MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Clostridium pasteurianum BC1

Total Repeats: 58904

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021182	ATA	2	6	446	451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	488769000
2	NC_021182	AAT	2	6	515	520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	488769000
3	NC_021182	TAC	2	6	613	618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488769000
4	NC_021182	AGA	2	6	652	657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488769000
5	NC_021182	CTG	2	6	660	665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488769000
6	NC_021182	TGA	2	6	670	675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488769000
7	NC_021182	ATA	2	6	699	704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	488769000
8	NC_021182	TCT	2	6	707	712	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488769000
9	NC_021182	ATG	2	6	714	719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488769000
10	NC_021182	TGC	2	6	793	798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488769000
11	NC_021182	ATT	2	6	841	846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488769000
12	NC_021182	TGG	2	6	853	858	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488769000
13	NC_021182	AAT	2	6	914	919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	488769000
14	NC_021182	GTA	2	6	932	937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488769000
15	NC_021182	TCT	2	6	944	949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488769000
16	NC_021182	GAT	2	6	986	991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488769000
17	NC_021182	GAA	2	6	998	1003	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488769000
18	NC_021182	GAT	2	6	1043	1048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488769000
19	NC_021182	TGG	2	6	1060	1065	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488769000
20	NC_021182	ATA	2	6	1119	1124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	488769000
21	NC_021182	ACC	2	6	1225	1230	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488769000
22	NC_021182	TAG	2	6	1368	1373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488769000
23	NC_021182	TTC	2	6	1378	1383	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488769000
24	NC_021182	AAG	2	6	1395	1400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488769000
25	NC_021182	AAG	2	6	1534	1539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488769000
26	NC_021182	GAA	2	6	1622	1627	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488769000
27	NC_021182	GGA	2	6	1631	1636	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	488769000
28	NC_021182	TGG	2	6	1678	1683	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488769000
29	NC_021182	ATA	2	6	1747	1752	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	488769000
30	NC_021182	ATC	2	6	2077	2082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488769001
31	NC_021182	TAC	2	6	2091	2096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488769001
32	NC_021182	AAT	2	6	2134	2139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	488769001
33	NC_021182	ATA	2	6	2234	2239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	488769001
34	NC_021182	GAT	2	6	2342	2347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488769001
35	NC_021182	GAT	2	6	2372	2377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488769001
36	NC_021182	CTA	2	6	2424	2429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488769001
37	NC_021182	TAG	2	6	2508	2513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488769001
38	NC_021182	AGT	2	6	2605	2610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488769001
39	NC_021182	ATA	2	6	2690	2695	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	488769001
40	NC_021182	AAT	2	6	2734	2739	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	488769001
41	NC_021182	GAA	2	6	2744	2749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488769001
42	NC_021182	AGA	2	6	2776	2781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488769001
43	NC_021182	TAG	2	6	2811	2816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488769001
44	NC_021182	TTA	2	6	2838	2843	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488769001
45	NC_021182	GAT	2	6	2858	2863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488769001
46	NC_021182	TAA	2	6	2871	2876	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	488769001
47	NC_021182	GAA	2	6	2906	2911	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488769001
48	NC_021182	TTA	2	6	2975	2980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488769001
49	NC_021182	ATA	2	6	2984	2989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	488769001
50	NC_021182	GAA	3	9	2993	3001	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488769001
51	NC_021182	ATA	2	6	3057	3062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	488769001
52	NC_021182	ATT	2	6	3091	3096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488769001
53	NC_021182	GAA	2	6	3173	3178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488769002
54	NC_021182	ATA	2	6	3197	3202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	488769002
55	NC_021182	TAT	2	6	3232	3237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488769002
56	NC_021182	GTT	2	6	3296	3301	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488769002
57	NC_021182	ATA	2	6	3368	3373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	488769002
58	NC_021182	TAA	2	6	3469	3474	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	488769003
59	NC_021182	AGA	2	6	3802	3807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488769003
60	NC_021182	AGA	2	6	3839	3844	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488769003
61	NC_021182	ATT	2	6	3885	3890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488769003
62	NC_021182	ATA	2	6	3945	3950	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	488769003
63	NC_021182	TAA	2	6	4014	4019	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	488769003
64	NC_021182	ATA	2	6	4064	4069	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	488769003
65	NC_021182	ATA	2	6	4137	4142	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	488769003
66	NC_021182	GAT	2	6	4226	4231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488769003
67	NC_021182	TAA	2	6	4242	4247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	488769003
68	NC_021182	ATA	2	6	4248	4253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	488769003
69	NC_021182	AAG	2	6	4261	4266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488769003
70	NC_021182	GAT	2	6	4370	4375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488769003
71	NC_021182	TAA	2	6	4462	4467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	488769003
72	NC_021182	AGC	2	6	4472	4477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488769003
73	NC_021182	AGG	2	6	4546	4551	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	488769003
74	NC_021182	GTA	2	6	4582	4587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488769004
