MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. Ty21a

Total Repeats: 673

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021176	GAAAA	2	10	10061	10070	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021176	TCTTT	2	10	11323	11332	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_021176	TATTG	2	10	17582	17591	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021176	GCGTC	2	10	28361	28370	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
5	NC_021176	TTTTA	2	10	33215	33224	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021176	ATCGT	2	10	34918	34927	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
7	NC_021176	ATTTT	2	10	34962	34971	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021176	ATTTT	2	10	35222	35231	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021176	TAAAA	2	10	44187	44196	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021176	GAAGG	2	10	47360	47369	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021176	AGCGC	2	10	57231	57240	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
12	NC_021176	ATTTG	2	10	75255	75264	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021176	TAAAA	2	10	95569	95578	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021176	TTTCC	2	10	96008	96017	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
15	NC_021176	GCGCT	2	10	97728	97737	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
16	NC_021176	AGCGC	2	10	97795	97804	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
17	NC_021176	AAGCG	2	10	109086	109095	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
18	NC_021176	TAATT	2	10	118130	118139	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021176	ATTTT	2	10	118156	118165	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021176	TAGTG	2	10	128211	128220	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021176	GGTTT	2	10	135570	135579	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021176	CCCAA	2	10	139584	139593	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
23	NC_021176	TTGTT	2	10	140931	140940	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021176	CGCGG	2	10	160070	160079	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
25	NC_021176	GCGCT	2	10	209265	209274	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
26	NC_021176	TTGCG	2	10	210230	210239	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
27	NC_021176	ATTTA	2	10	217727	217736	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021176	GTTGA	2	10	228623	228632	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021176	TTCAA	2	10	228729	228738	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_021176	GGAAT	2	10	229483	229492	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021176	GCAGC	2	10	230142	230151	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
32	NC_021176	TGCTC	2	10	243048	243057	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
33	NC_021176	CGCTT	2	10	244238	244247	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
34	NC_021176	GTCTG	2	10	253984	253993	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
35	NC_021176	GCCGC	2	10	271837	271846	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
36	NC_021176	GCCGG	2	10	273067	273076	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
37	NC_021176	GCGCT	2	10	277548	277557	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
38	NC_021176	TGTGT	2	10	284650	284659	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021176	AATGA	2	10	286361	286370	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021176	AGCGC	2	10	292836	292845	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
41	NC_021176	ATAAA	2	10	308916	308925	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021176	TTTGG	2	10	309217	309226	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021176	TGTAG	2	10	312089	312098	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021176	TTAAT	2	10	319865	319874	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021176	ATTTT	2	10	332757	332766	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021176	CGCTA	2	10	340843	340852	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
47	NC_021176	TGTGT	2	10	347074	347083	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021176	TGCTG	2	10	350908	350917	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
49	NC_021176	AAGCG	2	10	364533	364542	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
50	NC_021176	TTTAA	2	10	375211	375220	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021176	GGGGC	2	10	376449	376458	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
52	NC_021176	GGAAA	2	10	377368	377377	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021176	ATTTT	2	10	380024	380033	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021176	AGCGC	2	10	389173	389182	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
55	NC_021176	GCAGA	2	10	389474	389483	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
56	NC_021176	TTATT	2	10	389564	389573	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021176	CTTTT	2	10	389691	389700	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
58	NC_021176	GCGCA	2	10	391136	391145	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
59	NC_021176	CGGGC	2	10	400518	400527	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
60	NC_021176	TTGCC	2	10	402629	402638	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
61	NC_021176	CCGGC	2	10	404566	404575	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
62	NC_021176	AATCA	2	10	407388	407397	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
63	NC_021176	CTGCA	2	10	407738	407747	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
64	NC_021176	TGACC	2	10	407898	407907	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
65	NC_021176	TTGAG	2	10	409487	409496	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021176	AAAGT	2	10	461993	462002	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021176	TACTG	2	10	481949	481958	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
68	NC_021176	TATCG	2	10	484201	484210	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
69	NC_021176	TTTCA	2	10	484252	484261	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
70	NC_021176	CGCTT	2	10	485893	485902	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
71	NC_021176	GCGCC	2	10	486933	486942	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
72	NC_021176	AGGTG	2	10	499613	499622	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021176	AGCGC	2	10	511777	511786	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
74	NC_021176	GGCAG	2	10	513962	513971	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
75	NC_021176	GCATG	2	10	515000	515009	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
76	NC_021176	GCATG	2	10	515118	515127	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
77	NC_021176	TACTG	2	10	518934	518943	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
