MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis MAP4

Total Repeats: 10913

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021200	GC	3	6	234	239	0 %	0 %	50 %	50 %	499074416
2	NC_021200	CG	3	6	1779	1784	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NC_021200	GC	3	6	2980	2985	0 %	0 %	50 %	50 %	499074417
4	NC_021200	GC	3	6	3244	3249	0 %	0 %	50 %	50 %	499074417
5	NC_021200	GC	3	6	3635	3640	0 %	0 %	50 %	50 %	499074418
6	NC_021200	GC	3	6	3749	3754	0 %	0 %	50 %	50 %	499074418
7	NC_021200	GC	3	6	4573	4578	0 %	0 %	50 %	50 %	499074419
8	NC_021200	CG	3	6	4980	4985	0 %	0 %	50 %	50 %	499074419
9	NC_021200	GC	3	6	6509	6514	0 %	0 %	50 %	50 %	499074420
10	NC_021200	CG	3	6	6520	6525	0 %	0 %	50 %	50 %	499074420
11	NC_021200	CG	3	6	7234	7239	0 %	0 %	50 %	50 %	499074420
12	NC_021200	CG	3	6	7420	7425	0 %	0 %	50 %	50 %	499074421
13	NC_021200	CG	3	6	8093	8098	0 %	0 %	50 %	50 %	499074421
14	NC_021200	CG	3	6	8553	8558	0 %	0 %	50 %	50 %	499074421
15	NC_021200	CG	3	6	8781	8786	0 %	0 %	50 %	50 %	499074421
16	NC_021200	CA	3	6	9866	9871	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_021200	CG	3	6	10274	10279	0 %	0 %	50 %	50 %	499074422
18	NC_021200	TG	3	6	11183	11188	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021200	TG	3	6	11778	11783	0 %	50 %	50 %	0 %	499074423
20	NC_021200	GC	3	6	11787	11792	0 %	0 %	50 %	50 %	499074423
21	NC_021200	CG	3	6	11816	11821	0 %	0 %	50 %	50 %	499074423
22	NC_021200	GC	3	6	12034	12039	0 %	0 %	50 %	50 %	499074423
23	NC_021200	GC	3	6	12395	12400	0 %	0 %	50 %	50 %	499074423
24	NC_021200	TC	3	6	13737	13742	0 %	50 %	0 %	50 %	499074424
25	NC_021200	AC	3	6	14881	14886	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_021200	GC	3	6	15114	15119	0 %	0 %	50 %	50 %	499074426
27	NC_021200	GC	3	6	15207	15212	0 %	0 %	50 %	50 %	499074426
28	NC_021200	TG	3	6	15607	15612	0 %	50 %	50 %	0 %	499074426
29	NC_021200	GC	3	6	16452	16457	0 %	0 %	50 %	50 %	499074427
30	NC_021200	GC	4	8	17778	17785	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NC_021200	CT	3	6	17880	17885	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_021200	AC	3	6	18028	18033	50 %	0 %	0 %	50 %	499074428
33	NC_021200	CG	3	6	19057	19062	0 %	0 %	50 %	50 %	499074429
34	NC_021200	CA	4	8	19495	19502	50 %	0 %	0 %	50 %	499074429
35	NC_021200	GC	3	6	19528	19533	0 %	0 %	50 %	50 %	499074429
36	NC_021200	GA	3	6	19537	19542	50 %	0 %	50 %	0 %	499074429
37	NC_021200	AT	3	6	19611	19616	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021200	CG	3	6	21270	21275	0 %	0 %	50 %	50 %	499074430
39	NC_021200	GC	3	6	21424	21429	0 %	0 %	50 %	50 %	499074430
40	NC_021200	GT	3	6	22886	22891	0 %	50 %	50 %	0 %	499074431
41	NC_021200	GT	3	6	22907	22912	0 %	50 %	50 %	0 %	499074431
42	NC_021200	CG	3	6	23119	23124	0 %	0 %	50 %	50 %	499074431
43	NC_021200	CG	3	6	23689	23694	0 %	0 %	50 %	50 %	499074431
44	NC_021200	GC	3	6	24324	24329	0 %	0 %	50 %	50 %	499074431
45	NC_021200	CG	3	6	24476	24481	0 %	0 %	50 %	50 %	499074431
46	NC_021200	GC	3	6	24557	24562	0 %	0 %	50 %	50 %	499074432
47	NC_021200	CA	3	6	27152	27157	50 %	0 %	0 %	50 %	499074434
48	NC_021200	GC	3	6	27659	27664	0 %	0 %	50 %	50 %	499074435
49	NC_021200	GT	3	6	27920	27925	0 %	50 %	50 %	0 %	499074435
50	NC_021200	GC	3	6	28473	28478	0 %	0 %	50 %	50 %	499074435
51	NC_021200	GC	3	6	28640	28645	0 %	0 %	50 %	50 %	499074435
52	NC_021200	GC	3	6	30768	30773	0 %	0 %	50 %	50 %	499074438
53	NC_021200	CG	3	6	31477	31482	0 %	0 %	50 %	50 %	499074438
54	NC_021200	GC	3	6	31698	31703	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55	NC_021200	CG	3	6	32657	32662	0 %	0 %	50 %	50 %	499074439
56	NC_021200	CG	3	6	33166	33171	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57	NC_021200	CG	3	6	33226	33231	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58	NC_021200	GC	3	6	33570	33575	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59	NC_021200	GC	3	6	33803	33808	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
60	NC_021200	TC	3	6	33846	33851	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_021200	GC	3	6	34200	34205	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
