MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Treponema pallidum str. Fribourg-Blanc

Total Repeats: 29

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021179	CCTCCC	2	12	49441	49452	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
2	NC_021179	GCACGA	2	12	59451	59462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_021179	TCTCAA	2	12	125123	125134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_021179	GGCTGG	2	12	150597	150608	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_021179	TCGGGC	2	12	150612	150623	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_021179	CTGCGG	4	24	151789	151812	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_021179	CGGCTC	2	12	152294	152305	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
8	NC_021179	GTGCGA	2	12	234644	234655	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_021179	TCCTTC	2	12	236025	236036	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_021179	GTGCGA	2	12	283046	283057	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_021179	TCCTTC	2	12	284427	284438	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_021179	AATATA	2	12	355668	355679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021179	TTTCCG	2	12	372931	372942	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_021179	TTTGAG	2	12	517645	517656	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021179	CGTGCG	3	18	526086	526103	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_021179	TAACCC	2	12	562999	563010	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_021179	ATACTG	2	12	563093	563104	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_021179	TTCTCC	2	12	699901	699912	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_021179	ACGCGC	2	12	767399	767410	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
20	NC_021179	ACGCGC	2	12	767829	767840	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
21	NC_021179	ACGCAG	2	12	811735	811746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_021179	ACACGC	2	12	820570	820581	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
23	NC_021179	GCAGGG	2	12	829022	829033	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_021179	CAGAGA	2	12	854767	854778	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_021179	GTGCAC	2	12	871048	871059	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_021179	AAAGAC	2	12	883607	883618	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_021179	CCATCC	2	12	891556	891567	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_021179	GGCGCA	2	12	908852	908863	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_021179	GAGCAG	2	12	996737	996748	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.