MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Hyphomicrobium denitrificans 1NES1

Total Repeats: 9666

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021172	GCAG	2	8	112	119	25 %	0 %	50 %	25 %	488575047
2	NC_021172	CGGC	2	8	446	453	0 %	0 %	50 %	50 %	488575047
3	NC_021172	CGGC	2	8	570	577	0 %	0 %	50 %	50 %	488575047
4	NC_021172	CATT	2	8	718	725	25 %	50 %	0 %	25 %	488575047
5	NC_021172	TCGG	2	8	1426	1433	0 %	25 %	50 %	25 %	488575047
6	NC_021172	ATTG	2	8	1626	1633	25 %	50 %	25 %	0 %	488575047
7	NC_021172	GGCC	2	8	1703	1710	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_021172	GACA	2	8	1934	1941	50 %	0 %	25 %	25 %	488575048
9	NC_021172	GCGA	2	8	2778	2785	25 %	0 %	50 %	25 %	488575048
10	NC_021172	GGGC	2	8	2790	2797	0 %	0 %	75 %	25 %	488575048
11	NC_021172	TGTC	2	8	3466	3473	0 %	50 %	25 %	25 %	488575049
12	NC_021172	GATG	2	8	4065	4072	25 %	25 %	50 %	0 %	488575050
13	NC_021172	ACCG	2	8	5236	5243	25 %	0 %	25 %	50 %	488575051
14	NC_021172	AAGA	2	8	5249	5256	75 %	0 %	25 %	0 %	488575051
15	NC_021172	GCGG	2	8	5312	5319	0 %	0 %	75 %	25 %	488575051
16	NC_021172	GACG	2	8	5632	5639	25 %	0 %	50 %	25 %	488575051
17	NC_021172	TCGT	2	8	5748	5755	0 %	50 %	25 %	25 %	488575051
18	NC_021172	CGTG	2	8	5982	5989	0 %	25 %	50 %	25 %	488575051
19	NC_021172	CGGG	2	8	6457	6464	0 %	0 %	75 %	25 %	488575051
20	NC_021172	GATC	2	8	6691	6698	25 %	25 %	25 %	25 %	488575051
21	NC_021172	CTGG	2	8	6957	6964	0 %	25 %	50 %	25 %	488575051
22	NC_021172	GCTC	2	8	7053	7060	0 %	25 %	25 %	50 %	488575051
23	NC_021172	TGCC	2	8	7629	7636	0 %	25 %	25 %	50 %	488575052
24	NC_021172	CGTC	2	8	7779	7786	0 %	25 %	25 %	50 %	488575052
25	NC_021172	GCGT	2	8	7807	7814	0 %	25 %	50 %	25 %	488575052
26	NC_021172	GCCA	2	8	8192	8199	25 %	0 %	25 %	50 %	488575052
27	NC_021172	TCGA	2	8	8357	8364	25 %	25 %	25 %	25 %	488575052
28	NC_021172	TGCT	2	8	8813	8820	0 %	50 %	25 %	25 %	488575052
29	NC_021172	CGTC	2	8	8896	8903	0 %	25 %	25 %	50 %	488575052
30	NC_021172	CCCA	2	8	9392	9399	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
31	NC_021172	GCCG	2	8	10181	10188	0 %	0 %	50 %	50 %	488575053
32	NC_021172	GCCA	2	8	10793	10800	25 %	0 %	25 %	50 %	488575053
33	NC_021172	ACCG	2	8	11330	11337	25 %	0 %	25 %	50 %	488575053
34	NC_021172	TCGT	2	8	11690	11697	0 %	50 %	25 %	25 %	488575053
35	NC_021172	CAGC	2	8	12313	12320	25 %	0 %	25 %	50 %	488575054
36	NC_021172	GTGC	2	8	12406	12413	0 %	25 %	50 %	25 %	488575054
37	NC_021172	GACC	2	8	12866	12873	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
38	NC_021172	TCGA	2	8	12942	12949	25 %	25 %	25 %	25 %	488575055
39	NC_021172	GCAA	2	8	12990	12997	50 %	0 %	25 %	25 %	488575055
40	NC_021172	ATCC	2	8	13000	13007	25 %	25 %	0 %	50 %	488575055
41	NC_021172	CCGG	2	8	13284	13291	0 %	0 %	50 %	50 %	488575055
42	NC_021172	GCCC	2	8	13498	13505	0 %	0 %	25 %	75 %	488575055
43	NC_021172	GCGG	2	8	14106	14113	0 %	0 %	75 %	25 %	488575056
44	NC_021172	GCTC	2	8	14191	14198	0 %	25 %	25 %	50 %	488575056
45	NC_021172	GCGA	2	8	14304	14311	25 %	0 %	50 %	25 %	488575056
46	NC_021172	GCCG	2	8	15271	15278	0 %	0 %	50 %	50 %	488575057
47	NC_021172	CGGA	2	8	16020	16027	25 %	0 %	50 %	25 %	488575058
