MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Hyphomicrobium denitrificans 1NES1

Total Repeats: 52069

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021172	GTT	2	6	167	172	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488575047
2	NC_021172	CGT	2	6	298	303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575047
3	NC_021172	CTG	2	6	365	370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575047
4	NC_021172	GTC	2	6	413	418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575047
5	NC_021172	CGG	2	6	492	497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575047
6	NC_021172	TGC	2	6	534	539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575047
7	NC_021172	TTC	2	6	549	554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488575047
8	NC_021172	CGC	2	6	591	596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488575047
9	NC_021172	CTG	2	6	752	757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575047
10	NC_021172	TCG	2	6	840	845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575047
11	NC_021172	TGC	2	6	903	908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575047
12	NC_021172	CGA	2	6	913	918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575047
13	NC_021172	CAT	2	6	964	969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488575047
14	NC_021172	GCT	2	6	976	981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575047
15	NC_021172	GTC	2	6	1001	1006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575047
16	NC_021172	TGC	2	6	1150	1155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575047
17	NC_021172	GTC	2	6	1184	1189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575047
18	NC_021172	CAT	2	6	1369	1374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488575047
19	NC_021172	GCG	2	6	1417	1422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575047
20	NC_021172	ACG	2	6	1529	1534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575047
21	NC_021172	GAG	2	6	1601	1606	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	488575047
22	NC_021172	CGT	2	6	1997	2002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575048
23	NC_021172	TGC	2	6	2158	2163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575048
24	NC_021172	CCG	2	6	2437	2442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488575048
25	NC_021172	CAA	2	6	2708	2713	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	488575048
26	NC_021172	GGC	2	6	2853	2858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575048
27	NC_021172	GAA	2	6	2868	2873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488575048
28	NC_021172	CGA	2	6	2995	3000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575048
29	NC_021172	CGG	2	6	3011	3016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575048
30	NC_021172	CTA	2	6	3177	3182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488575049
31	NC_021172	TCG	2	6	3453	3458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575049
32	NC_021172	TCG	2	6	3650	3655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575050
33	NC_021172	TCT	2	6	3681	3686	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488575050
34	NC_021172	GCT	2	6	3699	3704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575050
35	NC_021172	GCG	2	6	3723	3728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575050
36	NC_021172	GCT	2	6	4194	4199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575050
37	NC_021172	CGA	2	6	4215	4220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575050
38	NC_021172	GCG	2	6	4276	4281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575050
39	NC_021172	TCG	2	6	4313	4318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575050
40	NC_021172	GTC	2	6	4359	4364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575050
41	NC_021172	GCA	2	6	4379	4384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575050
42	NC_021172	CGG	2	6	4409	4414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575050
43	NC_021172	AGA	2	6	4422	4427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488575050
44	NC_021172	GTC	2	6	4513	4518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575050
45	NC_021172	TGC	2	6	4577	4582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575050
46	NC_021172	CTG	2	6	4645	4650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575050
47	NC_021172	GTT	2	6	4695	4700	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488575050
48	NC_021172	GAA	2	6	4990	4995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488575051
49	NC_021172	GAC	2	6	5009	5014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575051
50	NC_021172	GAC	2	6	5093	5098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575051
51	NC_021172	CAC	2	6	5111	5116	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488575051
52	NC_021172	GTC	2	6	5129	5134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575051
53	NC_021172	CGA	2	6	5146	5151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575051
54	NC_021172	CGA	2	6	5218	5223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575051
55	NC_021172	CGA	2	6	5257	5262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575051
56	NC_021172	GTC	2	6	5378	5383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575051
57	NC_021172	TCG	2	6	5439	5444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575051
58	NC_021172	GTC	2	6	5480	5485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575051
59	NC_021172	GGC	2	6	5782	5787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575051
60	NC_021172	TGG	2	6	5792	5797	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488575051
61	NC_021172	CGG	2	6	5854	5859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575051
62	NC_021172	CAA	2	6	5902	5907	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	488575051
63	NC_021172	GAA	2	6	5915	5920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488575051
64	NC_021172	CGA	2	6	5959	5964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575051
65	NC_021172	TCG	2	6	6066	6071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575051
66	NC_021172	GAG	2	6	6107	6112	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	488575051
67	NC_021172	AAG	2	6	6120	6125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488575051
68	NC_021172	TCG	2	6	6135	6140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575051
