MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Mycobacterium tuberculosis str. Haarlem/NITR202

Total Repeats: 11272

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021192	CGAC	2	8	311	318	25 %	0 %	25 %	50 %	494690660
2	NC_021192	CGTT	2	8	527	534	0 %	50 %	25 %	25 %	494690660
3	NC_021192	CCCG	2	8	589	596	0 %	0 %	25 %	75 %	494690660
4	NC_021192	GGCA	2	8	660	667	25 %	0 %	50 %	25 %	494690660
5	NC_021192	CCCA	2	8	918	925	25 %	0 %	0 %	75 %	494690660
6	NC_021192	CCGA	2	8	1724	1731	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7	NC_021192	GTGG	2	8	2127	2134	0 %	25 %	75 %	0 %	494690661
8	NC_021192	GCCA	2	8	2145	2152	25 %	0 %	25 %	50 %	494690661
9	NC_021192	TCAG	2	8	2487	2494	25 %	25 %	25 %	25 %	494690661
10	NC_021192	CGTT	2	8	2710	2717	0 %	50 %	25 %	25 %	494690661
11	NC_021192	ACGG	2	8	3061	3068	25 %	0 %	50 %	25 %	494690661
12	NC_021192	GCCT	2	8	3123	3130	0 %	25 %	25 %	50 %	494690661
13	NC_021192	CGTC	2	8	3268	3275	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14	NC_021192	GGTA	2	8	3448	3455	25 %	25 %	50 %	0 %	494690662
15	NC_021192	GGTT	2	8	3630	3637	0 %	50 %	50 %	0 %	494690662
16	NC_021192	CCGC	2	8	3858	3865	0 %	0 %	25 %	75 %	494690662
17	NC_021192	TCCG	2	8	4558	4565	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
18	NC_021192	CCAC	2	8	5470	5477	25 %	0 %	0 %	75 %	494690664
19	NC_021192	ACCG	2	8	5489	5496	25 %	0 %	25 %	50 %	494690664
20	NC_021192	CAAG	2	8	5684	5691	50 %	0 %	25 %	25 %	494690664
21	NC_021192	CGCC	2	8	5780	5787	0 %	0 %	25 %	75 %	494690664
22	NC_021192	CGGC	2	8	6595	6602	0 %	0 %	50 %	50 %	494690664
23	NC_021192	GACA	2	8	7273	7280	50 %	0 %	25 %	25 %	494690664
24	NC_021192	CGGT	2	8	7493	7500	0 %	25 %	50 %	25 %	494690665
25	NC_021192	CGAG	2	8	8414	8421	25 %	0 %	50 %	25 %	494690666
26	NC_021192	CCAC	2	8	8944	8951	25 %	0 %	0 %	75 %	494690666
27	NC_021192	CGAC	2	8	9312	9319	25 %	0 %	25 %	50 %	494690666
28	NC_021192	GGTT	2	8	9540	9547	0 %	50 %	50 %	0 %	494690666
29	NC_021192	CCCG	2	8	10089	10096	0 %	0 %	25 %	75 %	494690667
30	NC_021192	GCAC	2	8	11555	11562	25 %	0 %	25 %	50 %	494690669
31	NC_021192	GAGC	2	8	12039	12046	25 %	0 %	50 %	25 %	494690670
32	NC_021192	CTCA	2	8	12250	12257	25 %	25 %	0 %	50 %	494690670
33	NC_021192	GCCC	2	8	12400	12407	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
34	NC_021192	AACC	2	8	13285	13292	50 %	0 %	0 %	50 %	494690672
35	NC_021192	CCCG	2	8	13394	13401	0 %	0 %	25 %	75 %	494690672
36	NC_021192	ATTC	2	8	13638	13645	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_021192	ACCC	2	8	14045	14052	25 %	0 %	0 %	75 %	494690674
38	NC_021192	TGAT	2	8	14082	14089	25 %	50 %	25 %	0 %	494690674
39	NC_021192	TGCT	2	8	14129	14136	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_021192	GCCC	2	8	14610	14617	0 %	0 %	25 %	75 %	494690675
41	NC_021192	GGGC	2	8	15383	15390	0 %	0 %	75 %	25 %	494690676
42	NC_021192	CTGA	2	8	15838	15845	25 %	25 %	25 %	25 %	494690677
43	NC_021192	TGGC	2	8	15980	15987	0 %	25 %	50 %	25 %	494690677
44	NC_021192	GCTT	2	8	16038	16045	0 %	50 %	25 %	25 %	494690677
45	NC_021192	CAGT	2	8	16066	16073	25 %	25 %	25 %	25 %	494690677
46	NC_021192	CGGT	2	8	16436	16443	0 %	25 %	50 %	25 %	494690677
47	NC_021192	GCCG	2	8	16498	16505	0 %	0 %	50 %	50 %	494690677
48	NC_021192	CGGG	2	8	17728	17735	0 %	0 %	75 %	25 %	494690678
49	NC_021192	CTGG	2	8	17836	17843	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
