MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Streptococcus agalactiae 2-22

Total Repeats: 579

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021195	ATTTAC	2	12	457	468	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	494702402
2	NC_021195	TGCTTA	2	12	9110	9121	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	494702408
3	NC_021195	AGAAAA	2	12	10868	10879	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	494702411
4	NC_021195	GTATTG	2	12	12331	12342	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	494702413
5	NC_021195	GAAAGA	2	12	15347	15358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	494702415
6	NC_021195	TTAAAT	2	12	28854	28865	50 %	50 %	0 %	0 %	494702420
7	NC_021195	CATAAG	2	12	30990	31001	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	494702423
8	NC_021195	GTTCAG	2	12	55750	55761	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	494702443
9	NC_021195	ATTTTA	2	12	58656	58667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	494702445
10	NC_021195	AACGTA	2	12	59481	59492	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	494702445
11	NC_021195	TATTGA	2	12	59557	59568	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	494702445
12	NC_021195	GAAAAA	3	18	59845	59862	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	494702445
13	NC_021195	AATTGA	2	12	62003	62014	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	494702448
14	NC_021195	ACTTAT	2	12	65248	65259	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	494702451
15	NC_021195	TAGTAA	2	12	67786	67797	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	494702453
16	NC_021195	TTACCA	2	12	67862	67873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	494702454
17	NC_021195	AGTACC	2	12	68431	68442	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	494702454
18	NC_021195	TTTTCT	2	12	70597	70608	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	494702455
19	NC_021195	CAAGAA	2	12	73724	73735	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	494702459
20	NC_021195	AGTTCT	2	12	73961	73972	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	494702459
21	NC_021195	AATGGT	2	12	74711	74722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	494702459
22	NC_021195	AATGAA	2	12	76016	76027	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	494702461
23	NC_021195	AAAGAA	2	12	82839	82850	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	494702467
24	NC_021195	GAGCTA	2	12	84218	84229	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	494702468
25	NC_021195	AATTGG	2	12	87157	87168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	494702470
26	NC_021195	GTATCG	2	12	88022	88033	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	494702471
27	NC_021195	TTTTAT	2	12	90600	90611	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	494702473
28	NC_021195	ATATTA	2	12	90902	90913	50 %	50 %	0 %	0 %	494702473
29	NC_021195	TAGATG	2	12	94478	94489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	494702477
30	NC_021195	CAAATT	2	12	95175	95186	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	494702478
31	NC_021195	AAATCA	2	12	98192	98203	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	494702481
32	NC_021195	GAATAC	2	12	99904	99915	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	494702482
33	NC_021195	CAAGAA	2	12	102509	102520	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	494702484
34	NC_021195	AATTTA	2	12	116397	116408	50 %	50 %	0 %	0 %	494702494
35	NC_021195	CGGTGG	2	12	118803	118814	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	494702497
36	NC_021195	TTAGCT	2	12	121027	121038	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	494702499
37	NC_021195	ATTGAA	2	12	133244	133255	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	494702510
38	NC_021195	TAACAC	2	12	134721	134732	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	494702511
39	NC_021195	TAATTT	2	12	135064	135075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	494702512
40	NC_021195	GTATTA	2	12	137574	137585	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	494702515
41	NC_021195	AAATGA	2	12	143648	143659	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	494702522
42	NC_021195	GCAGAT	2	12	144585	144596	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	494702522
43	NC_021195	ATTTAG	2	12	149296	149307	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	494702525
44	NC_021195	TTCAGT	2	12	149903	149914	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	494702525
45	NC_021195	TGTTAG	2	12	150837	150848	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	494702527
46	NC_021195	ATATTG	2	12	154762	154773	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	494702529
47	NC_021195	TTGGAT	2	12	162426	162437	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	494702538
48	NC_021195	TATTGG	2	12	164066	164077	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	494702540
49	NC_021195	CTCCTT	2	12	168319	168330	0 %	50 %	0 %	50 %	494702544
50	NC_021195	ACTGAG	2	12	187961	187972	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	494702559
51	NC_021195	CAGGCG	2	12	188415	188426	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	494702559
52	NC_021195	TGATGC	2	12	196060	196071	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	494702564
53	NC_021195	AATGAA	2	12	198089	198100	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	494702566
54	NC_021195	CAAATA	2	12	199285	199296	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	494702566
55	NC_021195	ATTTAG	2	12	203572	203583	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	494702570
56	NC_021195	AGGTAG	2	12	203782	203793	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	494702570
57	NC_021195	ATATGC	2	12	211903	211914	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	494702577
58	NC_021195	CGTACC	2	12	217017	217028	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	494702581
59	NC_021195	GGTAAA	2	12	217852	217863	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	494702583
60	NC_021195	CAGTAT	2	12	225068	225079	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	494702586
61	NC_021195	AAAGGT	2	12	227730	227741	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	494702589
62	NC_021195	CGCAAT	2	12	230311	230322	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	494702594
63	NC_021195	ATTGAA	2	12	230723	230734	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	494702595
