MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Clostridium pasteurianum BC1 plasmid pCLOPA01

Total Repeats: 50

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021183	TAAA	2	8	27	34	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021183	TATG	2	8	421	428	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021183	GTAT	2	8	1818	1825	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021183	ACAT	2	8	3414	3421	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_021183	ACAT	2	8	3426	3433	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_021183	ATTA	2	8	4319	4326	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021183	TTAT	2	8	4387	4394	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021183	TTCT	2	8	4745	4752	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_021183	CCCT	2	8	10041	10048	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
10	NC_021183	CTTT	2	8	10655	10662	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_021183	ATTT	2	8	10698	10705	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021183	CTTT	2	8	10711	10718	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_021183	TCCT	2	8	10932	10939	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_021183	CCTT	2	8	11002	11009	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_021183	TAGG	2	8	11095	11102	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021183	TGTT	2	8	11120	11127	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021183	CAAA	2	8	11146	11153	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_021183	CGTA	2	8	12403	12410	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_021183	ATAA	2	8	12420	12427	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021183	AATA	2	8	13198	13205	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021183	AAAT	2	8	14236	14243	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021183	ACTT	2	8	14546	14553	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_021183	CTAA	2	8	14798	14805	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_021183	TTAG	2	8	16794	16801	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021183	TAAC	2	8	16827	16834	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_021183	ATAA	2	8	18404	18411	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021183	TTTC	2	8	23222	23229	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_021183	GAAG	2	8	26943	26950	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021183	AGAT	2	8	27069	27076	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021183	TCTT	2	8	27650	27657	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_021183	TTTA	2	8	27756	27763	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021183	CTTT	2	8	29798	29805	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_021183	CCAT	2	8	30926	30933	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_021183	TCCA	2	8	31462	31469	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_021183	ACTG	2	8	32195	32202	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_021183	TATT	2	8	33116	33123	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021183	TCCC	2	8	35323	35330	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
38	NC_021183	TAAT	2	8	35563	35570	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021183	TTAT	2	8	38039	38046	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021183	ACTT	2	8	38174	38181	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_021183	AATT	2	8	38574	38581	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021183	TTTA	2	8	40823	40830	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021183	TATT	2	8	41211	41218	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021183	ATTT	2	8	41400	41407	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021183	CTCC	2	8	42949	42956	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
46	NC_021183	ATTT	2	8	43658	43665	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021183	TAAT	2	8	43702	43709	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021183	AATT	2	8	43743	43750	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021183	TAAA	2	8	44567	44574	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021183	GATT	2	8	44623	44630	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.