MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Streptococcus agalactiae 2-22

Total Repeats: 727

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021195	ATTTAC	2	12	457	468	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	494702402
2	NC_021195	TGCTTA	2	12	9110	9121	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	494702408
3	NC_021195	AGAAAA	2	12	10868	10879	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	494702411
4	NC_021195	GTATTG	2	12	12331	12342	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	494702413
5	NC_021195	GAAAGA	2	12	15347	15358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	494702415
6	NC_021195	ATGAAG	2	12	16080	16091	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021195	TAAGGA	2	12	18046	18057	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021195	ACTAAT	2	12	21198	21209	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_021195	TTAAAT	2	12	28854	28865	50 %	50 %	0 %	0 %	494702420
10	NC_021195	CATAAG	2	12	30990	31001	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	494702423
11	NC_021195	TTAGAC	2	12	45316	45327	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_021195	TTTTAT	2	12	50088	50099	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021195	CGGTAA	2	12	50100	50111	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_021195	GTTCAG	2	12	55750	55761	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	494702443
15	NC_021195	ATTTTA	2	12	58656	58667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	494702445
16	NC_021195	AACGTA	2	12	59481	59492	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	494702445
17	NC_021195	TATTGA	2	12	59557	59568	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	494702445
18	NC_021195	GAAAAA	3	18	59845	59862	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	494702445
19	NC_021195	AATTGA	2	12	62003	62014	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	494702448
20	NC_021195	ACTTAT	2	12	65248	65259	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	494702451
21	NC_021195	TAGTAA	2	12	67786	67797	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	494702453
22	NC_021195	TTACCA	2	12	67862	67873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	494702454
23	NC_021195	AGTACC	2	12	68431	68442	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	494702454
24	NC_021195	TTTTCT	2	12	70597	70608	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	494702455
25	NC_021195	CAAGAA	2	12	73724	73735	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	494702459
26	NC_021195	AGTTCT	2	12	73961	73972	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	494702459
27	NC_021195	AATGGT	2	12	74711	74722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	494702459
28	NC_021195	AATGAA	2	12	76016	76027	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	494702461
29	NC_021195	AAAGAA	2	12	82839	82850	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	494702467
30	NC_021195	GAGCTA	2	12	84218	84229	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	494702468
31	NC_021195	AATTGG	2	12	87157	87168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	494702470
32	NC_021195	GTATCG	2	12	88022	88033	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	494702471
33	NC_021195	TTTTAT	2	12	90600	90611	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	494702473
34	NC_021195	ATATTA	2	12	90902	90913	50 %	50 %	0 %	0 %	494702473
35	NC_021195	TAGATG	2	12	94478	94489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	494702477
36	NC_021195	CAAATT	2	12	95175	95186	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	494702478
37	NC_021195	AAATCA	2	12	98192	98203	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	494702481
38	NC_021195	GAATAC	2	12	99904	99915	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	494702482
39	NC_021195	CAAGAA	2	12	102509	102520	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	494702484
40	NC_021195	TAAGGA	2	12	104836	104847	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021195	ACTAAT	2	12	107988	107999	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_021195	AATTTA	2	12	116397	116408	50 %	50 %	0 %	0 %	494702494
43	NC_021195	CGGTGG	2	12	118803	118814	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	494702497
44	NC_021195	TTAGCT	2	12	121027	121038	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	494702499
45	NC_021195	ATAGTT	2	12	121397	121408	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021195	TGGTAT	2	12	124741	124752	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021195	ACTTTA	2	12	124762	124773	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_021195	ATATTA	2	12	125091	125102	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021195	ATTGAA	2	12	133244	133255	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	494702510
50	NC_021195	TAACAC	2	12	134721	134732	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	494702511
51	NC_021195	TAATTT	2	12	135064	135075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	494702512
52	NC_021195	GTATTA	2	12	137574	137585	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	494702515
53	NC_021195	AAATGA	2	12	143648	143659	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	494702522
54	NC_021195	GCAGAT	2	12	144585	144596	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	494702522
55	NC_021195	ATTTAG	2	12	149296	149307	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	494702525
56	NC_021195	TTCAGT	2	12	149903	149914	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	494702525
57	NC_021195	TGTTAG	2	12	150837	150848	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	494702527
58	NC_021195	ATATTG	2	12	154762	154773	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	494702529
