MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. Ty21a

Total Repeats: 9345

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021176	AT	3	6	55	60	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021176	GC	3	6	575	580	0 %	0 %	50 %	50 %	488652560
3	NC_021176	CT	3	6	1105	1110	0 %	50 %	0 %	50 %	488652560
4	NC_021176	TG	3	6	1417	1422	0 %	50 %	50 %	0 %	488652560
5	NC_021176	GC	3	6	1436	1441	0 %	0 %	50 %	50 %	488652560
6	NC_021176	CT	3	6	2254	2259	0 %	50 %	0 %	50 %	488652560
7	NC_021176	TC	3	6	2292	2297	0 %	50 %	0 %	50 %	488652560
8	NC_021176	GC	3	6	2314	2319	0 %	0 %	50 %	50 %	488652560
9	NC_021176	CG	3	6	2345	2350	0 %	0 %	50 %	50 %	488652560
10	NC_021176	CG	4	8	3503	3510	0 %	0 %	50 %	50 %	488652561
11	NC_021176	GC	3	6	3558	3563	0 %	0 %	50 %	50 %	488652561
12	NC_021176	CG	3	6	3962	3967	0 %	0 %	50 %	50 %	488652562
13	NC_021176	CG	3	6	4206	4211	0 %	0 %	50 %	50 %	488652562
14	NC_021176	TG	3	6	5148	5153	0 %	50 %	50 %	0 %	488652563
15	NC_021176	CG	3	6	5251	5256	0 %	0 %	50 %	50 %	488652563
16	NC_021176	CG	3	6	5470	5475	0 %	0 %	50 %	50 %	488652563
17	NC_021176	AG	3	6	5552	5557	50 %	0 %	50 %	0 %	488652563
18	NC_021176	CG	3	6	5971	5976	0 %	0 %	50 %	50 %	488652564
19	NC_021176	GC	3	6	6889	6894	0 %	0 %	50 %	50 %	488652564
20	NC_021176	CG	3	6	6991	6996	0 %	0 %	50 %	50 %	488652564
21	NC_021176	TC	3	6	7773	7778	0 %	50 %	0 %	50 %	488652565
22	NC_021176	CG	3	6	7860	7865	0 %	0 %	50 %	50 %	488652565
23	NC_021176	CG	3	6	7958	7963	0 %	0 %	50 %	50 %	488652565
24	NC_021176	CT	3	6	8451	8456	0 %	50 %	0 %	50 %	488652565
25	NC_021176	GC	3	6	9573	9578	0 %	0 %	50 %	50 %	488652567
26	NC_021176	CG	3	6	10533	10538	0 %	0 %	50 %	50 %	488652568
27	NC_021176	CG	3	6	12990	12995	0 %	0 %	50 %	50 %	488652570
28	NC_021176	GC	3	6	13302	13307	0 %	0 %	50 %	50 %	488652570
29	NC_021176	GC	3	6	14551	14556	0 %	0 %	50 %	50 %	488652572
30	NC_021176	GA	3	6	14662	14667	50 %	0 %	50 %	0 %	488652572
31	NC_021176	AT	3	6	15378	15383	50 %	50 %	0 %	0 %	488652573
32	NC_021176	AT	3	6	15653	15658	50 %	50 %	0 %	0 %	488652573
33	NC_021176	AT	3	6	15906	15911	50 %	50 %	0 %	0 %	488652573
34	NC_021176	AC	3	6	15967	15972	50 %	0 %	0 %	50 %	488652573
35	NC_021176	GA	3	6	17070	17075	50 %	0 %	50 %	0 %	488652576
36	NC_021176	GC	3	6	18372	18377	0 %	0 %	50 %	50 %	488652577
37	NC_021176	CT	3	6	20346	20351	0 %	50 %	0 %	50 %	488652578
38	NC_021176	GC	3	6	20662	20667	0 %	0 %	50 %	50 %	488652578
39	NC_021176	GC	3	6	20782	20787	0 %	0 %	50 %	50 %	488652578
40	NC_021176	GC	3	6	21187	21192	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_021176	GC	3	6	22045	22050	0 %	0 %	50 %	50 %	488652579
42	NC_021176	CT	3	6	22800	22805	0 %	50 %	0 %	50 %	488652579
43	NC_021176	AT	3	6	23588	23593	50 %	50 %	0 %	0 %	488652580
44	NC_021176	CG	3	6	23658	23663	0 %	0 %	50 %	50 %	488652580
45	NC_021176	GC	4	8	23801	23808	0 %	0 %	50 %	50 %	488652580
46	NC_021176	AT	3	6	24062	24067	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021176	CG	3	6	25068	25073	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_021176	CT	3	6	25354	25359	0 %	50 %	0 %	50 %	488652582
49	NC_021176	AT	3	6	25384	25389	50 %	50 %	0 %	0 %	488652582
