MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Treponema pallidum str. Fribourg-Blanc

Total Repeats: 3050

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021179	TTTG	2	8	237	244	0 %	75 %	25 %	0 %	488657417
2	NC_021179	TACC	2	8	297	304	25 %	25 %	0 %	50 %	488657417
3	NC_021179	TTCC	2	8	329	336	0 %	50 %	0 %	50 %	488657417
4	NC_021179	CATT	2	8	672	679	25 %	50 %	0 %	25 %	488657417
5	NC_021179	GATA	2	8	1047	1054	50 %	25 %	25 %	0 %	488657417
6	NC_021179	TTTG	2	8	1530	1537	0 %	75 %	25 %	0 %	488657418
7	NC_021179	AACT	2	8	1633	1640	50 %	25 %	0 %	25 %	488657418
8	NC_021179	CAAA	2	8	1939	1946	75 %	0 %	0 %	25 %	488657419
9	NC_021179	CTAT	2	8	2612	2619	25 %	50 %	0 %	25 %	488657419
10	NC_021179	GGTT	2	8	3587	3594	0 %	50 %	50 %	0 %	488657420
11	NC_021179	AAAG	2	8	4039	4046	75 %	0 %	25 %	0 %	488657421
12	NC_021179	GTAC	2	8	4104	4111	25 %	25 %	25 %	25 %	488657421
13	NC_021179	GCCC	2	8	4382	4389	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
14	NC_021179	CGTC	2	8	4650	4657	0 %	25 %	25 %	50 %	488657422
15	NC_021179	TCAT	2	8	4707	4714	25 %	50 %	0 %	25 %	488657422
16	NC_021179	GTGC	2	8	5540	5547	0 %	25 %	50 %	25 %	488657422
17	NC_021179	TTAC	2	8	5771	5778	25 %	50 %	0 %	25 %	488657422
18	NC_021179	AAGA	2	8	5807	5814	75 %	0 %	25 %	0 %	488657422
19	NC_021179	GGGC	2	8	6092	6099	0 %	0 %	75 %	25 %	488657422
20	NC_021179	GACG	2	8	6181	6188	25 %	0 %	50 %	25 %	488657422
21	NC_021179	GAGG	2	8	6427	6434	25 %	0 %	75 %	0 %	488657422
22	NC_021179	GCGT	2	8	6765	6772	0 %	25 %	50 %	25 %	488657422
23	NC_021179	AGTT	2	8	7082	7089	25 %	50 %	25 %	0 %	488657424
24	NC_021179	TTAC	2	8	7267	7274	25 %	50 %	0 %	25 %	488657424
25	NC_021179	TTGC	2	8	7317	7324	0 %	50 %	25 %	25 %	488657424
26	NC_021179	GTCA	2	8	7488	7495	25 %	25 %	25 %	25 %	488657424
27	NC_021179	GGTT	2	8	8562	8569	0 %	50 %	50 %	0 %	488657425
28	NC_021179	CCGT	2	8	9126	9133	0 %	25 %	25 %	50 %	488657425
29	NC_021179	GGTA	2	8	9207	9214	25 %	25 %	50 %	0 %	488657425
30	NC_021179	GCAT	2	8	10134	10141	25 %	25 %	25 %	25 %	488657425
31	NC_021179	ATGT	2	8	10213	10220	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021179	GTGG	2	8	10240	10247	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021179	GCTT	2	8	10623	10630	0 %	50 %	25 %	25 %	488657426
34	NC_021179	TGGA	2	8	11620	11627	25 %	25 %	50 %	0 %	488657426
35	NC_021179	AAGT	2	8	11844	11851	50 %	25 %	25 %	0 %	488657426
36	NC_021179	GAGC	2	8	12345	12352	25 %	0 %	50 %	25 %	488657426
37	NC_021179	GCGT	2	8	13221	13228	0 %	25 %	50 %	25 %	488657427
38	NC_021179	GTTT	2	8	13598	13605	0 %	75 %	25 %	0 %	488657427
39	NC_021179	GAAG	2	8	13656	13663	50 %	0 %	50 %	0 %	488657427
40	NC_021179	ACAT	2	8	13691	13698	50 %	25 %	0 %	25 %	488657427
41	NC_021179	AGGG	2	8	14109	14116	25 %	0 %	75 %	0 %	488657428
42	NC_021179	TTTC	2	8	14324	14331	0 %	75 %	0 %	25 %	488657428
43	NC_021179	AGAT	2	8	14982	14989	50 %	25 %	25 %	0 %	488657428
44	NC_021179	GCTC	2	8	15784	15791	0 %	25 %	25 %	50 %	488657428
45	NC_021179	GCTG	2	8	16214	16221	0 %	25 %	50 %	25 %	488657429
46	NC_021179	GTAC	2	8	16312	16319	25 %	25 %	25 %	25 %	488657429
47	NC_021179	TGCG	2	8	16696	16703	0 %	25 %	50 %	25 %	488657429
