MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Burkholderia thailandensis MSMB121 chromosome 2

Total Repeats: 166

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021174	GCAGGC	2	12	15118	15129	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_021174	CCACAA	2	12	15221	15232	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_021174	TCTATT	2	12	52700	52711	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_021174	GCGGAC	2	12	56146	56157	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_021174	ATGTTA	2	12	68393	68404	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021174	GGAAAC	2	12	79824	79835	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_021174	TCCGGC	2	12	83141	83152	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
8	NC_021174	GCCGCT	2	12	88252	88263	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
9	NC_021174	CACGCC	2	12	93406	93417	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_021174	CGTCGC	2	12	101657	101668	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
11	NC_021174	GCGGCT	2	12	170810	170821	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_021174	CCCGCG	2	12	178504	178515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_021174	GCCAAG	2	12	182075	182086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_021174	CGCATC	2	12	182745	182756	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
15	NC_021174	GACACT	2	12	186932	186943	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_021174	ATCGCG	2	12	193765	193776	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_021174	ATCCGC	2	12	203425	203436	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
18	NC_021174	AACGAA	2	12	203504	203515	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_021174	CGCCCG	2	12	208939	208950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_021174	CGTCGA	2	12	215676	215687	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_021174	CGCACG	2	12	253027	253038	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
22	NC_021174	CGACAT	2	12	285851	285862	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_021174	TAATAC	2	12	309098	309109	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_021174	CGACGC	2	12	319540	319551	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
25	NC_021174	CGATGC	2	12	337393	337404	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_021174	CATGCG	2	12	339415	339426	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_021174	CACGCG	2	12	383118	383129	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
28	NC_021174	CGCCGG	2	12	383395	383406	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29	NC_021174	GTCGCC	2	12	385531	385542	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
30	NC_021174	CACCGG	2	12	386286	386297	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
31	NC_021174	CGCTCG	2	12	415811	415822	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
32	NC_021174	GACCGC	2	12	432951	432962	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
33	NC_021174	CGCACG	2	12	433004	433015	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
34	NC_021174	GCTGCC	2	12	445153	445164	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
35	NC_021174	CACCGA	8	48	448034	448081	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
36	NC_021174	TTTCTG	2	12	477526	477537	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_021174	CTTCGA	2	12	490958	490969	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_021174	CATTCG	2	12	511389	511400	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_021174	GCCCGA	2	12	517670	517681	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
40	NC_021174	CGACGT	2	12	517878	517889	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_021174	CGATGC	2	12	523809	523820	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_021174	ATGCGC	2	12	527813	527824	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_021174	TATACA	2	12	562567	562578	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_021174	CGGACG	2	12	564062	564073	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_021174	GCGGCC	2	12	598343	598354	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
46	NC_021174	ACGCCG	2	12	603909	603920	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
47	NC_021174	AAAATT	2	12	624463	624474	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021174	GCAGAA	2	12	626053	626064	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_021174	TGATAA	2	12	633426	633437	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021174	TCCATA	2	12	637500	637511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_021174	CGTCAT	2	12	643761	643772	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_021174	GCCTCT	5	30	664974	665003	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
53	NC_021174	GCATTT	2	12	665004	665015	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_021174	GAACGG	2	12	671527	671538	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_021174	GGGCGC	2	12	682010	682021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_021174	GCATCG	2	12	682122	682133	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_021174	GCCGAT	2	12	685217	685228	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_021174	TCGATA	2	12	689546	689557	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_021174	GCAGCC	2	12	691155	691166	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
60	NC_021174	GCGAAT	2	12	694461	694472	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_021174	ACCGCA	2	12	694631	694642	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
62	NC_021174	TCGGCG	2	12	755312	755323	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_021174	CTCTCC	2	12	755931	755942	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_021174	CGCGCA	2	12	769114	769125	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
65	NC_021174	TCGGCG	2	12	919644	919655	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_021174	CCGTCG	2	12	921208	921219	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
67	NC_021174	ACGCGC	2	12	926210	926221	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
68	NC_021174	CGCCCG	2	12	937724	937735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_021174	TTTCGC	3	18	954014	954031	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_021174	GCCGCG	2	12	973354	973365	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
71	NC_021174	CGCGGC	2	12	989547	989558	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
72	NC_021174	CGACGG	2	12	1134804	1134815	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_021174	TTCGGG	2	12	1198872	1198883	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_021174	TGGCGC	2	12	1257318	1257329	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_021174	GTCGAT	2	12	1258530	1258541	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_021174	TCCGCT	2	12	1316182	1316193	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
77	NC_021174	AATGCG	2	12	1336864	1336875	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_021174	GATACG	2	12	1351002	1351013	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_021174	CCGATG	2	12	1367336	1367347	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_021174	GGCATT	2	12	1369578	1369589	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_021174	GGCATC	2	12	1369590	1369601	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_021174	AGATCG	2	12	1392410	1392421	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_021174	GCATCG	2	12	1395931	1395942	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_021174	CGGTAC	2	12	1410799	1410810	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_021174	CGTCGA	2	12	1410824	1410835	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_021174	GAACGA	2	12	1431875	1431886	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_021174	ATTCGA	2	12	1462693	1462704	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_021174	GCGCTC	2	12	1489732	1489743	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
