MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. Ty21a

Total Repeats: 9806

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021176	CAG	2	6	64	69	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_021176	ACA	2	6	181	186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_021176	CAC	3	9	204	212	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_021176	ACC	2	6	217	222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_021176	AAC	2	6	330	335	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_021176	GTG	2	6	5062	5067	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021176	CGC	2	6	5931	5936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_021176	TTG	2	6	7408	7413	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021176	TGA	2	6	7428	7433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021176	ATG	2	6	7453	7458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021176	CGG	2	6	7505	7510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_021176	CGT	2	6	7599	7604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_021176	ATC	2	6	7608	7613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_021176	AAT	2	6	8722	8727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021176	TAG	2	6	9334	9339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021176	TCC	2	6	9346	9351	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_021176	GGA	2	6	9359	9364	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021176	ATC	2	6	9954	9959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_021176	ATA	2	6	10017	10022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021176	TAA	2	6	10051	10056	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021176	TTA	2	6	11333	11338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021176	GTT	2	6	11362	11367	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021176	TGA	2	6	11447	11452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021176	GTG	2	6	11487	11492	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021176	TTA	2	6	11541	11546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021176	TTC	2	6	14755	14760	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_021176	TTG	2	6	14841	14846	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021176	CAG	2	6	14883	14888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_021176	TGA	2	6	14924	14929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021176	TAT	2	6	14976	14981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021176	ATG	2	6	16007	16012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021176	ATT	2	6	16061	16066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021176	ATT	2	6	17618	17623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021176	GTT	2	6	17710	17715	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021176	GTT	2	6	17734	17739	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021176	ATC	2	6	17763	17768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_021176	CCA	2	6	20037	20042	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_021176	TTA	2	6	23172	23177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021176	TAA	2	6	24101	24106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021176	AAG	2	6	24128	24133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021176	ATT	2	6	24134	24139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021176	ACA	2	6	24201	24206	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_021176	GAT	2	6	24238	24243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021176	TAA	2	6	24265	24270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021176	TAA	2	6	24272	24277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021176	ACG	2	6	24312	24317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_021176	AAG	2	6	24359	24364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021176	GAA	2	6	24403	24408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021176	CAG	2	6	24413	24418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_021176	CAT	2	6	26751	26756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_021176	GCC	2	6	26772	26777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_021176	CCG	2	6	26810	26815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_021176	GCG	2	6	26819	26824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_021176	CCG	2	6	26885	26890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_021176	GGC	2	6	26912	26917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_021176	GCG	2	6	26926	26931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_021176	TAG	2	6	26955	26960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021176	GCG	2	6	27077	27082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_021176	ATA	2	6	27146	27151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021176	GAT	2	6	27265	27270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021176	ATT	2	6	27347	27352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021176	TAT	2	6	27361	27366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021176	AGG	2	6	27370	27375	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021176	TTA	2	6	27428	27433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021176	TGA	2	6	27462	27467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021176	TTG	2	6	27478	27483	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021176	ACA	2	6	27533	27538	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_021176	ATG	3	9	27620	27628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021176	ACT	2	6	27720	27725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_021176	ACA	2	6	27746	27751	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_021176	GCG	2	6	27788	27793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_021176	CAG	2	6	27868	27873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_021176	GCG	2	6	27890	27895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_021176	TGG	2	6	27899	27904	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021176	GGT	2	6	28032	28037	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021176	CGA	2	6	28046	28051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_021176	TGA	2	6	28095	28100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021176	TGA	2	6	28110	28115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021176	TTG	2	6	28271	28276	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021176	ATC	2	6	28373	28378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_021176	TCC	2	6	28384	28389	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_021176	GGT	2	6	32468	32473	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021176	ATA	2	6	33138	33143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021176	CAT	2	6	33205	33210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_021176	TAA	2	6	33259	33264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021176	GTG	2	6	33304	33309	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021176	ATG	2	6	33331	33336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021176	CTT	2	6	34451	34456	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_021176	AGA	2	6	34464	34469	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021176	ATA	2	6	34495	34500	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021176	ATA	3	9	34849	34857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021176	ATG	2	6	34937	34942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021176	TAG	2	6	34995	35000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021176	TTG	2	6	35043	35048	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021176	AAT	2	6	35055	35060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_021176	ATT	2	6	35234	35239	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021176	TTG	2	6	35253	35258	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021176	TTG	2	6	35291	35296	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_021176	TAA	2	6	35323	35328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021176	TCA	2	6	38754	38759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_021176	TGT	2	6	39567	39572	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_021176	AAG	2	6	39576	39581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_021176	TGT	2	6	39672	39677	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_021176	TTA	2	6	39678	39683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021176	TGT	2	6	39717	39722	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_021176	AAT	2	6	39768	39773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021176	AAT	2	6	39980	39985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_021176	GAA	2	6	40010	40015	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021176	AAT	2	6	41625	41630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021176	GTA	2	6	42913	42918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_021176	GGC	2	6	43099	43104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_021176	TGA	2	6	44201	44206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021176	GTT	2	6	44210	44215	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021176	ATC	2	6	46030	46035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_021176	TCA	2	6	46100	46105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_021176	TAG	2	6	46146	46151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_021176	GAA	2	6	46156	46161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_021176	CCT	2	6	50415	50420	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_021176	ATT	2	6	51890	51895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_021176	AGT	2	6	51955	51960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_021176	ATT	2	6	51981	51986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_021176	TTA	2	6	52009	52014	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_021176	GGT	2	6	52047	52052	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_021176	CTT	2	6	52604	52609	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_021176	GTG	2	6	57253	57258	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_021176	GAT	2	6	58769	58774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_021176	GTC	2	6	58841	58846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_021176	ACG	2	6	66914	66919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_021176	GAC	2	6	66928	66933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_021176	CCG	2	6	67033	67038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_021176	TAA	2	6	68433	68438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_021176	ATT	2	6	68499	68504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_021176	TTA	2	6	68506	68511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_021176	TCT	2	6	73839	73844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_021176	GGC	2	6	73947	73952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_021176	TCT	2	6	74976	74981	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_021176	ATG	2	6	75248	75253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_021176	TGT	2	6	75304	75309	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_021176	GTT	2	6	75367	75372	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_021176	GTT	2	6	75377	75382	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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482	NC_021176	CCG	2	6	292862	292867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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