MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Clostridium pasteurianum BC1 plasmid pCLOPA01

Total Repeats: 107

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021183	AT	3	6	980	985	50 %	50 %	0 %	0 %	498827229
2	NC_021183	AT	3	6	1044	1049	50 %	50 %	0 %	0 %	498827229
3	NC_021183	AT	3	6	1177	1182	50 %	50 %	0 %	0 %	498827229
4	NC_021183	AC	3	6	1388	1393	50 %	0 %	0 %	50 %	498827229
5	NC_021183	GA	3	6	1482	1487	50 %	0 %	50 %	0 %	498827229
6	NC_021183	AT	3	6	2041	2046	50 %	50 %	0 %	0 %	498827230
7	NC_021183	AT	3	6	2541	2546	50 %	50 %	0 %	0 %	498827231
8	NC_021183	AT	3	6	3120	3125	50 %	50 %	0 %	0 %	498827231
9	NC_021183	AT	3	6	3174	3179	50 %	50 %	0 %	0 %	498827231
10	NC_021183	AT	3	6	3315	3320	50 %	50 %	0 %	0 %	498827231
11	NC_021183	TA	3	6	3644	3649	50 %	50 %	0 %	0 %	498827232
12	NC_021183	TA	3	6	4188	4193	50 %	50 %	0 %	0 %	498827232
13	NC_021183	TA	3	6	5118	5123	50 %	50 %	0 %	0 %	498827234
14	NC_021183	AT	3	6	5352	5357	50 %	50 %	0 %	0 %	498827234
15	NC_021183	AT	3	6	5439	5444	50 %	50 %	0 %	0 %	498827234
16	NC_021183	AT	3	6	5451	5456	50 %	50 %	0 %	0 %	498827234
17	NC_021183	TA	3	6	6024	6029	50 %	50 %	0 %	0 %	498827234
18	NC_021183	AT	3	6	6899	6904	50 %	50 %	0 %	0 %	498827235
19	NC_021183	AT	3	6	6953	6958	50 %	50 %	0 %	0 %	498827235
20	NC_021183	CA	3	6	7097	7102	50 %	0 %	0 %	50 %	498827235
21	NC_021183	TG	3	6	7216	7221	0 %	50 %	50 %	0 %	498827235
22	NC_021183	TA	3	6	9424	9429	50 %	50 %	0 %	0 %	498827236
23	NC_021183	AT	3	6	12017	12022	50 %	50 %	0 %	0 %	498827237
24	NC_021183	AG	3	6	12033	12038	50 %	0 %	50 %	0 %	498827237
25	NC_021183	TA	3	6	13505	13510	50 %	50 %	0 %	0 %	498827239
26	NC_021183	AT	3	6	13672	13677	50 %	50 %	0 %	0 %	498827239
27	NC_021183	GA	4	8	13740	13747	50 %	0 %	50 %	0 %	498827239
28	NC_021183	AT	3	6	13765	13770	50 %	50 %	0 %	0 %	498827239
29	NC_021183	AT	3	6	13900	13905	50 %	50 %	0 %	0 %	498827239
30	NC_021183	AT	3	6	15317	15322	50 %	50 %	0 %	0 %	498827240
31	NC_021183	TA	3	6	15394	15399	50 %	50 %	0 %	0 %	498827240
32	NC_021183	AT	3	6	15462	15467	50 %	50 %	0 %	0 %	498827240
33	NC_021183	AT	3	6	15924	15929	50 %	50 %	0 %	0 %	498827240
34	NC_021183	AT	3	6	16119	16124	50 %	50 %	0 %	0 %	498827240
35	NC_021183	AT	3	6	16233	16238	50 %	50 %	0 %	0 %	498827241
36	NC_021183	AT	3	6	16449	16454	50 %	50 %	0 %	0 %	498827241
37	NC_021183	AT	3	6	16972	16977	50 %	50 %	0 %	0 %	498827242
38	NC_021183	TA	3	6	17214	17219	50 %	50 %	0 %	0 %	498827242
39	NC_021183	GA	3	6	17809	17814	50 %	0 %	50 %	0 %	498827242
40	NC_021183	AT	3	6	18486	18491	50 %	50 %	0 %	0 %	498827243
41	NC_021183	TA	3	6	18493	18498	50 %	50 %	0 %	0 %	498827243
42	NC_021183	AG	3	6	18652	18657	50 %	0 %	50 %	0 %	498827243
43	NC_021183	AT	3	6	18920	18925	50 %	50 %	0 %	0 %	498827243
44	NC_021183	AT	3	6	19123	19128	50 %	50 %	0 %	0 %	498827243
45	NC_021183	TA	3	6	19330	19335	50 %	50 %	0 %	0 %	498827243
46	NC_021183	TG	3	6	19473	19478	0 %	50 %	50 %	0 %	498827243
47	NC_021183	TA	3	6	20404	20409	50 %	50 %	0 %	0 %	498827245
48	NC_021183	TA	3	6	20428	20433	50 %	50 %	0 %	0 %	498827245
49	NC_021183	AT	3	6	20472	20477	50 %	50 %	0 %	0 %	498827245
50	NC_021183	TA	3	6	20771	20776	50 %	50 %	0 %	0 %	498827245
51	NC_021183	TG	3	6	21160	21165	0 %	50 %	50 %	0 %	498827245
52	NC_021183	AT	3	6	21407	21412	50 %	50 %	0 %	0 %	498827245
53	NC_021183	TA	3	6	22147	22152	50 %	50 %	0 %	0 %	498827246