89	NC_021174	CGCTCG	2	12	1490864	1490875	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
90	NC_021174	CACCGA	2	12	1491000	1491011	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
91	NC_021174	GCGCGT	2	12	1513031	1513042	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_021174	CGATGC	2	12	1516991	1517002	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_021174	TGCCGA	2	12	1543497	1543508	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_021174	GCAAGA	2	12	1548384	1548395	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_021174	GAAACG	2	12	1557248	1557259	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_021174	CAATGA	2	12	1562990	1563001	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_021174	TCGCGC	2	12	1573442	1573453	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
98	NC_021174	CGCAAA	2	12	1590563	1590574	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_021174	CCGACG	2	12	1592172	1592183	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
100	NC_021174	GATGGG	2	12	1592203	1592214	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_021174	CGCCGG	2	12	1641977	1641988	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
102	NC_021174	AACGCG	2	12	1662919	1662930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_021174	CGTCGC	2	12	1695874	1695885	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
104	NC_021174	TCTTCA	2	12	1733166	1733177	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_021174	ATGCGG	2	12	1743027	1743038	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_021174	GTGCGG	2	12	1807817	1807828	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_021174	CCGCGC	2	12	1827236	1827247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_021174	GTTCGT	2	12	1833924	1833935	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_021174	CGCGCA	2	12	1850989	1851000	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
110	NC_021174	TTTCGA	2	12	1883194	1883205	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_021174	CGCCGT	2	12	1889714	1889725	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
112	NC_021174	CAGGGC	2	12	1891871	1891882	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_021174	GGCGTT	2	12	1898870	1898881	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_021174	GCATCA	2	12	1906338	1906349	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_021174	CCTCAA	2	12	1929208	1929219	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_021174	TCGCCG	2	12	1939845	1939856	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
117	NC_021174	AAAAAT	2	12	1944257	1944268	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_021174	AGCGCG	2	12	1944567	1944578	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_021174	CGTAAT	2	12	1969275	1969286	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_021174	AGGCGA	2	12	1972462	1972473	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_021174	CAGCGG	2	12	1973061	1973072	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_021174	ATGCCG	2	12	1975762	1975773	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_021174	CGGTGA	2	12	1977534	1977545	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_021174	GCGCCG	2	12	1998939	1998950	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
125	NC_021174	TCGTGC	2	12	2009659	2009670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_021174	GTGATG	2	12	2011987	2011998	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_021174	CAATTG	2	12	2021665	2021676	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_021174	GCGGAA	2	12	2045787	2045798	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_021174	TGGCCG	2	12	2054089	2054100	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_021174	GATCGG	2	12	2058547	2058558	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_021174	GACGCT	2	12	2060181	2060192	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_021174	ACGTAG	2	12	2078129	2078140	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
133	NC_021174	GGGGCG	2	12	2079499	2079510	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
134	NC_021174	GTGCGG	3	18	2145689	2145706	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
135	NC_021174	TCGATT	2	12	2165590	2165601	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
136	NC_021174	GCTTGC	2	12	2234389	2234400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_021174	ATCCGA	2	12	2235651	2235662	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_021174	CCAGCG	2	12	2286242	2286253	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
139	NC_021174	TGCGCG	2	12	2303971	2303982	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_021174	GGCACG	2	12	2306326	2306337	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_021174	GCGTTC	2	12	2331845	2331856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_021174	GACGCG	2	12	2352376	2352387	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_021174	GATCGA	2	12	2352564	2352575	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
144	NC_021174	CGGCCG	2	12	2374442	2374453	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
145	NC_021174	GCATGC	2	12	2384534	2384545	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_021174	CCGGAG	2	12	2389098	2389109	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_021174	TCGCCG	2	12	2391727	2391738	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
148	NC_021174	ATCGCA	2	12	2393316	2393327	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_021174	ATCGGC	7	42	2426997	2427038	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_021174	CGGGCG	2	12	2453269	2453280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_021174	TGACCG	2	12	2475853	2475864	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_021174	GTCGCC	2	12	2498497	2498508	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
153	NC_021174	CGCTCG	2	12	2498662	2498673	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
154	NC_021174	GCGCGG	2	12	2530843	2530854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
155	NC_021174	CGAAGT	2	12	2545911	2545922	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
156	NC_021174	CGGACA	2	12	2546955	2546966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
157	NC_021174	CGCAAG	2	12	2557090	2557101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
158	NC_021174	CGATCG	2	12	2567491	2567502	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
159	NC_021174	TCGCAT	2	12	2576985	2576996	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
160	NC_021174	AAAACC	2	12	2625025	2625036	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
161	NC_021174	CGGGCG	2	12	2625888	2625899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
162	NC_021174	CGTTGT	2	12	2645303	2645314	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
163	NC_021174	TCGTGT	2	12	2647844	2647855	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
164	NC_021174	CGAACG	2	12	2692798	2692809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
165	NC_021174	GTCGTG	2	12	2728895	2728906	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
166	NC_021174	GTCGAT	2	12	2748439	2748450	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.