62	NC_021200	CG	5	10	34351	34360	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63	NC_021200	TG	3	6	35939	35944	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021200	GT	3	6	36192	36197	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021200	GC	3	6	36320	36325	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
66	NC_021200	GT	3	6	36697	36702	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021200	CG	3	6	36814	36819	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
68	NC_021200	CG	3	6	37339	37344	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
69	NC_021200	AT	3	6	37750	37755	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021200	CG	3	6	38092	38097	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
71	NC_021200	GC	3	6	38625	38630	0 %	0 %	50 %	50 %	499074440
72	NC_021200	GC	3	6	38923	38928	0 %	0 %	50 %	50 %	499074440
73	NC_021200	GC	3	6	39274	39279	0 %	0 %	50 %	50 %	499074440
74	NC_021200	GC	3	6	40707	40712	0 %	0 %	50 %	50 %	499074440
75	NC_021200	CG	3	6	41346	41351	0 %	0 %	50 %	50 %	499074440
76	NC_021200	CG	3	6	41644	41649	0 %	0 %	50 %	50 %	499074440
77	NC_021200	GC	3	6	42065	42070	0 %	0 %	50 %	50 %	499074440
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80	NC_021200	GC	3	6	42482	42487	0 %	0 %	50 %	50 %	499074440
81	NC_021200	CG	3	6	42568	42573	0 %	0 %	50 %	50 %	499074440
82	NC_021200	GC	3	6	42585	42590	0 %	0 %	50 %	50 %	499074440
83	NC_021200	GC	3	6	42697	42702	0 %	0 %	50 %	50 %	499074440
84	NC_021200	GC	3	6	42704	42709	0 %	0 %	50 %	50 %	499074440
85	NC_021200	TG	3	6	43732	43737	0 %	50 %	50 %	0 %	499074440
86	NC_021200	CG	3	6	43936	43941	0 %	0 %	50 %	50 %	499074440
87	NC_021200	CG	3	6	44271	44276	0 %	0 %	50 %	50 %	499074440
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89	NC_021200	GC	3	6	45220	45225	0 %	0 %	50 %	50 %	499074440
90	NC_021200	CG	4	8	45284	45291	0 %	0 %	50 %	50 %	499074440
91	NC_021200	AG	3	6	46772	46777	50 %	0 %	50 %	0 %	499074440
92	NC_021200	CA	3	6	46816	46821	50 %	0 %	0 %	50 %	499074440
93	NC_021200	GC	3	6	47096	47101	0 %	0 %	50 %	50 %	499074440
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99	NC_021200	CA	3	6	49089	49094	50 %	0 %	0 %	50 %	499074441
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103	NC_021200	GC	3	6	50735	50740	0 %	0 %	50 %	50 %	499074443
104	NC_021200	CG	4	8	51554	51561	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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106	NC_021200	GC	3	6	51772	51777	0 %	0 %	50 %	50 %	499074444
107	NC_021200	GC	5	10	51886	51895	0 %	0 %	50 %	50 %	499074444
108	NC_021200	GC	3	6	51925	51930	0 %	0 %	50 %	50 %	499074444
109	NC_021200	CT	3	6	51943	51948	0 %	50 %	0 %	50 %	499074444
110	NC_021200	GC	3	6	52202	52207	0 %	0 %	50 %	50 %	499074444
111	NC_021200	GC	3	6	52657	52662	0 %	0 %	50 %	50 %	499074445
112	NC_021200	CG	3	6	53514	53519	0 %	0 %	50 %	50 %	499074445
113	NC_021200	GC	3	6	54395	54400	0 %	0 %	50 %	50 %	499074446
114	NC_021200	GC	4	8	55342	55349	0 %	0 %	50 %	50 %	499074446
115	NC_021200	AC	3	6	55556	55561	50 %	0 %	0 %	50 %	499074446
116	NC_021200	CG	4	8	55609	55616	0 %	0 %	50 %	50 %	499074446
117	NC_021200	CT	3	6	55762	55767	0 %	50 %	0 %	50 %	499074447
118	NC_021200	GC	3	6	56647	56652	0 %	0 %	50 %	50 %	499074448
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121	NC_021200	GT	3	6	59869	59874	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_021200	GT	3	6	59954	59959	0 %	50 %	50 %	0 %	499074451
123	NC_021200	CG	3	6	61221	61226	0 %	0 %	50 %	50 %	499074452
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126	NC_021200	GC	3	6	62109	62114	0 %	0 %	50 %	50 %	499074453
127	NC_021200	CG	3	6	62179	62184	0 %	0 %	50 %	50 %	499074453
128	NC_021200	GT	3	6	62827	62832	0 %	50 %	50 %	0 %	499074454
129	NC_021200	AC	3	6	63514	63519	50 %	0 %	0 %	50 %	499074454
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141	NC_021200	CG	3	6	69335	69340	0 %	0 %	50 %	50 %	499074459
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144	NC_021200	CG	3	6	72433	72438	0 %	0 %	50 %	50 %	499074462
145	NC_021200	GC	4	8	72577	72584	0 %	0 %	50 %	50 %	499074462
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