MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus acidophilus La-14

Total Repeats: 913

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021181	TGATAT	2	12	1047	1058	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	488766821
2	NC_021181	ATATTT	2	12	3589	3600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488766824
3	NC_021181	GGAGAA	2	12	4267	4278	50 %	0 %	50 %	0 %	488766824
4	NC_021181	ATCCAG	2	12	4845	4856	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	488766825
5	NC_021181	ACTAAG	2	12	5348	5359	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	488766825
6	NC_021181	TGCAAG	2	12	7193	7204	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	488766826
7	NC_021181	TGAAGA	2	12	7748	7759	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	488766826
8	NC_021181	TAATTT	2	12	9227	9238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488766827
9	NC_021181	GCAGAA	2	12	12457	12468	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	488766831
10	NC_021181	TGAAGT	2	12	14020	14031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488766832
11	NC_021181	GCTAAA	2	12	17636	17647	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	488766836
12	NC_021181	TTCATA	2	12	18883	18894	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	488766838
13	NC_021181	TAATTA	2	12	21536	21547	50 %	50 %	0 %	0 %	488766841
14	NC_021181	AATTCA	2	12	21840	21851	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	488766841
15	NC_021181	GAAAAA	2	12	26694	26705	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	488766846
16	NC_021181	ACAAAA	2	12	27499	27510	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	488766847
17	NC_021181	TTAAAA	2	12	27537	27548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	488766847
18	NC_021181	CAAGTA	2	12	32253	32264	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	488766854
19	NC_021181	ATAAAA	2	12	32461	32472	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	488766854
20	NC_021181	TAAAAA	2	12	32563	32574	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	488766854
21	NC_021181	CTTTGT	2	12	35257	35268	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	488766858
22	NC_021181	ATTATG	2	12	38936	38947	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	488766860
23	NC_021181	AGTAAA	2	12	42442	42453	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	488766865
24	NC_021181	TGGTGA	2	12	48674	48685	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	488766870
25	NC_021181	GCTAAT	2	12	48732	48743	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	488766870
26	NC_021181	AAAGGC	2	12	48746	48757	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	488766870
27	NC_021181	ATATTT	2	12	53933	53944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488766876
28	NC_021181	ATGAAG	2	12	56072	56083	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	488766877
29	NC_021181	CATTTA	2	12	56734	56745	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	488766877
30	NC_021181	GCAAAA	2	12	75751	75762	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	488766892
31	NC_021181	CTTTTC	2	12	78150	78161	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488766894
32	NC_021181	ATTCAA	2	12	80859	80870	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	488766896
33	NC_021181	TAAAGA	2	12	87514	87525	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	488766901
34	NC_021181	AATTGC	2	12	89288	89299	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	488766904
35	NC_021181	TTGGAA	2	12	89444	89455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488766904
36	NC_021181	GTGCTG	2	12	90157	90168	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	488766904
37	NC_021181	TTTGGT	2	12	91052	91063	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488766905
38	NC_021181	TTTTTC	2	12	94243	94254	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	488766909
39	NC_021181	AGTATT	2	12	99366	99377	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	488766915
40	NC_021181	GATATA	2	12	102050	102061	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	488766917
41	NC_021181	GAAAAA	2	12	102336	102347	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	488766918
42	NC_021181	TAAATT	2	12	102558	102569	50 %	50 %	0 %	0 %	488766919
43	NC_021181	TAATCC	2	12	105319	105330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488766921
44	NC_021181	CTTTTT	2	12	106975	106986	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	488766923
45	NC_021181	AACTTG	2	12	108314	108325	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	488766925
46	NC_021181	TAGTAA	2	12	108388	108399	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	488766925
47	NC_021181	ATAAAT	2	12	110634	110645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	488766926
48	NC_021181	GCTTCT	2	12	110734	110745	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	488766926
49	NC_021181	CTTATT	2	12	113681	113692	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	488766932
50	NC_021181	ATAAAT	2	12	114228	114239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	488766933
51	NC_021181	AACTTC	2	12	115530	115541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488766934
52	NC_021181	TGATAT	2	12	120141	120152	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	488766939
53	NC_021181	CTATTG	2	12	124817	124828	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	488766943
54	NC_021181	TTGATG	2	12	125773	125784	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	488766944
55	NC_021181	ATCAGG	2	12	128592	128603	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	488766947
56	NC_021181	TAAAAG	2	12	129214	129225	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	488766947
57	NC_021181	TGTTAG	2	12	129351	129362	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	488766948
58	NC_021181	GTAATT	2	12	129701	129712	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	488766948
59	NC_021181	GATAAA	2	12	130749	130760	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	488766949
60	NC_021181	AGCTGC	2	12	131018	131029	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	488766949
61	NC_021181	AATAAA	2	12	132056	132067	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	488766950
62	NC_021181	TTAGTG	2	12	132968	132979	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	488766951
63	NC_021181	AATAAG	2	12	135134	135145	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	488766953
64	NC_021181	CATCTT	2	12	138134	138145	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	488766955
65	NC_021181	TTTGAT	2	12	138362	138373	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	488766955
66	NC_021181	GAAGTC	2	12	140465	140476	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	488766957
