MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Archaeoglobus sulfaticallidus PM70-1

Total Repeats: 254

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021169	CCACA	2	10	16927	16936	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
2	NC_021169	TTTAA	2	10	20038	20047	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021169	TTAGA	2	10	20049	20058	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021169	TAAGA	2	10	31092	31101	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021169	CTCTT	2	10	52938	52947	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
6	NC_021169	AAATC	2	10	53589	53598	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_021169	GTTTC	2	10	70652	70661	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
8	NC_021169	AATAA	2	10	75162	75171	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021169	AGAGA	2	10	79521	79530	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021169	TTTCA	2	10	117465	117474	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_021169	AAACA	2	10	119945	119954	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_021169	TTGAA	2	10	148423	148432	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021169	TTTGA	2	10	164504	164513	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021169	TAACC	2	10	166984	166993	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
15	NC_021169	CCTGT	2	10	167319	167328	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
16	NC_021169	ATAGC	2	10	176240	176249	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
17	NC_021169	AATTT	2	10	176321	176330	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021169	ATTAA	2	10	176355	176364	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021169	AGTAA	2	10	177919	177928	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021169	AATCG	2	10	183436	183445	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
21	NC_021169	TTAAA	2	10	207830	207839	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021169	CAAAC	2	10	213766	213775	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
23	NC_021169	ACAAT	2	10	232434	232443	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_021169	AACAT	2	10	256634	256643	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_021169	ATACC	2	10	260733	260742	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
26	NC_021169	GGTAG	2	10	260803	260812	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021169	GTTTC	2	10	264550	264559	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
28	NC_021169	GAAAA	2	10	289928	289937	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021169	ATTAA	2	10	301768	301777	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021169	TACAT	2	10	304537	304546	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_021169	CAAGT	2	10	304694	304703	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
32	NC_021169	AAACC	2	10	320536	320545	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
33	NC_021169	ATGAA	2	10	325251	325260	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021169	TTCCT	2	10	354965	354974	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
35	NC_021169	AATAA	2	10	358744	358753	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021169	TAGAA	2	10	361398	361407	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021169	ACCCC	2	10	361526	361535	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
38	NC_021169	ACTTC	2	10	362085	362094	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
39	NC_021169	ATTTT	2	10	365603	365612	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021169	CCTTT	2	10	365771	365780	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
41	NC_021169	AGCAT	2	10	366823	366832	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
42	NC_021169	GTTTT	2	10	373725	373734	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021169	CTGAT	2	10	382252	382261	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
44	NC_021169	AAAAG	2	10	382326	382335	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021169	AGAGA	2	10	389346	389355	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021169	AATCC	2	10	405726	405735	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
47	NC_021169	TTTGA	2	10	416727	416736	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021169	TAAAA	2	10	416746	416755	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021169	AATTT	2	10	438113	438122	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021169	ATTTA	2	10	446050	446059	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021169	TCTCC	2	10	449002	449011	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
52	NC_021169	AAGCG	2	10	450074	450083	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
53	NC_021169	TTTAA	2	10	450942	450951	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021169	AACAG	2	10	451145	451154	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
55	NC_021169	TTCAG	2	10	486013	486022	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
56	NC_021169	CGCAC	2	10	495218	495227	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
57	NC_021169	AAACT	2	10	536479	536488	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
58	NC_021169	AGCAT	2	10	541338	541347	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
59	NC_021169	ATGTT	2	10	603231	603240	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021169	TTATA	2	10	629454	629463	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021169	AACTC	2	10	629521	629530	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
62	NC_021169	AGTTG	2	10	660006	660015	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021169	CACAT	2	10	680904	680913	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
64	NC_021169	ATAAA	2	10	685756	685765	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021169	TTCCA	2	10	699394	699403	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
66	NC_021169	ATTTT	2	10	711935	711944	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021169	ATTAA	2	10	740408	740417	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021169	AAAAT	2	10	768002	768011	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021169	AAAAG	2	10	770078	770087	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021169	AAAAG	2	10	770535	770544	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021169	ATCCC	2	10	771097	771106	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
72	NC_021169	GGGTG	2	10	781521	781530	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021169	ACCCC	2	10	781606	781615	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
74	NC_021169	ATAAA	2	10	781780	781789	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021169	TACCA	2	10	788854	788863	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
76	NC_021169	AAAAT	2	10	789617	789626	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021169	CTACC	2	10	822760	822769	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