59	NC_021195	AAGTTT	2	12	155578	155589	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021195	TTGGAT	2	12	162426	162437	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	494702538
61	NC_021195	TATTGG	2	12	164066	164077	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	494702540
62	NC_021195	CTCCTT	2	12	168319	168330	0 %	50 %	0 %	50 %	494702544
63	NC_021195	TAAGGA	2	12	173869	173880	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021195	ACTGAG	2	12	187961	187972	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	494702559
65	NC_021195	CAGGCG	2	12	188415	188426	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	494702559
66	NC_021195	TGATGC	2	12	196060	196071	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	494702564
67	NC_021195	AATGAA	2	12	198089	198100	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	494702566
68	NC_021195	CAAATA	2	12	199285	199296	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	494702566
69	NC_021195	AAAATA	2	12	200358	200369	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021195	TTTTTG	2	12	201869	201880	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021195	ATTTAG	2	12	203572	203583	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	494702570
72	NC_021195	AGGTAG	2	12	203782	203793	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	494702570
73	NC_021195	ATATGC	2	12	211903	211914	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	494702577
74	NC_021195	CGTACC	2	12	217017	217028	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	494702581
75	NC_021195	GGTAAA	2	12	217852	217863	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	494702583
76	NC_021195	CAGTAT	2	12	225068	225079	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	494702586
77	NC_021195	AAAGGT	2	12	227730	227741	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	494702589
78	NC_021195	CGCAAT	2	12	230311	230322	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	494702594
79	NC_021195	ATTGAA	2	12	230723	230734	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	494702595
80	NC_021195	ACATCA	2	12	230859	230870	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	494702595
81	NC_021195	ATCGTT	2	12	233400	233411	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	494702601
82	NC_021195	TAAAGG	2	12	234816	234827	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	494702604
83	NC_021195	ATAAAA	2	12	234999	235010	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	494702605
84	NC_021195	TTTCTG	2	12	235830	235841	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	494702606
85	NC_021195	AAATTA	2	12	235874	235885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	494702607
86	NC_021195	ATTGAA	2	12	238803	238814	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	494702611
87	NC_021195	GTAAAG	2	12	239488	239499	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	494702612
88	NC_021195	TAAGGA	2	12	243452	243463	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021195	ACTAAT	2	12	246604	246615	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_021195	TTTTCT	2	12	253288	253299	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	494702622
91	NC_021195	TTTTGA	2	12	254238	254249	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	494702623
92	NC_021195	ACTGAA	2	12	255084	255095	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	494702624
93	NC_021195	GTTTTT	2	12	255579	255590	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021195	AACTCA	2	12	256487	256498	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	494702625
95	NC_021195	TTGTCA	2	12	256644	256655	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	494702625
96	NC_021195	GATATT	2	12	260678	260689	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	494702628
97	NC_021195	TAACGA	2	12	263719	263730	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	494702632
98	NC_021195	TGACCT	2	12	266501	266512	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	494702635
99	NC_021195	CACCGT	2	12	267675	267686	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	494702635
100	NC_021195	GAGGAA	2	12	272479	272490	50 %	0 %	50 %	0 %	494702640
101	NC_021195	CAATGG	2	12	273110	273121	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	494702640
102	NC_021195	GCTTTT	2	12	275370	275381	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	494702642
103	NC_021195	CACCAG	2	12	278926	278937	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	494702646
104	NC_021195	TCAGGT	2	12	282030	282041	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	494702649
105	NC_021195	CAAAGA	2	12	282132	282143	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	494702649
106	NC_021195	TAGTAT	2	12	283418	283429	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	494702650
107	NC_021195	GTTAAC	2	12	287809	287820	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	494702653
108	NC_021195	GTTCAT	2	12	290788	290799	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	494702656
109	NC_021195	GTTGAA	2	12	290905	290916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	494702656
110	NC_021195	ACAAAA	2	12	291958	291969	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_021195	CAGAAG	2	12	292346	292357	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_021195	TTAAAA	2	12	293631	293642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021195	TTGATA	2	12	294797	294808	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	494702659
114	NC_021195	TTTGAT	2	12	299624	299635	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	494702661
115	NC_021195	TTTAGA	2	12	303746	303757	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	494702665
116	NC_021195	TTTCTA	2	12	304442	304453	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	494702665
