MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Hyphomicrobium denitrificans 1NES1

Total Repeats: 5190

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021172	GCC	2	6	1753	1758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_021172	CGG	2	6	1882	1887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_021172	GCC	2	6	1897	1902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_021172	GGA	2	6	3070	3075	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021172	GAG	2	6	3095	3100	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021172	GCG	2	6	4908	4913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_021172	TTC	2	6	7443	7448	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_021172	GAC	2	6	7505	7510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_021172	GCG	2	6	7550	7555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_021172	TTA	2	6	9565	9570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021172	TGC	2	6	9611	9616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_021172	ACG	2	6	9644	9649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_021172	CGA	2	6	9669	9674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_021172	CAT	2	6	12764	12769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_021172	GCA	2	6	12810	12815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_021172	CGC	2	6	12915	12920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_021172	AGC	2	6	13570	13575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_021172	CAC	2	6	13642	13647	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_021172	CGC	2	6	15078	15083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_021172	GTA	2	6	15117	15122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021172	GCG	2	6	15158	15163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_021172	GCC	2	6	16336	16341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_021172	CCG	2	6	16395	16400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_021172	CGA	3	9	19988	19996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_021172	CAG	2	6	20079	20084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_021172	CTG	2	6	20097	20102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_021172	CCG	2	6	20115	20120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_021172	GCG	2	6	23492	23497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_021172	CGA	2	6	24508	24513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_021172	AGG	2	6	25055	25060	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021172	TCT	2	6	25271	25276	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_021172	GGC	2	6	28334	28339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_021172	CGG	2	6	28352	28357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_021172	TCT	2	6	30049	30054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_021172	CGT	2	6	30073	30078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_021172	TCC	2	6	30347	30352	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_021172	TCA	2	6	30363	30368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_021172	CAA	2	6	30449	30454	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_021172	TGC	2	6	30456	30461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_021172	GAA	2	6	30902	30907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021172	GGC	2	6	30922	30927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_021172	CGT	2	6	34343	34348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_021172	GCG	2	6	34360	34365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_021172	GCC	2	6	34391	34396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_021172	GGC	2	6	34403	34408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_021172	ACG	2	6	35480	35485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_021172	CAA	2	6	38647	38652	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_021172	GTT	2	6	41480	41485	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021172	CGC	2	6	41507	41512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_021172	GAG	2	6	45845	45850	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021172	GAA	2	6	45954	45959	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021172	AGG	2	6	51460	51465	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021172	CAA	2	6	51475	51480	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_021172	GCG	2	6	51498	51503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_021172	GCG	2	6	51559	51564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_021172	TTG	2	6	52319	52324	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021172	GAA	2	6	52354	52359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021172	GCC	2	6	54833	54838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_021172	CAG	2	6	57580	57585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_021172	CGG	2	6	57591	57596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_021172	GCG	3	9	57648	57656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_021172	CAA	2	6	57752	57757	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_021172	CAT	2	6	57759	57764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_021172	CCA	2	6	57779	57784	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_021172	GTC	2	6	57873	57878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_021172	GCC	2	6	57904	57909	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_021172	ATA	2	6	57956	57961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021172	TGG	2	6	63785	63790	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021172	GCG	2	6	63838	63843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_021172	CGT	2	6	65331	65336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_021172	TGA	2	6	65607	65612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021172	GCG	2	6	67250	67255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_021172	CTT	2	6	67285	67290	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_021172	TGC	2	6	67319	67324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_021172	CTT	2	6	70440	70445	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_021172	AGC	2	6	70453	70458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_021172	TCT	2	6	70591	70596	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_021172	CGG	2	6	70604	70609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_021172	CTG	2	6	73185	73190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_021172	TGA	2	6	73918	73923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021172	GCC	2	6	73970	73975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_021172	CCG	2	6	75630	75635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_021172	ATG	2	6	75971	75976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021172	ATT	2	6	76795	76800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021172	GCG	2	6	77048	77053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_021172	TCT	2	6	77121	77126	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_021172	CGG	2	6	77981	77986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_021172	GAG	2	6	78789	78794	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021172	TTG	2	6	79802	79807	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021172	GGC	2	6	79865	79870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_021172	TGC	2	6	81435	81440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_021172	CGA	2	6	84141	84146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_021172	AAC	2	6	84209	84214	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_021172	TGA	2	6	85027	