50	NC_021192	GTGC	2	8	18330	18337	0 %	25 %	50 %	25 %	494690679
51	NC_021192	GCCG	2	8	18348	18355	0 %	0 %	50 %	50 %	494690679
52	NC_021192	CCGC	2	8	18707	18714	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
53	NC_021192	CCAG	2	8	20650	20657	25 %	0 %	25 %	50 %	494690680
54	NC_021192	CACC	2	8	20833	20840	25 %	0 %	0 %	75 %	494690680
55	NC_021192	CGGG	2	8	21788	21795	0 %	0 %	75 %	25 %	494690681
56	NC_021192	GCCG	2	8	21879	21886	0 %	0 %	50 %	50 %	494690681
57	NC_021192	GCTG	2	8	22259	22266	0 %	25 %	50 %	25 %	494690681
58	NC_021192	CGGC	2	8	22279	22286	0 %	0 %	50 %	50 %	494690681
59	NC_021192	GCCG	2	8	22950	22957	0 %	0 %	50 %	50 %	494690681
60	NC_021192	CCCA	2	8	22962	22969	25 %	0 %	0 %	75 %	494690681
61	NC_021192	GCTG	2	8	24102	24109	0 %	25 %	50 %	25 %	494690683
62	NC_021192	CGGC	2	8	24150	24157	0 %	0 %	50 %	50 %	494690683
63	NC_021192	GCCG	2	8	24245	24252	0 %	0 %	50 %	50 %	494690683
64	NC_021192	CGGG	2	8	24320	24327	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
65	NC_021192	TCAA	2	8	25413	25420	50 %	25 %	0 %	25 %	494690686
66	NC_021192	GGCC	2	8	25453	25460	0 %	0 %	50 %	50 %	494690686
67	NC_021192	GCTC	2	8	26375	26382	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
68	NC_021192	CCAA	2	8	26592	26599	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_021192	CAGC	2	8	26658	26665	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
70	NC_021192	AGGG	2	8	26800	26807	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021192	CGGC	2	8	27460	27467	0 %	0 %	50 %	50 %	494690687
72	NC_021192	CCGG	2	8	27947	27954	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
73	NC_021192	GCTC	2	8	28503	28510	0 %	25 %	25 %	50 %	494690689
74	NC_021192	TGCG	2	8	28642	28649	0 %	25 %	50 %	25 %	494690689
75	NC_021192	CCGG	2	8	28903	28910	0 %	0 %	50 %	50 %	494690689
76	NC_021192	CACG	2	8	29585	29592	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
77	NC_021192	ACCG	2	8	29666	29673	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
78	NC_021192	CCGG	2	8	29982	29989	0 %	0 %	50 %	50 %	494690690
79	NC_021192	GTCG	2	8	30158	30165	0 %	25 %	50 %	25 %	494690690
80	NC_021192	ACCA	2	8	30961	30968	50 %	0 %	0 %	50 %	494690690
81	NC_021192	CGAG	2	8	31292	31299	25 %	0 %	50 %	25 %	494690691
82	NC_021192	CGAC	2	8	31588	31595	25 %	0 %	25 %	50 %	494690692
83	NC_021192	GCCG	2	8	32313	32320	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
84	NC_021192	CCGA	2	8	33298	33305	25 %	0 %	25 %	50 %	494690695
85	NC_021192	GCTA	2	8	33670	33677	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
86	NC_021192	GGCC	2	8	34418	34425	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
87	NC_021192	GATC	2	8	35245	35252	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
88	NC_021192	CCAC	2	8	36056	36063	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
89	NC_021192	ACCG	2	8	36448	36455	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
90	NC_021192	CTGG	2	8	36791	36798	0 %	25 %	50 %	25 %	494690696
91	NC_021192	TGCC	2	8	36826	36833	0 %	25 %	25 %	50 %	494690696
92	NC_021192	GCAT	2	8	37183	37190	25 %	25 %	25 %	25 %	494690697
93	NC_021192	GCTG	2	8	37697	37704	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
94	NC_021192	AACG	2	8	38450	38457	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
95	NC_021192	CCGA	2	8	38511	38518	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
