MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactobacillus acidophilus La-14

Total Repeats: 103

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021181	AAGCGA	3	18	59015	59032	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_021181	CGGAGC	2	12	61675	61686	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_021181	AGCGAA	2	12	62898	62909	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_021181	TACTTT	2	12	64466	64477	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_021181	CATAAT	2	12	112597	112608	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_021181	GAAAAT	2	12	118300	118311	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021181	CTTTTA	2	12	140115	140126	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_021181	TTTAAC	2	12	140929	140940	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_021181	GCAATT	2	12	244286	244297	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_021181	AAAGAA	2	12	245191	245202	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021181	TGGTTA	2	12	317693	317704	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021181	TAATTA	2	12	339437	339448	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021181	AAGCGA	3	18	413535	413552	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_021181	CGGAGC	2	12	416442	416453	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_021181	AGCGAA	2	12	417665	417676	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_021181	AAGCGA	3	18	434003	434020	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_021181	CGGAGC	2	12	436663	436674	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_021181	AGCGAA	2	12	437886	437897	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_021181	AATAAA	2	12	448667	448678	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021181	TAAGTT	2	12	450714	450725	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021181	ATAAAA	2	12	546269	546280	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021181	TTTCTG	2	12	549862	549873	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_021181	TTTAGT	2	12	565406	565417	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021181	AACATA	2	12	571303	571314	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_021181	ATTTTG	2	12	667059	667070	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021181	ATCTAT	2	12	696324	696335	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_021181	CATTTT	2	12	712912	712923	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_021181	GCTATT	2	12	720657	720668	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_021181	ATTAGT	2	12	726065	726076	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021181	TATTAA	2	12	804678	804689	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021181	AATAAG	2	12	808534	808545	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021181	TTTAAA	2	12	860615	860626	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021181	AAAAAT	2	12	869258	869269	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021181	TTTTTA	2	12	875646	875657	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021181	ATAGTA	2	12	889857	889868	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021181	CTTATA	2	12	935458	935469	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_021181	ATATTA	2	12	939699	939710	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021181	AAAAAT	2	12	962183	962194	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021181	CTTTTT	2	12	982191	982202	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_021181	ATAATT	2	12	996820	996831	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021181	TATAAA	2	12	1007121	1007132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021181	ATATTT	2	12	1020002	1020013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021181	GGTAAT	2	12	1024982	1024993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021181	TAAATA	2	12	1041724	1041735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021181	AATATT	2	12	1051384	1051395	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021181	GAGAAT	2	12	1060621	1060632	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021181	CAAAAT	2	12	1089537	1089548	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_021181	CATTTA	2	12	1096716	1096727	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_021181	TTAAAA	2	12	1104232	1104243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021181	ATATTA	2	12	1105386	1105397	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021181	TTTAAA	2	12	1107385	1107396	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021181	CTTTAG	2	12	1108832	1108843	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_021181	TTTTAT	2	12	1162442	1162453	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021181	ATTAAA	2	12	1162464	1162475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021181	TAAGAA	2	12	1182963	1182974	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021181	TAAAAA	2	12	1217376	1217387	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021181	TAAAAA	2	12	1221264	1221275	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021181	CATTCG	2	12	1332477	1332488	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_021181	TTTAAT	2	12	1366632	1366643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021181	AAATTA	2	12	1401511	1401522	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021181	TTATAT	2	12	1401752	1401763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021181	TAATTA	2	12	1405826	1405837	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021181	AATTAA	2	12	1431462	1431473	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021181	CAAATA	2	12	1442642	1442653	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_021181	TATAAA	2	12	1473165	1473176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021181	TAAAAA	2	12	1496748	1496759	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021181	TTAATA	2	12	1507848	1507859	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021181	TTTGAT	2	12	1541748	1541759	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021181	AAAAAG	2	12	1558364	1558375	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021181	ATTTTA	2	12	1561098	1561109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021181	ATCTAA	2	12	1616371	1616382	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_021181	TAAAAA	2	12	1627188	1627199	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021181	TTCGCT	2	12	1628630	1628641	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_021181	GCTCCG	2	12	1629853	1629864	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
75	NC_021181	TCGCTT	3	18	1632507	1632524	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_021181	TTACCG	2	12	1640856	1640867	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_021181	TCTACC	2	12	1640975	1640986	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_021181	TTACCG	2	12	1641168	1641179	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_021181	TCTACC	2	12	1641287	1641298	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_021181	CATTTG	2	12	1642665	1642676	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_021181	CATATT	2	12	1643329	1643340	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_021181	CTTCAT	2	12	1644609	1644620	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_021181	TTTTAT	3	18	1674632	1674649	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021181	AAGAAA	2	12	1687220	1687231	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021181	TAATTA	2	12	1705923	1705934	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021181	TAAAAA	2	12	1712914	1712925	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021181	TATTTA	2	12	1721434	1721445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021181	AGCATT	2	12	1723402	1723413	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_021181	ACAATT	2	12	1746683	1746694	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_021181	ATTTCT	2	12	1749462	1749473	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_021181	AAGACT	2	12	1780364	1780375	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_021181	GGCTTC	2	12	1794698	1794709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_021181	ATAACA	2	12	1808839	1808850	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_021181	TCGCTT	2	12	1823966	1823977	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_021181	ATTTTA	2	12	1824177	1824188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_021181	TTCTAT	2	12	1836851	1836862	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_021181	ATTATA	2	12	1847237	1847248	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021181	CGTTTT	2	12	1860798	1860809	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_021181	ATTCCC	2	12	1868506	1868517	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_021181	TAAAAA	2	12	1869492	1869503	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_021181	TTATCA	2	12	1888259	1888270	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_021181	CCTTTT	2	12	1937768	1937779	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_021181	AATTAA	2	12	1940292	1940303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.