MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactobacillus acidophilus La-14

Total Repeats: 291

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021181	ATTTT	2	10	10143	10152	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021181	TTTTA	2	10	21061	21070	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021181	AAATT	2	10	22641	22650	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021181	TGTGT	2	10	24406	24415	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021181	AAAAT	2	10	27403	27412	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021181	GTAAA	2	10	41550	41559	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021181	CAAAA	2	10	44900	44909	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_021181	AAGGA	2	10	45183	45192	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021181	AGAGA	2	10	58797	58806	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021181	TCGTG	2	10	60348	60357	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
11	NC_021181	GGCAG	2	10	60747	60756	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
12	NC_021181	GAGAA	2	10	61003	61012	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021181	AAGGC	2	10	62403	62412	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
14	NC_021181	TTTAA	2	10	64606	64615	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021181	CTTAA	2	10	68242	68251	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_021181	TTTTG	2	10	79270	79279	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021181	TTGTT	2	10	94965	94974	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021181	TAAAC	2	10	107480	107489	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_021181	CAATA	2	10	109932	109941	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_021181	TTTAA	2	10	113411	113420	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021181	TTTTA	2	10	121320	121329	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021181	AAATT	2	10	122965	122974	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021181	TTCTA	2	10	123289	123298	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_021181	TAAAA	2	10	155796	155805	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021181	TAAAA	2	10	158944	158953	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021181	ATTTT	2	10	158975	158984	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021181	TATAA	2	10	163464	163473	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021181	AAAAG	2	10	169525	169534	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021181	ATAAA	2	10	171281	171290	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021181	TAATT	2	10	179304	179313	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021181	TATAT	2	10	179334	179343	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021181	AGTAA	2	10	194719	194728	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021181	CAAAA	2	10	201505	201514	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_021181	TTTTA	2	10	203565	203574	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021181	ATAGA	2	10	209437	209446	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021181	TTAGT	2	10	220580	220589	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021181	ACCTC	2	10	241686	241695	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
38	NC_021181	TATTT	2	10	246738	246747	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021181	TTTTA	2	10	250026	250035	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021181	AGGAT	2	10	251715	251724	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021181	ACTTA	2	10	267243	267252	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_021181	TAAAA	2	10	275221	275230	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021181	ACGTT	2	10	302818	302827	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
44	NC_021181	TAGTA	2	10	307677	307686	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021181	CATTT	2	10	311183	311192	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_021181	AGGAA	2	10	319794	319803	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021181	AAAAG	2	10	326028	326037	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021181	TAAAA	2	10	329624	329633	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021181	AATAT	2	10	350449	350458	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021181	ATATT	2	10	375184	375193	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021181	TATTT	2	10	407861	407870	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021181	CAATA	2	10	413279	413288	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
53	NC_021181	TCGTG	2	10	414868	414877	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
54	NC_021181	GGCAG	2	10	415267	415276	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
55	NC_021181	GAGAA	2	10	415770	415779	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021181	AAGGC	2	10	417170	417179	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
57	NC_021181	TAAAA	2	10	420404	420413	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021181	GAGAG	2	10	428360	428369	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021181	AGAGA	2	10	433785	433794	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021181	TCGTG	2	10	435336	435345	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
61	NC_021181	GGCAG	2	10	435735	435744	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
62	NC_021181	GAGAA	2	10	435991	436000	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021181	AAGGC	2	10	437391	437400	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
64	NC_021181	TCAAA	2	10	472560	472569	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
65	NC_021181	TATAA	2	10	476325	476334	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021181	ATTAA	2	10	495859	495868	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021181	TAAAA	2	10	497463	497472	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021181	TAAAA	2	10	524941	524950	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021181	GATAA	2	10	529528	529537	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021181	ATTTA	2	10	529573	529582	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021181	AGTCA	2	10	530366	530375	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
72	NC_021181	CTTGG	2	10	538120	538129	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
73	NC_021181	TTTTA	2	10	544126	544135	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021181	ATATT	2	10	544489	544498	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021181	TTAAT	2	10	550775	550784	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021181	ATAAA	2	10	564133	564142	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021181	ATTTT	2	10	574038	574047	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021181	TAAAA	2	10	578800	578809	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021181	AAGCT	2	10	592108	592117	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
