MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Clostridium pasteurianum BC1

Total Repeats: 2628

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021182	AATATA	2	12	3515	3526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	488769003
2	NC_021182	ATAAGG	2	12	3609	3620	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	488769003
3	NC_021182	AGACAA	2	12	5851	5862	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	488769005
4	NC_021182	AGCTAG	2	12	8043	8054	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	488769006
5	NC_021182	TCAAGT	2	12	17551	17562	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	488769009
6	NC_021182	TTATAA	2	12	17926	17937	50 %	50 %	0 %	0 %	488769009
7	NC_021182	GCTTAA	2	12	19849	19860	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	488769010
8	NC_021182	TTTATA	2	12	20279	20290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021182	AAACTA	2	12	20408	20419	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_021182	ATAAAT	2	12	20425	20436	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021182	TACTGT	2	12	21672	21683	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	488769011
12	NC_021182	TGAAAT	2	12	21860	21871	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	488769011
13	NC_021182	TGCAGA	2	12	25617	25628	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	488769014
14	NC_021182	ATTACT	2	12	27635	27646	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	488769015
15	NC_021182	TTATAT	2	12	27944	27955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488769016
16	NC_021182	TATTGT	2	12	28673	28684	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	488769016
17	NC_021182	TTTAAT	2	12	34533	34544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488769019
18	NC_021182	AAATAT	2	12	36490	36501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021182	GTATCA	2	12	40335	40346	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	488769024
20	NC_021182	ATGCTA	2	12	41985	41996	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	488769027
21	NC_021182	TAAATA	2	12	42094	42105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021182	TAAATT	2	12	43289	43300	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021182	ATATCT	2	12	45736	45747	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	488769033
24	NC_021182	AACTTT	2	12	46795	46806	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_021182	CAGATG	2	12	47451	47462	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	488769034
26	NC_021182	ATGAAA	2	12	51434	51445	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	488769036
27	NC_021182	ATAATT	2	12	51634	51645	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021182	TTCTAT	2	12	52457	52468	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	488769037
29	NC_021182	TGGTTT	2	12	56476	56487	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488769040
30	NC_021182	ATATAA	2	12	57459	57470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021182	CTTCTA	2	12	59136	59147	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	488769042
32	NC_021182	TTATAG	2	12	61852	61863	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	488769044
33	NC_021182	TTTTTA	2	12	62881	62892	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	488769045
34	NC_021182	TGGAAT	2	12	65446	65457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488769047
35	NC_021182	AATAAA	2	12	67434	67445	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021182	AAAAAT	2	12	68407	68418	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	488769048
37	NC_021182	GATCAA	2	12	69811	69822	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	488769049
38	NC_021182	ATAAAA	2	12	69862	69873	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	488769049
39	NC_021182	ACTATG	2	12	71061	71072	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	488769050
40	NC_021182	GTATTA	2	12	71400	71411	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	488769050
41	NC_021182	TATTTT	2	12	76437	76448	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	488769056
42	NC_021182	TATATG	2	12	83181	83192	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021182	AAATTG	2	12	85180	85191	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	488769070
44	NC_021182	TTTTAG	2	12	87080	87091	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	488769073
45	NC_021182	AAAACT	2	12	87330	87341	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	488769073
46	NC_021182	ATAAAT	2	12	88944	88955	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	488769074
47	NC_021182	ATATAA	2	12	90290	90301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021182	AATAAC	2	12	91528	91539	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_021182	TACTGA	2	12	98771	98782	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	488769085
50	NC_021182	AATATA	2	12	100340	100351	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021182	TTTTAC	2	12	105336	105347	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_021182	CCGAAG	2	12	108467	108478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488769090
53	NC_021182	TTTTCT	2	12	109387	109398	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	488769091
54	NC_021182	CAAGAC	2	12	109700	109711	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	488769091
55	NC_021182	AATTTA	2	12	110371	110382	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021182	ATTTTC	2	12	114538	114549	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	488769097
57	NC_021182	CCACAA	2	12	115052	115063	50 %	0 %	0 %	50 %	488769097
58	NC_021182	TTAATT	2	12	124019	124030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021182	TACTTT	2	12	131959	131970	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	488769103
60	NC_021182	TATACT	2	12	133664	133675	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	488769105
61	NC_021182	ATAGTA	2	12	133848	133859	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	488769105
62	NC_021182	CTTATG	2	12	133914	133925	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	488769105
