MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis str. Haarlem/NITR202

Total Repeats: 4491

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021192	CCGA	2	8	1724	1731	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NC_021192	CGTC	2	8	3268	3275	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3	NC_021192	TCCG	2	8	4558	4565	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4	NC_021192	GCCC	2	8	12400	12407	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5	NC_021192	ATTC	2	8	13638	13645	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_021192	TGCT	2	8	14129	14136	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_021192	CTGG	2	8	17836	17843	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8	NC_021192	CCGC	2	8	18707	18714	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
9	NC_021192	CGGG	2	8	24320	24327	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
10	NC_021192	GCTC	2	8	26375	26382	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11	NC_021192	CCAA	2	8	26592	26599	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_021192	CAGC	2	8	26658	26665	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13	NC_021192	AGGG	2	8	26800	26807	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021192	CCGG	2	8	27947	27954	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_021192	CACG	2	8	29585	29592	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
16	NC_021192	ACCG	2	8	29666	29673	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
17	NC_021192	GCCG	2	8	32313	32320	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_021192	GCTA	2	8	33670	33677	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_021192	GGCC	2	8	34418	34425	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_021192	GATC	2	8	35245	35252	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_021192	CCAC	2	8	36056	36063	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
22	NC_021192	ACCG	2	8	36448	36455	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
23	NC_021192	GCTG	2	8	37697	37704	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
24	NC_021192	AACG	2	8	38450	38457	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_021192	CCGA	2	8	38511	38518	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
26	NC_021192	CCAC	2	8	38667	38674	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
27	NC_021192	CAGC	2	8	38894	38901	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
28	NC_021192	GGCC	2	8	39920	39927	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29	NC_021192	CGAC	2	8	43613	43620	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
30	NC_021192	CCGC	2	8	46549	46556	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
31	NC_021192	GCAG	2	8	47275	47282	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
32	NC_021192	GTGC	2	8	48173	48180	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
33	NC_021192	GCCG	2	8	48454	48461	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_021192	GGTA	2	8	51853	51860	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021192	GGCC	2	8	56043	56050	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36	NC_021192	CGCT	2	8	56753	56760	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
37	NC_021192	CCTT	2	8	58566	58573	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_021192	CGGC	2	8	59638	59645	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_021192	GCGG	2	8	59650	59657	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
40	NC_021192	CGGG	2	8	66949	66956	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
41	NC_021192	CGCC	2	8	66966	66973	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
42	NC_021192	CGGC	2	8	67008	67015	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_021192	CGGT	2	8	67044	67051	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
44	NC_021192	CCGG	2	8	67425	67432	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_021192	GGCA	2	8	68290	68297	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
46	NC_021192	TGCT	2	8	68457	68464	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_021192	TCGC	2	8	68482	68489	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
48	NC_021192	CGGT	2	8	68730	68737	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
49	NC_021192	ATCG	2	8	69420	69427	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_021192	GCTC	2	8	70074	70081	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
51	NC_021192	TCGA	2	8	70200	70207	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_021192	GCGT	2	8	70826	70833	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
53	NC_021192	GCAT	2	8	78155	78162	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_021192	CGGT	2	8	78751	78758	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
55	NC_021192	CGGT	2	8	78936	78943	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
56	NC_021192	GAAC	2	8	79214	79221	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_021192	CGGG	2	8	79288	79295	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
58	NC_021192	TTGC	2	8	81052	81059	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_021192	GAAT	2	8	81650	81657	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021192	ACCG	2	8	81750	81757	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
61	NC_021192	GGAT	2	8	83186	83193	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021192	CCCG	2	8	83451	83458	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
63	NC_021192	CCGG	2	8	83873	83880	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_021192	TGCG	2	8	95814	95821	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
65	NC_021192	CCGG	2	8	96659	96666	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
66	NC_021192	CGAA	2	8	96877	96884	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
67	NC_021192	CGCT	2	8	97139	97146	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
68	NC_021192	TGCG	2	8	98358	98365	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
69	NC_021192	ACCG	2	8	99541	99548	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
70	NC_021192	ATCG	2	8	99581	99588	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
71	NC_021192	CGGC	2	8	101026	101033	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
72	NC_021192	CGGG	2	8	101614	101621	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