64	NC_021195	ACATCA	2	12	230859	230870	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	494702595
65	NC_021195	ATCGTT	2	12	233400	233411	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	494702601
66	NC_021195	TAAAGG	2	12	234816	234827	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	494702604
67	NC_021195	ATAAAA	2	12	234999	235010	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	494702605
68	NC_021195	TTTCTG	2	12	235830	235841	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	494702606
69	NC_021195	AAATTA	2	12	235874	235885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	494702607
70	NC_021195	ATTGAA	2	12	238803	238814	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	494702611
71	NC_021195	GTAAAG	2	12	239488	239499	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	494702612
72	NC_021195	TTTTCT	2	12	253288	253299	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	494702622
73	NC_021195	TTTTGA	2	12	254238	254249	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	494702623
74	NC_021195	ACTGAA	2	12	255084	255095	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	494702624
75	NC_021195	AACTCA	2	12	256487	256498	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	494702625
76	NC_021195	TTGTCA	2	12	256644	256655	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	494702625
77	NC_021195	GATATT	2	12	260678	260689	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	494702628
78	NC_021195	TAACGA	2	12	263719	263730	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	494702632
79	NC_021195	TGACCT	2	12	266501	266512	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	494702635
80	NC_021195	CACCGT	2	12	267675	267686	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	494702635
81	NC_021195	GAGGAA	2	12	272479	272490	50 %	0 %	50 %	0 %	494702640
82	NC_021195	CAATGG	2	12	273110	273121	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	494702640
83	NC_021195	GCTTTT	2	12	275370	275381	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	494702642
84	NC_021195	CACCAG	2	12	278926	278937	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	494702646
85	NC_021195	TCAGGT	2	12	282030	282041	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	494702649
86	NC_021195	CAAAGA	2	12	282132	282143	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	494702649
87	NC_021195	TAGTAT	2	12	283418	283429	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	494702650
88	NC_021195	GTTAAC	2	12	287809	287820	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	494702653
89	NC_021195	GTTCAT	2	12	290788	290799	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	494702656
90	NC_021195	GTTGAA	2	12	290905	290916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	494702656
91	NC_021195	TTGATA	2	12	294797	294808	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	494702659
92	NC_021195	TTTGAT	2	12	299624	299635	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	494702661
93	NC_021195	TTTAGA	2	12	303746	303757	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	494702665
94	NC_021195	TTTCTA	2	12	304442	304453	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	494702665
95	NC_021195	CTGAAG	2	12	306350	306361	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	494702667
96	NC_021195	TCTGTT	2	12	307423	307434	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	494702668
97	NC_021195	AAATCA	2	12	314514	314525	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	494702674
98	NC_021195	GACAAC	2	12	314614	314625	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	494702674
99	NC_021195	TATTGC	2	12	323249	323260	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	494702677
100	NC_021195	TAAACC	2	12	324751	324762	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	494702678
101	NC_021195	GGTAGT	2	12	328057	328068	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	494702680
102	NC_021195	TACGGT	2	12	333697	333708	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	494702682
103	NC_021195	GTGAAG	2	12	334742	334753	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	494702682
104	NC_021195	GTGTAT	2	12	341765	341776	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	494702688
105	NC_021195	GCTTGT	2	12	345236	345247	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	494702691
106	NC_021195	CAGTTT	2	12	348245	348256	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	494702696
107	NC_021195	GCTTTG	2	12	350001	350012	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	494702698
108	NC_021195	TGGTAG	2	12	352720	352731	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	494702700
109	NC_021195	TCAAAA	2	12	353876	353887	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	494702702
110	NC_021195	AGCTAA	2	12	354839	354850	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	494702702
111	NC_021195	TATTAA	2	12	355004	355015	50 %	50 %	0 %	0 %	494702702
112	NC_021195	GTCATG	2	12	355369	355380	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	494702702
113	NC_021195	GTTGAA	2	12	365280	365291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	494702708
114	NC_021195	AAATCA	2	12	366084	366095	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	494702709
115	NC_021195	ATTGAT	2	12	372491	372502	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	494702713
116	NC_021195	AGCTAG	2	12	378998	379009	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	494702722
117	NC_021195	GCACAA	2	12	379789	379800	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	494702724
118	NC_021195	AGCTAA	2	12	382227	382238	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	494702728
119	NC_021195	ATGTGA	2	12	384554	384565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	494702731
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229	NC_021195	TTGGAC	2	12	744611	744622	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	494703019
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231	NC_021195	TTGATT	2	12	746121	746132	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	494703021
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342	NC_021195	ATTTTG	2	12	1096573	1096584	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	494703313
343	NC_021195	ATCTGT	2	12	1098533	1098544	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	494703315
344	NC_021195	TAACCT	2	12	1098982	1098993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	494703316
