MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Clostridium pasteurianum BC1 plasmid pCLOPA01

Total Repeats: 55

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021183	AATAA	2	10	1683	1692	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021183	ATTTA	2	10	1699	1708	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021183	AAATA	2	10	3636	3645	80 %	20 %	0 %	0 %	498827232
4	NC_021183	TAATA	2	10	4589	4598	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021183	GTATA	2	10	4604	4613	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021183	TTTGT	2	10	5424	5433	0 %	80 %	20 %	0 %	498827234
7	NC_021183	CTTTC	2	10	5544	5553	0 %	60 %	0 %	40 %	498827234
8	NC_021183	CATTT	2	10	5656	5665	20 %	60 %	0 %	20 %	498827234
9	NC_021183	TTTTA	2	10	5878	5887	20 %	80 %	0 %	0 %	498827234
10	NC_021183	TTTTG	2	10	8858	8867	0 %	80 %	20 %	0 %	498827236
11	NC_021183	CTTTG	2	10	9528	9537	0 %	60 %	20 %	20 %	498827236
12	NC_021183	ATTAC	2	10	12004	12013	40 %	40 %	0 %	20 %	498827237
13	NC_021183	GTATT	2	10	13593	13602	20 %	60 %	20 %	0 %	498827239
14	NC_021183	AATTC	2	10	13753	13762	40 %	40 %	0 %	20 %	498827239
15	NC_021183	AATTA	2	10	14213	14222	60 %	40 %	0 %	0 %	498827239
16	NC_021183	AACAC	2	10	14441	14450	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
17	NC_021183	AAACA	2	10	14837	14846	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_021183	AGAAT	2	10	15327	15336	60 %	20 %	20 %	0 %	498827240
19	NC_021183	CTTTT	2	10	15585	15594	0 %	80 %	0 %	20 %	498827240
20	NC_021183	TTTAA	2	10	17723	17732	40 %	60 %	0 %	0 %	498827242
21	NC_021183	TGATT	2	10	17815	17824	20 %	60 %	20 %	0 %	498827242
22	NC_021183	ATATT	2	10	18446	18455	40 %	60 %	0 %	0 %	498827243
23	NC_021183	CAATC	2	10	19264	19273	40 %	20 %	0 %	40 %	498827243
24	NC_021183	CTTTT	2	10	21552	21561	0 %	80 %	0 %	20 %	498827246
25	NC_021183	TTACC	2	10	21651	21660	20 %	40 %	0 %	40 %	498827246
26	NC_021183	AAATT	2	10	22406	22415	60 %	40 %	0 %	0 %	498827246
27	NC_021183	TTATT	2	10	23622	23631	20 %	80 %	0 %	0 %	498827248
28	NC_021183	GCCAT	2	10	24095	24104	20 %	20 %	20 %	40 %	498827248
29	NC_021183	TGGAA	2	10	24377	24386	40 %	20 %	40 %	0 %	498827248
30	NC_021183	GAAAA	2	10	24979	24988	80 %	0 %	20 %	0 %	498827249
31	NC_021183	AATTA	2	10	26441	26450	60 %	40 %	0 %	0 %	498827249
32	NC_021183	TAGTT	2	10	26765	26774	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021183	ACAAA	2	10	27022	27031	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_021183	TTTCA	2	10	27977	27986	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
35	NC_021183	TTTTG	2	10	31395	31404	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021183	TTTCT	2	10	32650	32659	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
37	NC_021183	ATAGA	2	10	33388	33397	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021183	ATTAA	2	10	36849	36858	60 %	40 %	0 %	0 %	498827255
39	NC_021183	TATTT	2	10	37895	37904	20 %	80 %	0 %	0 %	498827255
40	NC_021183	TCTTA	2	10	38257	38266	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_021183	ACTTG	2	10	38309	38318	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
42	NC_021183	TTAAC	2	10	40345	40354	40 %	40 %	0 %	20 %	498827256
43	NC_021183	AATGA	2	10	40722	40731	60 %	20 %	20 %	0 %	498827256
44	NC_021183	TAAAT	2	10	41158	41167	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021183	ATTAA	2	10	41457	41466	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021183	TTAAT	2	10	41471	41480	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021183	TTGTA	2	10	44001	44010	20 %	60 %	20 %	0 %	498827261
48	NC_021183	TAATG	2	10	44241	44250	40 %	40 %	20 %	0 %	498827261
49	NC_021183	AGAAT	2	10	44857	44866	60 %	20 %	20 %	0 %	498827262
50	NC_021183	TGTTT	2	10	45691	45700	0 %	80 %	20 %	0 %	498827262
51	NC_021183	CTGTT	2	10	49927	49936	0 %	60 %	20 %	20 %	498827269
52	NC_021183	TCTGA	2	10	50810	50819	20 %	40 %	20 %	20 %	498827270
53	NC_021183	ATCTA	2	10	52886	52895	40 %	40 %	0 %	20 %	498827271
54	NC_021183	CACTT	2	10	53006	53015	20 %	40 %	0 %	40 %	498827271
55	NC_021183	ATTTT	2	10	53020	53029	20 %	80 %	0 %	0 %	498827271

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.