73	NC_021192	CGGG	2	8	102838	102845	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
74	NC_021192	GCTG	2	8	102872	102879	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
75	NC_021192	CTTT	2	8	105474	105481	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_021192	CATA	2	8	106898	106905	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_021192	TCGA	2	8	107363	107370	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
78	NC_021192	CGAA	2	8	107491	107498	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_021192	GCTC	2	8	111207	111214	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
80	NC_021192	CGGC	2	8	111675	111682	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
81	NC_021192	AGCG	2	8	112210	112217	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
82	NC_021192	CGGG	2	8	114678	114685	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
83	NC_021192	TTGT	2	8	114799	114806	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021192	CCGG	2	8	114832	114839	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
85	NC_021192	CGGG	2	8	114894	114901	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
86	NC_021192	GCTG	2	8	115084	115091	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
87	NC_021192	CCGG	2	8	115186	115193	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
88	NC_021192	CCGG	2	8	115344	115351	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
89	NC_021192	CGAC	2	8	115567	115574	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
90	NC_021192	ACGG	2	8	115709	115716	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
91	NC_021192	CTGT	2	8	115796	115803	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
92	NC_021192	GCGG	2	8	115809	115816	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
93	NC_021192	TCGT	2	8	116399	116406	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
94	NC_021192	CCGA	3	12	116774	116785	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
95	NC_021192	CCGT	2	8	117655	117662	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
96	NC_021192	CACC	2	8	119568	119575	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
97	NC_021192	TCCT	2	8	119622	119629	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_021192	CGAC	2	8	119846	119853	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
99	NC_021192	TCGC	2	8	120121	120128	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
100	NC_021192	ACGC	2	8	121764	121771	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
101	NC_021192	CGGT	2	8	124182	124189	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
102	NC_021192	ACCC	2	8	124220	124227	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
103	NC_021192	GGCG	2	8	126028	126035	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
104	NC_021192	GCTG	2	8	127850	127857	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
105	NC_021192	TGCA	2	8	128536	128543	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
106	NC_021192	GCCG	2	8	128728	128735	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
107	NC_021192	CCAG	2	8	129370	129377	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
108	NC_021192	CTGT	2	8	129787	129794	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
109	NC_021192	GCGA	2	8	129973	129980	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
110	NC_021192	CGGG	2	8	130016	130023	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
111	NC_021192	GCTC	2	8	130523	130530	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
112	NC_021192	CCCA	2	8	131023	131030	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
113	NC_021192	CGGG	2	8	133212	133219	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
114	NC_021192	GTCG	2	8	133280	133287	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
115	NC_021192	GCCA	2	8	133372	133379	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
116	NC_021192	GGCT	2	8	134078	134085	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
117	NC_021192	GGCC	2	8	134784	134791	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
118	NC_021192	AGCG	2	8	134937	134944	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
119	NC_021192	CTAC	2	8	135629	135636	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_021192	CCGG	2	8	135789	135796	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
121	NC_021192	CGCA	2	8	135863	135870	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
122	NC_021192	TTCT	2	8	139077	139084	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_021192	CTGA	2	8	140173	140180	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
124	NC_021192	CGGC	2	8	142748	142755	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
125	NC_021192	GCCG	2	8	143111	143118	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
126	NC_021192	GGCC	2	8	143401	143408	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
127	NC_021192	ACGC	2	8	143822	143829	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
128	NC_021192	ACCG	2	8	144092	144099	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
129	NC_021192	CCAC	2	8	144227	144234	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
130	NC_021192	CGAC	2	8	145631	145638	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
131	NC_021192	GCGT	2	8	147629	147636	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
132	NC_021192	CAAG	2	8	148112	148119	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
133	NC_021192	GCGG	2	8	148690	148697	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
134	NC_021192	CAGG	2	8	149637	149644	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
135	NC_021192	CGGC	2	8	149821	149828	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
136	NC_021192	GCGG	2	8	149832	149839	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
137	NC_021192	ATTG	2	8	151414	151421	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_021192	ATCG	2	8	151700	151707	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
139	NC_021192	AGCG	2	8	151994	152001	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
140	NC_021192	ACAA	2	8	154529	154536	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
141	NC_021192	CCGG	2	8	154695	154702	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
142	NC_021192	CGCC	2	8	154731	154738	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