80	NC_021181	TTTCA	2	10	593076	593085	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
81	NC_021181	TGAAA	2	10	593086	593095	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021181	GTAAA	2	10	593157	593166	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021181	AAATG	2	10	593250	593259	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021181	TAGCT	2	10	597332	597341	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
85	NC_021181	TTTAG	2	10	664854	664863	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021181	TAAAA	2	10	700712	700721	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021181	AATTA	2	10	709635	709644	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021181	AAATA	2	10	713019	713028	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021181	AAATG	2	10	730041	730050	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021181	TAAAA	2	10	738975	738984	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021181	TATAA	2	10	741867	741876	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021181	TCAAT	2	10	744768	744777	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
93	NC_021181	ATTCA	2	10	749187	749196	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
94	NC_021181	TTTAG	2	10	751952	751961	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021181	AATAT	2	10	767223	767232	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_021181	AAAAT	2	10	769109	769118	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021181	TATAA	2	10	775067	775076	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021181	CAATT	2	10	784251	784260	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_021181	ATTTA	2	10	796315	796324	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021181	TAACT	2	10	844998	845007	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
101	NC_021181	TAGAA	2	10	851613	851622	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_021181	TTTAC	2	10	852028	852037	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
103	NC_021181	ATCTT	2	10	858327	858336	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
104	NC_021181	GAGTT	2	10	874216	874225	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021181	ATTTT	2	10	879827	879836	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_021181	GGAGT	2	10	880071	880080	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021181	GTATA	2	10	900411	900420	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
108	NC_021181	AAAAG	2	10	901227	901236	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021181	ATTTT	2	10	903767	903776	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021181	AATTA	2	10	905488	905497	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_021181	TTTTA	2	10	908827	908836	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021181	ATAAA	2	10	913374	913383	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021181	GTATA	2	10	921756	921765	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021181	GAATT	2	10	932466	932475	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021181	TATTT	2	10	935435	935444	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_021181	CAGGG	2	10	939725	939734	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
117	NC_021181	TTACT	2	10	939844	939853	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
118	NC_021181	TAAAT	2	10	962768	962777	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021181	GTAAA	2	10	965925	965934	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
120	NC_021181	GTGGA	2	10	965994	966003	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
121	NC_021181	TTTAT	2	10	969959	969968	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_021181	ATTAC	2	10	973497	973506	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
123	NC_021181	TAAAT	2	10	973560	973569	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_021181	ATAGA	2	10	982951	982960	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
125	NC_021181	GGAAC	2	10	982981	982990	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
126	NC_021181	ATACA	2	10	986160	986169	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
127	NC_021181	AGACT	2	10	993827	993836	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
128	NC_021181	ATATA	2	10	1019011	1019020	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_021181	TGTAT	2	10	1021492	1021501	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
130	NC_021181	ATTAA	2	10	1022098	1022107	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_021181	AAGTT	2	10	1025188	1025197	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
132	NC_021181	TTAAG	2	10	1033277	1033286	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
133	NC_021181	TCTTG	2	10	1034128	1034137	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
134	NC_021181	GCAAT	2	10	1045435	1045444	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
135	NC_021181	AATTA	2	10	1050797	1050806	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_021181	AAAAT	2	10	1051788	1051797	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_021181	CAAAA	2	10	1052844	1052853	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
138	NC_021181	GGAAA	2	10	1056887	1056896	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
139	NC_021181	TATAA	2	10	1060298	1060307	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_021181	ATCAA	2	10	1060309	1060318	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
141	NC_021181	ATTTA	2	10	1061894	1061903	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_021181	ATTTT	2	10	1062616	1062625	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_021181	TTTTA	2	10	1069577	1069586	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_021181	ATTTT	2	10	1072462	1072471	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_021181	TTCTT	2	10	1078657	1078666	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
146	NC_021181	TGAAA	2	10	1080236	1080245	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
147	NC_021181	TTAAA	2	10	1081100	1081109	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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287	NC_021181	CAACT	2	10	1937433	1937442	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
288	NC_021181	ATATT	2	10	1952418	1952427	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
289	NC_021181	GTTTA	2	10	1961504	1961513	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
290	NC_021181	TAAGA	2	10	1967089	1967098	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
291	NC_021181	AGTTA	2	10	1967352	1967361	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.