055	54062	25 %	0 %	25 %	50 %	499074446
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