MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Archaeoglobus sulfaticallidus PM70-1

Total Repeats: 134

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021169	CCTCCC	2	12	1517	1528	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
2	NC_021169	TTACTT	2	12	13108	13119	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_021169	CATCAA	2	12	15412	15423	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_021169	ATTTTC	2	12	49209	49220	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_021169	ATTTTT	2	12	49483	49494	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021169	ATTTTT	2	12	53074	53085	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021169	TTAAAA	2	12	72274	72285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021169	ATGATA	2	12	122352	122363	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021169	GAAAGG	2	12	148469	148480	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021169	TCAGGA	2	12	225314	225325	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_021169	AATTAA	2	12	237540	237551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021169	CTGAGA	2	12	264893	264904	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_021169	TAAAAG	2	12	265547	265558	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021169	TGCTAA	2	12	275200	275211	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_021169	ATTTTT	2	12	301657	301668	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021169	TAACTT	2	12	344894	344905	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_021169	CTAAAC	2	12	352266	352277	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_021169	AAAATT	2	12	357160	357171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021169	TTGGAA	2	12	362238	362249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021169	TTTTGT	2	12	370495	370506	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021169	TTAATT	2	12	384616	384627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021169	ATTCAA	2	12	403394	403405	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_021169	TAAGAG	2	12	418371	418382	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021169	TTTTTA	2	12	424685	424696	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021169	ATAAAA	2	12	428834	428845	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021169	TAATTA	2	12	438023	438034	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021169	TAAAAA	2	12	507714	507725	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021169	GTTTTT	2	12	558936	558947	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021169	TTCTTT	2	12	629238	629249	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_021169	ATTGAG	2	12	634863	634874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021169	TTCTGG	2	12	666262	666273	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_021169	AAGAAA	2	12	666426	666437	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021169	AAATTT	2	12	740418	740429	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021169	TAATTT	2	12	746281	746292	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021169	TAAAAG	2	12	765051	765062	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021169	GGTTTC	2	12	769735	769746	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_021169	AATTTT	2	12	774170	774181	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021169	AAATAT	2	12	780883	780894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021169	ATAGAG	2	12	781370	781381	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021169	TTGATT	2	12	793416	793427	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021169	AAAGGA	2	12	840335	840346	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021169	TTACAT	2	12	856782	856793	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_021169	AAAATT	2	12	861443	861454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021169	GAGTAT	2	12	872274	872285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021169	CCTTTT	2	12	896496	896507	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_021169	ATTTTT	2	12	915025	915036	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021169	CATTTA	2	12	929924	929935	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_021169	TCAAAA	2	12	930272	930283	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_021169	TTAATT	2	12	951365	951376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021169	AAAATA	2	12	993305	993316	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021169	AAAGGT	2	12	1008454	1008465	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021169	GATTTT	2	12	1011111	1011122	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021169	ATTGTT	2	12	1027218	1027229	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021169	TAATTT	2	12	1030416	1030427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021169	CGAAGC	2	12	1055889	1055900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_021169	TTAACG	2	12	1060729	1060740	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_021169	AAATTT	2	12	1114694	1114705	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021169	TTTGAG	2	12	1115070	1115081	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021169	AGTTAA	2	12	1119302	1119313	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021169	TTAAGT	2	12	1127877	1127888	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021169	ATCTCG	2	12	1140780	1140791	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_021169	AAATAA	2	12	1142422	1142433	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021169	ATGCCC	2	12	1168191	1168202	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
64	NC_021169	GCTTTG	2	12	1168917	1168928	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_021169	TTTCAC	2	12	1184927	1184938	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_021169	ATTTCT	2	12	1189460	1189471	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_021169	ATTGCG	2	12	1193290	1193301	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_021169	TTAAAA	2	12	1193404	1193415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021169	CTTCTC	2	12	1195059	1195070	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_021169	TGGGTT	2	12	1196536	1196547	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021169	CCATTC	2	12	1197055	1197066	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_021169	GTTAAA	2	12	1199624	1199635	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021169	TGTGGT	2	12	1221437	1221448	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021169	GAGCAG	2	12	1221545	1221556	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_021169	TAATTC	2	12	1244013	1244024	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_021169	CAATTT	2	12	1266129	1266140	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_021169	AAACAG	2	12	1266214	1266225	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_021169	ATTTTT	2	12	1289632	1289643	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021169	TTTTTA	2	12	1295300	1295311	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021169	CTCTAT	2	12	1314947	1314958	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_021169	TGATGG	2	12	1318204	1318215	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021169	TCATAA	2	12	1331956	1331967	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_021169	CCTTGA	2	12	1333559	1333570	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_021169	CTGTTG	2	12	1334312	1334323	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_021169	CATTAT	2	12	1334324	1334335	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_021169	AAAAAT	2	12	1365281	1365292	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021169	ATTTAA	2	12	1400799	1400810	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021169	TTTTAA	2	12	1412493	1412504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021169	TTTTTA	2	12	1429240	1429251	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021169	GGTTTT	2	12	1435864	1435875	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021169	CCATAA	2	12	1471028	1471039	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_021169	TTGCTT	2	12	1479254	1479265	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_021169	TTCACC	2	12	1503416	1503427	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_021169	TTGTTT	2	12	1543397	1543408	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021169	AAATAA	2	12	1557043	1557054	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_021169	TATCAT	2	12	1583366	1583377	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_021169	ATTTTT	2	12	1606533	1606544	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021169	TATCGC	2	12	1627706	1627717	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_021169	TTAAAC	2	12	1651995	1652006	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_021169	AATTTT	2	12	1657733	1657744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_021169	GAGCAA	2	12	1676623	1676634	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_021169	ATTTTA	2	12	1716777	1716788	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_021169	TTTTGA	2	12	1724938	1724949	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_021169	TATTTT	2	12	1725118	1725129	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021169	GTGAAA	2	12	1738733	1738744	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_021169	TAAAAT	2	12	1758385	1758396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021169	AAAGCT	2	12	1763382	1763393	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_021169	TGAAAG	2	12	1772164	1772175	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021169	AAAATA	2	12	1789510	1789521	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021169	TCGGCT	2	12	1799998	1800009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_021169	TTTTGG	2	12	1812679	1812690	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021169	TAAAAA	2	12	1814985	1814996	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021169	CTTATA	2	12	1815088	1815099	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_021169	ATCAGA	2	12	1829400	1829411	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_021169	ATTTTA	2	12	1841702	1841713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_021169	TTTTGC	2	12	1843512	1843523	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_021169	AATTTA	2	12	1844035	1844046	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_021169	ACTTTA	2	12	1858254	1858265	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_021169	GAAAAA	2	12	1882118	1882129	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_021169	CTAACT	2	12	1886601	1886612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_021169	TAAAAA	2	12	1908684	1908695	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_021169	CTCCAA	2	12	1916006	1916017	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_021169	TTTCTC	2	12	1943609	1943620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_021169	TGGGGG	2	12	1953459	1953470	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_021169	GCTGAA	2	12	1965437	1965448	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_021169	ATACAA	2	12	1967211	1967222	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_021169	TATAAA	2	12	1981565	1981576	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_021169	TATAAT	2	12	2001036	2001047	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_021169	TAATTT	2	12	2013062	2013073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_021169	TTTTAA	2	12	2046404	2046415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_021169	CGTTGT	2	12	2059155	2059166	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
132	NC_021169	TTCCAT	2	12	2059350	2059361	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_021169	TTTATT	2	12	2063421	2063432	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_021169	AAATAA	2	12	2068922	2068933	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.