MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Clostridium pasteurianum BC1 plasmid pCLOPA01

Total Repeats: 93

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021183	TAGC	2	8	546	553	25 %	25 %	25 %	25 %	498827229
2	NC_021183	AGAA	2	8	1167	1174	75 %	0 %	25 %	0 %	498827229
3	NC_021183	TAAA	2	8	2347	2354	75 %	25 %	0 %	0 %	498827231
4	NC_021183	CTTT	2	8	2533	2540	0 %	75 %	0 %	25 %	498827231
5	NC_021183	ATTT	2	8	2897	2904	25 %	75 %	0 %	0 %	498827231
6	NC_021183	TTCT	3	12	3090	3101	0 %	75 %	0 %	25 %	498827231
7	NC_021183	AATT	2	8	3604	3611	50 %	50 %	0 %	0 %	498827232
8	NC_021183	TCCG	2	8	5094	5101	0 %	25 %	25 %	50 %	498827234
9	NC_021183	CTTT	2	8	5514	5521	0 %	75 %	0 %	25 %	498827234
10	NC_021183	ATAA	2	8	6288	6295	75 %	25 %	0 %	0 %	498827234
11	NC_021183	TCAG	2	8	7447	7454	25 %	25 %	25 %	25 %	498827235
12	NC_021183	CCAT	2	8	8389	8396	25 %	25 %	0 %	50 %	498827236
13	NC_021183	TCCA	2	8	8925	8932	25 %	25 %	0 %	50 %	498827236
14	NC_021183	AATT	2	8	13387	13394	50 %	50 %	0 %	0 %	498827238
15	NC_021183	ATAG	2	8	13416	13423	50 %	25 %	25 %	0 %	498827238
16	NC_021183	AAAT	2	8	13561	13568	75 %	25 %	0 %	0 %	498827239
17	NC_021183	TAAA	2	8	13647	13654	75 %	25 %	0 %	0 %	498827239
18	NC_021183	TGAT	2	8	13785	13792	25 %	50 %	25 %	0 %	498827239
19	NC_021183	GAAA	2	8	14191	14198	75 %	0 %	25 %	0 %	498827239
20	NC_021183	TAAT	2	8	15171	15178	50 %	50 %	0 %	0 %	498827240
21	NC_021183	TTTA	2	8	16037	16044	25 %	75 %	0 %	0 %	498827240
22	NC_021183	TAAA	2	8	16196	16203	75 %	25 %	0 %	0 %	498827241
23	NC_021183	GATT	2	8	16512	16519	25 %	50 %	25 %	0 %	498827241
24	NC_021183	TTTG	2	8	16534	16541	0 %	75 %	25 %	0 %	498827241
25	NC_021183	GATA	2	8	16692	16699	50 %	25 %	25 %	0 %	498827241
26	NC_021183	GTAT	2	8	19902	19909	25 %	50 %	25 %	0 %	498827243
27	NC_021183	TAAA	2	8	20141	20148	75 %	25 %	0 %	0 %	498827244
28	NC_021183	CAAT	2	8	20538	20545	50 %	25 %	0 %	25 %	498827245
29	NC_021183	TGAT	2	8	20755	20762	25 %	50 %	25 %	0 %	498827245
30	NC_021183	GAAT	2	8	20837	20844	50 %	25 %	25 %	0 %	498827245
31	NC_021183	ATTT	2	8	20941	20948	25 %	75 %	0 %	0 %	498827245
32	NC_021183	GTTC	2	8	20949	20956	0 %	50 %	25 %	25 %	498827245
33	NC_021183	ACCA	2	8	20963	20970	50 %	0 %	0 %	50 %	498827245
34	NC_021183	CCAT	2	8	21317	21324	25 %	25 %	0 %	50 %	498827245
35	NC_021183	ATAA	2	8	21779	21786	75 %	25 %	0 %	0 %	498827246
36	NC_021183	ATTG	2	8	22447	22454	25 %	50 %	25 %	0 %	498827246
37	NC_021183	ATCC	2	8	22695	22702	25 %	25 %	0 %	50 %	498827246
38	NC_021183	TTTA	2	8	23654	23661	25 %	75 %	0 %	0 %	498827248
39	NC_021183	ATTA	2	8	23701	23708	50 %	50 %	0 %	0 %	498827248
40	NC_021183	TTAT	2	8	23973	23980	25 %	75 %	0 %	0 %	498827248
41	NC_021183	TATT	3	12	24122	24133	25 %	75 %	0 %	0 %	498827248
42	NC_021183	AATT	2	8	24555	24562	50 %	50 %	0 %	0 %	498827248
43	NC_021183	TTAA	2	8	24572	24579	50 %	50 %	0 %	0 %	498827248
44	NC_021183	TTTG	2	8	24733	24740	0 %	75 %	25 %	0 %	498827248
45	NC_021183	ATCT	2	8	25109	25116	25 %	50 %	0 %	25 %	498827249
46	NC_021183	CATT	2	8	25267	25274	25 %	50 %	0 %	25 %	498827249
