MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Clostridium pasteurianum BC1

Total Repeats: 1653

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021182	TTTTA	2	10	258	267	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021182	ATCTA	2	10	1953	1962	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_021182	AAAAT	2	10	3159	3168	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021182	TATAA	2	10	3425	3434	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021182	TCGTG	2	10	10996	11005	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
6	NC_021182	AGTAA	2	10	11588	11597	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021182	TAAGT	2	10	12759	12768	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021182	GGGAT	2	10	14438	14447	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021182	AGATT	2	10	14484	14493	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021182	ATATT	2	10	14645	14654	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021182	TATTT	2	10	15089	15098	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021182	AATAT	2	10	15141	15150	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021182	AATTT	2	10	20125	20134	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021182	TAATT	2	10	20136	20145	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021182	TTTTA	2	10	26133	26142	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021182	TTTAG	2	10	29953	29962	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021182	TTTAT	2	10	30533	30542	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021182	TGTTA	2	10	35497	35506	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021182	TTTTC	2	10	36211	36220	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_021182	AAAAG	2	10	37582	37591	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021182	TATAA	2	10	37800	37809	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021182	GTTAT	2	10	38087	38096	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021182	ATTAT	2	10	43386	43395	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021182	AGAAA	2	10	43853	43862	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021182	ATTTT	2	10	44580	44589	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021182	AATTA	2	10	46130	46139	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021182	ATTTA	2	10	46449	46458	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021182	TTCAA	2	10	46576	46585	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_021182	CATAT	2	10	49225	49234	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_021182	ATAAA	2	10	49572	49581	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021182	AATTC	2	10	51468	51477	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_021182	AAAAT	2	10	51865	51874	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021182	AAATT	2	10	59311	59320	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021182	ATTAT	2	10	59487	59496	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021182	CTACA	2	10	62288	62297	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
36	NC_021182	AATTC	2	10	75884	75893	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
37	NC_021182	ATTGA	2	10	76264	76273	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021182	TAAAT	2	10	84372	84381	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021182	TATAT	2	10	90238	90247	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021182	TATTT	2	10	93544	93553	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021182	TATTT	2	10	95267	95276	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021182	AAATA	2	10	95299	95308	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021182	TTAAT	2	10	99851	99860	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021182	TATAT	2	10	100128	100137	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021182	TCGTG	2	10	101675	101684	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
46	NC_021182	AGTAA	2	10	102267	102276	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021182	TAAGT	2	10	103438	103447	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021182	GGGAT	2	10	105116	105125	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021182	AGATT	2	10	105162	105171	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021182	TTTTA	2	10	107235	107244	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021182	AATAA	2	10	107262	107271	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021182	ATTAT	2	10	110212	110221	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021182	AAATT	2	10	113501	113510	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021182	ATATA	2	10	117295	117304	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021182	TCGTG	2	10	118496	118505	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
56	NC_021182	AGTAA	2	10	119088	119097	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021182	TAAGT	2	10	120259	120268	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021182	GGGAT	2	10	121937	121946	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021182	AGATT	2	10	121983	121992	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021182	ATATT	2	10	122144	122153	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021182	GTAAA	2	10	123749	123758	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021182	AATAA	2	10	123958	123967	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021182	TGATA	2	10	124950	124959	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021182	TATAA	2	10	124961	124970	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021182	TAATA	2	10	126420	126429	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021182	ATATA	2	10	126559	126568	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021182	TCGTG	2	10	127760	127769	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
68	NC_021182	AGTAA	2	10	128352	128361	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021182	TAAGT	2	10	129523	129532	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021182	GGGAT	2	10	131201	131210	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021182	AGATT	2	10	131247	131256	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021182	ATATT	2	10	131408	131417	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021182	TTTTG	2	10	132783	132792	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021182	TATTT	2	10	133288	133297	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021182	TATAG	2	10	133346	133355	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021182	TTTTG	2	10	139103	139112	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021182	TATCA	2	10	139397	139406	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_021182	TCGTG	2	10	141046	141055	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
79	NC_021182	AGTAA	2	10	141638	141647	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021182	TAAGT	2	10	142809	142818	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021182	GGGAT	2	10	144487	144496	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021182	AGATT	2	10	144533	144542	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021182	ATATT	2	10	144694	144703	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021182	TAAAA	2	10	145185	145194	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021182	TTATT	2	10	145255	145264	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021182	CTATT	2	10	148146	148155	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