75	NC_021182	ACT	2	6	4627	4632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488769004
76	NC_021182	AGA	3	9	4671	4679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488769004
77	NC_021182	TCT	2	6	4771	4776	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488769004
78	NC_021182	AAT	2	6	4854	4859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	488769005
79	NC_021182	ATG	2	6	4867	4872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488769005
80	NC_021182	TCA	2	6	4958	4963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488769005
81	NC_021182	GGT	2	6	5007	5012	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488769005
82	NC_021182	TGA	2	6	5066	5071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488769005
83	NC_021182	CAT	2	6	5097	5102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488769005
84	NC_021182	GGA	2	6	5151	5156	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	488769005
85	NC_021182	GGT	3	9	5166	5174	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488769005
86	NC_021182	AGG	2	6	5186	5191	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	488769005
87	NC_021182	GTT	2	6	5214	5219	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488769005
88	NC_021182	GAA	2	6	5331	5336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488769005
89	NC_021182	AAG	2	6	5545	5550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488769005
90	NC_021182	ATG	2	6	5623	5628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488769005
91	NC_021182	CAG	2	6	5806	5811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488769005
92	NC_021182	TTG	2	6	5890	5895	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488769005
93	NC_021182	ATA	2	6	5955	5960	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	488769005
94	NC_021182	GCA	2	6	5979	5984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488769005
95	NC_021182	GCA	2	6	5997	6002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488769005
96	NC_021182	AAG	2	6	6023	6028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488769005
97	NC_021182	ACT	2	6	6045	6050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488769005
98	NC_021182	TTC	2	6	6077	6082	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488769005
99	NC_021182	CAG	2	6	6091	6096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488769005
100	NC_021182	TGG	2	6	6131	6136	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488769005
101	NC_021182	ATT	3	9	6321	6329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488769005
102	NC_021182	CCA	2	6	6438	6443	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488769005
103	NC_021182	AGA	2	6	6512	6517	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488769005
104	NC_021182	TGG	2	6	6521	6526	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488769005
105	NC_021182	ATA	3	9	6532	6540	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	488769005
106	NC_021182	AAC	2	6	6583	6588	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	488769005
107	NC_021182	AGA	2	6	6615	6620	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488769005
108	NC_021182	AGA	2	6	6641	6646	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488769005
109	NC_021182	AAT	2	6	6940	6945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	488769006
110	NC_021182	AGT	2	6	6973	6978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488769006
111	NC_021182	TTA	2	6	7016	7021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488769006
112	NC_021182	AGA	2	6	7069	7074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488769006
113	NC_021182	ATT	2	6	7075	7080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488769006
114	NC_021182	ATG	2	6	7190	7195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488769006
115	NC_021182	CAG	2	6	7280	7285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488769006
116	NC_021182	GAA	4	12	7387	7398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488769006
117	NC_021182	TTA	2	6	7429	7434	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488769006
118	NC_021182	CCT	2	6	7480	7485	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	488769006
119	NC_021182	ATG	2	6	7535	7540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488769006
120	NC_021182	AAG	2	6	7620	7625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488769006
121	NC_021182	GGT	2	6	7650	7655	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488769006
122	NC_021182	GAA	2	6	7678	7683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488769006
123	NC_021182	AAT	2	6	7684	7689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	488769006
124	NC_021182	TAA	2	6	7731	7736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	488769006
125	NC_021182	TAG	2	6	7937	7942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488769006
126	NC_021182	GAA	3	9	8015	8023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488769006
127	NC_021182	TGA	2	6	8097	8102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488769006
128	NC_021182	ATC	2	6	8121	8126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488769006
129	NC_021182	AGA	2	6	8145	8150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488769006
130	NC_021182	AGA	2	6	8215	8220	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488769006
131	NC_021182	AGA	3	9	8247	8255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488769006
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254	NC_021182	ATC	2	6	22078	22083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488769012
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257	NC_021182	CTA	2	6	22144	22149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488769012
258	NC_021182	AGC	2	6	22175	22180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488769012
259	NC_021182	TAA	2	6	22204	22209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	488769012
260	NC_021182	ATA	2	6	22228	22233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	488769012
261	NC_021182	TGC	2	6	22238	22243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488769012
262	NC_021182	TAA	2	6	22271	22276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	488769012
263	NC_021182	GAA	2	6	22447	22452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488769012
264	NC_021182	TAT	2	6	22503	22508	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488769012
265	NC_021182	TAC	2	6	22517	22522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488769012
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286	NC_021182	ATA	2	6	23501	23506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	488769013
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373	NC_021182	TGA	2	6	31268	31273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488769018
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377	NC_021182	TAA	2	6	31529	31534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	488769018
378	NC_021182	CTG	2	6	31540	31545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488769018
379	NC_021182	TTA	3	9	31568	31576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488769018
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