MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis MAP4

Total Repeats: 178

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021200	T	6	6	1572	1577	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021200	T	6	6	1593	1598	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021200	G	6	6	2048	2053	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021200	G	6	6	12469	12474	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021200	G	6	6	35875	35880	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021200	G	6	6	36730	36735	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021200	C	6	6	47536	47541	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
8	NC_021200	C	6	6	76443	76448	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
9	NC_021200	C	7	7	94234	94240	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10	NC_021200	G	6	6	94247	94252	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021200	G	6	6	102055	102060	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021200	G	7	7	131529	131535	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021200	C	6	6	143583	143588	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
14	NC_021200	C	6	6	156283	156288	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
15	NC_021200	G	6	6	186553	186558	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021200	C	6	6	213733	213738	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
17	NC_021200	C	6	6	214488	214493	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
18	NC_021200	G	7	7	240769	240775	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021200	G	6	6	240842	240847	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021200	C	6	6	279918	279923	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
21	NC_021200	A	7	7	332673	332679	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021200	T	6	6	346991	346996	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021200	A	6	6	358952	358957	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021200	G	6	6	426911	426916	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021200	C	6	6	451505	451510	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
26	NC_021200	A	6	6	483301	483306	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021200	A	6	6	509973	509978	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021200	C	6	6	559612	559617	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
29	NC_021200	C	6	6	614898	614903	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
30	NC_021200	C	6	6	616663	616668	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
31	NC_021200	C	6	6	626105	626110	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
32	NC_021200	G	6	6	627303	627308	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021200	C	6	6	730267	730272	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
34	NC_021200	C	6	6	746307	746312	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
35	NC_021200	T	7	7	753623	753629	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021200	C	6	6	753751	753756	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
37	NC_021200	C	6	6	759988	759993	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
38	NC_021200	G	6	6	816955	816960	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021200	T	6	6	830003	830008	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021200	G	6	6	907193	907198	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021200	G	7	7	910900	910906	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021200	G	6	6	926064	926069	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021200	A	6	6	985151	985156	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021200	G	6	6	1073928	1073933	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021200	G	6	6	1112388	1112393	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021200	C	6	6	1114967	1114972	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
47	NC_021200	G	6	6	1114976	1114981	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021200	T	6	6	1118911	1118916	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021200	A	6	6	1118931	1118936	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021200	G	6	6	1118985	1118990	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021200	T	6	6	1147959	1147964	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021200	A	6	6	1198578	1198583	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021200	T	6	6	1323734	1323739	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021200	G	6	6	1333818	1333823	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021200	G	8	8	1389584	1389591	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021200	G	6	6	1398921	1398926	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021200	G	6	6	1398929	1398934	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021200	T	6	6	1399035	1399040	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021200	A	6	6	1419654	1419659	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021200	G	6	6	1446952	1446957	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021200	T	6	6	1459533	1459538	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021200	G	6	6	1461464	1461469	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021200	C	6	6	1462574	1462579	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
64	NC_021200	C	6	6	1462726	1462731	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
65	NC_021200	G	6	6	1488378	1488383	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021200	A	6	6	1496315	1496320	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021200	C	6	6	1561009	1561014	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
68	NC_021200	A	6	6	1581749	1581754	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021200	G	6	6	1635992	1635997	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021200	G	6	6	1755753	1755758	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021200	G	6	6	1758455	1758460	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021200	G	6	6	1768151	1768156	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021200	A	6	6	1825484	1825489	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021200	T	6	6	1828063	1828068	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021200	C	6	6	1845400	1845405	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
76	NC_021200	C	6	6	1880766	1880771	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
77	NC_021200	C	6	6	1999576	1999581	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
78	NC_021200	G	6	6	2124705	2124710	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021200	C	7	7	2154282	2154288	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
80	NC_021200	G	6	6	2163318	2163323	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021200	G	6	6	2163640	2163645	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021200	G	6	6	2164517	2164522	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021200	G	6	6	2313072	2313077	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021200	G	6	6	2314242	2314247	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021200	A	7	7	2318595	2318601	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021200	C	6	6	2322627	2322632	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
87	NC_021200	G	6	6	2438037	2438042	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021200	C	6	6	2525977	2525982	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
89	NC_021200	C	6	6	2544801	2544806	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
90	NC_021200	C	7	7	2554031	2554037	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
91	NC_021200	C	6	6	2557746	2557751	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
92	NC_021200	A	6	6	2644959	2644964	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021200	C	6	6	2647596	2647601	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
94	NC_021200	G	6	6	2721700	2721705	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021200	C	6	6	2766061	2766066	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
96	NC_021200	A	6	6	2849001	2849006	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021200	G	6	6	2861284	2861289	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021200	C	6	6	2869342	2869347	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
99	NC_021200	C	6	6	2873489	2873494	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
100	NC_021200	G	6	6	2900805	2900810	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
101	NC_021200	G	6	6	2930374	2930379	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
102	NC_021200	G	6	6	2991191	2991196	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
103	NC_021200	C	6	6	2997560	2997565	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
104	NC_021200	C	6	6	3015331	3015336	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
105	NC_021200	C	6	6	3015400	3015405	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
106	NC_021200	C	6	6	3033145	3033150	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
107	NC_021200	G	6	6	3033189	3033194	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
108	NC_021200	C	6	6	3064668	3064673	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
109	NC_021200	C	7	7	3092556	3092562	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
110	NC_021200	C	6	6	3093014	3093019	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
111	NC_021200	G	6	6	3142723	3142728	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021200	A	6	6	3143496	3143501	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021200	C	6	6	3144459	3144464	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
114	NC_021200	A	6	6	3149888	3149893	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021200	C	6	6	3168810	3168815	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
116	NC_021200	G	6	6	3170777	3170782	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
117	NC_021200	T	6	6	3289843	3289848	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_021200	C	6	6	3325441	3325446	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
119	NC_021200	G	6	6	3336481	3336486	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
120	NC_021200	C	6	6	3449470	3449475	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
121	NC_021200	A	6	6	3461191	3461196	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_021200	A	7	7	3514897	3514903	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_021200	T	6	6	3538944	3538949	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_021200	G	6	6	3545305	3545310	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
125	NC_021200	C	6	6	3622785	3622790	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
126	NC_021200	C	6	6	3622988	3622993	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
127	NC_021200	C	6	6	3698002	3698007	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
128	NC_021200	G	6	6	3700151	3700156	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
129	NC_021200	C	6	6	3753356	3753361	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
130	NC_021200	C	6	6	3759817	3759822	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
131	NC_021200	C	6	6	3760711	3760716	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
132	NC_021200	G	6	6	3760744	3760749	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
133	NC_021200	G	9	9	3769499	3769507	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
134	NC_021200	G	6	6	3769538	3769543	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
135	NC_021200	A	6	6	3769628	3769633	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_021200	T	7	7	3791261	3791267	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_021200	C	6	6	3791388	3791393	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
138	NC_021200	G	6	6	3840680	3840685	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
139	NC_021200	A	6	6	3847866	3847871	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_021200	C	6	6	3908346	3908351	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
141	NC_021200	A	6	6	3937290	3937295	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_021200	C	6	6	3999695	3999700	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
143	NC_021200	C	6	6	4007116	4007121	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
144	NC_021200	C	6	6	4008899	4008904	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
145	NC_021200	C	6	6	4026703	4026708	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
146	NC_021200	G	8	8	4039861	4039868	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
147	NC_021200	C	6	6	4047755	4047760	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
148	NC_021200	G	6	6	4076846	4076851	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
149	NC_021200	G	6	6	4092047	4092052	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.