MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Treponema pallidum str. Fribourg-Blanc

Total Repeats: 305

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021179	TC	3	6	4346	4351	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_021179	GA	3	6	12512	12517	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021179	GT	3	6	12520	12525	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021179	GA	4	8	24347	24354	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021179	CA	3	6	24385	24390	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_021179	TC	3	6	24426	24431	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_021179	GA	4	8	24491	24498	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021179	TC	3	6	24571	24576	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_021179	AT	3	6	28937	28942	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021179	CG	3	6	34000	34005	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11	NC_021179	GC	3	6	35440	35445	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_021179	GA	3	6	46726	46731	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021179	CA	3	6	55785	55790	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_021179	GT	3	6	55797	55802	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021179	TG	3	6	62909	62914	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021179	GT	3	6	79035	79040	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021179	GC	3	6	80794	80799	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_021179	AG	3	6	82368	82373	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021179	CA	3	6	94412	94417	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_021179	TG	3	6	97418	97423	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021179	CG	3	6	102780	102785	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_021179	GC	3	6	105848	105853	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_021179	CT	3	6	106670	106675	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_021179	GA	3	6	106681	106686	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021179	TG	3	6	108186	108191	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021179	TA	3	6	113755	113760	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021179	GT	3	6	113775	113780	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021179	CA	3	6	122245	122250	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_021179	GC	3	6	124680	124685	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NC_021179	TG	3	6	124746	124751	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021179	TG	4	8	124942	124949	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021179	GT	3	6	125168	125173	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021179	TG	3	6	129811	129816	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021179	GT	3	6	129875	129880	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021179	AG	3	6	132784	132789	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021179	GT	3	6	139640	139645	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021179	CG	3	6	140972	140977	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_021179	CT	3	6	141017	141022	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_021179	GC	3	6	142951	142956	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_021179	CT	3	6	143048	143053	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_021179	CG	3	6	147598	147603	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_021179	CT	3	6	154269	154274	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_021179	CG	3	6	157585	157590	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_021179	GC	3	6	157637	157642	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_021179	GC	3	6	157692	157697	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
46	NC_021179	CG	4	8	157706	157713	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_021179	GT	3	6	157898	157903	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021179	TC	3	6	169187	169192	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_021179	GC	3	6	169468	169473	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50	NC_021179	TG	3	6	170017	170022	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021179	GC	3	6	170080	170085	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52	NC_021179	GC	3	6	170337	170342	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53	NC_021179	CT	3	6	176980	176985	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_021179	CG	3	6	184393	184398	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55	NC_021179	GC	3	6	204234	204239	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56	NC_021179	GT	3	6	205688	205693	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021179	GT	4	8	206055	206062	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021179	TC	3	6	219017	219022	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_021179	GC	3	6	219804	219809	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
60	NC_021179	TG	3	6	221803	221808	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021179	TG	4	8	221960	221967	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021179	TG	3	6	228580	228585	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021179	TG	3	6	230213	230218	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021179	TG	4	8	231089	231096	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021179	GC	3	6	231112	231117	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
66	NC_021179	AC	3	6	231525	231530	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_021179	CA	3	6	232021	232026	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_021179	AC	3	6	232439	232444	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_021179	AC	3	6	232608	232613	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_021179	TC	3	6	232847	232852	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_021179	AG	3	6	233292	233297	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021179	CG	3	6	233364	233369	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
73	NC_021179	AG	3	6	233432	233437	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021179	AG	3	6	234368	234373	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021179	GA	3	6	234781	234786	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021179	AC	3	6	234813	234818	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_021179	AC	3	6	237732	237737	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_021179	GA	3	6	241423	241428	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021179	GT	3	6	242113	242118	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021179	GT	3	6	242181	242186	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021179	TG	3	6	242942	242947	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021179	TG	3	6	246479	246484	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021179	TG	3	6	254552	254557	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021179	GT	3	6	263983	263988	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021179	GT	3	6	264035	264040	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021179	GT	3	6	266626	266631	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021179	GT	3	6	268213	268218	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021179	GC	3	6	271855	271860	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
89	NC_021179	CA	3	6	271908	271913	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_021179	GC	3	6	273367	273372	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
91	NC_021179	TG	3	6	275272	275277	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021179	TG	4	8	279501	279508	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021179	GC	3	6	279524	279529	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
94	NC_021179	AC	3	6	279937	279942	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_021179	CA	3	6	280433	280438	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_021179	AC	3	6	280851	280856	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_021179	AC	3	6	281020	281025	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_021179	TC	3	6	281259	281264	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_021179	AG	3	6	281694	281699	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021179	CG	3	6	281766	281771	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
101	NC_021179	AG	3	6	281834	281839	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_021179	AG	3	6	282770	282775	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_021179	GA	3	6	283183	283188	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_021179	AC	3	6	283215	283220	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_021179	GA	3	6	291276	291281	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_021179	GC	3	6	293472	293477	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
107	NC_021179	TC	3	6	293512	293517	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_021179	GC	3	6	295234	295239	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
109	NC_021179	GT	3	6	297925	297930	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021179	GT	3	6	298056	298061	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_021179	AG	3	6	298951	298956	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021179	TC	3	6	312092	312097	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_021179	GA	3	6	312186	312191	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021179	CG	3	6	323787	323792	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
115	NC_021179	TG	3	6	323844	323849	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_021179	GC	4	8	323868	323875	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
117	NC_021179	GT	3	6	326665	326670	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_021179	GT	3	6	327859	327864	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021179	GA	3	6	327892	327897	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_021179	CA	3	6	336431	336436	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_021179	GT	3	6	337770	337775	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_021179	CG	3	6	353593	353598	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
123	NC_021179	GT	3	6	378635	378640	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_021179	TG	3	6	380679	380684	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_021179	TG	3	6	381270	381275	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_021179	GT	3	6	381283	381288	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_021179	CG	3	6	396078	396083	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
128	NC_021179	AG	3	6	396424	396429	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_021179	CG	4	8	398078	398085	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
130	NC_021179	CA	5	10	406924	406933	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_021179	GC	3	6	408832	408837	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
132	NC_021179	GT	3	6	424415	424420	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_021179	GC	3	6	431608	431613	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
134	NC_021179	TG	4	8	432559	432566	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_021179	TG	3	6	432569	432574	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_021179	AG	3	6	432588	432593	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_021179	GC	3	6	436674	436679	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
138	NC_021179	CG	4	8	436681	436688	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
139	NC_021179	CG	3	6	440175	440180	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
140	NC_021179	CT	3	6	449466	449471	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_021179	GT	3	6	453480	453485	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_021179	TG	3	6	473597	473602	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_021179	CG	3	6	476676	476681	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
144	NC_021179	CG	3	6	494415	494420	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
145	NC_021179	TC	3	6	509514	509519	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
146	NC_021179	GC	4	8	511910	511917	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
147	NC_021179	GC	3	6	517748	517753	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
148	NC_021179	CG	3	6	525770	525775	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
149	NC_021179	CG	3	6	526102	526107	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
150	NC_021179	CT	3	6	532951	532956	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
151	NC_021179	TA	3	6	533133	533138	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_021179	AT	3	6	533142	533147	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_021179	TC	3	6	541309	541314	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.