78	NC_021169	TGAAA	2	10	824159	824168	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021169	TAAAT	2	10	828544	828553	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021169	AGCTC	2	10	832747	832756	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
81	NC_021169	GTCAA	2	10	832788	832797	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
82	NC_021169	CAAAA	2	10	844003	844012	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
83	NC_021169	AAATA	2	10	858676	858685	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021169	AAGAA	2	10	863801	863810	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021169	CAGAA	2	10	873369	873378	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
86	NC_021169	ATTTT	2	10	873618	873627	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021169	TTTGA	2	10	883143	883152	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021169	TATGT	2	10	886870	886879	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021169	TTTAT	2	10	890564	890573	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021169	TTATA	2	10	900659	900668	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021169	CAACT	2	10	905267	905276	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
92	NC_021169	AATCA	2	10	932783	932792	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
93	NC_021169	GATTT	2	10	955333	955342	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021169	AATTT	2	10	993272	993281	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021169	TAAAT	2	10	998249	998258	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_021169	GCCAA	2	10	998300	998309	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
97	NC_021169	TTCAC	2	10	1010464	1010473	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
98	NC_021169	CCAAG	2	10	1011188	1011197	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
99	NC_021169	TAGAT	2	10	1011301	1011310	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021169	AACTA	2	10	1017751	1017760	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
101	NC_021169	ATTTT	2	10	1019678	1019687	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_021169	AAATT	2	10	1021704	1021713	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_021169	CAAGC	2	10	1037945	1037954	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
104	NC_021169	CTATG	2	10	1043148	1043157	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
105	NC_021169	CTCAT	2	10	1051390	1051399	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
106	NC_021169	CCACA	2	10	1056563	1056572	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
107	NC_021169	ATAAA	2	10	1057966	1057975	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_021169	CAAAA	2	10	1061678	1061687	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
109	NC_021169	TTCAT	2	10	1062617	1062626	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
110	NC_021169	ACAAT	2	10	1064014	1064023	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
111	NC_021169	ATTGG	2	10	1085723	1085732	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021169	TTAAA	2	10	1085795	1085804	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021169	ACCCC	2	10	1096496	1096505	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
114	NC_021169	TAAAT	2	10	1101163	1101172	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021169	ATTTT	2	10	1114141	1114150	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_021169	AAAAT	2	10	1114216	1114225	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_021169	TAGCT	2	10	1114737	1114746	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
118	NC_021169	GAGAG	2	10	1117721	1117730	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021169	GGATT	2	10	1117806	1117815	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
120	NC_021169	CTCTG	2	10	1117940	1117949	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
121	NC_021169	GAAAA	2	10	1118127	1118136	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
122	NC_021169	TCGAC	2	10	1129204	1129213	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
123	NC_021169	TTTGA	2	10	1156036	1156045	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
124	NC_021169	CATAA	2	10	1165508	1165517	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
125	NC_021169	GATTT	2	10	1186049	1186058	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
126	NC_021169	GGAGG	2	10	1186158	1186167	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
127	NC_021169	CGGTG	2	10	1186351	1186360	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
128	NC_021169	ACTTC	2	10	1186683	1186692	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
129	NC_021169	TACGA	2	10	1190978	1190987	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
130	NC_021169	TACGA	2	10	1191084	1191093	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
131	NC_021169	TACGA	2	10	1191250	1191259	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
132	NC_021169	TACGA	2	10	1191416	1191425	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
133	NC_021169	TACGA	2	10	1191582	1191591	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
134	NC_021169	AGTAA	2	10	1192062	1192071	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
135	NC_021169	TGAAG	2	10	1194924	1194933	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
136	NC_021169	ATTTT	2	10	1196025	1196034	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_021169	TTCCA	2	10	1196787	1196796	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
138	NC_021169	CCAGT	2	10	1197074	1197083	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
139	NC_021169	ATCCA	2	10	1197184	1197193	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
140	NC_021169	CCATT	2	10	1197252	1197261	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
141	NC_021169	TATTC	2	10	1197773	1197782	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
142	NC_021169	GGAAT	2	10	1199329	1199338	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
143	NC_021169	GAGTG	2	10	1201617	1201626	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
144	NC_021169	AAACA	2	10	1205376	1205385	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
145	NC_021169	TTTTA	2	10	1205566	1205575	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_021169	AAACA	2	10	1210273	1210282	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
147	NC_021169	ACTTA	2	10	1248106	1248115	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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181	NC_021169	AATTT	2	10	1516740	1516749	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
182	NC_021169	TTAGA	2	10	1529689	1529698	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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193	NC_021169	TAAAA	2	10	1642687	1642696	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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252	NC_021169	CGAGG	2	10	2049088	2049097	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
253	NC_021169	AATAA	2	10	2054517	2054526	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
254	NC_021169	TTTTC	2	10	2059825	2059834	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.