MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus agalactiae 2-22

Total Repeats: 148

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021195	ATGAAG	2	12	16080	16091	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021195	TAAGGA	2	12	18046	18057	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021195	ACTAAT	2	12	21198	21209	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_021195	TTAGAC	2	12	45316	45327	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_021195	TTTTAT	2	12	50088	50099	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021195	CGGTAA	2	12	50100	50111	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_021195	TAAGGA	2	12	104836	104847	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021195	ACTAAT	2	12	107988	107999	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_021195	ATAGTT	2	12	121397	121408	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021195	TGGTAT	2	12	124741	124752	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021195	ACTTTA	2	12	124762	124773	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_021195	ATATTA	2	12	125091	125102	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021195	AAGTTT	2	12	155578	155589	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021195	TAAGGA	2	12	173869	173880	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021195	AAAATA	2	12	200358	200369	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021195	TTTTTG	2	12	201869	201880	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021195	TAAGGA	2	12	243452	243463	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021195	ACTAAT	2	12	246604	246615	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_021195	GTTTTT	2	12	255579	255590	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021195	ACAAAA	2	12	291958	291969	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_021195	CAGAAG	2	12	292346	292357	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_021195	TTAAAA	2	12	293631	293642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021195	TTAAAT	2	12	305029	305040	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021195	TAAGGA	2	12	317024	317035	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021195	ACTAAT	2	12	320176	320187	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_021195	ATAATG	2	12	320801	320812	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021195	CTTGTT	2	12	329430	329441	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_021195	TTATTT	2	12	339334	339345	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021195	TATTAG	2	12	343022	343033	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021195	TGAAAA	2	12	352288	352299	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021195	AAGGTA	2	12	359175	359186	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021195	AAATAA	2	12	377550	377561	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021195	TAAGGA	2	12	391384	391395	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021195	ACTAAT	2	12	394536	394547	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_021195	AAATTG	2	12	411724	411735	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021195	ATGAAA	2	12	423307	423318	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021195	GAAAAA	2	12	431732	431743	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021195	AGAAGC	2	12	433700	433711	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_021195	TGCTAT	2	12	434963	434974	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_021195	AGAATC	2	12	440989	441000	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_021195	AGAAAC	2	12	444167	444178	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_021195	CTTTGA	2	12	452740	452751	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_021195	TGGTAT	2	12	457403	457414	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021195	CTTAAT	2	12	466694	466705	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_021195	TTTATA	2	12	471645	471656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021195	TCGGTA	2	12	472185	472196	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_021195	ATTTTC	2	12	489151	489162	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_021195	CAAGCT	2	12	561502	561513	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_021195	GACAAA	2	12	569269	569280	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_021195	AAAAGG	2	12	574005	574016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021195	TTTAGA	2	12	575521	575532	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021195	CAAGAC	2	12	580299	580310	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_021195	TAAAAC	2	12	582078	582089	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_021195	ATCTTA	2	12	594249	594260	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_021195	ATGAAT	2	12	603135	603146	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021195	AGATAA	2	12	603579	603590	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021195	CTTATT	2	12	609440	609451	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_021195	CAATTT	2	12	613586	613597	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_021195	TGAGAT	2	12	662438	662449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021195	TAGAAC	2	12	698022	698033	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_021195	AGGACT	2	12	698261	698272	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_021195	TTTTTA	2	12	734698	734709	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021195	TTTAGT	2	12	735468	735479	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021195	AAAACA	2	12	740648	740659	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_021195	AAGCAG	2	12	741771	741782	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_021195	AAAGAT	2	12	810768	810779	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021195	AATGCA	2	12	820579	820590	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_021195	GGGGAT	2	12	820962	820973	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021195	AATTGA	2	12	822575	822586	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021195	GCTAAA	2	12	847101	847112	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_021195	ACAATA	2	12	850697	850708	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_021195	TTAAAA	2	12	852184	852195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021195	GGTAAA	2	12	864730	864741	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021195	TAAATT	2	12	873100	873111	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021195	CACCAT	2	12	926886	926897	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_021195	CATCTA	2	12	927597	927608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_021195	ATCTAC	2	12	928669	928680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_021195	TCATTT	2	12	929533	929544	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_021195	ATCCAG	2	12	957107	957118	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_021195	CTTTAA	2	12	957357	957368	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_021195	ATCTTT	2	12	962277	962288	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_021195	ATTCAA	2	12	962295	962306	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_021195	AATTAA	2	12	963111	963122	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021195	ATTAAT	2	12	966078	966089	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021195	ATTTTA	2	12	992372	992383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021195	AAAAAC	2	12	999222	999233	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_021195	CCCGAA	2	12	1025672	1025683	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
88	NC_021195	TGTTAT	2	12	1081418	1081429	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021195	TGAACA	2	12	1082353	1082364	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_021195	AATCAT	2	12	1092641	1092652	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_021195	TAGCTT	2	12	1092664	1092675	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_021195	TGGTTA	2	12	1094040	1094051	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021195	TCTTTT	2	12	1108157	1108168	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_021195	CTTCAT	2	12	1114319	1114330	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_021195	TGCTAA	2	12	1148911	1148922	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_021195	AAATGC	2	12	1149064	1149075	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_021195	GCAATC	2	12	1149176	1149187	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_021195	TAACAA	2	12	1160187	1160198	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_021195	TTTATA	2	12	1164267	1164278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021195	TGCTTC	2	12	1164318	1164329	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_021195	GCTGGA	2	12	1196345	1196356	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_021195	AGTCGC	2	12	1196696	1196707	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_021195	TTGCAA	2	12	1204249	1204260	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_021195	TATTGT	2	12	1247355	1247366	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021195	TAGCAT	2	12	1249491	1249502	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_021195	TACGAA	2	12	1258097	1258108	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_021195	ATGGCT	2	12	1258932	1258943	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_021195	TTTCTC	2	12	1259293	1259304	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_021195	CAGTTG	2	12	1260775	1260786	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_021195	TATCCA	2	12	1269218	1269229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_021195	AATTAA	2	12	1293627	1293638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021195	ACTCCA	2	12	1301648	1301659	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_021195	TTTTCT	2	12	1305844	1305855	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_021195	AAAAAT	2	12	1349660	1349671	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021195	ACCTAA	2	12	1366497	1366508	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_021195	CAAAAA	2	12	1367063	1367074	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_021195	TAGCTA	2	12	1367324	1367335	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_021195	ATTTCA	2	12	1402110	1402121	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_021195	TTTTAT	2	12	1462236	1462247	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_021195	AAATAA	2	12	1474296	1474307	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_021195	ATATTT	2	12	1474561	1474572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_021195	ATAAAA	2	12	1474604	1474615	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_021195	ACTATT	2	12	1475068	1475079	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_021195	ATTAGT	2	12	1475132	1475143	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_021195	ATTTTT	2	12	1486263	1486274	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_021195	CTTTAT	2	12	1487040	1487051	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_021195	TTTCAT	2	12	1507696	1507707	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_021195	AAAAGT	2	12	1546264	1546275	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_021195	AAAGAG	2	12	1564324	1564335	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_021195	TCACCA	2	12	1572521	1572532	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_021195	CAAGAA	2	12	1579758	1579769	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
132	NC_021195	CCTTTA	2	12	1582563	1582574	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_021195	TTCAAT	2	12	1593832	1593843	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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147	NC_021195	TAAATT	2	12	1822906	1822917	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_021195	CTATAA	2	12	1836806	1836817	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.