50	NC_021176	GC	3	6	26087	26092	0 %	0 %	50 %	50 %	488652583
51	NC_021176	CG	3	6	28017	28022	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52	NC_021176	GC	3	6	28145	28150	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53	NC_021176	TC	3	6	28377	28382	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_021176	GT	3	6	28495	28500	0 %	50 %	50 %	0 %	488652584
55	NC_021176	GT	3	6	28624	28629	0 %	50 %	50 %	0 %	488652584
56	NC_021176	CT	3	6	30109	30114	0 %	50 %	0 %	50 %	488652586
57	NC_021176	CG	3	6	30172	30177	0 %	0 %	50 %	50 %	488652586
58	NC_021176	CG	3	6	30435	30440	0 %	0 %	50 %	50 %	488652586
59	NC_021176	AT	3	6	30536	30541	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021176	GC	3	6	30767	30772	0 %	0 %	50 %	50 %	488652587
61	NC_021176	GC	3	6	31057	31062	0 %	0 %	50 %	50 %	488652587
62	NC_021176	GT	3	6	33045	33050	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021176	TC	3	6	33489	33494	0 %	50 %	0 %	50 %	488652591
64	NC_021176	AT	3	6	33739	33744	50 %	50 %	0 %	0 %	488652591
65	NC_021176	TA	3	6	33942	33947	50 %	50 %	0 %	0 %	488652591
66	NC_021176	TA	3	6	34437	34442	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021176	AT	3	6	34695	34700	50 %	50 %	0 %	0 %	488652592
68	NC_021176	AT	3	6	35441	35446	50 %	50 %	0 %	0 %	488652593
69	NC_021176	TG	4	8	35656	35663	0 %	50 %	50 %	0 %	488652593
70	NC_021176	GC	3	6	36249	36254	0 %	0 %	50 %	50 %	488652593
71	NC_021176	TA	3	6	37199	37204	50 %	50 %	0 %	0 %	488652594
72	NC_021176	AT	3	6	39515	39520	50 %	50 %	0 %	0 %	488652595
73	NC_021176	AT	3	6	39831	39836	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021176	AT	3	6	39946	39951	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021176	AT	4	8	40032	40039	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021176	AT	3	6	40086	40091	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021176	CG	3	6	40374	40379	0 %	0 %	50 %	50 %	488652596
78	NC_021176	CG	3	6	41062	41067	0 %	0 %	50 %	50 %	488652596
79	NC_021176	GT	3	6	41768	41773	0 %	50 %	50 %	0 %	488652597
80	NC_021176	TG	3	6	42798	42803	0 %	50 %	50 %	0 %	488652597
81	NC_021176	CG	3	6	43312	43317	0 %	0 %	50 %	50 %	488652598
82	NC_021176	TA	3	6	43685	43690	50 %	50 %	0 %	0 %	488652598
83	NC_021176	CA	3	6	44998	45003	50 %	0 %	0 %	50 %	488652599
84	NC_021176	GC	3	6	45701	45706	0 %	0 %	50 %	50 %	488652599
85	NC_021176	TA	3	6	46106	46111	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021176	GA	3	6	46173	46178	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021176	TA	3	6	46805	46810	50 %	50 %	0 %	0 %	488652600
88	NC_021176	TG	3	6	47186	47191	0 %	50 %	50 %	0 %	488652600
89	NC_021176	GC	4	8	47325	47332	0 %	0 %	50 %	50 %	488652600
90	NC_021176	GA	3	6	47407	47412	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021176	GA	3	6	48239	48244	50 %	0 %	50 %	0 %	488652601
92	NC_021176	CG	4	8	49306	49313	0 %	0 %	50 %	50 %	488652602
93	NC_021176	CG	3	6	49519	49524	0 %	0 %	50 %	50 %	488652602
94	NC_021176	TG	3	6	50137	50142	0 %	50 %	50 %	0 %	488652602
95	NC_021176	GC	3	6	51205	51210	0 %	0 %	50 %	50 %	488652603
96	NC_021176	GC	3	6	51505	51510	0 %	0 %	50 %	50 %	488652603
