MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Desulfotomaculum gibsoniae DSM 7213

Total Repeats: 298

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021184	CGCAGG	2	12	14185	14196	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_021184	TTAGCT	2	12	14558	14569	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_021184	AAAAGC	2	12	23912	23923	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_021184	AGGTTT	2	12	40342	40353	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021184	AAGCTC	2	12	41774	41785	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_021184	CAAATG	2	12	42137	42148	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_021184	TTTTAT	2	12	87787	87798	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021184	CGAATA	2	12	126039	126050	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_021184	ACTGGA	2	12	126735	126746	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_021184	TCTTTA	2	12	150550	150561	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_021184	AAAAAG	2	12	157905	157916	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021184	AACCTT	2	12	165917	165928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_021184	CAAAAT	2	12	166358	166369	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_021184	GGTATT	2	12	168944	168955	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021184	CTTTTC	2	12	169317	169328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_021184	AAAAAG	2	12	170799	170810	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021184	AAAACT	2	12	186367	186378	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_021184	TAATCA	2	12	196672	196683	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_021184	AAAAAC	2	12	212988	212999	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_021184	TTTATA	2	12	235131	235142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021184	AAATTT	2	12	248257	248268	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021184	TACTGT	2	12	262560	262571	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_021184	TGCCGG	2	12	325411	325422	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_021184	TATTAA	2	12	331504	331515	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021184	AATGTT	2	12	389104	389115	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021184	AGTATC	2	12	389251	389262	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_021184	TGAAAT	2	12	394634	394645	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021184	TAATAG	2	12	396438	396449	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021184	AAAACA	2	12	424212	424223	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_021184	CAACTG	2	12	424647	424658	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_021184	GTTAGA	2	12	432669	432680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021184	CCTAGC	2	12	435305	435316	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
33	NC_021184	TTAAAT	2	12	437381	437392	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021184	ATTAAA	2	12	492250	492261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021184	AAGATA	2	12	520279	520290	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021184	GTTTCG	2	12	520742	520753	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_021184	AGCCAC	2	12	529707	529718	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
38	NC_021184	CATTCT	2	12	530637	530648	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_021184	CATACG	2	12	531368	531379	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_021184	TATTCA	2	12	554395	554406	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_021184	ATTTTT	2	12	554928	554939	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021184	ATTAAA	2	12	555098	555109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021184	AGAAAA	2	12	558456	558467	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021184	GCCCTG	2	12	595775	595786	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
45	NC_021184	AGGTCA	2	12	595964	595975	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_021184	ATAGAT	2	12	615784	615795	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021184	TCCCCT	2	12	648487	648498	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_021184	GGAAAA	2	12	652475	652486	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021184	AATTTA	2	12	652531	652542	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021184	GTTAAA	2	12	660801	660812	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021184	AAGTTA	2	12	661700	661711	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021184	CTTTAA	2	12	661735	661746	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_021184	TCCCCT	2	12	675288	675299	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_021184	AAGCTC	2	12	696924	696935	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_021184	ACCTTT	2	12	703051	703062	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_021184	AATAAA	2	12	703341	703352	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021184	ATGACA	2	12	750781	750792	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_021184	CATTTG	2	12	790394	790405	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_021184	ATCAAT	2	12	790925	790936	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_021184	GGGGTA	2	12	809791	809802	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021184	TATAGT	3	18	809893	809910	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021184	AAGTTA	2	12	819609	819620	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021184	TCTATC	2	12	833671	833682	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_021184	CCGGTG	2	12	861242	861253	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_021184	AATCGG	2	12	861362	861373	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_021184	ATCAAT	2	12	862996	863007	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_021184	AAGGGC	2	12	880792	880803	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_021184	TTATTT	2	12	880834	880845	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021184	TAAACA	2	12	926044	926055	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_021184	TTTTTA	2	12	935178	935189	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021184	ATTAAA	2	12	935201	935212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021184	TTTTTA	2	12	942772	942783	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021184	AAGTTT	2	12	950272	950283	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021184	AAATAA	2	12	958894	958905	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021184	GGGAAG	2	12	976640	976651	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021184	ATACTG	3	18	1054386	1054403	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_021184	GGCAAA	2	12	1088214	1088225	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_021184	CAATAC	2	12	1088315	1088326	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_021184	AAAGAA	2	12	1096241	1096252	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021184	AATTTA	2	12	1166336	1166347	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021184	ACAATA	2	12	1219231	1219242	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_021184	TCTAGG	2	12	1226995	1227006	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_021184	TAAATT	2	12	1228428	1228439	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021184	CGCAGG	2	12	1272635	1272646	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_021184	TATCAC	2	12	1278266	1278277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_021184	CAGCTT	2	12	1292598	1292609	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_021184	ATATGA	2	12	1310926	1310937	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021184	ATAGAC	2	12	1313015	1313026	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_021184	GTGCTT	2	12	1313037	1313048	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_021184	TAAATT	2	12	1313146	1313157	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021184	ATATTT	2	12	1325005	1325016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021184	TGTTTA	2	12	1368438	1368449	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021184	TAAATT	2	12	1389988	1389999	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021184	TTATAT	2	12	1408970	1408981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021184	GCCCAA	2	12	1413430	1413441	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