87	NC_021182	CAAAA	2	10	154654	154663	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
88	NC_021182	TATTG	2	10	156380	156389	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021182	AATTA	2	10	156394	156403	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021182	ATTAT	2	10	156459	156468	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021182	TAATC	2	10	160123	160132	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
92	NC_021182	TTTTG	2	10	164549	164558	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021182	ATTAA	2	10	164814	164823	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021182	TCGTG	2	10	169863	169872	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
95	NC_021182	AGTAA	2	10	170455	170464	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_021182	TAAGT	2	10	171626	171635	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021182	GGGAT	2	10	173304	173313	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021182	AGATT	2	10	173350	173359	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
99	NC_021182	ATATT	2	10	173511	173520	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021182	AAAAT	2	10	178549	178558	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_021182	ATTAT	2	10	179588	179597	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_021182	ATATA	2	10	179641	179650	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_021182	TCGTG	2	10	180838	180847	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
104	NC_021182	AGTAA	2	10	181602	181611	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021182	TAAGT	2	10	182767	182776	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
106	NC_021182	GGGAT	2	10	184445	184454	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021182	AGATT	2	10	184491	184500	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
108	NC_021182	ATATT	2	10	184652	184661	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021182	TTAAA	2	10	185185	185194	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021182	TATAG	2	10	186173	186182	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_021182	TATAA	2	10	187519	187528	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021182	TAATA	2	10	187536	187545	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021182	AAATA	2	10	188395	188404	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021182	AAAAT	2	10	191309	191318	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021182	TAAAA	2	10	191333	191342	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_021182	CTATA	2	10	194303	194312	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
117	NC_021182	TATAA	2	10	197863	197872	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_021182	ATATA	2	10	197949	197958	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021182	ATTTA	2	10	201877	201886	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_021182	TTTAT	2	10	204068	204077	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_021182	ATTAT	2	10	205927	205936	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_021182	TTATA	2	10	205991	206000	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_021182	TATAT	2	10	210467	210476	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_021182	ATTAT	2	10	210620	210629	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_021182	TATAT	2	10	221505	221514	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_021182	AACAA	2	10	221780	221789	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
127	NC_021182	AGGTA	2	10	222659	222668	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
128	NC_021182	TAAAA	2	10	222698	222707	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_021182	AGGTG	2	10	223486	223495	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
130	NC_021182	TATAA	2	10	225514	225523	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_021182	ATATA	2	10	226120	226129	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_021182	ATTAA	2	10	228270	228279	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_021182	TATAA	2	10	228531	228540	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_021182	TGGAT	2	10	229746	229755	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
135	NC_021182	TACAA	2	10	229897	229906	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
136	NC_021182	AATTT	2	10	237316	237325	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_021182	ATATA	2	10	237350	237359	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_021182	AAAAT	2	10	237425	237434	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_021182	CTAAA	2	10	241590	241599	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
140	NC_021182	GAAAT	2	10	241914	241923	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
141	NC_021182	ATTTA	2	10	244233	244242	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_021182	ATAAA	2	10	244298	244307	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_021182	ATATT	2	10	246626	246635	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_021182	AATAC	2	10	255144	255153	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
145	NC_021182	ATGGA	2	10	266312	266321	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
146	NC_021182	GTATT	2	10	266391	266400	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
147	NC_021182	AATAT	2	10	271709	271718	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_021182	AATTA	2	10	271978	271987	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_021182	AATAT	2	10	276327	276336	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_021182	TATAA	2	10	277482	277491	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_021182	TCTTT	2	10	280970	280979	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
152	NC_021182	ATAAA	2	10	281066	281075	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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165	NC_021182	TAAAA	2	10	339435	339444	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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185	NC_021182	ATATT	2	10	419587	419596	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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192	NC_021182	ATTTT	2	10	438080	438089	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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281	NC_021182	GTTCT	2	10	730527	730536	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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289	NC_021182	AGTAT	2	10	744781	744790	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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291	NC_021182	GTATA	2	10	745132	745141	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
292	NC_021182	TATAA	2	10	748414	748423	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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