63	NC_021182	TAAATT	2	12	134699	134710	50 %	50 %	0 %	0 %	488769106
64	NC_021182	ATAATT	2	12	137081	137092	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021182	TATAAA	2	12	137721	137732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	488769108
66	NC_021182	AATATA	2	12	148348	148359	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021182	TAAATT	2	12	149477	149488	50 %	50 %	0 %	0 %	488769114
68	NC_021182	AAAAAT	2	12	155825	155836	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	488769120
69	NC_021182	ATTATA	2	12	155988	155999	50 %	50 %	0 %	0 %	488769120
70	NC_021182	ATAAAT	2	12	161275	161286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	488769123
71	NC_021182	TTAAAA	2	12	168421	168432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021182	ATTAAA	2	12	175648	175659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021182	AGTAAT	2	12	176846	176857	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	488769131
74	NC_021182	TAGGTG	2	12	177273	177284	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	488769131
75	NC_021182	TAAACT	2	12	177468	177479	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	488769131
76	NC_021182	AATATT	2	12	178014	178025	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021182	TAAAAT	2	12	178128	178139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021182	ATAATT	2	12	179383	179394	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021182	CTTTTT	2	12	185066	185077	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_021182	ATCACA	2	12	187012	187023	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	488769135
81	NC_021182	AAATTA	2	12	190378	190389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	488769138
82	NC_021182	TCACCT	2	12	191582	191593	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	488769140
83	NC_021182	GAAATA	2	12	193880	193891	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	488769143
84	NC_021182	CGATTA	2	12	197338	197349	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	488769148
85	NC_021182	AAGAAA	2	12	197624	197635	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	488769149
86	NC_021182	ATTTAG	2	12	197840	197851	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021182	TTTTAA	2	12	198131	198142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021182	GAAAGA	2	12	199793	199804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488769151
89	NC_021182	TTTATT	2	12	203312	203323	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021182	TAGATG	2	12	206431	206442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488769156
91	NC_021182	GAATAA	2	12	207277	207288	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	488769157
92	NC_021182	GTATAG	2	12	210205	210216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488769160
93	NC_021182	CAGAAG	2	12	212069	212080	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	488769162
94	NC_021182	TAATAT	2	12	213436	213447	50 %	50 %	0 %	0 %	488769163
95	NC_021182	AGGAAT	2	12	215147	215158	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_021182	GCATAA	2	12	215728	215739	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	488769166
97	NC_021182	TGAGGA	2	12	217101	217112	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	488769167
98	NC_021182	TTTTTA	2	12	218179	218190	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_021182	TCAGAG	2	12	218684	218695	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	488769169
100	NC_021182	CAATTG	2	12	221866	221877	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_021182	AAATAA	2	12	228144	228155	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_021182	TACTTA	2	12	229204	229215	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	488769180
103	NC_021182	TAAATA	2	12	233602	233613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	488769186
104	NC_021182	ATAAAA	2	12	234132	234143	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	488769187
105	NC_021182	AATTTT	2	12	235940	235951	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_021182	TAAAGT	2	12	236024	236035	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021182	GAAGAG	2	12	239583	239594	50 %	0 %	50 %	0 %	488769192
108	NC_021182	AATGAT	2	12	239718	239729	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	488769192
109	NC_021182	CAGAAA	2	12	240211	240222	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	488769192
110	NC_021182	TTAAAT	2	12	246323	246334	50 %	50 %	0 %	0 %	488769196
111	NC_021182	ATAAAT	2	12	249968	249979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	488769198
112	NC_021182	GAACTT	2	12	254369	254380	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	488769203
113	NC_021182	AATTAA	2	12	257764	257775	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021182	AGTAAT	2	12	259973	259984	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	488769206
115	NC_021182	TATAAA	2	12	261606	261617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	488769208
116	NC_021182	ATTTAG	2	12	262794	262805	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	488769209
117	NC_021182	TAAAAA	2	12	263409	263420	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_021182	TATAAT	2	12	263503	263514	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021182	GTAAAC	2	12	264357	264368	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	488769211
120	NC_021182	AATTCT	2	12	264891	264902	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	488769211
121	NC_021182	GCTGTA	2	12	265581	265592	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	488769211
122	NC_021182	ATATTA	2	12	266367	266378	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_021182	CAGCTG	2	12	269157	269168	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	488769214
124	NC_021182	GTAAGG	2	12	271623	271634	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	488769215
125	NC_021182	ATTTTG	2	12	275393	275404	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_021182	AGAACT	2	12	281497	281508	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	488769221
127	NC_021182	TACAAT	2	12	281587	281598	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	488769221