48	NC_021179	TGGT	2	8	17149	17156	0 %	50 %	50 %	0 %	488657429
49	NC_021179	GCAG	2	8	17503	17510	25 %	0 %	50 %	25 %	488657429
50	NC_021179	AAGG	2	8	17682	17689	50 %	0 %	50 %	0 %	488657429
51	NC_021179	GTGC	2	8	18156	18163	0 %	25 %	50 %	25 %	488657429
52	NC_021179	TTTA	2	8	18327	18334	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021179	CGAT	2	8	18417	18424	25 %	25 %	25 %	25 %	488657430
54	NC_021179	CGTT	2	8	18640	18647	0 %	50 %	25 %	25 %	488657430
55	NC_021179	TATG	2	8	18686	18693	25 %	50 %	25 %	0 %	488657430
56	NC_021179	GTTA	2	8	19791	19798	25 %	50 %	25 %	0 %	488657431
57	NC_021179	GAAA	2	8	20643	20650	75 %	0 %	25 %	0 %	488657431
58	NC_021179	TGCG	2	8	20855	20862	0 %	25 %	50 %	25 %	488657431
59	NC_021179	GCTT	2	8	21175	21182	0 %	50 %	25 %	25 %	488657431
60	NC_021179	ACAA	2	8	22721	22728	75 %	0 %	0 %	25 %	488657432
61	NC_021179	GCAC	2	8	22860	22867	25 %	0 %	25 %	50 %	488657432
62	NC_021179	ATGT	2	8	23081	23088	25 %	50 %	25 %	0 %	488657432
63	NC_021179	CTTC	2	8	24292	24299	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_021179	AAAG	2	8	25262	25269	75 %	0 %	25 %	0 %	488657433
65	NC_021179	TTAT	2	8	25315	25322	25 %	75 %	0 %	0 %	488657433
66	NC_021179	GATT	2	8	25861	25868	25 %	50 %	25 %	0 %	488657434
67	NC_021179	AGCG	2	8	25999	26006	25 %	0 %	50 %	25 %	488657434
68	NC_021179	CCTT	2	8	26835	26842	0 %	50 %	0 %	50 %	488657434
69	NC_021179	GCAC	2	8	26941	26948	25 %	0 %	25 %	50 %	488657434
70	NC_021179	AGCG	2	8	27254	27261	25 %	0 %	50 %	25 %	488657434
71	NC_021179	CAGT	2	8	27345	27352	25 %	25 %	25 %	25 %	488657434
72	NC_021179	TGCG	2	8	27793	27800	0 %	25 %	50 %	25 %	488657435
73	NC_021179	CATC	2	8	27822	27829	25 %	25 %	0 %	50 %	488657435
74	NC_021179	AGTG	2	8	28055	28062	25 %	25 %	50 %	0 %	488657435
75	NC_021179	TTTG	2	8	28439	28446	0 %	75 %	25 %	0 %	488657435
76	NC_021179	AAAG	2	8	30939	30946	75 %	0 %	25 %	0 %	488657437
77	NC_021179	GCGG	2	8	31115	31122	0 %	0 %	75 %	25 %	488657437
78	NC_021179	TCGT	2	8	31281	31288	0 %	50 %	25 %	25 %	488657437
79	NC_021179	TGTC	2	8	31421	31428	0 %	50 %	25 %	25 %	488657437
80	NC_021179	ATCC	2	8	32111	32118	25 %	25 %	0 %	50 %	488657437
81	NC_021179	CTCG	2	8	32120	32127	0 %	25 %	25 %	50 %	488657437
82	NC_021179	GTAC	2	8	32144	32151	25 %	25 %	25 %	25 %	488657437
83	NC_021179	TTCA	2	8	32456	32463	25 %	50 %	0 %	25 %	488657437
84	NC_021179	GTTG	2	8	32485	32492	0 %	50 %	50 %	0 %	488657437
85	NC_021179	CAAA	2	8	32794	32801	75 %	0 %	0 %	25 %	488657437
86	NC_021179	TGCG	2	8	33241	33248	0 %	25 %	50 %	25 %	488657438
87	NC_021179	CCGC	2	8	33644	33651	0 %	0 %	25 %	75 %	488657438
88	NC_021179	GCCG	2	8	34513	34520	0 %	0 %	50 %	50 %	488657439
89	NC_021179	ATTG	2	8	34799	34806	25 %	50 %	25 %	0 %	488657439
90	NC_021179	GACG	2	8	34950	34957	25 %	0 %	50 %	25 %	488657439
91	NC_021179	CGTG	2	8	35744	35751	0 %	25 %	50 %	25 %	488657440
92	NC_021179	GGGT	2	8	36287	36294	0 %	25 %	75 %	0 %	488657440
93	NC_021179	GACA	2	8	36429	36436	50 %	0 %	25 %	25 %	488657440
94	NC_021179	TAAG	2	8	36812	36819	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021179	GTGC	2	8	37188	37195	0 %	25 %	50 %	25 %	488657441
96	NC_021179	GCGA	2	8	37470	37477	25 %	0 %	50 %	25 %	488657441
