MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Treponema pallidum str. Fribourg-Blanc

Total Repeats: 785

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021179	AAAGT	2	10	1370	1379	60 %	20 %	20 %	0 %	488657417
2	NC_021179	AGCAC	2	10	1683	1692	40 %	0 %	20 %	40 %	488657418
3	NC_021179	CGAAG	2	10	4771	4780	40 %	0 %	40 %	20 %	488657422
4	NC_021179	ATCGG	2	10	7147	7156	20 %	20 %	40 %	20 %	488657424
5	NC_021179	AAGGA	2	10	9497	9506	60 %	0 %	40 %	0 %	488657425
6	NC_021179	GAAAG	2	10	11082	11091	60 %	0 %	40 %	0 %	488657426
7	NC_021179	CTGTG	2	10	11273	11282	0 %	40 %	40 %	20 %	488657426
8	NC_021179	CTGCG	2	10	15902	15911	0 %	20 %	40 %	40 %	488657429
9	NC_021179	TTGCG	2	10	19721	19730	0 %	40 %	40 %	20 %	488657431
10	NC_021179	GTTTT	2	10	20300	20309	0 %	80 %	20 %	0 %	488657431
11	NC_021179	TGCGA	2	10	22064	22073	20 %	20 %	40 %	20 %	488657432
12	NC_021179	TACCG	2	10	22204	22213	20 %	20 %	20 %	40 %	488657432
13	NC_021179	GCCAC	2	10	22299	22308	20 %	0 %	20 %	60 %	488657432
14	NC_021179	AAGGG	2	10	22901	22910	40 %	0 %	60 %	0 %	488657432
15	NC_021179	CGGTG	2	10	23468	23477	0 %	20 %	60 %	20 %	488657432
16	NC_021179	GTATC	2	10	26078	26087	20 %	40 %	20 %	20 %	488657434
17	NC_021179	GGTGG	2	10	26985	26994	0 %	20 %	80 %	0 %	488657434
18	NC_021179	TATTT	2	10	27711	27720	20 %	80 %	0 %	0 %	488657435
19	NC_021179	CTGCG	2	10	27777	27786	0 %	20 %	40 %	40 %	488657435
20	NC_021179	TGCGC	2	10	29965	29974	0 %	20 %	40 %	40 %	488657437
21	NC_021179	TCCAG	2	10	30791	30800	20 %	20 %	20 %	40 %	488657437
22	NC_021179	TGGGG	2	10	31349	31358	0 %	20 %	80 %	0 %	488657437
23	NC_021179	AAGAT	2	10	33655	33664	60 %	20 %	20 %	0 %	488657438
24	NC_021179	AAAGT	2	10	36209	36218	60 %	20 %	20 %	0 %	488657440
25	NC_021179	GTTGT	2	10	36309	36318	0 %	60 %	40 %	0 %	488657440
26	NC_021179	GATGT	2	10	37372	37381	20 %	40 %	40 %	0 %	488657441
27	NC_021179	TGCAT	2	10	38012	38021	20 %	40 %	20 %	20 %	488657441
28	NC_021179	GGTCA	2	10	39199	39208	20 %	20 %	40 %	20 %	488657442
29	NC_021179	CGGGT	2	10	39309	39318	0 %	20 %	60 %	20 %	488657442
30	NC_021179	TTTTC	2	10	40335	40344	0 %	80 %	0 %	20 %	488657444
31	NC_021179	TGCTG	2	10	43276	43285	0 %	40 %	40 %	20 %	488657447
32	NC_021179	ACGTA	2	10	43477	43486	40 %	20 %	20 %	20 %	488657447
33	NC_021179	CGTCG	2	10	44169	44178	0 %	20 %	40 %	40 %	488657448
34	NC_021179	TTTTG	2	10	46794	46803	0 %	80 %	20 %	0 %	488657451
35	NC_021179	TGTTT	2	10	47641	47650	0 %	80 %	20 %	0 %	488657452
36	NC_021179	AGTTG	2	10	49265	49274	20 %	40 %	40 %	0 %	488657452
37	NC_021179	GCGCA	2	10	49580	49589	20 %	0 %	40 %	40 %	488657453
38	NC_021179	GCGCA	2	10	50740	50749	20 %	0 %	40 %	40 %	488657454
39	NC_021179	TGCAG	2	10	52871	52880	20 %	20 %	40 %	20 %	488657455
40	NC_021179	CGCTG	2	10	53795	53804	0 %	20 %	40 %	40 %	488657455
41	NC_021179	GCTAC	2	10	54159	54168	20 %	20 %	20 %	40 %	488657455
42	NC_021179	TCGCT	2	10	54196	54205	0 %	40 %	20 %	40 %	488657455
43	NC_021179	ATGCT	2	10	55487	55496	20 %	40 %	20 %	20 %	488657457
44	NC_021179	CTGCA	2	10	56890	56899	20 %	20 %	20 %	40 %	488657459
