MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Clostridium pasteurianum BC1 plasmid pCLOPA01

Total Repeats: 821

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021183	ATT	2	6	21	26	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021183	ACA	2	6	41	46	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_021183	TGT	2	6	55	60	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021183	ATA	2	6	149	154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021183	ATA	2	6	170	175	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021183	ATA	2	6	193	198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021183	ATA	2	6	214	219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021183	ATA	2	6	235	240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021183	ATA	2	6	258	263	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021183	ATA	2	6	279	284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021183	ATA	2	6	300	305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021183	ATA	2	6	323	328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021183	TAA	2	6	341	346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021183	ATA	2	6	366	371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021183	TAT	2	6	430	435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021183	TAT	2	6	451	456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	498827229
17	NC_021183	ATT	2	6	465	470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	498827229
18	NC_021183	TAA	2	6	492	497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	498827229
19	NC_021183	ATA	2	6	713	718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	498827229
20	NC_021183	AAT	2	6	1003	1008	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	498827229
21	NC_021183	ATA	2	6	1116	1121	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	498827229
22	NC_021183	AAT	2	6	1373	1378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	498827229
23	NC_021183	AGA	2	6	1462	1467	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	498827229
24	NC_021183	ACT	2	6	1522	1527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_021183	TAG	2	6	1584	1589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021183	TAT	2	6	1590	1595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021183	TAT	2	6	1612	1617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021183	ATA	2	6	1763	1768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021183	TAA	2	6	1878	1883	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021183	TTA	2	6	1943	1948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021183	TCT	3	9	1983	1991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	498827230
32	NC_021183	AGC	2	6	1993	1998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	498827230
33	NC_021183	TCA	2	6	2001	2006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	498827230
34	NC_021183	GAA	2	6	2049	2054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	498827230
35	NC_021183	TAT	2	6	2056	2061	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	498827230
36	NC_021183	TCT	2	6	2067	2072	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	498827230
37	NC_021183	ATT	2	6	2109	2114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	498827230
38	NC_021183	CAA	2	6	2116	2121	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	498827230
39	NC_021183	ATT	2	6	2141	2146	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	498827230
40	NC_021183	TGC	2	6	2225	2230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	498827230
41	NC_021183	ATT	2	6	2232	2237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	498827230
42	NC_021183	CAT	2	6	2245	2250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	498827230
43	NC_021183	AGT	2	6	2363	2368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	498827231
44	NC_021183	TGT	2	6	2430	2435	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	498827231
45	NC_021183	ACC	2	6	2441	2446	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	498827231
46	NC_021183	TCA	2	6	2511	2516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	498827231
47	NC_021183	CTT	2	6	2602	2607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	498827231
48	NC_021183	TCC	2	6	2771	2776	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	498827231
49	NC_021183	ATC	2	6	2888	2893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	498827231
50	NC_021183	TAA	2	6	2923	2928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	498827231
51	NC_021183	TCA	2	6	3132	3137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	498827231
52	NC_021183	TAC	2	6	3140	3145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	498827231
53	NC_021183	ATC	2	6	3155	3160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	498827231
54	NC_021183	ATT	2	6	3242	3247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	498827231
55	NC_021183	TAC	2	6	3302	3307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	498827231
56	NC_021183	TCC	2	6	3324	3329	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_021183	ATC	2	6	3670	3675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	498827232
58	NC_021183	TAA	2	6	3679	3684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	498827232
59	NC_021183	TAA	2	6	3733	3738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	498827232
60	NC_021183	ATA	3	9	3789	3797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	498827232
61	NC_021183	CTA	2	6	3834	3839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	498827232
62	NC_021183	ACA	3	9	3941	3949	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	498827232
63	NC_021183	AGA	2	6	4090	4095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	498827232
64	NC_021183	ATA	2	6	4297	4302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	498827232
65	NC_021183	ATA	2	6	4340	4345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021183	AGA	2	6	4351	4356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021183	ACA	2	6	4424	4429	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_021183	AGG	2	6	4431	4436	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021183	TAG	2	6	4487	4492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	498827233
70	NC_021183	GTA	2	6	4507	4512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	498827233
71	NC_021183	TAT	2	6	4570	4575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	498827233
72	NC_021183	ATA	2	6	4623	4628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021183	CAA	2	6	4635	4640	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_021183	TTG	2	6	4645	4650	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021183	ATT	3	9	4787	4795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021183	GTA	2	6	4800	4805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021183	AAT	2	6	4834	4839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021183	TAA	2	6	4992	4997	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021183	GCG	2	6	5009	5014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	498827234
80	NC_021183	CTT	2	6	5024	5029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	498827234
81	NC_021183	TTA	2	6	5127	5132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	498827234
82	NC_021183	ATT	2	6	5143	5148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	498827234
83	NC_021183	TTC	2	6	5176	5181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	498827234
84	NC_021183	CTT	3	9	5230	5238	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	498827234
85	NC_021183	TTC	2	6	5610	5615	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	498827234
86	NC_021183	CAA	2	6	5616	5621	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	498827234
87	NC_021183	CTT	2	6	5649	5654	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	498827234
88	NC_021183	TCC	2	6	5998	6003	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	498827234
89	NC_021183	CTT	2	6	6147	6152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	498827234
90	NC_021183	GCT	2	6	6199	6204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	498827234
91	NC_021183	TGT	2	6	6208	6213	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	498827234
92	NC_021183	TCT	2	6	6365	6370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	498827234
93	NC_021183	ATT	2	6	6480	6485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021183	AAT	2	6	6633	6638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021183	TAA	2	6	6664	6669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_021183	ATT	2	6	6756	6761	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021183	GAA	2	6	6778	6783	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021183	TAA	2	6	6792	6797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_021183	AAG	2	6	6877	6882	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	498827235