48	NC_021172	CGTC	2	8	16323	16330	0 %	25 %	25 %	50 %	488575058
49	NC_021172	AAAG	2	8	16461	16468	75 %	0 %	25 %	0 %	488575059
50	NC_021172	AGCA	2	8	16531	16538	50 %	0 %	25 %	25 %	488575059
51	NC_021172	CCGA	2	8	16687	16694	25 %	0 %	25 %	50 %	488575059
52	NC_021172	GCGA	2	8	17305	17312	25 %	0 %	50 %	25 %	488575059
53	NC_021172	CGCT	2	8	17771	17778	0 %	25 %	25 %	50 %	488575059
54	NC_021172	CGCC	2	8	18835	18842	0 %	0 %	25 %	75 %	488575060
55	NC_021172	AGCC	2	8	18895	18902	25 %	0 %	25 %	50 %	488575060
56	NC_021172	TCGC	2	8	19841	19848	0 %	25 %	25 %	50 %	488575061
57	NC_021172	TCGC	2	8	19895	19902	0 %	25 %	25 %	50 %	488575061
58	NC_021172	CCGG	2	8	20556	20563	0 %	0 %	50 %	50 %	488575062
59	NC_021172	CGGC	2	8	20620	20627	0 %	0 %	50 %	50 %	488575062
60	NC_021172	CGGC	2	8	21366	21373	0 %	0 %	50 %	50 %	488575064
61	NC_021172	GCTG	2	8	21747	21754	0 %	25 %	50 %	25 %	488575064
62	NC_021172	CTGA	2	8	22947	22954	25 %	25 %	25 %	25 %	488575065
63	NC_021172	TGCC	2	8	23352	23359	0 %	25 %	25 %	50 %	488575065
64	NC_021172	GTGA	2	8	23379	23386	25 %	25 %	50 %	0 %	488575065
65	NC_021172	CGGC	2	8	23582	23589	0 %	0 %	50 %	50 %	488575066
66	NC_021172	GCAG	2	8	24489	24496	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
67	NC_021172	CGCT	2	8	24567	24574	0 %	25 %	25 %	50 %	488575067
68	NC_021172	GAGC	2	8	24629	24636	25 %	0 %	50 %	25 %	488575067
69	NC_021172	GAAC	2	8	24687	24694	50 %	0 %	25 %	25 %	488575067
70	NC_021172	GATC	2	8	24985	24992	25 %	25 %	25 %	25 %	488575067
71	NC_021172	TGCT	2	8	25113	25120	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
72	NC_021172	GGCA	2	8	25614	25621	25 %	0 %	50 %	25 %	488575068
73	NC_021172	CGTC	2	8	26175	26182	0 %	25 %	25 %	50 %	488575068
74	NC_021172	CGTC	2	8	26566	26573	0 %	25 %	25 %	50 %	488575069
75	NC_021172	TGGC	2	8	26883	26890	0 %	25 %	50 %	25 %	488575069
76	NC_021172	CTGC	2	8	27240	27247	0 %	25 %	25 %	50 %	488575070
77	NC_021172	TTGG	2	8	27690	27697	0 %	50 %	50 %	0 %	488575070
78	NC_021172	GCCG	2	8	28270	28277	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
79	NC_021172	CTGC	2	8	28737	28744	0 %	25 %	25 %	50 %	488575071
80	NC_021172	AAGG	2	8	28904	28911	50 %	0 %	50 %	0 %	488575071
81	NC_021172	GGTT	2	8	28996	29003	0 %	50 %	50 %	0 %	488575071
82	NC_021172	GTCG	2	8	29042	29049	0 %	25 %	50 %	25 %	488575071
83	NC_021172	GGCG	2	8	29054	29061	0 %	0 %	75 %	25 %	488575071
84	NC_021172	ACGC	2	8	29247	29254	25 %	0 %	25 %	50 %	488575071
85	NC_021172	CCAG	2	8	29951	29958	25 %	0 %	25 %	50 %	488575072
86	NC_021172	TGCG	2	8	29972	29979	0 %	25 %	50 %	25 %	488575072
87	NC_021172	GCTT	2	8	30436	30443	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
88	NC_021172	GCCG	2	8	30989	30996	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
89	NC_021172	CGAT	2	8	31546	31553	25 %	25 %	25 %	25 %	488575075
90	NC_021172	CCGG	2	8	31969	31976	0 %	0 %	50 %	50 %	488575075
91	NC_021172	GCCG	2	8	32094	32101	0 %	0 %	50 %	50 %	488575075
92	NC_021172	TCGG	2	8	32194	32201	0 %	25 %	50 %	25 %	488575075
93	NC_021172	GTCG	2	8	32226	32233	0 %	25 %	50 %	25 %	488575076
94	NC_021172	GCGT	2	8	32575	32582	0 %	25 %	50 %	25 %	488575076