67	NC_021181	GTTTTT	2	12	140883	140894	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	488766957
68	NC_021181	TAAGCA	2	12	146152	146163	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	488766965
69	NC_021181	AGTGAA	2	12	148520	148531	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	488766968
70	NC_021181	TTTGAT	2	12	148736	148747	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	488766968
71	NC_021181	CGATTT	2	12	149062	149073	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	488766968
72	NC_021181	CAAAGG	2	12	150343	150354	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	488766969
73	NC_021181	CTAAGA	2	12	151843	151854	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	488766970
74	NC_021181	AGAATT	2	12	153832	153843	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	488766971
75	NC_021181	TGGTCT	2	12	155561	155572	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	488766972
76	NC_021181	ATTGAT	2	12	155944	155955	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	488766973
77	NC_021181	AAATGA	2	12	156950	156961	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	488766974
78	NC_021181	GCCTTG	2	12	157970	157981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488766975
79	NC_021181	TTCATT	2	12	159403	159414	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	488766976
80	NC_021181	ACGAAT	2	12	162393	162404	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	488766977
81	NC_021181	GTAACA	2	12	162792	162803	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	488766977
82	NC_021181	TTGTTC	2	12	164215	164226	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	488766979
83	NC_021181	AGCGCC	2	12	164563	164574	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	488766979
84	NC_021181	CGTTGA	2	12	167526	167537	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	488766982
85	NC_021181	AGCTTT	2	12	168002	168013	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	488766982
86	NC_021181	TAAATT	2	12	169333	169344	50 %	50 %	0 %	0 %	488766983
87	NC_021181	CATCAA	2	12	170109	170120	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	488766984
88	NC_021181	AAAGGA	2	12	174225	174236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488766987
89	NC_021181	TACGAT	2	12	174810	174821	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	488766987
90	NC_021181	ATTAGA	2	12	178234	178245	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	488766990
91	NC_021181	AGAGAA	2	12	180733	180744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488766994
92	NC_021181	GTTTTA	2	12	181754	181765	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	488766994
93	NC_021181	AAGAAC	2	12	191973	191984	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	488767002
94	NC_021181	CAAAAG	2	12	192180	192191	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	488767002
95	NC_021181	GTATCA	2	12	192525	192536	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	488767002
96	NC_021181	TGGTGT	2	12	195375	195386	0 %	50 %	50 %	0 %	488767004
97	NC_021181	CAACTG	2	12	196456	196467	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	488767005
98	NC_021181	TCCAGA	2	12	199907	199918	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	488767008
99	NC_021181	TGACGA	2	12	202509	202520	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	488767011
100	NC_021181	GATAAG	2	12	205069	205080	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	488767014
101	NC_021181	AAGATG	2	12	205205	205216	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	488767014
102	NC_021181	TCAGGT	2	12	207395	207406	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	488767017
103	NC_021181	TGAAGA	2	12	209866	209877	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	488767018
104	NC_021181	TCTAAA	2	12	210407	210418	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	488767018
105	NC_021181	ATCTGA	2	12	213230	213241	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	488767021
106	NC_021181	AACTTT	2	12	217236	217247	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	488767026
107	NC_021181	TCAACT	2	12	218271	218282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488767027
108	NC_021181	AGACTA	2	12	218886	218897	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	488767028
109	NC_021181	GCTTCA	2	12	219227	219238	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	488767028
110	NC_021181	AAGAAA	2	12	219545	219556	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	488767028
111	NC_021181	CTCGTG	2	12	221016	221027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488767029
112	NC_021181	CGTCAC	2	12	230840	230851	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	488767038
113	NC_021181	AAAATG	2	12	231621	231632	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	488767039
114	NC_021181	GTATTC	2	12	231960	231971	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	488767039
115	NC_021181	TTGATC	2	12	233196	233207	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	488767041
116	NC_021181	ATTTTA	2	12	235477	235488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488767043
117	NC_021181	GCCTAA	2	12	235813	235824	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	488767044
118	NC_021181	AACGGC	2	12	236875	236886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488767044
119	NC_021181	CACCGA	2	12	237094	237105	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	488767045
120	NC_021181	ATTGTC	2	12	238191	238202	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	488767046
121	NC_021181	CAACTC	2	12	247959	247970	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	488767057
122	NC_021181	GATTTT	2	12	248069	248080	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	488767057
123	NC_021181	TTACTT	2	12	248778	248789	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	488767060
124	NC_021181	TCACCA	2	12	253525	253536	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	488767065
125	NC_021181	CTGATC	2	12	255073	255084	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	488767066
126	NC_021181	ACTGGT	2	12	257936	257947	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	488767069
127	NC_021181	TAAAGT	2	12	260621	260632	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	488767071
128	NC_021181	TTTAAC	2	12	265755	265766	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	488767075
129	NC_021181	ATCAAA	2	12	269285	269296	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	488767079
130	NC_021181	CTGGTA	2	12	270139	270150	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	488767080
131	NC_021181	GGTAAG	2	12	273874	273885	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	488767083
132	NC_021181	TTTTGA	2	12	276173	276184	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	488767084