69	NC_021172	TCG	2	6	6147	6152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575051
70	NC_021172	GGC	2	6	6154	6159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575051
71	NC_021172	GCG	2	6	6173	6178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575051
72	NC_021172	TCG	2	6	6288	6293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575051
73	NC_021172	TGC	2	6	6351	6356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575051
74	NC_021172	GTC	2	6	6409	6414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575051
75	NC_021172	CAT	2	6	6430	6435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488575051
76	NC_021172	TCA	3	9	6501	6509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488575051
77	NC_021172	GCT	3	9	6547	6555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575051
78	NC_021172	TTC	2	6	6560	6565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488575051
79	NC_021172	GCC	2	6	6616	6621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488575051
80	NC_021172	TCG	2	6	6768	6773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575051
81	NC_021172	GGC	2	6	6794	6799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575051
82	NC_021172	CGT	2	6	6832	6837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575051
83	NC_021172	CGG	2	6	6853	6858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575051
84	NC_021172	CGG	3	9	6885	6893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575051
85	NC_021172	CGA	2	6	6931	6936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575051
86	NC_021172	GGA	2	6	6943	6948	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	488575051
87	NC_021172	GCT	2	6	6969	6974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575051
88	NC_021172	GCG	2	6	7066	7071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575051
89	NC_021172	AGC	2	6	7248	7253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575051
90	NC_021172	CGA	2	6	7324	7329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575051
91	NC_021172	TCG	2	6	7356	7361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575051
92	NC_021172	TCG	2	6	7670	7675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575052
93	NC_021172	CGA	2	6	7725	7730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575052
94	NC_021172	CGA	2	6	7875	7880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575052
95	NC_021172	TGA	2	6	7911	7916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488575052
96	NC_021172	CGA	2	6	8013	8018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575052
97	NC_021172	CGA	2	6	8103	8108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575052
98	NC_021172	GCT	2	6	8165	8170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575052
99	NC_021172	GGT	2	6	8174	8179	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488575052
100	NC_021172	CAG	2	6	8281	8286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575052
101	NC_021172	AGC	2	6	8342	8347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575052
102	NC_021172	GCA	2	6	8418	8423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575052
103	NC_021172	CGT	2	6	8440	8445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575052
104	NC_021172	GAA	2	6	8503	8508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488575052
105	NC_021172	GAG	2	6	8518	8523	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	488575052
106	NC_021172	GTC	2	6	8546	8551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575052
107	NC_021172	AGC	2	6	8585	8590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575052
108	NC_021172	CGA	2	6	8595	8600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575052
109	NC_021172	GCC	2	6	8627	8632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488575052
110	NC_021172	GTC	2	6	8686	8691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575052
111	NC_021172	GCA	2	6	8727	8732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575052
112	NC_021172	CGA	2	6	8742	8747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575052
113	NC_021172	AGC	2	6	8756	8761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575052
114	NC_021172	GCA	2	6	8778	8783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575052
115	NC_021172	CGA	2	6	8838	8843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575052
116	NC_021172	CAA	2	6	8845	8850	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	488575052
117	NC_021172	GAC	2	6	8857	8862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575052
118	NC_021172	CCG	2	6	8907	8912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488575052
119	NC_021172	CGA	2	6	8959	8964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575052
120	NC_021172	GAT	3	9	8983	8991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488575052
121	NC_021172	GTG	2	6	8996	9001	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488575052
122	NC_021172	GCC	2	6	9041	9046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488575052
123	NC_021172	AGC	2	6	9137	9142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575052
124	NC_021172	GCG	2	6	9254	9259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575052
125	NC_021172	CAG	2	6	9767	9772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575053
126	NC_021172	GAA	2	6	9799	9804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488575053
127	NC_021172	GCG	2	6	9920	9925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575053
128	NC_021172	ATG	2	6	9926	9931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488575053
129	NC_021172	TAA	2	6	9973	9978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	488575053
130	NC_021172	GCG	2	6	10035	10040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575053
131	NC_021172	GCC	2	6	10088	10093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488575053
132	NC_021172	GGA	2	6	10105	10110	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	488575053
133	NC_021172	GGC	2	6	10199	10204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575053
134	NC_021172	GCA	2	6	10216	10221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575053
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140	NC_021172	CGA	2	6	10485	10490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575053
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149	NC_021172	CGG	2	6	10828	10833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575053