95	NC_021172	GCGA	2	8	32825	32832	25 %	0 %	50 %	25 %	488575076
96	NC_021172	CGAG	2	8	32935	32942	25 %	0 %	50 %	25 %	488575076
97	NC_021172	TGCC	2	8	33089	33096	0 %	25 %	25 %	50 %	488575077
98	NC_021172	GGCC	2	8	33287	33294	0 %	0 %	50 %	50 %	488575077
99	NC_021172	ACGA	2	8	33427	33434	50 %	0 %	25 %	25 %	488575077
100	NC_021172	GCCG	2	8	33573	33580	0 %	0 %	50 %	50 %	488575077
101	NC_021172	CGAA	2	8	33752	33759	50 %	0 %	25 %	25 %	488575077
102	NC_021172	TCGG	2	8	33832	33839	0 %	25 %	50 %	25 %	488575078
103	NC_021172	GAAA	2	8	34200	34207	75 %	0 %	25 %	0 %	488575078
104	NC_021172	GTCG	2	8	34278	34285	0 %	25 %	50 %	25 %	488575078
105	NC_021172	GGGA	2	8	34674	34681	25 %	0 %	75 %	0 %	488575079
106	NC_021172	GCCT	2	8	34730	34737	0 %	25 %	25 %	50 %	488575079
107	NC_021172	CTCG	2	8	36181	36188	0 %	25 %	25 %	50 %	488575081
108	NC_021172	GCTG	2	8	36223	36230	0 %	25 %	50 %	25 %	488575081
109	NC_021172	TGCG	2	8	36576	36583	0 %	25 %	50 %	25 %	488575081
110	NC_021172	TGGC	2	8	36908	36915	0 %	25 %	50 %	25 %	488575082
111	NC_021172	ACGC	2	8	36956	36963	25 %	0 %	25 %	50 %	488575082
112	NC_021172	ACGC	2	8	37766	37773	25 %	0 %	25 %	50 %	488575083
113	NC_021172	GGGC	2	8	37841	37848	0 %	0 %	75 %	25 %	488575083
114	NC_021172	AAGG	2	8	38177	38184	50 %	0 %	50 %	0 %	488575083
115	NC_021172	GGCG	2	8	38380	38387	0 %	0 %	75 %	25 %	488575083
116	NC_021172	CGGC	2	8	38406	38413	0 %	0 %	50 %	50 %	488575083
117	NC_021172	TCGT	2	8	38901	38908	0 %	50 %	25 %	25 %	488575084
118	NC_021172	GGCA	2	8	41164	41171	25 %	0 %	50 %	25 %	488575084
119	NC_021172	GCCG	2	8	41275	41282	0 %	0 %	50 %	50 %	488575084
120	NC_021172	CGTC	2	8	41311	41318	0 %	25 %	25 %	50 %	488575084
121	NC_021172	CGAT	2	8	41332	41339	25 %	25 %	25 %	25 %	488575084
122	NC_021172	CAAG	2	8	41494	41501	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
123	NC_021172	CGCC	2	8	42181	42188	0 %	0 %	25 %	75 %	488575085
124	NC_021172	CGCC	2	8	42967	42974	0 %	0 %	25 %	75 %	488575086
125	NC_021172	GGCC	2	8	43054	43061	0 %	0 %	50 %	50 %	488575086
126	NC_021172	CGAT	2	8	43135	43142	25 %	25 %	25 %	25 %	488575086
127	NC_021172	TCGG	2	8	43257	43264	0 %	25 %	50 %	25 %	488575086
128	NC_021172	GACG	2	8	45672	45679	25 %	0 %	50 %	25 %	488575088
129	NC_021172	TCAC	2	8	46036	46043	25 %	25 %	0 %	50 %	488575089
130	NC_021172	CAGC	2	8	46364	46371	25 %	0 %	25 %	50 %	488575089
131	NC_021172	CCGA	2	8	47571	47578	25 %	0 %	25 %	50 %	488575089
132	NC_021172	GGCG	2	8	48481	48488	0 %	0 %	75 %	25 %	488575089
133	NC_021172	CGTT	2	8	50074	50081	0 %	50 %	25 %	25 %	488575089
134	NC_021172	GAGC	2	8	50105	50112	25 %	0 %	50 %	25 %	488575089
135	NC_021172	TGCG	2	8	50748	50755	0 %	25 %	50 %	25 %	488575089
136	NC_021172	AATG	2	8	51353	51360	50 %	25 %	25 %	0 %	488575089
137	NC_021172	ATCA	2	8	51654	51661	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
138	NC_021172	TGCG	2	8	51842	51849	0 %	25 %	50 %	25 %	488575090
139	NC_021172	GGGC	2	8	52918	52925	0 %	0 %	75 %	25 %	488575091
140	NC_021172	AGCG	2	8	53635	53642	25 %	0 %	50 %	25 %	488575091
141	NC_021172	TCGA	2	8	53717	53724	25 %	25 %	25 %	25 %	488575091
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