96	NC_021184	TTATTC	2	12	1413677	1413688	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_021184	TTAAAT	2	12	1438735	1438746	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021184	AATTGT	2	12	1467517	1467528	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_021184	GTTTAG	2	12	1487594	1487605	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021184	ATTGTT	2	12	1488726	1488737	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_021184	GCTTTT	2	12	1512506	1512517	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_021184	ATTTTT	2	12	1517156	1517167	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_021184	GTACCA	2	12	1538719	1538730	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_021184	AAATAA	2	12	1542143	1542154	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021184	AGAGCC	2	12	1551583	1551594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_021184	AAAGCA	2	12	1553617	1553628	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_021184	CGCAGG	2	12	1556461	1556472	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_021184	TTTTCG	2	12	1558331	1558342	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_021184	TTCATT	2	12	1626646	1626657	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_021184	TGTTGA	2	12	1632208	1632219	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_021184	CATTGC	2	12	1643582	1643593	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_021184	TTTTTA	2	12	1645535	1645546	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021184	TATATT	2	12	1649587	1649598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021184	GACAAC	2	12	1652572	1652583	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_021184	CATATA	2	12	1665177	1665188	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_021184	AAGGGC	2	12	1684851	1684862	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_021184	TTTCAG	2	12	1690596	1690607	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_021184	GAGTAG	2	12	1692774	1692785	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021184	GGAAAA	2	12	1705148	1705159	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_021184	ATTATA	2	12	1712997	1713008	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_021184	GTTGCA	2	12	1723057	1723068	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_021184	CGCAGG	2	12	1740754	1740765	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_021184	TAGTAA	3	18	1742669	1742686	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_021184	AGAGCC	2	12	1755204	1755215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_021184	CGCAGG	2	12	1760207	1760218	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_021184	TATAAA	2	12	1762953	1762964	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_021184	GGATGA	2	12	1787068	1787079	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_021184	TTCAAT	2	12	1789083	1789094	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_021184	TATCCA	2	12	1797847	1797858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_021184	ATGGCC	2	12	1800788	1800799	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_021184	TTAGCT	2	12	1812702	1812713	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
132	NC_021184	ATTGTA	2	12	1903266	1903277	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_021184	TTTAAT	2	12	1955856	1955867	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_021184	ATTGTA	2	12	1992115	1992126	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
135	NC_021184	ATTGGT	2	12	2095825	2095836	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_021184	TGCAGG	2	12	2107390	2107401	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
137	NC_021184	AATGTC	2	12	2109283	2109294	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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139	NC_021184	ACAATG	2	12	2227894	2227905	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
140	NC_021184	TTTAAT	2	12	2238316	2238327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_021184	TCGTTA	2	12	2273438	2273449	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
142	NC_021184	ATTTGA	2	12	2314795	2314806	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
143	NC_021184	TTTTGT	2	12	2321251	2321262	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
144	NC_021184	TAAAAA	2	12	2324185	2324196	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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147	NC_021184	AAAAGA	2	12	2398527	2398538	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
148	NC_021184	ATTTTT	2	12	2398773	2398784	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_021184	AATCAT	2	12	2416890	2416901	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
150	NC_021184	CATTTC	2	12	2462886	2462897	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_021184	TTTTAT	2	12	2470835	2470846	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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153	NC_021184	ACATTA	2	12	2569727	2569738	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
154	NC_021184	TAAATA	2	12	2616073	2616084	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_021184	GATTTA	2	12	2638368	2638379	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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159	NC_021184	AACCAC	2	12	2685588	2685599	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
160	NC_021184	TAAAAA	3	18	2694573	2694590	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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170	NC_021184	TAAATT	2	12	2924851	2924862	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
171	NC_021184	ACAATA	2	12	2924868	2924879	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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243	NC_021184	CCATTT	2	12	3946782	3946793	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
244	NC_021184	GTGCAC	2	12	3947001	3947012	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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246	NC_021184	TATTAA	2	12	4001010	4001021	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
247	NC_021184	TATTAA	2	12	4003102	4003113	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
248	NC_021184	AACCAC	2	12	4036861	4036872	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
249	NC_021184	ATTTTT	2	12	4054598	4054609	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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251	NC_021184	TATACC	2	12	4089421	4089432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
252	NC_021184	TTTTTA	2	12	4103004	4103015	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
253	NC_021184	ACAAAA	2	12	4111689	4111700	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
254	NC_021184	TACCTT	2	12	4114130	4114141	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
255	NC_021184	GTTTTA	2	12	4114709	4114720	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
256	NC_021184	CCTGCG	2	12	4115546	4115557	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
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258	NC_021184	CCTGCG	2	12	4136368	4136379	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
259	NC_021184	CCTGCG	2	12	4146998	4147009	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.