85032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021172	GCC	2	6	85147	85152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_021172	TGG	2	6	85202	85207	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021172	CGT	2	6	85465	85470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_021172	CGA	2	6	86094	86099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_021172	AAT	2	6	86101	86106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021172	TTG	2	6	86236	86241	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_021172	CGT	2	6	87014	87019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_021172	CCG	2	6	87395	87400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_021172	CTT	2	6	87403	87408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_021172	GGT	2	6	87429	87434	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021172	CGG	2	6	87886	87891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_021172	TCG	2	6	88179	88184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_021172	TGG	2	6	88245	88250	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_021172	AAC	2	6	91103	91108	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_021172	AAT	2	6	91170	91175	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021172	GAT	2	6	91195	91200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_021172	CAA	2	6	91205	91210	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_021172	CAA	2	6	91338	91343	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_021172	ATT	2	6	91347	91352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021172	CCG	2	6	97429	97434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_021172	GAT	2	6	97443	97448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_021172	CGT	2	6	97459	97464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_021172	CGA	2	6	97984	97989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_021172	GAA	2	6	98075	98080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021172	CGA	2	6	98093	98098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_021172	CGT	2	6	98108	98113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_021172	CAG	2	6	98328	98333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_021172	CGC	2	6	98506	98511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_021172	TGC	2	6	100445	100450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_021172	CTC	2	6	100528	100533	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
125	NC_021172	TGC	2	6	100582	100587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_021172	GAC	2	6	102734	102739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_021172	CCG	2	6	102771	102776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_021172	ATC	3	9	102796	102804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_021172	CCA	2	6	103720	103725	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_021172	GCA	2	6	103738	103743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_021172	TGA	2	6	103795	103800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_021172	CAT	3	9	103816	103824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_021172	CCG	2	6	104845	104850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_021172	CCG	2	6	104881	104886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_021172	TGA	2	6	105331	105336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_021172	ATA	2	6	105382	105387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_021172	CCG	2	6	105527	105532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_021172	CAG	2	6	105582	105587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_021172	CCA	2	6	107122	107127	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
140	NC_021172	CAC	2	6	107131	107136	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
141	NC_021172	TGT	2	6	107146	107151	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_021172	CGC	2	6	107637	107642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
143	NC_021172	CGT	2	6	107699	107704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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149	NC_021172	CGA	2	6	110490	110495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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161	NC_021172	TGA	2	6	116905	116910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
162	NC_021172	GAG	2	6	119153	119158	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
163	NC_021172	CGC	2	6	119199	119204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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172	NC_021172	GCA	2	6	130381	130386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
173	NC_021172	CTT	2	6	130394	130399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
174	NC_021172	CCA	2	6	130477	130482	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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253	NC_021172	GCT	2	6	155449	155454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
254	NC_021172	GGC	2	6	158841	158846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
255	NC_021172	GCT	2	6	160703	160708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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271	NC_021172	GAT	2	6	173553	173558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
272	NC_021172	GCC	2	6	177028	177033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
273	NC_021172	ATC	2	6	177744	177749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
274	NC_021172	ACC	2	6	177853	177858	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
275	NC_021172	GGC	2	6	177949	177954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
276	NC_021172	GCC	2	6	177998	178003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
277	NC_021172	CTC	2	6	178020	178025	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
278	NC_021172	GTT	2	6	179391	179396	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
279	NC_021172	GAT	2	6	184417	184422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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281	NC_021172	TGG	2	6	185280	185285	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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285	NC_021172	CCT	2	6	186130	186135	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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287	NC_021172	ATC	2	6	189842	189847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
288	NC_021172	GCG	2	6	189874	189879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
289	NC_021172	GCG	2	6	190607	190612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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293	NC_021172	CTG	2	6	191489	191494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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299	NC_021172	CTC	2	6	193575	193580	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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303	NC_021172	GAC	2	6	199196	199201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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305	NC_021172	CCT	2	6	199249	199254	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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307	NC_021172	GCG	2	6	199492	199497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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313	NC_021172	GCC	2	6	203164	203169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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331	NC_021172	CTC	2	6	218533	218538	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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