133	NC_021181	GTAGAA	2	12	277968	277979	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	488767085
134	NC_021181	GAAGGC	2	12	284247	284258	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	488767087
135	NC_021181	CTGGTA	2	12	286252	286263	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	488767087
136	NC_021181	AAAAAT	2	12	286739	286750	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	488767088
137	NC_021181	AAATCA	2	12	287337	287348	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	488767089
138	NC_021181	TAAGGT	2	12	292117	292128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488767094
139	NC_021181	AATCAC	2	12	292649	292660	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	488767096
140	NC_021181	GCAGAT	2	12	293467	293478	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	488767097
141	NC_021181	AGGTGT	2	12	294978	294989	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	488767100
142	NC_021181	AGAAAA	2	12	295219	295230	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	488767101
143	NC_021181	AAAGTT	2	12	296098	296109	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	488767104
144	NC_021181	CCAATG	2	12	296225	296236	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	488767104
145	NC_021181	AAGTGA	2	12	297678	297689	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	488767108
146	NC_021181	GCACAA	2	12	297793	297804	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	488767108
147	NC_021181	TAAGGG	2	12	297978	297989	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	488767108
148	NC_021181	CTCGTA	2	12	302348	302359	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	488767117
149	NC_021181	CTGATG	2	12	304561	304572	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	488767121
150	NC_021181	TTAAAG	2	12	305139	305150	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	488767121
151	NC_021181	TATCGA	2	12	307196	307207	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	488767124
152	NC_021181	CTTTAA	2	12	308362	308373	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	488767126
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154	NC_021181	AGAAAA	2	12	314853	314864	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	488767134
155	NC_021181	AAAAGA	2	12	316419	316430	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	488767134
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191	NC_021181	GTAACT	2	12	380663	380674	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	488767208
192	NC_021181	ACTGAA	2	12	380849	380860	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	488767208
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200	NC_021181	CTTGGG	2	12	393661	393672	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	488767218
201	NC_021181	TCACTC	2	12	395036	395047	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	488767218
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214	NC_021181	CTTAGG	2	12	452429	452440	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	488767260
215	NC_021181	CATCTT	2	12	454155	454166	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	488767262
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218	NC_021181	AACTGA	2	12	457606	457617	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	488767264
219	NC_021181	ATGATC	2	12	457925	457936	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	488767264
220	NC_021181	AAGATG	2	12	459491	459502	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	488767265
221	NC_021181	GATATT	2	12	460156	460167	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	488767265
222	NC_021181	CAGATG	2	12	460898	460909	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	488767266
223	NC_021181	CGAAAA	2	12	461145	461156	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	488767266
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225	NC_021181	AAATTT	2	12	461751	461762	50 %	50 %	0 %	0 %	488767267
226	NC_021181	GATAAA	2	12	464739	464750	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	488767269
227	NC_021181	CAAATT	2	12	468036	468047	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	488767269
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229	NC_021181	AAAATA	2	12	468624	468635	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	488767270
230	NC_021181	TATAGA	2	12	468764	468775	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	488767270
231	NC_021181	AAGATC	2	12	471432	471443	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	488767272
232	NC_021181	AAATGG	2	12	473378	473389	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	488767275
233	NC_021181	CTTAAA	2	12	477865	477876	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	488767280
234	NC_021181	GCAATG	2	12	480422	480433	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	488767285
235	NC_021181	ACATAA	2	12	482304	482315	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	488767286
236	NC_021181	CTTGGA	2	12	484448	484459	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	488767288
237	NC_021181	GATGCT	2	12	486430	486441	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	488767291
238	NC_021181	TGGACT	2	12	489224	489235	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	488767295
239	NC_021181	CATTAT	2	12	490821	490832	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	488767296
240	NC_021181	TGGAAT	2	12	503638	503649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488767309
241	NC_021181	CTCATG	2	12	505972	505983	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	488767311
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243	NC_021181	ATTGGT	2	12	509767	509778	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	488767313
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250	NC_021181	AGGATG	2	12	521096	521107	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	488767322
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255	NC_021181	TTTGCC	2	12	528118	528129	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	488767329
256	NC_021181	TAAGGG	2	12	531551	531562	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	488767330
257	NC_021181	GCTAAT	2	12	531984	531995	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	488767330
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340	NC_021181	AGTACA	2	12	731496	731507	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	488767522
341	NC_021181	ATTCAC	2	12	732132	732143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488767522
342	NC_021181	CAGTTG	2	12	733876	733887	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	488767525
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344	NC_021181	AGGACT	2	12	734651	734662	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	488767525
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