97	NC_021179	ACGT	2	8	37678	37685	25 %	25 %	25 %	25 %	488657441
98	NC_021179	GAGC	2	8	37733	37740	25 %	0 %	50 %	25 %	488657441
99	NC_021179	TGCG	2	8	38047	38054	0 %	25 %	50 %	25 %	488657441
100	NC_021179	CTTG	2	8	38421	38428	0 %	50 %	25 %	25 %	488657442
101	NC_021179	ACGA	2	8	38548	38555	50 %	0 %	25 %	25 %	488657442
102	NC_021179	GACT	2	8	39605	39612	25 %	25 %	25 %	25 %	488657442
103	NC_021179	GGTT	2	8	39624	39631	0 %	50 %	50 %	0 %	488657442
104	NC_021179	GTAT	2	8	39935	39942	25 %	50 %	25 %	0 %	488657442
105	NC_021179	TTTC	2	8	40095	40102	0 %	75 %	0 %	25 %	488657443
106	NC_021179	TCGG	2	8	40168	40175	0 %	25 %	50 %	25 %	488657443
107	NC_021179	TCCA	2	8	40472	40479	25 %	25 %	0 %	50 %	488657444
108	NC_021179	GAAA	2	8	41025	41032	75 %	0 %	25 %	0 %	488657444
109	NC_021179	AGAA	2	8	41216	41223	75 %	0 %	25 %	0 %	488657445
110	NC_021179	GAAA	2	8	41624	41631	75 %	0 %	25 %	0 %	488657445
111	NC_021179	CATC	2	8	43821	43828	25 %	25 %	0 %	50 %	488657448
112	NC_021179	GCTC	2	8	44237	44244	0 %	25 %	25 %	50 %	488657448
113	NC_021179	GGGT	2	8	44279	44286	0 %	25 %	75 %	0 %	488657448
114	NC_021179	ACCC	2	8	44488	44495	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
115	NC_021179	GCAC	2	8	45358	45365	25 %	0 %	25 %	50 %	488657449
116	NC_021179	AGGA	2	8	45740	45747	50 %	0 %	50 %	0 %	488657450
117	NC_021179	TTAC	2	8	47157	47164	25 %	50 %	0 %	25 %	488657452
118	NC_021179	TCCC	2	8	47201	47208	0 %	25 %	0 %	75 %	488657452
119	NC_021179	TGGG	2	8	47825	47832	0 %	25 %	75 %	0 %	488657452
120	NC_021179	GTCG	2	8	48718	48725	0 %	25 %	50 %	25 %	488657452
121	NC_021179	GGAC	2	8	48768	48775	25 %	0 %	50 %	25 %	488657452
122	NC_021179	CGCC	2	8	49292	49299	0 %	0 %	25 %	75 %	488657452
123	NC_021179	AGCG	2	8	49429	49436	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
124	NC_021179	CGGG	2	8	49497	49504	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
125	NC_021179	GAGG	2	8	49934	49941	25 %	0 %	75 %	0 %	488657453
126	NC_021179	GCAG	2	8	50850	50857	25 %	0 %	50 %	25 %	488657454
127	NC_021179	TTCT	2	8	51464	51471	0 %	75 %	0 %	25 %	488657454
128	NC_021179	GGGC	2	8	52168	52175	0 %	0 %	75 %	25 %	488657454
129	NC_021179	ATGC	2	8	52825	52832	25 %	25 %	25 %	25 %	488657455
130	NC_021179	AATC	2	8	53327	53334	50 %	25 %	0 %	25 %	488657455
131	NC_021179	ATTA	2	8	53355	53362	50 %	50 %	0 %	0 %	488657455
132	NC_021179	CAAA	2	8	53697	53704	75 %	0 %	0 %	25 %	488657455
133	NC_021179	GGAA	2	8	54320	54327	50 %	0 %	50 %	0 %	488657455
134	NC_021179	CAGG	2	8	54524	54531	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
135	NC_021179	GTAC	2	8	54537	54544	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
136	NC_021179	CATC	2	8	54681	54688	25 %	25 %	0 %	50 %	488657456
137	NC_021179	TTTC	2	8	54770	54777	0 %	75 %	0 %	25 %	488657456
138	NC_021179	CTTT	2	8	54900	54907	0 %	75 %	0 %	25 %	488657456
139	NC_021179	TCGT	2	8	55366	55373	0 %	50 %	25 %	25 %	488657456
140	NC_021179	CTAA	2	8	56046	56053	50 %	25 %	0 %	25 %	488657458
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142	NC_021179	TCCT	2	8	56420	56427	0 %	50 %	0 %	50 %	488657458
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