150	NC_021172	TCG	2	6	10845	10850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575053
151	NC_021172	GCG	2	6	10940	10945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575053
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153	NC_021172	GCT	2	6	11206	11211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575053
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162	NC_021172	GAT	2	6	11542	11547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488575053
163	NC_021172	ACG	2	6	11552	11557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575053
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250	NC_021172	GCG	2	6	18322	18327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575060
251	NC_021172	TCG	2	6	18338	18343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575060
252	NC_021172	TCC	2	6	18371	18376	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	488575060
253	NC_021172	TCA	2	6	18574	18579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488575060
254	NC_021172	GCG	2	6	18601	18606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575060
255	NC_021172	GCG	2	6	18625	18630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575060
256	NC_021172	AGA	2	6	18643	18648	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488575060
257	NC_021172	TCG	2	6	18667	18672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575060
258	NC_021172	TGC	2	6	18697	18702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575060
259	NC_021172	GCG	2	6	18705	18710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575060
260	NC_021172	CAG	2	6	18766	18771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575060
261	NC_021172	TCG	2	6	18880	18885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575060
262	NC_021172	TCG	2	6	18904	18909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575060
263	NC_021172	GGC	2	6	18921	18926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575060
264	NC_021172	GCG	2	6	18927	18932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575060
265	NC_021172	CGG	2	6	18964	18969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575060
266	NC_021172	GAT	2	6	19021	19026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488575061
267	NC_021172	ACC	2	6	19136	19141	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488575061
268	NC_021172	GGC	2	6	19266	19271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575061
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270	NC_021172	GCC	2	6	19753	19758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488575061
271	NC_021172	GGC	2	6	19915	19920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575061
272	NC_021172	GCT	2	6	20159	20164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575062
273	NC_021172	GCT	2	6	20173	20178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575062
274	NC_021172	CGG	2	6	20224	20229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575062
275	NC_021172	GCG	2	6	20253	20258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575062
276	NC_021172	AGC	2	6	20281	20286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575062
277	NC_021172	TCC	2	6	20407	20412	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	488575062
278	NC_021172	TCA	2	6	20683	20688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488575062
279	NC_021172	CGT	2	6	20701	20706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575063
280	NC_021172	GCG	2	6	20730	20735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575063
281	NC_021172	GAC	2	6	20814	20819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575063
282	NC_021172	GCG	2	6	20885	20890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575063
283	NC_021172	GCC	2	6	20954	20959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488575063
284	NC_021172	ACA	2	6	20988	20993	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	488575063
285	NC_021172	GCA	2	6	21058	21063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575063
286	NC_021172	CGG	2	6	21077	21082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575063
287	NC_021172	CCT	2	6	21113	21118	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	488575063
288	NC_021172	GCC	2	6	21225	21230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488575064
289	NC_021172	GGC	2	6	21238	21243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575064
290	NC_021172	CGC	2	6	21291	21296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488575064
291	NC_021172	GCT	2	6	21401	21406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575064
292	NC_021172	GCG	2	6	21422	21427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575064
293	NC_021172	TCG	2	6	21491	21496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575064
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300	NC_021172	GGA	2	6	21921	21926	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	488575064
301	NC_021172	CGG	2	6	22109	22114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575064
302	NC_021172	CGG	2	6	22158	22163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575064
303	NC_021172	TCG	2	6	22298	22303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575064
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321	NC_021172	TGA	2	6	23314	23319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488575065
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355	NC_021172	ATA	2	6	26168	26173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	488575068
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369	NC_021172	TCG	2	6	26975	26980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575070
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372	NC_021172	CGT	3	9	27076	27084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575070
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374	NC_021172	ATC	2	6	27200	27205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488575070
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498	NC_021172	TGA	2	6	36435	36440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488575081
499	NC_021172	ACG	2	6	36488	36493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575081
500	NC_021172	GGC	2	6	36526	36531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575081

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