96	NC_021192	CCAC	2	8	38667	38674	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
97	NC_021192	CAGC	2	8	38894	38901	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
98	NC_021192	CCGG	2	8	39389	39396	0 %	0 %	50 %	50 %	494690698
99	NC_021192	GGCC	2	8	39920	39927	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
100	NC_021192	CGAT	2	8	40367	40374	25 %	25 %	25 %	25 %	494690699
101	NC_021192	GCCG	2	8	40667	40674	0 %	0 %	50 %	50 %	494690699
102	NC_021192	ACCG	2	8	40912	40919	25 %	0 %	25 %	50 %	494690699
103	NC_021192	GCGT	2	8	40938	40945	0 %	25 %	50 %	25 %	494690699
104	NC_021192	CTGC	2	8	41642	41649	0 %	25 %	25 %	50 %	494690700
105	NC_021192	CCAC	2	8	41653	41660	25 %	0 %	0 %	75 %	494690700
106	NC_021192	CGAT	2	8	41662	41669	25 %	25 %	25 %	25 %	494690700
107	NC_021192	GGCC	2	8	42358	42365	0 %	0 %	50 %	50 %	494690701
108	NC_021192	CCCG	2	8	42949	42956	0 %	0 %	25 %	75 %	494690702
109	NC_021192	CGGG	2	8	42978	42985	0 %	0 %	75 %	25 %	494690702
110	NC_021192	CGAC	2	8	43613	43620	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
111	NC_021192	GAGC	2	8	43993	44000	25 %	0 %	50 %	25 %	494690703
112	NC_021192	GGCT	2	8	44021	44028	0 %	25 %	50 %	25 %	494690703
113	NC_021192	GGGC	2	8	45147	45154	0 %	0 %	75 %	25 %	494690703
114	NC_021192	CGGC	2	8	45242	45249	0 %	0 %	50 %	50 %	494690703
115	NC_021192	GCCG	2	8	46204	46211	0 %	0 %	50 %	50 %	494690703
116	NC_021192	TTGC	2	8	46367	46374	0 %	50 %	25 %	25 %	494690703
117	NC_021192	CCGC	2	8	46516	46523	0 %	0 %	25 %	75 %	494690703
118	NC_021192	CCGC	2	8	46549	46556	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
119	NC_021192	GGTC	2	8	46657	46664	0 %	25 %	50 %	25 %	494690704
120	NC_021192	CTAC	2	8	46981	46988	25 %	25 %	0 %	50 %	494690704
121	NC_021192	CGGG	2	8	47202	47209	0 %	0 %	75 %	25 %	494690704
122	NC_021192	GCAG	2	8	47275	47282	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
123	NC_021192	GTGC	2	8	48173	48180	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
124	NC_021192	GCCG	2	8	48454	48461	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
125	NC_021192	CAGC	2	8	49628	49635	25 %	0 %	25 %	50 %	494690706
126	NC_021192	CGGG	2	8	49816	49823	0 %	0 %	75 %	25 %	494690706
127	NC_021192	GCCG	2	8	49916	49923	0 %	0 %	50 %	50 %	494690706
128	NC_021192	CTCA	2	8	50849	50856	25 %	25 %	0 %	50 %	494690707
129	NC_021192	CGCT	2	8	50988	50995	0 %	25 %	25 %	50 %	494690707
130	NC_021192	GGTA	2	8	51853	51860	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_021192	CTGG	2	8	52446	52453	0 %	25 %	50 %	25 %	494690710
132	NC_021192	ACCA	2	8	53464	53471	50 %	0 %	0 %	50 %	494690712
133	NC_021192	GTGC	2	8	54345	54352	0 %	25 %	50 %	25 %	494690712
134	NC_021192	CCCG	2	8	55373	55380	0 %	0 %	25 %	75 %	494690712
135	NC_021192	GGCC	2	8	56043	56050	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
136	NC_021192	CGCT	2	8	56753	56760	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
137	NC_021192	GCGG	2	8	58483	58490	0 %	0 %	75 %	25 %	494690714
138	NC_021192	CCTT	2	8	58566	58573	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_021192	GTTC	2	8	58697	58704	0 %	50 %	25 %	25 %	494690715
140	NC_021192	AGCG	2	8	58902	58909	25 %	0 %	50 %	25 %	494690715
141	NC_021192	CGGC	2	8	59638	59645	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
142	NC_021192	GCGG	2	8	59650	59657	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
143	NC_021192	CAGC	2	8	61166	61173	25 %	0 %	25 %	50 %	494690718