97	NC_021176	GC	3	6	52509	52514	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
98	NC_021176	GT	3	6	52916	52921	0 %	50 %	50 %	0 %	488652606
99	NC_021176	CG	3	6	53262	53267	0 %	0 %	50 %	50 %	488652606
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101	NC_021176	GT	3	6	54412	54417	0 %	50 %	50 %	0 %	488652607
102	NC_021176	GC	3	6	55023	55028	0 %	0 %	50 %	50 %	488652607
103	NC_021176	CG	3	6	55097	55102	0 %	0 %	50 %	50 %	488652607
104	NC_021176	CG	3	6	55831	55836	0 %	0 %	50 %	50 %	488652607
105	NC_021176	CG	3	6	56086	56091	0 %	0 %	50 %	50 %	488652607
106	NC_021176	GC	3	6	57005	57010	0 %	0 %	50 %	50 %	488652608
107	NC_021176	GC	3	6	57881	57886	0 %	0 %	50 %	50 %	488652610
108	NC_021176	GC	4	8	58111	58118	0 %	0 %	50 %	50 %	488652610
109	NC_021176	TG	3	6	60720	60725	0 %	50 %	50 %	0 %	488652612
110	NC_021176	TC	3	6	61124	61129	0 %	50 %	0 %	50 %	488652613
111	NC_021176	GC	3	6	62386	62391	0 %	0 %	50 %	50 %	488652614
112	NC_021176	AT	3	6	63061	63066	50 %	50 %	0 %	0 %	488652614
113	NC_021176	GT	3	6	63387	63392	0 %	50 %	50 %	0 %	488652614
114	NC_021176	GC	4	8	64117	64124	0 %	0 %	50 %	50 %	488652615
115	NC_021176	GC	3	6	64582	64587	0 %	0 %	50 %	50 %	488652615
116	NC_021176	GC	3	6	66226	66231	0 %	0 %	50 %	50 %	488652616
117	NC_021176	CG	3	6	66323	66328	0 %	0 %	50 %	50 %	488652616
118	NC_021176	GC	3	6	66729	66734	0 %	0 %	50 %	50 %	488652617
119	NC_021176	AT	3	6	68153	68158	50 %	50 %	0 %	0 %	488652618
120	NC_021176	GC	3	6	69032	69037	0 %	0 %	50 %	50 %	488652619
121	NC_021176	GC	3	6	69606	69611	0 %	0 %	50 %	50 %	488652619
122	NC_021176	AC	3	6	69658	69663	50 %	0 %	0 %	50 %	488652619
123	NC_021176	AG	3	6	69804	69809	50 %	0 %	50 %	0 %	488652620
124	NC_021176	CG	3	6	69883	69888	0 %	0 %	50 %	50 %	488652620
125	NC_021176	GC	3	6	69911	69916	0 %	0 %	50 %	50 %	488652620
126	NC_021176	CG	3	6	70540	70545	0 %	0 %	50 %	50 %	488652621
127	NC_021176	CG	3	6	70820	70825	0 %	0 %	50 %	50 %	488652621
128	NC_021176	TG	3	6	71461	71466	0 %	50 %	50 %	0 %	488652622
129	NC_021176	GC	3	6	71972	71977	0 %	0 %	50 %	50 %	488652622
130	NC_021176	TG	3	6	72032	72037	0 %	50 %	50 %	0 %	488652622
131	NC_021176	GC	3	6	72279	72284	0 %	0 %	50 %	50 %	488652622
132	NC_021176	GC	3	6	72456	72461	0 %	0 %	50 %	50 %	488652623
133	NC_021176	CG	3	6	73317	73322	0 %	0 %	50 %	50 %	488652624
134	NC_021176	GC	3	6	73463	73468	0 %	0 %	50 %	50 %	488652624
135	NC_021176	TC	3	6	73850	73855	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_021176	GC	3	6	73959	73964	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
137	NC_021176	AT	3	6	74894	74899	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_021176	TA	3	6	75213	75218	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_021176	CT	3	6	75978	75983	0 %	50 %	0 %	50 %	488652626
140	NC_021176	GC	3	6	77143	77148	0 %	0 %	50 %	50 %	488652627
141	NC_021176	CG	3	6	77279	77284	0 %	0 %	50 %	50 %	488652627
142	NC_021176	TC	3	6	77441	77446	0 %	50 %	0 %	50 %	488652627
143	NC_021176	CG	3	6	77755	77760	0 %	0 %	50 %	50 %	488652627
144	NC_021176	GC	5	10	78801	78810	0 %	0 %	50 %	50 %	488652627
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