45	NC_021179	GCAGG	2	10	58864	58873	20 %	0 %	60 %	20 %	488657462
46	NC_021179	CTGCA	2	10	59844	59853	20 %	20 %	20 %	40 %	488657463
47	NC_021179	TCAAA	2	10	60367	60376	60 %	20 %	0 %	20 %	488657463
48	NC_021179	GCCAC	2	10	63811	63820	20 %	0 %	20 %	60 %	488657466
49	NC_021179	TGCCT	2	10	65584	65593	0 %	40 %	20 %	40 %	488657469
50	NC_021179	TGAAG	2	10	66061	66070	40 %	20 %	40 %	0 %	488657469
51	NC_021179	TGGGG	2	10	66663	66672	0 %	20 %	80 %	0 %	488657470
52	NC_021179	CGTTG	2	10	67718	67727	0 %	40 %	40 %	20 %	488657471
53	NC_021179	TGAGT	2	10	67739	67748	20 %	40 %	40 %	0 %	488657471
54	NC_021179	CACGG	2	10	68037	68046	20 %	0 %	40 %	40 %	488657471
55	NC_021179	CAGAG	2	10	68856	68865	40 %	0 %	40 %	20 %	488657471
56	NC_021179	CGCTT	2	10	69201	69210	0 %	40 %	20 %	40 %	488657473
57	NC_021179	AGCGT	2	10	71087	71096	20 %	20 %	40 %	20 %	488657477
58	NC_021179	GAAAA	2	10	76664	76673	80 %	0 %	20 %	0 %	488657486
59	NC_021179	AATAA	2	10	77718	77727	80 %	20 %	0 %	0 %	488657486
60	NC_021179	GCGCC	2	10	79353	79362	0 %	0 %	40 %	60 %	488657488
61	NC_021179	CGTGT	2	10	81009	81018	0 %	40 %	40 %	20 %	488657490
62	NC_021179	ATGCA	2	10	83674	83683	40 %	20 %	20 %	20 %	488657492
63	NC_021179	GCACC	2	10	86614	86623	20 %	0 %	20 %	60 %	488657494
64	NC_021179	CGCAC	2	10	87075	87084	20 %	0 %	20 %	60 %	488657494
65	NC_021179	GTACC	2	10	88951	88960	20 %	20 %	20 %	40 %	488657495
66	NC_021179	TTTGC	2	10	90653	90662	0 %	60 %	20 %	20 %	488657498
67	NC_021179	TGGTG	2	10	92023	92032	0 %	40 %	60 %	0 %	488657498
68	NC_021179	CGTGT	2	10	92279	92288	0 %	40 %	40 %	20 %	488657499
69	NC_021179	GGTAT	2	10	92293	92302	20 %	40 %	40 %	0 %	488657499
70	NC_021179	TCGCT	2	10	93129	93138	0 %	40 %	20 %	40 %	488657500
71	NC_021179	CGTAT	2	10	96107	96116	20 %	40 %	20 %	20 %	488657503
72	NC_021179	CGTAC	2	10	96398	96407	20 %	20 %	20 %	40 %	488657504
73	NC_021179	CCCGT	2	10	96565	96574	0 %	20 %	20 %	60 %	488657504
74	NC_021179	AAGGA	2	10	98350	98359	60 %	0 %	40 %	0 %	488657506
75	NC_021179	ACTGC	2	10	100325	100334	20 %	20 %	20 %	40 %	488657508
76	NC_021179	TCCTC	2	10	102358	102367	0 %	40 %	0 %	60 %	488657510
77	NC_021179	CTGCT	2	10	103454	103463	0 %	40 %	20 %	40 %	488657511
78	NC_021179	CTACT	2	10	103517	103526	20 %	40 %	0 %	40 %	488657511
79	NC_021179	GCGGT	2	10	104025	104034	0 %	20 %	60 %	20 %	488657512
80	NC_021179	GTGCT	2	10	105707	105716	0 %	40 %	40 %	20 %	488657512
81	NC_021179	GCGTC	2	10	107115	107124	0 %	20 %	40 %	40 %	488657515
82	NC_021179	ACCTG	2	10	107730	107739	20 %	20 %	20 %	40 %	488657516
83	NC_021179	GAACG	2	10	108046	108055	40 %	0 %	40 %	20 %	488657516
84	NC_021179	GTTCC	2	10	108375	108384	0 %	40 %	20 %	40 %	488657517
85	NC_021179	CCTCG	2	10	110521	110530	0 %	20 %	20 %	60 %	488657519
86	NC_021179	CTGCG	2	10	112595	112604	0 %	20 %	40 %	40 %	488657520
87	NC_021179	TTCGT	2	10	112677	112686	0 %	60 %	20 %	20 %	488657520
88	NC_021179	GGACG	2	10	113194	113203	20 %	0 %	60 %	20 %	488657520
89	NC_021179	GATGT	2	10	113375	113384	20 %	40 %	40 %	0 %	488657520
90	NC_021179	GATTT	2	10	114205	114214	20 %	60 %	20 %	0 %	488657521