100	NC_021183	ATA	2	6	6927	6932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	498827235
101	NC_021183	ATT	2	6	6963	6968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	498827235
102	NC_021183	TAT	2	6	7002	7007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	498827235
103	NC_021183	TAA	2	6	7035	7040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	498827235
104	NC_021183	ATA	2	6	7185	7190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	498827235
105	NC_021183	ATG	2	6	7212	7217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	498827235
106	NC_021183	ATT	2	6	7274	7279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	498827235
107	NC_021183	ATG	2	6	7302	7307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	498827235
108	NC_021183	TTG	2	6	7323	7328	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	498827235
109	NC_021183	TGA	2	6	7366	7371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	498827235
110	NC_021183	ATT	2	6	7384	7389	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	498827235
111	NC_021183	GTG	2	6	7399	7404	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	498827235
112	NC_021183	ATT	2	6	7491	7496	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021183	TAA	2	6	7747	7752	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021183	CTT	2	6	7790	7795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_021183	ATA	2	6	7873	7878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_021183	TTA	2	6	7958	7963	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_021183	TTC	2	6	7988	7993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_021183	TTC	2	6	8107	8112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_021183	AAT	2	6	8131	8136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_021183	TCT	2	6	8147	8152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_021183	TCT	2	6	8213	8218	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_021183	CAT	2	6	8316	8321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	498827236
123	NC_021183	TTC	2	6	8383	8388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	498827236
124	NC_021183	TCT	2	6	8438	8443	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	498827236
125	NC_021183	ATA	2	6	8513	8518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	498827236
126	NC_021183	ATA	2	6	8550	8555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	498827236
127	NC_021183	TAT	2	6	8564	8569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	498827236
128	NC_021183	TCC	2	6	8593	8598	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	498827236
129	NC_021183	TTA	2	6	8634	8639	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	498827236
130	NC_021183	GTC	2	6	8753	8758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	498827236
131	NC_021183	CAT	2	6	8881	8886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	498827236
132	NC_021183	TTA	2	6	9013	9018	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	498827236
133	NC_021183	TAG	2	6	9113	9118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	498827236
134	NC_021183	TAC	2	6	9290	9295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	498827236
135	NC_021183	TGG	3	9	9380	9388	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	498827236
136	NC_021183	ATT	2	6	9431	9436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	498827236
137	NC_021183	CAG	2	6	9481	9486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	498827236
138	NC_021183	TCC	2	6	9571	9576	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
139	NC_021183	ATA	2	6	9607	9612	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_021183	TCA	2	6	9646	9651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_021183	TAC	2	6	9653	9658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_021183	TCT	2	6	9825	9830	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_021183	TGA	2	6	9866	9871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NC_021183	CAG	2	6	9990	9995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_021183	GGT	2	6	10001	10006	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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147	NC_021183	GCA	2	6	10059	10064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_021183	CTT	2	6	10102	10107	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_021183	ATC	2	6	10116	10121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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151	NC_021183	TCA	2	6	10355	10360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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154	NC_021183	TCT	2	6	10510	10515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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157	NC_021183	ATC	2	6	10959	10964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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160	NC_021183	CAT	2	6	11187	11192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
161	NC_021183	ACC	2	6	11234	11239	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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259	NC_021183	ATT	2	6	18125	18130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
260	NC_021183	TAA	2	6	18267	18272	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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265	NC_021183	TAA	2	6	18896	18901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	498827243
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268	NC_021183	AAC	2	6	19064	19069	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	498827243
269	NC_021183	AAT	2	6	19100	19105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	498827243
270	NC_021183	ATT	2	6	19140	19145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	498827243
271	NC_021183	ATA	2	6	19159	19164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	498827243
272	NC_021183	CTT	2	6	19180	19185	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	498827243
273	NC_021183	GCA	2	6	19254	19259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	498827243
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281	NC_021183	AAC	2	6	19718	19723	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	498827243
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289	NC_021183	TCA	3	9	20208	20216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	498827244
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298	NC_021183	TAT	2	6	21095	21100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	498827245
299	NC_021183	TTA	2	6	21177	21182	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	498827245
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335	NC_021183	AGA	2	6	22957	22962	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
336	NC_021183	TAA	2	6	23154	23159	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	498827247
337	NC_021183	ATC	2	6	23172	23177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
338	NC_021183	TAA	2	6	23250	23255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
339	NC_021183	TAA	2	6	23257	23262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
340	NC_021183	ATG	2	6	23308	23313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
341	NC_021183	ATA	2	6	23352	23357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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343	NC_021183	TAT	2	6	23433	23438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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373	NC_021183	TAT	2	6	25283	25288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	498827249
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379	NC_021183	AGA	2	6	25678	25683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	498827249
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382	NC_021183	ATT	2	6	25793	25798	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	498827249
383	NC_021183	GGA	2	6	25812	25817	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	498827249
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389	NC_021183	TCT	2	6	26171	26176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	498827249
390	NC_021183	ATG	2	6	26188	26193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	498827249
391	NC_021183	TAC	2	6	26300	26305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	498827249
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393	NC_021183	GCT	2	6	26373	26378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	498827249
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