MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Clostridium pasteurianum BC1 plasmid pCLOPA01

Total Repeats: 31

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021183	ATACAT	2	12	390	401	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_021183	GTATTA	2	12	409	420	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021183	TTTTGA	2	12	1051	1062	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	498827229
4	NC_021183	ATGTAA	2	12	2266	2277	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	498827230
5	NC_021183	AACATT	2	12	2612	2623	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	498827231
6	NC_021183	TTCAAA	2	12	2870	2881	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	498827231
7	NC_021183	AGAAAA	2	12	3904	3915	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	498827232
8	NC_021183	TAAAGA	2	12	4048	4059	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	498827232
9	NC_021183	CATTTT	2	12	5736	5747	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	498827234
10	NC_021183	CAAATA	2	12	6855	6866	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	498827235
11	NC_021183	ATTGCA	2	12	9198	9209	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	498827236
12	NC_021183	AATAAC	2	12	11943	11954	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	498827237
13	NC_021183	TGAAGC	2	12	13126	13137	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_021183	TTCTTA	2	12	14554	14565	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_021183	ATTTTA	2	12	16609	16620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	498827241
16	NC_021183	TCTTTT	2	12	20434	20445	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	498827245
17	NC_021183	TTATAT	2	12	20559	20570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	498827245
18	NC_021183	GTTCAA	2	12	21106	21117	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	498827245
19	NC_021183	GTACCA	2	12	23068	23079	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	498827247
20	NC_021183	TAAAAA	2	12	24142	24153	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	498827248
21	NC_021183	TTTTCT	2	12	28912	28923	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	498827251
22	NC_021183	ATTGCA	2	12	31735	31746	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_021183	AAAGTT	2	12	40809	40820	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021183	TAATAT	2	12	42182	42193	50 %	50 %	0 %	0 %	498827258
25	NC_021183	TTTATA	2	12	42875	42886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021183	TCCTAA	2	12	44837	44848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	498827262
27	NC_021183	TGCCAT	2	12	45168	45179	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	498827262
28	NC_021183	AATTCT	2	12	47840	47851	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_021183	CATTTA	2	12	49134	49145	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	498827266
30	NC_021183	TATTTT	2	12	50774	50785	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	498827270
31	NC_021183	ATTTAC	2	12	50794	50805	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	498827270

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.