91	NC_021179	TCAGA	2	10	117432	117441	40 %	20 %	20 %	20 %	488657522
92	NC_021179	GCAGA	2	10	118432	118441	40 %	0 %	40 %	20 %	488657522
93	NC_021179	ACAGA	2	10	119787	119796	60 %	0 %	20 %	20 %	488657523
94	NC_021179	GGGAG	2	10	119993	120002	20 %	0 %	80 %	0 %	488657523
95	NC_021179	GTGCG	2	10	120124	120133	0 %	20 %	60 %	20 %	488657523
96	NC_021179	TACTG	2	10	120818	120827	20 %	40 %	20 %	20 %	488657524
97	NC_021179	CGTCA	2	10	121731	121740	20 %	20 %	20 %	40 %	488657524
98	NC_021179	TCTTT	2	10	122586	122595	0 %	80 %	0 %	20 %	488657525
99	NC_021179	CGCAG	2	10	124390	124399	20 %	0 %	40 %	40 %	488657526
100	NC_021179	AGCAC	2	10	124426	124435	40 %	0 %	20 %	40 %	488657526
101	NC_021179	CATTG	2	10	126720	126729	20 %	40 %	20 %	20 %	488657527
102	NC_021179	CCGTG	2	10	127081	127090	0 %	20 %	40 %	40 %	488657528
103	NC_021179	AACCA	2	10	128805	128814	60 %	0 %	0 %	40 %	488657529
104	NC_021179	AAAAG	2	10	129456	129465	80 %	0 %	20 %	0 %	488657529
105	NC_021179	TTATC	2	10	130071	130080	20 %	60 %	0 %	20 %	488657530
106	NC_021179	CGCGC	2	10	132206	132215	0 %	0 %	40 %	60 %	488657532
107	NC_021179	GCGAT	2	10	134529	134538	20 %	20 %	40 %	20 %	488657533
108	NC_021179	TGTTT	2	10	135951	135960	0 %	80 %	20 %	0 %	488657534
109	NC_021179	GTCTT	2	10	137139	137148	0 %	60 %	20 %	20 %	488657535
110	NC_021179	ACCAA	2	10	142263	142272	60 %	0 %	0 %	40 %	488657540
111	NC_021179	AGCCA	2	10	142735	142744	40 %	0 %	20 %	40 %	488657540
112	NC_021179	GCAGC	2	10	145449	145458	20 %	0 %	40 %	40 %	488657541
113	NC_021179	GGATC	2	10	147510	147519	20 %	20 %	40 %	20 %	488657543
114	NC_021179	CTTGC	2	10	148897	148906	0 %	40 %	20 %	40 %	488657545
115	NC_021179	GTTTG	2	10	150951	150960	0 %	60 %	40 %	0 %	488657550
116	NC_021179	TGCGC	2	10	153116	153125	0 %	20 %	40 %	40 %	488657555
117	NC_021179	TGTTT	2	10	153390	153399	0 %	80 %	20 %	0 %	488657555
118	NC_021179	GGTCT	2	10	154426	154435	0 %	40 %	40 %	20 %	488657556
119	NC_021179	GGTCT	2	10	155655	155664	0 %	40 %	40 %	20 %	488657557
120	NC_021179	CGGGG	2	10	157029	157038	0 %	0 %	80 %	20 %	488657558
121	NC_021179	GCAAG	2	10	159538	159547	40 %	0 %	40 %	20 %	488657561
122	NC_021179	TGCCT	2	10	164064	164073	0 %	40 %	20 %	40 %	488657567
123	NC_021179	AGAGG	2	10	166152	166161	40 %	0 %	60 %	0 %	488657569
124	NC_021179	GCAGC	2	10	166856	166865	20 %	0 %	40 %	40 %	488657569
125	NC_021179	TGAAG	2	10	168352	168361	40 %	20 %	40 %	0 %	488657570
126	NC_021179	CGGTA	2	10	171702	171711	20 %	20 %	40 %	20 %	488657571
127	NC_021179	ATTCC	2	10	171805	171814	20 %	40 %	0 %	40 %	488657571
128	NC_021179	ATAAG	2	10	172023	172032	60 %	20 %	20 %	0 %	488657571
129	NC_021179	ACGCA	2	10	172612	172621	40 %	0 %	20 %	40 %	488657572
130	NC_021179	CGTGA	2	10	173678	173687	20 %	20 %	40 %	20 %	488657574
131	NC_021179	CTTGC	2	10	173703	173712	0 %	40 %	20 %	40 %	488657574
132	NC_021179	CTTTT	2	10	173743	173752	0 %	80 %	0 %	20 %	488657574
133	NC_021179	CTTCT	2	10	175825	175834	0 %	60 %	0 %	40 %	488657576
134	NC_021179	GTGCT	2	10	175969	175978	0 %	40 %	40 %	20 %	488657576
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