MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. Ty21a

Total Repeats: 2635

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021176	AGGTA	2	10	2553	2562	40 %	20 %	40 %	0 %	488652560
2	NC_021176	ATTGC	2	10	3396	3405	20 %	40 %	20 %	20 %	488652561
3	NC_021176	CGGCG	2	10	4144	4153	0 %	0 %	60 %	40 %	488652562
4	NC_021176	CCGCG	2	10	7184	7193	0 %	0 %	40 %	60 %	488652564
5	NC_021176	GCGTG	2	10	13991	14000	0 %	20 %	60 %	20 %	488652572
6	NC_021176	AATCA	2	10	15512	15521	60 %	20 %	0 %	20 %	488652573
7	NC_021176	GGCTG	2	10	18857	18866	0 %	20 %	60 %	20 %	488652577
8	NC_021176	CCTGA	2	10	19919	19928	20 %	20 %	20 %	40 %	488652577
9	NC_021176	GGCCG	2	10	21680	21689	0 %	0 %	60 %	40 %	488652579
10	NC_021176	CTTTT	2	10	23399	23408	0 %	80 %	0 %	20 %	488652580
11	NC_021176	CGGTA	2	10	24565	24574	20 %	20 %	40 %	20 %	488652581
12	NC_021176	CTGTT	2	10	24604	24613	0 %	60 %	20 %	20 %	488652581
13	NC_021176	ATCTG	2	10	30969	30978	20 %	40 %	20 %	20 %	488652587
14	NC_021176	TTACG	2	10	31024	31033	20 %	40 %	20 %	20 %	488652587
15	NC_021176	GGGCG	2	10	31793	31802	0 %	0 %	80 %	20 %	488652588
16	NC_021176	TGCGT	2	10	32172	32181	0 %	40 %	40 %	20 %	488652589
17	NC_021176	AAAAG	2	10	32566	32575	80 %	0 %	20 %	0 %	488652590
18	NC_021176	TATAA	2	10	34169	34178	60 %	40 %	0 %	0 %	488652591
19	NC_021176	AGCGA	2	10	35591	35600	40 %	0 %	40 %	20 %	488652593
20	NC_021176	TCCTG	2	10	35801	35810	0 %	40 %	20 %	40 %	488652593
21	NC_021176	GGTCA	2	10	38036	38045	20 %	20 %	40 %	20 %	488652594
22	NC_021176	TTCAT	2	10	39308	39317	20 %	60 %	0 %	20 %	488652595
23	NC_021176	TGAAA	2	10	40124	40133	60 %	20 %	20 %	0 %	488652596
24	NC_021176	ACGGC	2	10	44483	44492	20 %	0 %	40 %	40 %	488652599
25	NC_021176	GGGCT	2	10	46557	46566	0 %	20 %	60 %	20 %	488652600
26	NC_021176	GCGTA	2	10	48433	48442	20 %	20 %	40 %	20 %	488652602
27	NC_021176	GACCA	2	10	49038	49047	40 %	0 %	20 %	40 %	488652602
28	NC_021176	CAGAC	2	10	50370	50379	40 %	0 %	20 %	40 %	488652602
29	NC_021176	GTTTG	2	10	54526	54535	0 %	60 %	40 %	0 %	488652607
30	NC_021176	GTTTG	2	10	55454	55463	0 %	60 %	40 %	0 %	488652607
31	NC_021176	CACTA	2	10	56585	56594	40 %	20 %	0 %	40 %	488652607
32	NC_021176	TTCAC	2	10	57378	57387	20 %	40 %	0 %	40 %	488652609
33	NC_021176	AAAAT	2	10	58949	58958	80 %	20 %	0 %	0 %	488652611
34	NC_021176	GGAAA	2	10	59736	59745	60 %	0 %	40 %	0 %	488652611
35	NC_021176	CGCTG	2	10	60226	60235	0 %	20 %	40 %	40 %	488652612
36	NC_021176	CGGCG	2	10	63992	64001	0 %	0 %	60 %	40 %	488652615
37	NC_021176	GCGCG	2	10	64939	64948	0 %	0 %	60 %	40 %	488652616
38	NC_021176	ACGGC	2	10	69540	69549	20 %	0 %	40 %	40 %	488652619