78	NC_021176	AAATG	2	10	528900	528909	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021176	AAAAT	2	10	530653	530662	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021176	TATAA	2	10	539496	539505	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021176	ATAAA	2	10	543051	543060	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021176	ACCCG	2	10	552966	552975	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
83	NC_021176	GTACC	2	10	556911	556920	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
84	NC_021176	GAAAG	2	10	563351	563360	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021176	AGGGC	2	10	571012	571021	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
86	NC_021176	CGCGC	2	10	584195	584204	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
87	NC_021176	ACAGG	2	10	585370	585379	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
88	NC_021176	GCAAA	2	10	598128	598137	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
89	NC_021176	ATTAA	2	10	643249	643258	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021176	TGCTT	2	10	643305	643314	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
91	NC_021176	GAGTA	2	10	652751	652760	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021176	TGAGC	2	10	660632	660641	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
93	NC_021176	ATTGT	2	10	667679	667688	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021176	AATAA	2	10	687813	687822	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021176	GTGGC	2	10	700385	700394	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
96	NC_021176	TTAAA	2	10	701498	701507	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021176	TTACC	2	10	702499	702508	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
98	NC_021176	GGTGC	2	10	706893	706902	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
99	NC_021176	CGCGC	2	10	707009	707018	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
100	NC_021176	TGATG	2	10	707213	707222	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
101	NC_021176	CGGGG	2	10	711578	711587	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
102	NC_021176	TTTAT	2	10	715983	715992	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_021176	TCCGC	2	10	727726	727735	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
104	NC_021176	GAGAG	2	10	758249	758258	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021176	AAAGA	2	10	785813	785822	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
106	NC_021176	TCGCT	2	10	792030	792039	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
107	NC_021176	AGGTA	2	10	802101	802110	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
108	NC_021176	CCAGA	2	10	805306	805315	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
109	NC_021176	TTAAT	2	10	806001	806010	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021176	TCTAT	2	10	812422	812431	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
111	NC_021176	ATCAT	2	10	814741	814750	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
112	NC_021176	AGCGC	2	10	819429	819438	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
113	NC_021176	TAGTT	2	10	820096	820105	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021176	CGGCA	2	10	831880	831889	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
115	NC_021176	AATGC	2	10	842715	842724	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
116	NC_021176	GTGGA	2	10	842834	842843	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
117	NC_021176	TATTT	2	10	884745	884754	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_021176	AGCGC	2	10	896609	896618	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
119	NC_021176	CGGGT	2	10	905791	905800	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
120	NC_021176	TAAAA	2	10	906079	906088	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_021176	ATAAA	2	10	909844	909853	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_021176	AAAGA	2	10	910874	910883	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
123	NC_021176	ATTTA	2	10	930654	930663	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_021176	TGTTT	2	10	932001	932010	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
125	NC_021176	TGTCC	2	10	943739	943748	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
126	NC_021176	TGCCG	2	10	943970	943979	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
127	NC_021176	GCGTT	2	10	944061	944070	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
128	NC_021176	TCTTT	2	10	954313	954322	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
129	NC_021176	TTTTA	2	10	960419	960428	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_021176	ATAAA	2	10	964114	964123	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_021176	CTAAT	2	10	964874	964883	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
132	NC_021176	TAAAT	2	10	964980	964989	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_021176	TCTTT	2	10	970603	970612	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
134	NC_021176	TAAAA	2	10	970699	970708	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_021176	CAATT	2	10	979715	979724	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
136	NC_021176	ATAAA	2	10	985648	985657	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_021176	TAAAG	2	10	995602	995611	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
138	NC_021176	GGTTG	2	10	1006312	1006321	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
139	NC_021176	GACGC	2	10	1006936	1006945	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
140	NC_021176	TTATT	2	10	1032920	1032929	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_021176	TGTAG	2	10	1033631	1033640	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
142	NC_021176	AATAA	2	10	1034644	1034653	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_021176	AAGCG	2	10	1035831	1035840	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
144	NC_021176	TAAAA	2	10	1038959	1038968	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_021176	GCCTT	2	10	1040437	1040446	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
146	NC_021176	AAAGT	2	10	1045035	1045044	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
147	NC_021176	GCGCT	2	10	1049911	1049920	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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281	NC_021176	TGGTA	2	10	1935583	1935592	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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284	NC_021176	CGCGG	2	10	1975695	1975704	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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453	NC_021176	GCGCT	2	10	3231286	3231295	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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460	NC_021176	TTTAC	2	10	3287455	3287464	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
461	NC_021176	GGACG	2	10	3299953	3299962	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
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490	NC_021176	TAAGG	2	10	3584182	3584191	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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500	NC_021176	AAATA	2	10	3642001	3642010	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding

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