128	NC_021182	AAATAA	2	12	283395	283406	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	488769223
129	NC_021182	AAGAGG	2	12	284647	284658	50 %	0 %	50 %	0 %	488769225
130	NC_021182	TAAAAG	2	12	285271	285282	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	488769225
131	NC_021182	GAAAAA	2	12	287103	287114	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	488769225
132	NC_021182	TAAATG	2	12	287779	287790	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	488769225
133	NC_021182	TGGCTA	2	12	289131	289142	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	488769226
134	NC_021182	AATTAT	2	12	289719	289730	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_021182	TACATT	2	12	291452	291463	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	488769228
136	NC_021182	TATGGA	2	12	295364	295375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488769231
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138	NC_021182	AATAGG	2	12	297381	297392	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	488769233
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143	NC_021182	GGAAAT	2	12	305620	305631	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	488769239
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145	NC_021182	TATGAG	2	12	316076	316087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488769246
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156	NC_021182	CTTTTT	2	12	328755	328766	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	488769257
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228	NC_021182	GCATCT	2	12	456178	456189	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	488769384
229	NC_021182	TATCAA	2	12	457223	457234	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	488769384
230	NC_021182	AAAATT	2	12	458207	458218	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
231	NC_021182	ATAGCA	2	12	459139	459150	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	488769385
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234	NC_021182	ATAATT	2	12	464381	464392	50 %	50 %	0 %	0 %	488769392
235	NC_021182	TCCATT	2	12	466110	466121	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
236	NC_021182	TAATAT	2	12	471208	471219	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
237	NC_021182	TCCTAA	2	12	474557	474568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488769402
238	NC_021182	CAATAA	2	12	477872	477883	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
239	NC_021182	AGATGT	2	12	479332	479343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488769408
240	NC_021182	GATGTA	2	12	482322	482333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488769412
241	NC_021182	AAATGT	2	12	482420	482431	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	488769412
242	NC_021182	AAAGAA	2	12	482702	482713	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	488769412
243	NC_021182	ATGCAG	2	12	482959	482970	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	488769412
244	NC_021182	TTAATA	2	12	483664	483675	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
245	NC_021182	GATACA	2	12	488100	488111	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
246	NC_021182	AATGAA	2	12	492455	492466	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	488769419
247	NC_021182	TATTAA	2	12	493709	493720	50 %	50 %	0 %	0 %	488769421
248	NC_021182	AATAGA	2	12	494309	494320	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	488769421
249	NC_021182	ATACAT	2	12	494977	494988	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	488769422
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252	NC_021182	TTGTCT	2	12	503325	503336	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	488769432
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257	NC_021182	GCATTA	2	12	513183	513194	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	488769442
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263	NC_021182	AGGTGA	2	12	521090	521101	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	488769447
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265	NC_021182	GAAATT	2	12	527855	527866	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	488769454
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269	NC_021182	AGATTT	2	12	537278	537289	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
270	NC_021182	ATACTA	2	12	537770	537781	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	488769465
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272	NC_021182	TATAAT	2	12	543650	543661	50 %	50 %	0 %	0 %	488769471
273	NC_021182	TTACAG	2	12	545703	545714	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	488769473
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302	NC_021182	AAAACT	2	12	621196	621207	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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342	NC_021182	TTTGAC	2	12	704708	704719	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	488769621
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345	NC_021182	TACAGC	2	12	721710	721721	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	488769632
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350	NC_021182	TTGTAA	2	12	728986	728997	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
351	NC_021182	AGCAGT	2	12	732392	732403	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	488769642
352	NC_021182	CAATAA	2	12	734326	734337	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
353	NC_021182	TATTTT	2	12	736879	736890	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	488769645
354	NC_021182	TCATAA	2	12	737684	737695	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	488769646
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356	NC_021182	TAATGA	2	12	745187	745198	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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480	NC_021182	GGTCTT	2	12	1005630	1005641	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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