54	NC_021183	TA	3	6	22293	22298	50 %	50 %	0 %	0 %	498827246
55	NC_021183	TA	3	6	23967	23972	50 %	50 %	0 %	0 %	498827248
56	NC_021183	TA	3	6	24549	24554	50 %	50 %	0 %	0 %	498827248
57	NC_021183	AT	3	6	24722	24727	50 %	50 %	0 %	0 %	498827248
58	NC_021183	AT	3	6	24847	24852	50 %	50 %	0 %	0 %	498827248
59	NC_021183	TA	3	6	24903	24908	50 %	50 %	0 %	0 %	498827248
60	NC_021183	AT	3	6	25030	25035	50 %	50 %	0 %	0 %	498827249
61	NC_021183	AT	3	6	25196	25201	50 %	50 %	0 %	0 %	498827249
62	NC_021183	TA	3	6	26719	26724	50 %	50 %	0 %	0 %	498827249
63	NC_021183	AT	3	6	27384	27389	50 %	50 %	0 %	0 %	498827250
64	NC_021183	TA	3	6	29320	29325	50 %	50 %	0 %	0 %	498827251
65	NC_021183	TC	3	6	29532	29537	0 %	50 %	0 %	50 %	498827251
66	NC_021183	AT	3	6	29570	29575	50 %	50 %	0 %	0 %	498827251
67	NC_021183	TA	3	6	36005	36010	50 %	50 %	0 %	0 %	498827254
68	NC_021183	AT	3	6	36149	36154	50 %	50 %	0 %	0 %	498827254
69	NC_021183	GT	3	6	36167	36172	0 %	50 %	50 %	0 %	498827254
70	NC_021183	AT	3	6	37327	37332	50 %	50 %	0 %	0 %	498827255
71	NC_021183	TA	3	6	37462	37467	50 %	50 %	0 %	0 %	498827255
72	NC_021183	TA	3	6	37556	37561	50 %	50 %	0 %	0 %	498827255
73	NC_021183	AT	3	6	41771	41776	50 %	50 %	0 %	0 %	498827257
74	NC_021183	AT	3	6	41783	41788	50 %	50 %	0 %	0 %	498827257
75	NC_021183	AT	3	6	41810	41815	50 %	50 %	0 %	0 %	498827257
76	NC_021183	CT	3	6	41820	41825	0 %	50 %	0 %	50 %	498827257
77	NC_021183	AT	3	6	42031	42036	50 %	50 %	0 %	0 %	498827257
78	NC_021183	AG	3	6	42241	42246	50 %	0 %	50 %	0 %	498827258
79	NC_021183	AT	3	6	42581	42586	50 %	50 %	0 %	0 %	498827259
80	NC_021183	AT	3	6	43246	43251	50 %	50 %	0 %	0 %	498827260
81	NC_021183	AT	3	6	43289	43294	50 %	50 %	0 %	0 %	498827260
82	NC_021183	AT	3	6	44055	44060	50 %	50 %	0 %	0 %	498827261
83	NC_021183	TA	3	6	44926	44931	50 %	50 %	0 %	0 %	498827262
84	NC_021183	TA	3	6	45096	45101	50 %	50 %	0 %	0 %	498827262
85	NC_021183	TA	3	6	45369	45374	50 %	50 %	0 %	0 %	498827262
86	NC_021183	TA	3	6	46399	46404	50 %	50 %	0 %	0 %	498827263
87	NC_021183	TA	3	6	46879	46884	50 %	50 %	0 %	0 %	498827263
88	NC_021183	AT	3	6	48026	48031	50 %	50 %	0 %	0 %	498827264
89	NC_021183	AT	3	6	48286	48291	50 %	50 %	0 %	0 %	498827264
90	NC_021183	TA	3	6	49182	49187	50 %	50 %	0 %	0 %	498827266
91	NC_021183	TA	3	6	49468	49473	50 %	50 %	0 %	0 %	498827267
92	NC_021183	TA	3	6	49855	49860	50 %	50 %	0 %	0 %	498827269
93	NC_021183	TA	4	8	50174	50181	50 %	50 %	0 %	0 %	498827269
94	NC_021183	TA	3	6	50318	50323	50 %	50 %	0 %	0 %	498827269
95	NC_021183	AT	3	6	50477	50482	50 %	50 %	0 %	0 %	498827270
96	NC_021183	TA	3	6	50650	50655	50 %	50 %	0 %	0 %	498827270
97	NC_021183	AG	3	6	50736	50741	50 %	0 %	50 %	0 %	498827270
98	NC_021183	AT	3	6	51295	51300	50 %	50 %	0 %	0 %	498827270
99	NC_021183	AT	3	6	51813	51818	50 %	50 %	0 %	0 %	498827270
100	NC_021183	AT	3	6	51938	51943	50 %	50 %	0 %	0 %	498827270
101	NC_021183	AT	3	6	52052	52057	50 %	50 %	0 %	0 %	498827270
102	NC_021183	AT	3	6	52100	52105	50 %	50 %	0 %	0 %	498827270
103	NC_021183	CT	3	6	52261	52266	0 %	50 %	0 %	50 %	498827271
104	NC_021183	TC	3	6	52287	52292	0 %	50 %	0 %	50 %	498827271
105	NC_021183	TA	5	10	52336	52345	50 %	50 %	0 %	0 %	498827271
106	NC_021183	TA	3	6	52775	52780	50 %	50 %	0 %	0 %	498827271
107	NC_021183	TC	3	6	52856	52861	0 %	50 %	0 %	50 %	498827271

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.