47	NC_021183	AACA	2	8	25607	25614	75 %	0 %	0 %	25 %	498827249
48	NC_021183	TGTT	2	8	25864	25871	0 %	75 %	25 %	0 %	498827249
49	NC_021183	TATT	2	8	26209	26216	25 %	75 %	0 %	0 %	498827249
50	NC_021183	ACTT	2	8	26317	26324	25 %	50 %	0 %	25 %	498827249
51	NC_021183	TATC	2	8	26473	26480	25 %	50 %	0 %	25 %	498827249
52	NC_021183	ATTA	2	8	26558	26565	50 %	50 %	0 %	0 %	498827249
53	NC_021183	TTTA	2	8	27561	27568	25 %	75 %	0 %	0 %	498827250
54	NC_021183	CGTT	2	8	28486	28493	0 %	50 %	25 %	25 %	498827251
55	NC_021183	AATT	2	8	29002	29009	50 %	50 %	0 %	0 %	498827251
56	NC_021183	CTGT	2	8	29087	29094	0 %	50 %	25 %	25 %	498827251
57	NC_021183	TGCT	2	8	29330	29337	0 %	50 %	25 %	25 %	498827251
58	NC_021183	TATC	2	8	34169	34176	25 %	50 %	0 %	25 %	498827253
59	NC_021183	TCTA	2	8	36492	36499	25 %	50 %	0 %	25 %	498827254
60	NC_021183	TAAA	2	8	36826	36833	75 %	25 %	0 %	0 %	498827255
61	NC_021183	ATAA	2	8	37721	37728	75 %	25 %	0 %	0 %	498827255
62	NC_021183	TAAA	2	8	37753	37760	75 %	25 %	0 %	0 %	498827255
63	NC_021183	AGAT	2	8	39701	39708	50 %	25 %	25 %	0 %	498827256
64	NC_021183	AGAA	2	8	39839	39846	75 %	0 %	25 %	0 %	498827256
65	NC_021183	GGTT	2	8	40316	40323	0 %	50 %	50 %	0 %	498827256
66	NC_021183	ACTG	2	8	40437	40444	25 %	25 %	25 %	25 %	498827256
67	NC_021183	GATG	2	8	40545	40552	25 %	25 %	50 %	0 %	498827256
68	NC_021183	ATTT	2	8	41572	41579	25 %	75 %	0 %	0 %	498827257
69	NC_021183	TAAA	2	8	41977	41984	75 %	25 %	0 %	0 %	498827257
70	NC_021183	TTTA	2	8	41988	41995	25 %	75 %	0 %	0 %	498827257
71	NC_021183	AATT	2	8	42524	42531	50 %	50 %	0 %	0 %	498827259
72	NC_021183	ATTG	2	8	43090	43097	25 %	50 %	25 %	0 %	498827260
73	NC_021183	ATGA	2	8	43151	43158	50 %	25 %	25 %	0 %	498827260
74	NC_021183	TCTT	2	8	43169	43176	0 %	75 %	0 %	25 %	498827260
75	NC_021183	AATG	2	8	43177	43184	50 %	25 %	25 %	0 %	498827260
76	NC_021183	CTTG	2	8	44374	44381	0 %	50 %	25 %	25 %	498827261
77	NC_021183	AATG	2	8	44389	44396	50 %	25 %	25 %	0 %	498827261
78	NC_021183	ATAA	2	8	44943	44950	75 %	25 %	0 %	0 %	498827262
79	NC_021183	CTTC	2	8	45810	45817	0 %	50 %	0 %	50 %	498827262
80	NC_021183	GCAC	2	8	45950	45957	25 %	0 %	25 %	50 %	498827262
81	NC_021183	CAAT	2	8	46706	46713	50 %	25 %	0 %	25 %	498827263
82	NC_021183	ATCT	2	8	46995	47002	25 %	50 %	0 %	25 %	498827263
83	NC_021183	TCTT	2	8	47329	47336	0 %	75 %	0 %	25 %	498827263
84	NC_021183	AAAT	2	8	47440	47447	75 %	25 %	0 %	0 %	498827263
85	NC_021183	TTTC	2	8	47570	47577	0 %	75 %	0 %	25 %	498827263
86	NC_021183	AGCA	2	8	48198	48205	50 %	0 %	25 %	25 %	498827264
87	NC_021183	AGTA	2	8	48918	48925	50 %	25 %	25 %	0 %	498827266
88	NC_021183	GATT	2	8	49192	49199	25 %	50 %	25 %	0 %	498827266
89	NC_021183	TTTC	2	8	49499	49506	0 %	75 %	0 %	25 %	498827267
90	NC_021183	CATT	2	8	50224	50231	25 %	50 %	0 %	25 %	498827269
91	NC_021183	TTCT	2	8	51037	51044	0 %	75 %	0 %	25 %	498827270
92	NC_021183	AATT	2	8	51155	51162	50 %	50 %	0 %	0 %	498827270
93	NC_021183	TTCT	2	8	52066	52073	0 %	75 %	0 %	25 %	498827270

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.