117	NC_021195	TTAAAT	2	12	305029	305040	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_021195	CTGAAG	2	12	306350	306361	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	494702667
119	NC_021195	TCTGTT	2	12	307423	307434	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	494702668
120	NC_021195	AAATCA	2	12	314514	314525	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	494702674
121	NC_021195	GACAAC	2	12	314614	314625	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	494702674
122	NC_021195	TAAGGA	2	12	317024	317035	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_021195	ACTAAT	2	12	320176	320187	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_021195	ATAATG	2	12	320801	320812	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_021195	TATTGC	2	12	323249	323260	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	494702677
126	NC_021195	TAAACC	2	12	324751	324762	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	494702678
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128	NC_021195	CTTGTT	2	12	329430	329441	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_021195	TACGGT	2	12	333697	333708	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	494702682
130	NC_021195	GTGAAG	2	12	334742	334753	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	494702682
131	NC_021195	TTATTT	2	12	339334	339345	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_021195	GTGTAT	2	12	341765	341776	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	494702688
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134	NC_021195	GCTTGT	2	12	345236	345247	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	494702691
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138	NC_021195	TGGTAG	2	12	352720	352731	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	494702700
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141	NC_021195	TATTAA	2	12	355004	355015	50 %	50 %	0 %	0 %	494702702
142	NC_021195	GTCATG	2	12	355369	355380	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	494702702
143	NC_021195	AAGGTA	2	12	359175	359186	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NC_021195	GTTGAA	2	12	365280	365291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	494702708
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148	NC_021195	AGCTAG	2	12	378998	379009	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	494702722
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160	NC_021195	CAAAGT	2	12	415303	415314	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	494702752
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227	NC_021195	AAAAGG	2	12	574005	574016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
228	NC_021195	TTTAGA	2	12	575521	575532	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
229	NC_021195	CAAGAC	2	12	580299	580310	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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234	NC_021195	GTCAAG	2	12	598175	598186	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	494702900
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351	NC_021195	GCTCCT	2	12	874208	874219	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	494703120
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354	NC_021195	CCCTGT	2	12	876254	876265	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	494703123
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456	NC_021195	AAATGC	2	12	1149064	1149075	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
457	NC_021195	GCAATC	2	12	1149176	1149187	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
458	NC_021195	AGCAAT	2	12	1156215	1156226	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	494703358
459	NC_021195	TAACAA	2	12	1160187	1160198	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
460	NC_021195	TTTATA	2	12	1164267	1164278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
461	NC_021195	TGCTTC	2	12	1164318	1164329	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
462	NC_021195	TTTTCA	2	12	1167527	1167538	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	494703367
463	NC_021195	TCAACT	2	12	1168171	1168182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	494703368
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465	NC_021195	TTTGCT	2	12	1172383	1172394	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	494703375
466	NC_021195	AAAATA	2	12	1173328	1173339	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	494703375
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468	NC_021195	TATCAA	2	12	1178736	1178747	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	494703381
469	NC_021195	TTTAGC	2	12	1185243	1185254	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	494703386
470	NC_021195	AACTTT	2	12	1186053	1186064	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	494703388
471	NC_021195	TAGTTT	2	12	1187497	1187508	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	494703390
472	NC_021195	CGATAA	2	12	1190012	1190023	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	494703394
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484	NC_021195	GTACTT	2	12	1205573	1205584	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	494703406
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487	NC_021195	CAGTTA	2	12	1207393	1207404	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	494703406
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494	NC_021195	ACCATC	2	12	1221313	1221324	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	494703420
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499	NC_021195	AAATCA	2	12	1240018	1240029	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	494703435
500	NC_021195	ATTATC	2	12	1240891	1240902	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	494703436

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