345	NC_021195	GATATT	2	12	1099094	1099105	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	494703316
346	NC_021195	CTAGCT	2	12	1099902	1099913	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	494703316
347	NC_021195	AAAGCA	2	12	1100055	1100066	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	494703316
348	NC_021195	GAAATA	2	12	1103866	1103877	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	494703319
349	NC_021195	GCTTCT	2	12	1108526	1108537	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	494703323
350	NC_021195	TAGCTT	2	12	1108578	1108589	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	494703323
351	NC_021195	AGCCTC	2	12	1112440	1112451	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	494703326
352	NC_021195	CGATGG	2	12	1112516	1112527	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	494703326
353	NC_021195	TCTTCA	2	12	1118994	1119005	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	494703332
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359	NC_021195	GCCTTT	2	12	1130401	1130412	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	494703344
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365	NC_021195	TTTGCT	2	12	1172383	1172394	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	494703375
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381	NC_021195	GTACTT	2	12	1205573	1205584	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	494703406
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411	NC_021195	CTGTAA	2	12	1309345	1309356	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	494703482
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442	NC_021195	TGGTGC	2	12	1411069	1411080	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	494703584
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453	NC_021195	TTCTGA	2	12	1447536	1447547	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	494703622
454	NC_021195	AGAAAA	2	12	1451090	1451101	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	494703626
455	NC_021195	AACTGC	2	12	1454187	1454198	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	494703629
456	NC_021195	TAAATC	2	12	1460043	1460054	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	494703633
457	NC_021195	TACCAG	2	12	1463664	1463675	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	494703636
458	NC_021195	ATCAAT	2	12	1466638	1466649	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	494703638
459	NC_021195	CTTTTT	2	12	1469364	1469375	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	494703640
460	NC_021195	GAATTA	2	12	1470108	1470119	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	494703640
461	NC_021195	AAGGAC	2	12	1470169	1470180	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	494703640
462	NC_021195	AAAGAA	2	12	1470766	1470777	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	494703641
463	NC_021195	TTACCT	2	12	1472868	1472879	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	494703644
464	NC_021195	TAATCA	2	12	1476818	1476829	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	494703649
465	NC_021195	AATGGA	2	12	1482030	1482041	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	494703651
466	NC_021195	CATATC	2	12	1482106	1482117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	494703651
467	NC_021195	CAATAT	2	12	1482495	1482506	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	494703651
468	NC_021195	ACGAAC	2	12	1482568	1482579	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	494703651
469	NC_021195	CCTGAT	2	12	1482995	1483006	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	494703651
470	NC_021195	ATCTTC	2	12	1484247	1484258	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	494703653
471	NC_021195	TTCATC	2	12	1489321	1489332	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	494703659
472	NC_021195	ATAGCC	2	12	1491115	1491126	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	494703661
473	NC_021195	ATCCTC	2	12	1494385	1494396	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	494703665
474	NC_021195	CTACGA	2	12	1501089	1501100	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	494703668
475	NC_021195	TATCAA	2	12	1502939	1502950	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	494703670
476	NC_021195	AACCAA	2	12	1506740	1506751	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	494703675
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478	NC_021195	ACTGAT	2	12	1508656	1508667	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	494703677
479	NC_021195	GACTTT	2	12	1511062	1511073	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	494703678
480	NC_021195	CATAAT	2	12	1519194	1519205	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	494703684
481	NC_021195	ACTGTT	2	12	1519226	1519237	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	494703684
482	NC_021195	ATTAAT	2	12	1520779	1520790	50 %	50 %	0 %	0 %	494703685
483	NC_021195	TCTTTT	2	12	1522337	1522348	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	494703686
484	NC_021195	CTAACC	2	12	1529960	1529971	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	494703694
485	NC_021195	AGAAAA	2	12	1531980	1531991	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	494703696
486	NC_021195	ACAGCA	2	12	1532377	1532388	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	494703696
487	NC_021195	TTGATA	2	12	1533698	1533709	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	494703698
488	NC_021195	CTTCAA	2	12	1537546	1537557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	494703702
489	NC_021195	ATCTAA	2	12	1541271	1541282	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	494703706
490	NC_021195	GGAACA	2	12	1542092	1542103	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	494703707
491	NC_021195	GCACGA	2	12	1542203	1542214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494703707
492	NC_021195	TCGAAT	2	12	1543517	1543528	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	494703708
493	NC_021195	GTTCTT	2	12	1544913	1544924	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	494703708
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499	NC_021195	TATCAT	2	12	1569194	1569205	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	494703735
500	NC_021195	TATCTT	2	12	1573205	1573216	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	494703736

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