143	NC_021192	CCGG	2	8	154755	154762	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
144	NC_021192	GCGT	3	12	154783	154794	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
145	NC_021192	TGTC	2	8	154989	154996	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
146	NC_021192	TCGT	2	8	155219	155226	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
147	NC_021192	GCTC	2	8	155332	155339	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
148	NC_021192	TACC	2	8	155455	155462	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_021192	TCAA	2	8	155487	155494	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
150	NC_021192	CTGC	2	8	155699	155706	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
151	NC_021192	TGGT	2	8	155899	155906	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
152	NC_021192	GGCT	2	8	156917	156924	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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262	NC_021192	GCCA	2	8	269790	269797	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
263	NC_021192	CGGG	2	8	270062	270069	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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271	NC_021192	CGGT	2	8	272087	272094	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
272	NC_021192	GGCT	2	8	272143	272150	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
273	NC_021192	TCGG	2	8	272709	272716	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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447	NC_021192	TGGC	2	8	466157	466164	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
448	NC_021192	CAGC	2	8	466579	466586	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
449	NC_021192	GGCG	2	8	467269	467276	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
450	NC_021192	GCCG	2	8	469069	469076	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
451	NC_021192	CACT	2	8	469280	469287	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
452	NC_021192	GCAC	2	8	473633	473640	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
453	NC_021192	CAAC	2	8	477493	477500	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
454	NC_021192	GTCG	2	8	479105	479112	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
455	NC_021192	CACG	2	8	479352	479359	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
456	NC_021192	GATG	2	8	481938	481945	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
457	NC_021192	TGCT	2	8	481950	481957	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
458	NC_021192	GTCC	2	8	483710	483717	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
459	NC_021192	GGGT	2	8	483841	483848	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
460	NC_021192	ATGC	2	8	484083	484090	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
461	NC_021192	GGCG	2	8	484416	484423	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
462	NC_021192	CGGT	2	8	484677	484684	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
463	NC_021192	GCTG	2	8	484730	484737	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
464	NC_021192	CTGT	2	8	485422	485429	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
465	NC_021192	ACCT	2	8	487534	487541	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
466	NC_021192	GCCG	2	8	487705	487712	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
467	NC_021192	GCAC	2	8	490585	490592	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
468	NC_021192	GTCG	2	8	490757	490764	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
469	NC_021192	GGCC	2	8	490793	490800	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
470	NC_021192	CGGA	2	8	491170	491177	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
471	NC_021192	AGCG	2	8	491506	491513	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
472	NC_021192	CGGC	2	8	491604	491611	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
473	NC_021192	TGGC	2	8	491972	491979	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
474	NC_021192	TGGT	2	8	492347	492354	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
475	NC_021192	TCGG	2	8	492430	492437	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
476	NC_021192	CCGG	2	8	492501	492508	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
477	NC_021192	GTTG	2	8	494879	494886	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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481	NC_021192	CGGG	2	8	502166	502173	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
482	NC_021192	TGCC	2	8	504502	504509	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
483	NC_021192	GCCA	2	8	504692	504699	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
484	NC_021192	CCGC	2	8	504755	504762	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
485	NC_021192	GGCC	2	8	504795	504802	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
486	NC_021192	ACGC	2	8	505514	505521	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
487	NC_021192	CCAG	2	8	508129	508136	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
488	NC_021192	TGGT	2	8	509712	509719	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
489	NC_021192	GCAC	2	8	510143	510150	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
490	NC_021192	CGAC	2	8	510460	510467	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
491	NC_021192	GCTT	2	8	510804	510811	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
492	NC_021192	GGCT	2	8	511351	511358	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
493	NC_021192	GCAC	2	8	512345	512352	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
494	NC_021192	GATG	2	8	512368	512375	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
495	NC_021192	TGGC	2	8	512484	512491	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
496	NC_021192	CCAC	2	8	512757	512764	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
497	NC_021192	CTGA	2	8	512987	512994	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
498	NC_021192	CGTG	2	8	513320	513327	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
499	NC_021192	AGCC	2	8	513424	513431	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
500	NC_021192	CCGA	2	8	513939	513946	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding

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