39	NC_021176	CGTGC	2	10	71361	71370	0 %	20 %	40 %	40 %	488652622
40	NC_021176	TTGAT	2	10	71531	71540	20 %	60 %	20 %	0 %	488652622
41	NC_021176	ACCGC	2	10	72091	72100	20 %	0 %	20 %	60 %	488652622
42	NC_021176	CGATG	2	10	77561	77570	20 %	20 %	40 %	20 %	488652627
43	NC_021176	GCGAA	2	10	78502	78511	40 %	0 %	40 %	20 %	488652627
44	NC_021176	TTGCC	2	10	81029	81038	0 %	40 %	20 %	40 %	488652629
45	NC_021176	TGGCG	2	10	83077	83086	0 %	20 %	60 %	20 %	488652631
46	NC_021176	TCAGC	2	10	84260	84269	20 %	20 %	20 %	40 %	488652632
47	NC_021176	GTACG	2	10	86979	86988	20 %	20 %	40 %	20 %	488652634
48	NC_021176	CAGAA	2	10	87692	87701	60 %	0 %	20 %	20 %	488652634
49	NC_021176	CCGCA	2	10	89811	89820	20 %	0 %	20 %	60 %	488652637
50	NC_021176	CGGTT	2	10	90316	90325	0 %	40 %	40 %	20 %	488652638
51	NC_021176	TGGCG	2	10	92097	92106	0 %	20 %	60 %	20 %	488652640
52	NC_021176	GTGGC	2	10	96577	96586	0 %	20 %	60 %	20 %	488652645
53	NC_021176	TGCAC	2	10	98493	98502	20 %	20 %	20 %	40 %	488652647
54	NC_021176	TGGCA	2	10	98562	98571	20 %	20 %	40 %	20 %	488652647
55	NC_021176	TCTGT	2	10	98888	98897	0 %	60 %	20 %	20 %	488652648
56	NC_021176	GCGCT	2	10	99198	99207	0 %	20 %	40 %	40 %	488652648
57	NC_021176	GGCGC	2	10	99612	99621	0 %	0 %	60 %	40 %	488652648
58	NC_021176	GCGAC	2	10	99925	99934	20 %	0 %	40 %	40 %	488652648
59	NC_021176	TCTGT	2	10	100217	100226	0 %	60 %	20 %	20 %	488652648
60	NC_021176	AACGT	2	10	102372	102381	40 %	20 %	20 %	20 %	488652651
61	NC_021176	CCCAA	2	10	104522	104531	40 %	0 %	0 %	60 %	488652654
62	NC_021176	TTGTT	2	10	105229	105238	0 %	80 %	20 %	0 %	488652654
63	NC_021176	GCTTC	2	10	106603	106612	0 %	40 %	20 %	40 %	488652655
64	NC_021176	TGCGT	2	10	106890	106899	0 %	40 %	40 %	20 %	488652655
65	NC_021176	TGATC	2	10	108590	108599	20 %	40 %	20 %	20 %	488652656
66	NC_021176	TGGCG	2	10	111750	111759	0 %	20 %	60 %	20 %	488652658
67	NC_021176	AGCGC	2	10	112310	112319	20 %	0 %	40 %	40 %	488652658
68	NC_021176	CCGCG	2	10	113395	113404	0 %	0 %	40 %	60 %	488652659
69	NC_021176	GGGGT	2	10	114791	114800	0 %	20 %	80 %	0 %	488652659
70	NC_021176	ACGGT	2	10	116620	116629	20 %	20 %	40 %	20 %	488652662
71	NC_021176	TGGCG	2	10	116988	116997	0 %	20 %	60 %	20 %	488652662
72	NC_021176	ACAGA	2	10	118339	118348	60 %	0 %	20 %	20 %	488652664
73	NC_021176	CAGCG	2	10	119514	119523	20 %	0 %	40 %	40 %	488652666
74	NC_021176	GCCGG	2	10	119814	119823	0 %	0 %	60 %	40 %	488652666
75	NC_021176	CGAGC	2	10	119939	119948	20 %	0 %	40 %	40 %	488652666
76	NC_021176	ATTTG	2	10	120382	120391	20 %	60 %	20 %	0 %	488652666