144	NC_021192	TGGC	2	8	61784	61791	0 %	25 %	50 %	25 %	494690718
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284	NC_021192	CCGG	2	8	114832	114839	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
285	NC_021192	CGGG	2	8	114894	114901	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
286	NC_021192	GCTG	2	8	115084	115091	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
287	NC_021192	CCGG	2	8	115186	115193	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
288	NC_021192	CCGG	2	8	115344	115351	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
289	NC_021192	CGAC	2	8	115567	115574	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
290	NC_021192	ACGG	2	8	115709	115716	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
291	NC_021192	CTGT	2	8	115796	115803	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
292	NC_021192	GCGG	2	8	115809	115816	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
293	NC_021192	TCGT	2	8	116399	116406	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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295	NC_021192	CCGT	2	8	117655	117662	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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321	NC_021192	CTGT	2	8	129787	129794	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
322	NC_021192	GCGA	2	8	129973	129980	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
323	NC_021192	CGGG	2	8	130016	130023	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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331	NC_021192	GTCG	2	8	133280	133287	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
332	NC_021192	GCCA	2	8	133372	133379	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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358	NC_021192	ACCG	2	8	144092	144099	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
359	NC_021192	CCAC	2	8	144227	144234	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
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386	NC_021192	AGCG	2	8	151994	152001	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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388	NC_021192	GCTG	2	8	154387	154394	0 %	25 %	50 %	25 %	494690790
389	NC_021192	ACAA	2	8	154529	154536	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
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391	NC_021192	CGCC	2	8	154731	154738	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
392	NC_021192	CCGG	2	8	154755	154762	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
393	NC_021192	GCGT	3	12	154783	154794	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
394	NC_021192	TGTC	2	8	154989	154996	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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400	NC_021192	TGGT	2	8	155899	155906	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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405	NC_021192	GGCT	2	8	156917	156924	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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418	NC_021192	CCCG	2	8	160828	160835	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
419	NC_021192	GGGT	2	8	161418	161425	0 %	25 %	75 %	0 %	494690795
420	NC_021192	GCTG	2	8	161548	161555	0 %	25 %	50 %	25 %	494690795
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