77	NC_021176	TTGCC	2	10	124886	124895	0 %	40 %	20 %	40 %	488652670
78	NC_021176	AGTTT	2	10	127793	127802	20 %	60 %	20 %	0 %	488652672
79	NC_021176	TCGAT	2	10	129641	129650	20 %	40 %	20 %	20 %	488652673
80	NC_021176	CGTTT	2	10	132413	132422	0 %	60 %	20 %	20 %	488652676
81	NC_021176	ATTCC	2	10	137515	137524	20 %	40 %	0 %	40 %	488652680
82	NC_021176	AAAGC	2	10	139812	139821	60 %	0 %	20 %	20 %	488652682
83	NC_021176	CCGCA	2	10	140345	140354	20 %	0 %	20 %	60 %	488652682
84	NC_021176	AGTTC	2	10	142716	142725	20 %	40 %	20 %	20 %	488652685
85	NC_021176	TGCCT	2	10	142816	142825	0 %	40 %	20 %	40 %	488652686
86	NC_021176	AAGCG	2	10	147469	147478	40 %	0 %	40 %	20 %	488652689
87	NC_021176	GTTTG	2	10	149372	149381	0 %	60 %	40 %	0 %	488652691
88	NC_021176	CGTAT	2	10	150843	150852	20 %	40 %	20 %	20 %	488652692
89	NC_021176	ATGGC	2	10	152096	152105	20 %	20 %	40 %	20 %	488652693
90	NC_021176	ATCAG	2	10	152679	152688	40 %	20 %	20 %	20 %	488652694
91	NC_021176	CTGCC	2	10	154688	154697	0 %	20 %	20 %	60 %	488652695
92	NC_021176	CGGCG	2	10	157418	157427	0 %	0 %	60 %	40 %	488652698
93	NC_021176	CCGGC	2	10	160774	160783	0 %	0 %	40 %	60 %	488652701
94	NC_021176	CGCTG	2	10	161666	161675	0 %	20 %	40 %	40 %	488652701
95	NC_021176	GAACC	2	10	164633	164642	40 %	0 %	20 %	40 %	488652704
96	NC_021176	GATCA	2	10	165821	165830	40 %	20 %	20 %	20 %	488652706
97	NC_021176	ATCCC	2	10	168267	168276	20 %	20 %	0 %	60 %	488652709
98	NC_021176	AGCGC	2	10	168975	168984	20 %	0 %	40 %	40 %	488652709
99	NC_021176	TGAGC	2	10	170824	170833	20 %	20 %	40 %	20 %	488652710
100	NC_021176	CGCAT	2	10	171086	171095	20 %	20 %	20 %	40 %	488652711
101	NC_021176	CGAAC	2	10	171815	171824	40 %	0 %	20 %	40 %	488652712
102	NC_021176	GTTCA	2	10	172081	172090	20 %	40 %	20 %	20 %	488652712
103	NC_021176	ATGAC	2	10	173047	173056	40 %	20 %	20 %	20 %	488652713
104	NC_021176	ACTGG	2	10	173636	173645	20 %	20 %	40 %	20 %	488652714
105	NC_021176	CAGAA	2	10	175756	175765	60 %	0 %	20 %	20 %	488652716
106	NC_021176	CGAAG	2	10	178627	178636	40 %	0 %	40 %	20 %	488652719
107	NC_021176	GACTG	2	10	180428	180437	20 %	20 %	40 %	20 %	488652720
108	NC_021176	GGCAT	2	10	185908	185917	20 %	20 %	40 %	20 %	488652723
109	NC_021176	GGCCA	2	10	186330	186339	20 %	0 %	40 %	40 %	488652724
110	NC_021176	CGTTT	2	10	186845	186854	0 %	60 %	20 %	20 %	488652724
111	NC_021176	GGGGA	2	10	186897	186906	20 %	0 %	80 %	0 %	488652724
112	NC_021176	TCTGG	2	10	190530	190539	0 %	40 %	40 %	20 %	488652726
113	NC_021176	CGGCG	2	10	192513	192522	0 %	0 %	60 %	40 %	488652728
114	NC_021176	CCGCT	2	10	193220	193229	0 %	20 %	20 %	60 %	488652728
115	NC_021176	GCCCA	2	10	195772	195781	20 %	0 %	20 %	60 %	488652731
116	NC_021176	GCGCA	2	10	196177	196186	20 %	0 %	40 %	40 %	488652731
117	NC_021176	ATCGG	2	10	197568	197577	20 %	20 %	40 %	20 %	488652733
118	NC_021176	GCCGC	2	10	198778	198787	0 %	0 %	40 %	60 %	488652735
119	NC_021176	CAAAC	2	10	200804	200813	60 %	0 %	0 %	40 %	488652736
120	NC_021176	ATCCA	2	10	204128	204137	40 %	20 %	0 %	40 %	488652738
121	NC_021176	CGGCG	2	10	206361	206370	0 %	0 %	60 %	40 %	488652741
122	NC_021176	TGGGC	2	10	206932	206941	0 %	20 %	60 %	20 %	488652742
123	NC_021176	TTCGG	2	10	207241	207250	0 %	40 %	40 %	20 %	488652742
124	NC_021176	CTTGC	2	10	208250	208259	0 %	40 %	20 %	40 %	488652743
125	NC_021176	TGAGC	2	10	208662	208671	20 %	20 %	40 %	20 %	488652744
126	NC_021176	GGCGT	2	10	209865	209874	0 %	20 %	60 %	20 %	488652745
127	NC_021176	TTTTA	2	10	212441	212450	20 %	80 %	0 %	0 %	488652748
128	NC_021176	GTTGC	2	10	213334	213343	0 %	40 %	40 %	20 %	488652750
129	NC_021176	TTCAC	2	10	214764	214773	20 %	40 %	0 %	40 %	488652750
130	NC_021176	GAGTT	2	10	216099	216108	20 %	40 %	40 %	0 %	488652751
131	NC_021176	CGCGG	2	10	218287	218296	0 %	0 %	60 %	40 %	488652754
132	NC_021176	CGCGG	2	10	218471	218480	0 %	0 %	60 %	40 %	488652754
133	NC_021176	GCCAG	2	10	220455	220464	20 %	0 %	40 %	40 %	488652755
134	NC_021176	GCGCG	2	10	221021	221030	0 %	0 %	60 %	40 %	488652756
135	NC_021176	CGGGG	2	10	222839	222848	0 %	0 %	80 %	20 %	488652759
136	NC_021176	CAGCG	2	10	225022	225031	20 %	0 %	40 %	40 %	488652759
137	NC_021176	GGCGG	2	10	226772	226781	0 %	0 %	80 %	20 %	488652760
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139	NC_021176	GGCGT	2	10	232536	232545	0 %	20 %	60 %	20 %	488652763
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142	NC_021176	TGCTT	2	10	236693	236702	0 %	60 %	20 %	20 %	488652765
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244	NC_021176	CCATG	2	10	417962	417971	20 %	20 %	20 %	40 %	488652901
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247	NC_021176	TGAGA	2	10	424872	424881	40 %	20 %	40 %	0 %	488652907
248	NC_021176	TTCAG	2	10	426025	426034	20 %	40 %	20 %	20 %	488652907
249	NC_021176	CAGCT	2	10	426157	426166	20 %	20 %	20 %	40 %	488652907
250	NC_021176	CTTCG	2	10	426953	426962	0 %	40 %	20 %	40 %	488652908
251	NC_021176	GATGT	2	10	429536	429545	20 %	40 %	40 %	0 %	488652911
252	NC_021176	ATCGA	2	10	430247	430256	40 %	20 %	20 %	20 %	488652911
253	NC_021176	CCATT	2	10	434361	434370	20 %	40 %	0 %	40 %	488652915
254	NC_021176	TCGAA	2	10	435883	435892	40 %	20 %	20 %	20 %	488652917
255	NC_021176	TGCCC	2	10	436715	436724	0 %	20 %	20 %	60 %	488652918
256	NC_021176	TTCAT	2	10	439107	439116	20 %	60 %	0 %	20 %	488652921
257	NC_021176	GCCGC	2	10	440641	440650	0 %	0 %	40 %	60 %	488652923
258	NC_021176	CGCTA	2	10	440820	440829	20 %	20 %	20 %	40 %	488652923
259	NC_021176	GTTAT	2	10	443050	443059	20 %	60 %	20 %	0 %	488652925
260	NC_021176	GGCGA	2	10	445119	445128	20 %	0 %	60 %	20 %	488652926
261	NC_021176	GGCGC	2	10	446217	446226	0 %	0 %	60 %	40 %	488652928
262	NC_021176	ATGCC	2	10	453073	453082	20 %	20 %	20 %	40 %	488652933
263	NC_021176	ACACA	2	10	453551	453560	60 %	0 %	0 %	40 %	488652933
264	NC_021176	CGCGC	2	10	453677	453686	0 %	0 %	40 %	60 %	488652933
265	NC_021176	AGTTG	2	10	454516	454525	20 %	40 %	40 %	0 %	488652933
266	NC_021176	TTTTA	2	10	455338	455347	20 %	80 %	0 %	0 %	488652934
267	NC_021176	TTTTA	2	10	456207	456216	20 %	80 %	0 %	0 %	488652934
268	NC_021176	TGCAA	2	10	456298	456307	40 %	20 %	20 %	20 %	488652934
269	NC_021176	ATGGG	2	10	456370	456379	20 %	20 %	60 %	0 %	488652934
270	NC_021176	TGACC	2	10	456916	456925	20 %	20 %	20 %	40 %	488652935
271	NC_021176	CAACT	2	10	457000	457009	40 %	20 %	0 %	40 %	488652935
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280	NC_021176	TGGCG	2	10	474401	474410	0 %	20 %	60 %	20 %	488652951
281	NC_021176	GTTCG	2	10	475078	475087	0 %	40 %	40 %	20 %	488652952
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373	NC_021176	GCCAC	2	10	637850	637859	20 %	0 %	20 %	60 %	488653111
374	NC_021176	GCAGC	2	10	639253	639262	20 %	0 %	40 %	40 %	488653113
375	NC_021176	CTGTC	2	10	641608	641617	0 %	40 %	20 %	40 %	488653114
376	NC_021176	GCGCG	2	10	642169	642178	0 %	0 %	60 %	40 %	488653115
377	NC_021176	CTGCG	2	10	642353	642362	0 %	20 %	40 %	40 %	488653115
378	NC_021176	CCGGC	2	10	646121	646130	0 %	0 %	40 %	60 %	488653119
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380	NC_021176	ATTTT	2	10	651655	651664	20 %	80 %	0 %	0 %	488653125
381	NC_021176	CGCAA	2	10	653237	653246	40 %	0 %	20 %	40 %	488653126
382	NC_021176	TCCGG	2	10	653873	653882	0 %	20 %	40 %	40 %	488653126
383	NC_021176	CTTCA	2	10	654399	654408	20 %	40 %	0 %	40 %	488653127
384	NC_021176	GCTGA	2	10	659079	659088	20 %	20 %	40 %	20 %	488653130
385	NC_021176	GAGCA	2	10	664174	664183	40 %	0 %	40 %	20 %	488653135
386	NC_021176	CCACG	2	10	664677	664686	20 %	0 %	20 %	60 %	488653135
387	NC_021176	GATGC	2	10	666616	666625	20 %	20 %	40 %	20 %	488653136
388	NC_021176	GCGAC	2	10	666660	666669	20 %	0 %	40 %	40 %	488653136
389	NC_021176	TTCTC	2	10	669763	669772	0 %	60 %	0 %	40 %	488653138
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